Result of FASTA (ccds) for pF1KB6614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6614, 432 aa
  1>>>pF1KB6614 432 - 432 aa - 432 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8390+/-0.00136; mu= 2.3010+/- 0.081
 mean_var=247.8459+/-49.584, 0's: 0 Z-trim(108.7): 112  B-trim: 286 in 2/50
 Lambda= 0.081467
 statistics sampled from 10303 (10414) to 10303 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.32), width:  16
 Scan time:  2.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17         ( 432) 2737 335.1 8.1e-92
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17         ( 472) 1958 243.6 3.1e-64
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17         ( 473) 1843 230.1 3.7e-60
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17         ( 456) 1710 214.4 1.8e-55
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17         ( 400) 1635 205.5 7.5e-53
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 458) 1619 203.7   3e-52
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 420) 1616 203.3 3.6e-52
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17         ( 584) 1527 193.0 6.5e-49
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17         ( 494) 1466 185.8 8.3e-47
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17         ( 467) 1376 175.2 1.2e-43
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17       ( 525) 1361 173.5 4.5e-43
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17       ( 459) 1349 172.0 1.1e-42
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17       ( 464) 1327 169.4 6.6e-42
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17        ( 424) 1298 166.0 6.5e-41
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17         ( 455) 1290 165.0 1.3e-40
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17       ( 450) 1264 162.0 1.1e-39
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17          ( 623) 1236 158.8 1.3e-38
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17       ( 468) 1223 157.2 3.2e-38
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17        ( 404) 1216 156.3   5e-38
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17         ( 416) 1213 156.0 6.6e-38
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17        ( 404) 1211 155.7 7.6e-38
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17         ( 436) 1207 155.3 1.1e-37
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17         ( 448) 1201 154.6 1.8e-37
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17       ( 431) 1103 143.0 5.3e-34
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12         ( 430) 1091 141.6 1.4e-33
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17         ( 456) 1066 138.7 1.1e-32
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17         ( 449) 1060 138.0 1.8e-32
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 422) 1057 137.6 2.2e-32
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17       ( 491) 1058 137.8 2.3e-32
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 285)  752 101.6   1e-21
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432)  689 94.4 2.3e-19
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431)  680 93.3 4.9e-19
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916)  686 94.3 5.1e-19
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438)  679 93.2 5.3e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470)  651 90.0 5.5e-18
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499)  649 89.7 6.7e-18
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466)  647 89.5 7.6e-18
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543)  638 88.5 1.8e-17
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12           ( 470)  580 81.6 1.8e-15
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483)  575 81.0 2.7e-15
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511)  575 81.1 2.8e-15
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3          ( 415)  569 80.3   4e-15
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12          ( 507)  565 79.9 6.4e-15
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22          (1020)  561 79.7 1.5e-14
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12          ( 551)  554 78.6 1.7e-14
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12          ( 493)  552 78.3 1.8e-14
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12           ( 469)  546 77.6 2.8e-14
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12         ( 486)  545 77.5 3.2e-14
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12          ( 600)  546 77.7 3.4e-14
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12         ( 505)  541 77.1 4.5e-14


>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17              (432 aa)
 initn: 2737 init1: 2737 opt: 2737  Z-score: 1761.9  bits: 335.1 E(32554): 8.1e-92
Smith-Waterman score: 2737; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (1-432:1-432)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKV
              370       380       390       400       410       420

              430  
pF1KB6 ISSREQVHQTTR
       ::::::::::::
CCDS11 ISSREQVHQTTR
              430  

>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17              (472 aa)
 initn: 2242 init1: 1867 opt: 1958  Z-score: 1266.6  bits: 243.6 E(32554): 3.1e-64
Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-430:1-470)

               10            20               30            40     
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA
       :::  ::::::::.:::    .:.:::::: :       ::     .:::...: :..:.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
               10        20        30        40        50        60

            50        60                      70        80         
pF1KB6 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ
       :  :::.  ::.  ::  :::::              ::.:..:.: ::::.:.::.:::
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
               70        80        90       100       110       120

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB6 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT
       ::::::::::::::::::::..:::::::::::: :.  .::: :..:::.:.:::::::
CCDS11 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
              130       140       150       160       170       180

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB6 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
       :::::.:::::::::::::::::.:::  ::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
              190       200       210       220       230       240

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB6 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
       .:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
              250       260       270       280       290       300

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB6 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA
       :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..: 
CCDS11 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
              310       320       330       340       350       360

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB6 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
       ::..:::.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
              370       380       390       400       410       420

     390         400              410       420       430  
pF1KB6 GEDAHLT--QYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       ::::::.  :...     . ::.  ::.:: : .:.::::.:..::: .:  
CCDS11 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
              430       440       450       460       470  

>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17              (473 aa)
 initn: 2010 init1: 1803 opt: 1843  Z-score: 1193.5  bits: 230.1 E(32554): 3.7e-60
Smith-Waterman score: 1897; 70.1% identity (84.7% similar) in 445 aa overlap (2-410:2-445)

               10        20        30        40                    
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL----------------GS
        ::  ::::::::.::: :.::: .  : :.:. :..::::                 :.
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
               10        20        30        40        50        60

           50        60          70                        80      
pF1KB6 AGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--GGYGSSFG----------------GVDGLLAGGEKA
       : :::.  ::. .::  :::::  ::::...:                : ::::.:.::.
CCDS11 ACGLGGGYGGG-FSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEKV
               70         80        90       100       110         

         90       100       110       120       130       140      
pF1KB6 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKIL
       :::::::::::::::::::::::..:::::::::::: :.  .::: :..:::.:.:::.
CCDS11 TMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKII
     120       130       140       150       160       170         

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB6 TATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEM
       .::..::. .::::::::::::::::.: : ::: .::::.::::::::::::::.::::
CCDS11 AATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLEM
     180       190       200       210       220       230         

        210       220       230       240       250       260      
pF1KB6 QIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEK
       :::.::::::::.::::::: :::::.::..::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS11 QIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAEK
     240       250       260       270       280       290         

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB6 NRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEG
       ::.::: ::.:::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::.
CCDS11 NRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLEN
     300       310       320       330       340       350         

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB6 NLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRR
       .: ::..:::.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::
CCDS11 SLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYRR
     360       370       380       390       400       410         

        390         400       410       420       430        
pF1KB6 LLEGEDAHLT--QYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR      
       :::::::::.  : . .  ..:.: :                            
CCDS11 LLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
     420       430       440       450       460       470   

>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17              (456 aa)
 initn: 1626 init1: 1307 opt: 1710  Z-score: 1109.2  bits: 214.4 E(32554): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 1722; 62.1% identity (83.7% similar) in 454 aa overlap (1-426:1-454)

               10            20        30             40           
pF1KB6 MTTSIRQFTSSS----SIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLG-----AGSCRL---GSAGGL
       :::.. : .::.    : .:.: :.::..  .  :::: :     :.: :.   ::.:: 
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
               10        20        30        40        50        60

       50                60        70         80        90         
pF1KB6 GSTL--------GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDG-LLAGGEKATMQNLNDRLASYL
       :. .        .:: ... .. : :::.:..::: :: ::.:.:: :::::::::::::
CCDS11 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB6 DKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAP-GPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQ
       ::::::::::..:::::.::::.:.: .:  :::::..:::::..::...:.::. ..:.
CCDS11 DKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILE
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB6 IDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYL
       :::::::::::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::::.:::::::.:.::::::
CCDS11 IDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYL
              190       200       210       220       230       240

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB6 KKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSK
       ::::::::. . .:..:..::::::::::::.:.: :::.::: ::::::.:.: :::::
CCDS11 KKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSK
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB6 TEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQ
       :::::.:::.:.:..:..:.::..:::::: :::::::::::::.::..::::: :: .:
CCDS11 TEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQ
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pF1KB6 LSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQY
       :.:::::::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.::...  
CCDS11 LQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGI
              370       380       390       400       410       420

      400             410       420       430  
pF1KB6 KKEPVTT------RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
         . ...       . .  :::  ::.:.::...      
CCDS11 AIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI    
              430       440       450          

>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17              (400 aa)
 initn: 1675 init1: 1580 opt: 1635  Z-score: 1062.3  bits: 205.5 E(32554): 7.5e-53
Smith-Waterman score: 1635; 65.7% identity (87.7% similar) in 397 aa overlap (1-394:1-390)

                10        20        30        40         50        
pF1KB6 MTT-SIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-GSAGGLGSTLGGSSYS
       ::. : :: ...::.   .::::::     :.. :..  .  . :..:: : ..... . 
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSF---GGLGGGS----VRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFV
               10           20            30        40        50   

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pF1KB6 SCYSFGS-GGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIR
       :  : :. :::::. . . ::::::.:: :::::::::::::::::::: :: :::::::
CCDS11 SSSSSGAYGGGYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIR
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pF1KB6 DWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQ
       ::::.:.:::.::::.:: ::..:..::: ::..:. :.:::::::::::::::::::::
CCDS11 DWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQ
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pF1KB6 ALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEI
       :::.::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::...:::::::..
CCDS11 ALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQV
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KB6 NVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGK
       .::.:.:::.::..::..::.::: :::.:::::: :: :.::::::::: ..: .: ..
CCDS11 SVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSR
           240       250       260       270       280       290   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 SEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLR
       ::...::::.:.:::::::::::::.:: .::::: :. .::..::.::...: ::...:
CCDS11 SEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVR
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KB6 CEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQD
        . :.:::::. :.:.:.:::::::::: ::::.. :                       
CCDS11 ADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL             
           360       370       380       390       400             

       420       430  
pF1KB6 GKVISSREQVHQTTR

>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (458 aa)
 initn: 1547 init1: 1272 opt: 1619  Z-score: 1051.4  bits: 203.7 E(32554): 3e-52
Smith-Waterman score: 1640; 59.7% identity (81.3% similar) in 449 aa overlap (4-423:2-444)

               10        20        30        40             50     
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG--
          :.:  .::.:  :  :.::::    :.:.:: :...:       ::::: :. ..  
CCDS11   MSLRLQSSSASYGG--GFGGGS----CQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG
                 10          20            30        40        50  

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pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
            ::.... :. : :::::...::          ::      :::.:.:: ::::::
CCDS11 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
             60        70        80        90       100       110  

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pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
       :::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
CCDS11 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
            120       130       140       150       160       170  

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pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
       :  ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
CCDS11 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
            180       190       200       210       220       230  

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pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
       .:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
CCDS11 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
       :.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
CCDS11 EEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
            300       310       320       330       340       350  

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
       : :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
CCDS11 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
            360       370       380       390       400       410  

             400       410       420       430       
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR     
       ::..  . .   ..    : :  .....: ..              
CCDS11 DAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
            420       430       440       450        

>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (420 aa)
 initn: 1546 init1: 1271 opt: 1616  Z-score: 1050.0  bits: 203.3 E(32554): 3.6e-52
Smith-Waterman score: 1637; 62.9% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (4-397:2-418)

               10        20        30        40             50     
pF1KB6 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRL-----GSAGGLGSTLG--
          :.:  .::.:  :  :.:::    ::.:.:: :...:       ::::: :. ..  
CCDS11   MSLRLQSSSASYGG--GFGGG----SCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCG
                 10              20        30        40        50  

                 60        70                        80        90  
pF1KB6 -----GSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
            ::.... :. : :::::...::          ::      :::.:.:: ::::::
CCDS11 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
             60        70        80        90       100       110  

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB6 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
       :::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
CCDS11 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
            120       130       140       150       160       170  

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB6 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
       :  ..:.:::::::::::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
CCDS11 NNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
            180       190       200       210       220       230  

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB6 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
       .:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
CCDS11 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
            240       250       260       270       280       290  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB6 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
       :.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
CCDS11 EEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
            300       310       320       330       340       350  

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB6 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
       : :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
CCDS11 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
            360       370       380       390       400       410  

             400       410       420       430  
pF1KB6 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       ::.  :                                   
CCDS11 DAKKRQPP                                 
            420                                 

>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17              (584 aa)
 initn: 1473 init1: 1183 opt: 1527  Z-score: 991.6  bits: 193.0 E(32554): 6.5e-49
Smith-Waterman score: 1531; 63.4% identity (82.3% similar) in 407 aa overlap (8-391:52-456)

                                      10        20          30     
pF1KB6                        MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLG--GGSSRTSCRLSGGL
                                     :...:  .:::: :  ::::     : ::.
CCDS11 GGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGL-GGF
              30        40        50        60        70         80

          40                  50        60                70       
pF1KB6 GAGSCRL--------GSAGGL--GSTLGGSSYSSCYSFGSGG--------GYGSSFGGVD
       :.:: :         :: ::.  :...::.:...  :::.::        :.:..:::  
CCDS11 GGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGG-SFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDG
               90       100       110        120       130         

        80        90       100       110       120          130    
pF1KB6 GLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQA---PGPARDYSQY
       :::.:.::.:::::::::::::::::::::.: ::: ::..::....    :  ::::.:
CCDS11 GLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKY
     140       150       160       170       180       190         

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB6 YRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVL
       :.::..:.:.::. :.:::::::::::::::::::: :.:.: ::: :::::::::::::
CCDS11 YKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVL
     200       210       220       230       240       250         

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB6 DELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILN
       :::::..::::::::.: ::::::::::::::. ::.   :..::::.:::::::...::
CCDS11 DELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLN
     260       270       280       290       300       310         

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB6 EMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIEL
       .::.:::..::.:::::: ::  :..::. :. .: : ..: ::::.::::..:::::::
CCDS11 NMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIEL
     320       330       340       350       360       370         

          320       330       340       350       360       370    
pF1KB6 QSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVK
       ::::..: :::..:::::.::::::::::. :...:::: :.: : : :: ::. :::.:
CCDS11 QSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIK
     380       390       400       410       420       430         

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB6 TRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR  
        :::.:: ::: :::::                                           
CCDS11 IRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGY
     440       450       460       470       480       490         

>>CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17              (494 aa)
 initn: 1456 init1: 1109 opt: 1466  Z-score: 953.8  bits: 185.8 E(32554): 8.3e-47
Smith-Waterman score: 1521; 57.3% identity (79.2% similar) in 443 aa overlap (8-426:57-488)

                                      10        20        30       
pF1KB6                        MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGA
                                     :...: . .:::.::::. .   ..:::::
CCDS11 IGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAASMFGSSSGFGGGSGSS---MAGGLGA
         30        40        50        60        70           80   

        40           50        60        70        80        90    
pF1KB6 GSCRL---GSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDR
       :  :    :: ::::  .:::         .::. :   :.  :::.:.:: ::::::::
CCDS11 GYGRALGGGSFGGLGMGFGGSP--------GGGSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDR
            90       100               110       120       130     

          100       110       120           130       140       150
pF1KB6 LASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPA----RDYSQYYRTIEELQNKILTATV
       ::::::::::::::::::: :::.::. .. : :     :::.::  ::.:.:::..:..
CCDS11 LASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASI
         140       150       160       170       180       190     

              160       170       180       190       200       210
pF1KB6 DNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIEN
        ::..:::::::::::.::: :.:.: ::: .:::::::::::::::::.:.:::::::.
CCDS11 GNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIES
         200       210       220       230       240       250     

              220       230       240       250       260       270
pF1KB6 LKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKD
       :.:::::.:::::.:....:    ::..:::::::::::.:.::.:: ::: .::.::::
CCDS11 LNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKD
         260       270       280       290       300       310     

              280       290       300       310       320       330
pF1KB6 AEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAE
       :: ::. :. :: .:..::.: .::.:::...:::..: :::::::::.:: ::: .:::
CCDS11 AEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAE
         320       330       340       350       360       370     

              340       350       360       370       380       390
pF1KB6 TENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEG
       .:. ::.::::.: ::...: :: :.: . :.:: ... ::.::.::: :: ::::::.:
CCDS11 AEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDG
         380       390       400       410       420       430     

                               400       410       420       430  
pF1KB6 E-----------------DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
       :                 .:. :. .:.:. ::...:.:.:. .:.:.::. :      
CCDS11 EAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM
         440       450       460       470       480       490    

>>CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17              (467 aa)
 initn: 1454 init1: 1278 opt: 1376  Z-score: 896.9  bits: 175.2 E(32554): 1.2e-43
Smith-Waterman score: 1420; 54.6% identity (75.7% similar) in 456 aa overlap (10-428:11-463)

                10        20               30           40         
pF1KB6  MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTS-------CR---LSGGLGAGSCRLGSAGGLG
                 :..::::  : .:: ::.:       ::   :.:. :  :   .. .:::
CCDS11 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVGSCRVPSLAGAAGYISSARSGLSGLG
               10        20        30        40        50        60

      50         60        70        80        90       100        
pF1KB6 STLGGSSYSS-CYSFGSGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEA
       : : ::  :: :.. :  :. :. :   .: . :.:: ::: ::::::.::.::: ::. 
CCDS11 SCLPGSYLSSECHTSGFVGS-GGWF--CEGSFNGSEKETMQFLNDRLANYLEKVRQLERE
               70        80           90       100       110       

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB6 NTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADD
       :.::: .:..::. : :    ::..:..:::..:.::: .  .:: ..::::::.:::::
CCDS11 NAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQIDNAKLAADD
       120       130       140       150       160       170       

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB6 FRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNA
       ::::.::: .::  ::::::::::.:::::: .:::: :.:.:::::  ::::::::...
CCDS11 FRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVSV
       180       190       200       210       220       230       

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB6 LRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVAT
       :: :.: ..:::.:::: :::..::..:: ::: ..:.::.:.: :: ..:::::..:..
CCDS11 LRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQTEELNQQVVS
       240       250       260       270       280       290       

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB6 NSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGS
       .:: .:  ..:: :::::..:::::::.: ::. :::..::::: ::  ::.:.: ::..
CCDS11 SSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQLAQMQCLISN
       300       310       320       330       340       350       

      350       360       370       380       390             400  
pF1KB6 VEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHL------TQYKK--
       :: ::...::..:.:::::..:::::.::: ::::::.:::::: .:      :  :   
CCDS11 VEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCKLPPQPCATACKPVI
       360       370       380       390       400       410       

                                410       420       430  
pF1KB6 ------------------EPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
                          : .  :.:::.::..:::::::::.:.    
CCDS11 RVPSVPPVPCVPSVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQSRPL
       420       430       440       450       460       




432 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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