Result of FASTA (ccds) for pF1KB4567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4567, 760 aa
  1>>>pF1KB4567 760 - 760 aa - 760 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5336+/-0.00103; mu= 6.3246+/- 0.062
 mean_var=193.7905+/-40.759, 0's: 0 Z-trim(110.3): 56  B-trim: 9 in 1/49
 Lambda= 0.092131
 statistics sampled from 11449 (11500) to 11449 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.353), width:  16
 Scan time:  4.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44877.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12        ( 760) 4998 677.4 2.2e-194
CCDS8802.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12         ( 759) 4965 673.0 4.6e-193
CCDS55826.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12        ( 600) 3959 539.3 6.9e-153
CCDS58230.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12        ( 457) 3036 416.5 4.8e-116
CCDS42768.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2        ( 938)  748 112.6   3e-24
CCDS56143.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2        ( 971)  737 111.1 8.4e-24
CCDS56145.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2        ( 716)  728 109.9 1.5e-23
CCDS11641.1 LIMD2 gene_id:80774|Hs108|chr17        ( 127)  465 74.4 1.3e-13


>>CCDS44877.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12             (760 aa)
 initn: 4998 init1: 4998 opt: 4998  Z-score: 3603.2  bits: 677.4 E(32554): 2.2e-194
Smith-Waterman score: 4998; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760
pF1KB4 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
              730       740       750       760

>>CCDS8802.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12              (759 aa)
 initn: 2784 init1: 2784 opt: 4965  Z-score: 3579.5  bits: 673.0 E(32554): 4.6e-193
Smith-Waterman score: 4965; 99.7% identity (99.7% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-759)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MESSPFNRRQWTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SQHFRKGTLTVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EEQIHPRSRLRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISEN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TDASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LSSSTFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  :::::::::::::::
CCDS88 HKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSR-DSQVKSEVQQPVHPK
              310       320       330       340        350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSY
     360       370       380       390       400       410         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 CNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPA
     420       430       440       450       460       470         

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELG
     480       490       500       510       520       530         

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQS
     540       550       560       570       580       590         

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESK
     600       610       620       630       640       650         

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEF
     660       670       680       690       700       710         

              730       740       750       760
pF1KB4 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
     720       730       740       750         

>>CCDS55826.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12             (600 aa)
 initn: 3959 init1: 3959 opt: 3959  Z-score: 2858.3  bits: 539.3 E(32554): 6.9e-153
Smith-Waterman score: 3959; 100.0% identity (100.0% similar) in 600 aa overlap (161-760:1-600)

              140       150       160       170       180       190
pF1KB4 RSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISENTDASGKIEKY
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                               MENCLGESRHEVEKSEISENTDASGKIEKY
                                             10        20        30

              200       210       220       230       240       250
pF1KB4 NVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQLSSSTFDSEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQLSSSTFDSEK
               40        50        60        70        80        90

              260       270       280       290       300       310
pF1KB4 NESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKIHKMEQKENVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYTNELKASGGEIKIHKMEQKENVP
              100       110       120       130       140       150

              320       330       340       350       360       370
pF1KB4 PGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PGPEVCITHQEGEKISANENSLAVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASS
              160       170       180       190       200       210

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KMSKPKWPPEDEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE
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>>CCDS58230.1 LIMA1 gene_id:51474|Hs108|chr12             (457 aa)
 initn: 2784 init1: 2784 opt: 3036  Z-score: 2196.9  bits: 416.5 E(32554): 4.8e-116
Smith-Waterman score: 3036; 99.6% identity (99.6% similar) in 458 aa overlap (303-760:1-457)

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CCDS58                               MEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL
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       :::::::::::  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVRSTPAEDDSR-DSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGN
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CCDS58 YDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ASSQQEKEDKPAETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPEDEISKPEVPEDV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLDLKKLRRSSSLKERSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERKQVENAKASKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFLKQQSPQEPKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRY
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pF1KB4 YDEDEDEE
       ::::::::
CCDS58 YDEDEDEE
     450       

>>CCDS42768.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2             (938 aa)
 initn: 767 init1: 487 opt: 748  Z-score: 548.9  bits: 112.6 E(32554): 3e-24
Smith-Waterman score: 763; 28.3% identity (56.4% similar) in 674 aa overlap (41-693:64-677)

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pF1KB4 WTSLSLRVTAKELSLVNKNKSSAIVEIFSKYQKAAEETNMEKKRSNTENLSQHFRK-GTL
                                     :. . :  . . ..... . :.. :. :  
CCDS42 TIFQPQESKLLAPEGEVVSAPQSLDPTSLPYSTGEEMWSSKPEEKDSVDKSNNTREYGRP
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pF1KB4 TVLKKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQEEQIHPRSR
        :::.     .:... . . .  .  :.:   . : .  .. :  :.:  . :.      
CCDS42 EVLKED----SLSSRRRIERFSIALDELRSVFEAPKSG-NKPAEYGGKEVEIERSLCSPA
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pF1KB4 LRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEVEKSEISENTDASGKIEK
       ..: : . ..     .::. : : . :   ::    :.::  . ..  . :   ::  : 
CCDS42 FKSHPGSQLEDS---VKDS-DKKGKETSFDKMSPESGHSR--IFEATAGPNKPESGFAED
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pF1KB4 YNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASG--RKISENSYSLDDLEIGPGQLSS--ST
         .  . .. . :     . .. : :.  . :  :..: : .  ...   :: :..  . 
CCDS42 SAARGEGVSDLHEV-VSLKERMARYQAAVSRGDCRSFSANMMEESEMCAVPGGLAKVKKQ
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pF1KB4 FDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYT-NELKASGGEIKIHKME
       :..: . :: ..   . .. . ... : ... :. . :: ... :: ..:    :..:..
CCDS42 FEDEITSSRNTFAQYQYQHQNRSEQEAIHSSQVGTSRSSQEMARNEQEGS----KVQKID
             270       280       290       300       310           

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pF1KB4 QKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL-------AVRSTPAEDDSPGDSQ--VKSEVQQ
        .     : :. ..: : .   .:. :        .: .:: ... :  :   .: . ..
CCDS42 VH-----GTEM-VSHLEKHTEEVNQASQFHQYVQETVIDTPEDEEIPKVSTKLLKEQFEK
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pF1KB4 PVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHISC
        .. : :  :.. ..     : : .::.    .: :. ::::::::: :.:..: :: ::
CCDS42 SAQEKILYSDKEMTT-----PAKQIKKLLLQDKEICILCQKTVYPMECLVADKQNFHKSC
             380            390       400       410       420      

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pF1KB4 FRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENEEI
       ::: .::.:::::.::::::.:::::::.:::::::::::::::. ::: :  ::... .
CCDS42 FRCHHCNSKLSLGNYASLHGQIYCKPHFKQLFKSKGNYDEGFGHKQHKDRWNCKNQSRSV
        430       440       450       460       470       480      

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pF1KB4 L----ERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKE-DKPAETKKLR
            :.: .  :  :.   :: ..            ..:  :  :...  : .:  ::.
CCDS42 DFIPNEEPNMCKNIAENTLVPGDRNE----------HLDAGNSEGQRNDLRKLGERGKLK
        490       500       510                 520       530      

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pF1KB4 IAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPE-DEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKERS
       . :::  :. ..   .:: .::::::::::   . .::   .  :.  .  .... ..  
CCDS42 VIWPPSKEIPKKTLPFEEELKMSKPKWPPEMTTLLSPEFKSESLLEDVRTPENKGQRQDH
        540       550       560       570       580       590      

     590       600       610       620       630       640         
pF1KB4 RPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNGNV
        :: .   .::: :                  :.:. .:  . : :. :. :  ::.:  
CCDS42 FPF-LQPYLQSTHVC-----------------QKEDVIG--IKEMKMPEGRKDEKKEG--
         600       610                          620       630      

     650       660       670       680       690       700         
pF1KB4 GKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLNWS
        . . :.. :..:  : ....     .:.:.. ..:........                
CCDS42 -RKNVQDRPSEAEDTKSNRKSAMDLNDNNNVIVQSAEKEKNEKTNQTNGAEVLQVTNTDD
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pF1KB4 SFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE         
                                                                   
CCDS42 EMMPENHKENLNKNNNNNYVAVSYLNNCRQKTSILEFLDLLPLSSEANDTANEYEIEKLE
           700       710       720       730       740       750   

>>CCDS56143.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2             (971 aa)
 initn: 767 init1: 487 opt: 737  Z-score: 540.8  bits: 111.1 E(32554): 8.4e-24
Smith-Waterman score: 748; 29.1% identity (56.7% similar) in 616 aa overlap (103-693:152-710)

             80        90       100       110       120            
pF1KB4 KKKWENPGLGAESHTDSLRNSSTEIRHRADHPPAEVTSHAASGAKADQE---EQIHPRSR
                                     :: ... . . .. :  .:   ... :.: 
CCDS56 EAPKSGNKPAEYGGKEVEIERSLCSPAFKSHPGSQLEDSVKDSDKKGKETSFDKMSPESG
             130       140       150       160       170       180 

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pF1KB4 LRSPPEALVQGRYPHIKDGEDLKDHSTESKKMENCLGESRHEV----EKSEISENTDASG
            ::. .    .:     :. :   .:  .: :  : .      .: : .   :...
CCDS56 HSRIFEAVFSTDQAQILR---LHLHPKLTKTPKNSLKSSTYISTAGPNKPESGFAEDSAA
             190          200       210       220       230        

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB4 KIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASGRKISENSYSLDDLEIGPGQLSS--
       . :  .  :...  . :.    :. . :.. :: :.  . :.     ..   :: :..  
CCDS56 RGEGVS-DLHEVVSLKERMARYQAAVSRGDCRSFSANMMEES-----EMCAVPGGLAKVK
      240        250       260       270            280       290  

           250       260       270       280        290       300  
pF1KB4 STFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYT-NELKASGGEIKIHK
       . :..: . :: ..   . .. . ... : ... :. . :: ... :: ..:    :..:
CCDS56 KQFEDEITSSRNTFAQYQYQHQNRSEQEAIHSSQVGTSRSSQEMARNEQEGS----KVQK
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pF1KB4 MEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL-------AVRSTPAEDDSPGDSQ--VKSEV
       .. .     : :. ..: : .   .:. :        .: .:: ... :  :   .: . 
CCDS56 IDVH-----GTEM-VSHLEKHTEEVNQASQFHQYVQETVIDTPEDEEIPKVSTKLLKEQF
      350             360       370       380       390       400  

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pF1KB4 QQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCVECQKTVYPMERLLANQQVFHI
       .. .. : :  :.. ..     : : .::.    .: :. ::::::::: :.:..: :: 
CCDS56 EKSAQEKILYSDKEMTT-----PAKQIKKLLLQDKEICILCQKTVYPMECLVADKQNFHK
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pF1KB4 SCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWASKNENE
       ::::: .::.:::::.::::::.:::::::.:::::::::::::::. ::: :  ::...
CCDS56 SCFRCHHCNSKLSLGNYASLHGQIYCKPHFKQLFKSKGNYDEGFGHKQHKDRWNCKNQSR
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pF1KB4 EIL----ERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKE-DKPAETKK
        .     :.: .  :  :.   :: ..            ..:  :  :...  : .:  :
CCDS56 SVDFIPNEEPNMCKNIAENTLVPGDRNE----------HLDAGNSEGQRNDLRKLGERGK
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pF1KB4 LRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPE-DEISKPEVPEDVDLDLKKLRRSSSLKE
       :.. :::  :. ..   .:: .::::::::::   . .::   .  :.  .  .... ..
CCDS56 LKVIWPPSKEIPKKTLPFEEELKMSKPKWPPEMTTLLSPEFKSESLLEDVRTPENKGQRQ
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pF1KB4 RSRPFTVAASFQSTSVKSPKTVSPPIRKGWSMSEQSEESVGGRVAERKQVENAKASKKNG
          :: .   .::: :                  :.:. .:  . : :. :. :  ::.:
CCDS56 DHFPF-LQPYLQSTHVC-----------------QKEDVIG--IKEMKMPEGRKDEKKEG
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pF1KB4 NVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQEPKSLN
          . . :.. :..:  : ....     .:.:.. ..:........              
CCDS56 ---RKNVQDRPSEAEDTKSNRKSAMDLNDNNNVIVQSAEKEKNEKTNQTNGAEVLQVTNT
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pF1KB4 WSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE       
                                                                   
CCDS56 DDEMMPENHKENLNKNNNNNYVAVSYLNNCRQKTSILEFLDLLPLSSEANDTANEYEIEK
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>>CCDS56145.1 XIRP2 gene_id:129446|Hs108|chr2             (716 aa)
 initn: 714 init1: 487 opt: 728  Z-score: 536.2  bits: 109.9 E(32554): 1.5e-23
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pF1KB4 ASGKIEKYNVPLNRLKMMFEKGEPTQTKILRAQSRSASG--RKISENSYSLDDLEIGPGQ
                                     : :.  . :  :..: : .  ...   :: 
CCDS56                             MARYQAAVSRGDCRSFSANMMEESEMCAVPGG
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pF1KB4 LSS--STFDSEKNESRRNLELPRLSETSIKDRMAKYQAAVSKQSSSTNYT-NELKASGGE
       :..  . :..: . :: ..   . .. . ... : ... :. . :: ... :: ..:   
CCDS56 LAKVKKQFEDEITSSRNTFAQYQYQHQNRSEQEAIHSSQVGTSRSSQEMARNEQEGS---
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pF1KB4 IKIHKMEQKENVPPGPEVCITHQEGEKISANENSL-------AVRSTPAEDDSPGDSQ--
        :..:.. .     : :. ..: : .   .:. :        .: .:: ... :  :   
CCDS56 -KVQKIDVH-----GTEM-VSHLEKHTEEVNQASQFHQYVQETVIDTPEDEEIPKVSTKL
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       .: . .. .. : :  :.. ..     : : .::.    .: :. ::::::::: :.:..
CCDS56 LKEQFEKSAQEKILYSDKEMTT-----PAKQIKKLLLQDKEICILCQKTVYPMECLVADK
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pF1KB4 QVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGNYDEGFGHRPHKDLWAS
       : :: ::::: .::.:::::.::::::.:::::::.:::::::::::::::. ::: :  
CCDS56 QNFHKSCFRCHHCNSKLSLGNYASLHGQIYCKPHFKQLFKSKGNYDEGFGHKQHKDRWNC
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pF1KB4 KNENEEIL----ERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAKASSQQEKE-DKP
       ::... .     :.: .  :  :.   :: ..            ..:  :  :...  : 
CCDS56 KNQSRSVDFIPNEEPNMCKNIAENTLVPGDRNE----------HLDAGNSEGQRNDLRKL
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pF1KB4 AETKKLRIAWPPPTELGSSGSALEEGIKMSKPKWPPE-DEISKPEVPEDVDLDLKKLRRS
       .:  ::.. :::  :. ..   .:: .::::::::::   . .::   .  :.  .  ..
CCDS56 GERGKLKVIWPPSKEIPKKTLPFEEELKMSKPKWPPEMTTLLSPEFKSESLLEDVRTPEN
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       .. ..   :: .   .::: :                  :.:. .:  . : :. :. : 
CCDS56 KGQRQDHFPF-LQPYLQSTHVC-----------------QKEDVIG--IKEMKMPEGRKD
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pF1KB4 SKKNGNVGKTTWQNKESKGETGKRSKEGHSLEMENENLVENGADSDEDDNSFLKQQSPQE
        ::.:   . . :.. :..:  : ....     .:.:.. ..:........         
CCDS56 EKKEG---RKNVQDRPSEAEDTKSNRKSAMDLNDNNNVIVQSAEKEKNEKTNQTNGAEVL
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pF1KB4 PKSLNWSSFVDNTFAEEFTTQNQKSQDVELWEGEVVKELSVEEQIKRNRYYDEDEDEE  
                                                                   
CCDS56 QVTNTDDEMMPENHKENLNKNNNNNYVAVSYLNNCRQKTSILEFLDLLPLSSEANDTANE
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>>CCDS11641.1 LIMD2 gene_id:80774|Hs108|chr17             (127 aa)
 initn: 471 init1: 451 opt: 465  Z-score: 357.9  bits: 74.4 E(32554): 1.3e-13
Smith-Waterman score: 465; 58.9% identity (86.9% similar) in 107 aa overlap (363-469:13-118)

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB4 AVRSTPAEDDSPGDSQVKSEVQQPVHPKPLSPDSRASSLSESSPPKAMKKFQAPARETCV
                                     : :..... :  .  :... ..: ..:::.
CCDS11                   MFQAAGAAQATPSHDAKGGGSSTVQRSKSFS-LRAQVKETCA
                                 10        20        30         40 

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pF1KB4 ECQKTVYPMERLLANQQVFHISCFRCSYCNNKLSLGTYASLHGRIYCKPHFNQLFKSKGN
        :::::::::::.:.. .:: ::: :..:..:::::.::.:::..::::::.::::::::
CCDS11 ACQKTVYPMERLVADKLIFHNSCFCCKHCHTKLSLGSYAALHGEFYCKPHFQQLFKSKGN
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pF1KB4 YDEGFGHRPHKDLWASKNENEEILERPAQLANARETPHSPGVEDAPIAKVGVLAASMEAK
       ::::::.. ::.::: :                                           
CCDS11 YDEGFGRKQHKELWAHKEVDPGTKTA                                  
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760 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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