Result of FASTA (omim) for pF1KB5207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5207, 529 aa
  1>>>pF1KB5207 529 - 529 aa - 529 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0397+/-0.000398; mu= 15.0855+/- 0.025
 mean_var=75.7814+/-14.525, 0's: 0 Z-trim(112.2): 14  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.147331
 statistics sampled from 20974 (20987) to 20974 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.246), width:  16
 Scan time:  9.000

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001677 (OMIM: 102910) ATP synthase subunit beta ( 529) 3376 727.3 2.8e-209
NP_001244264 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 503)  377 89.8 2.1e-17
NP_001001935 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 503)  377 89.8 2.1e-17
NP_004037 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthas ( 553)  377 89.8 2.3e-17
NP_001001937 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 553)  377 89.8 2.3e-17
XP_016881278 (OMIM: 164360,615228,616045) PREDICTE ( 586)  377 89.8 2.4e-17
NP_001684 (OMIM: 124480,606939,616455) V-type prot ( 511)  368 87.9 7.9e-17
NP_001683 (OMIM: 192132,267300) V-type proton ATPa ( 513)  361 86.4 2.2e-16
XP_011531209 (OMIM: 192132,267300) PREDICTED: V-ty ( 553)  357 85.6 4.3e-16
NP_001681 (OMIM: 607027) V-type proton ATPase cata ( 617)  337 81.3   9e-15
NP_001244263 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synt ( 531)  280 69.2 3.5e-11


>>NP_001677 (OMIM: 102910) ATP synthase subunit beta, mi  (529 aa)
 initn: 3376 init1: 3376 opt: 3376  Z-score: 3878.2  bits: 727.3 E(85289): 2.8e-209
Smith-Waterman score: 3376; 100.0% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAAT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 GRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 EILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 REGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 VLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 ARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHMGK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520         
pF1KB5 LVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS
              490       500       510       520         

>>NP_001244264 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase  (503 aa)
 initn: 277 init1: 214 opt: 377  Z-score: 433.5  bits: 89.8 E(85289): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 394; 25.1% identity (56.3% similar) in 435 aa overlap (115-526:70-485)

           90       100       110       120        130       140   
pF1KB5 ALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGR
                                     :.. :.. :. :  .:: . .::: : :::
NP_001 VQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGR
      40        50        60        70        80        90         

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB5 IMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIG
       .....:. :: .::: .:    .  .:: ..     .: . ::::.:: :.: ..: .  
NP_001 VVDALGNAIDGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQREL
     100       110       120       130       140       150         

           210       220              230       240       250      
pF1KB5 LFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVI
       ..:   .::: . .. : :  . . :       : .....:..     .: ... ..   
NP_001 IIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA---
     160       170       180       190       200       210         

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB5 NLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGS
          :: . . .: .  ..    .  .  .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :  
NP_001 ---DAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYR
           220       230       240       250        260       270  

        320       330       340       350           360       370  
pF1KB5 EVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAP
       ..: :: : :.  .:   .    . . :: .  .     ::.:.. .: . : :..   :
NP_001 QMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIP
            280       290       300       310       320       330  

            380       390       400       410       420        430 
pF1KB5 ATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDY
       .....  :.   :   .   :: ::..   :.::.   . . .. .  . :..:. : .:
NP_001 TNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQY
            340       350       360         370       380       390

             440       450       460               470       480   
pF1KB5 KSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVP
       . .   .: .: : :.   .  .::. .. ..:.:    :.    ::: ...:  : :  
NP_001 REVA-AFAQFGSD-LDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDK
               400        410       420       430       440        

            490       500       510       520                      
pF1KB5 LKET-IKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS            
       :. . :  :.. .    .:.  :   ..: :     .:: :..:.               
NP_001 LEPSKITKFENAF---LSHVVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAG
      450       460          470            480       490       500

NP_001 FEA
          

>>NP_001001935 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase  (503 aa)
 initn: 277 init1: 214 opt: 377  Z-score: 433.5  bits: 89.8 E(85289): 2.1e-17
Smith-Waterman score: 394; 25.1% identity (56.3% similar) in 435 aa overlap (115-526:70-485)

           90       100       110       120        130       140   
pF1KB5 ALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGR
                                     :.. :.. :. :  .:: . .::: : :::
NP_001 VQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGR
      40        50        60        70        80        90         

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB5 IMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIG
       .....:. :: .::: .:    .  .:: ..     .: . ::::.:: :.: ..: .  
NP_001 VVDALGNAIDGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQREL
     100       110       120       130       140       150         

           210       220              230       240       250      
pF1KB5 LFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVI
       ..:   .::: . .. : :  . . :       : .....:..     .: ... ..   
NP_001 IIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA---
     160       170       180       190       200       210         

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB5 NLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGS
          :: . . .: .  ..    .  .  .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :  
NP_001 ---DAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYR
           220       230       240       250        260       270  

        320       330       340       350           360       370  
pF1KB5 EVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAP
       ..: :: : :.  .:   .    . . :: .  .     ::.:.. .: . : :..   :
NP_001 QMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIP
            280       290       300       310       320       330  

            380       390       400       410       420        430 
pF1KB5 ATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDY
       .....  :.   :   .   :: ::..   :.::.   . . .. .  . :..:. : .:
NP_001 TNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQY
            340       350       360         370       380       390

             440       450       460               470       480   
pF1KB5 KSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVP
       . .   .: .: : :.   .  .::. .. ..:.:    :.    ::: ...:  : :  
NP_001 REVA-AFAQFGSD-LDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDK
               400        410       420       430       440        

            490       500       510       520                      
pF1KB5 LKET-IKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS            
       :. . :  :.. .    .:.  :   ..: :     .:: :..:.               
NP_001 LEPSKITKFENAF---LSHVVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAG
      450       460          470            480       490       500

NP_001 FEA
          

>>NP_004037 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase su  (553 aa)
 initn: 277 init1: 214 opt: 377  Z-score: 432.9  bits: 89.8 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 397; 24.1% identity (55.2% similar) in 560 aa overlap (7-526:5-535)

               10        20        30         40        50         
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
             ::::: . .  ::         : :. : :  ..   .:.. :...   :.:.:
NP_004   MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
                 10                 20        30        40         

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pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
           .    ..:: ..:...:         :.  . .  .::..:    .  .  .. .:
NP_004 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
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pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
         ..: .... :.. :.. :. :  .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .: 
NP_004 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
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pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
          .  .:: ..     .: . ::::.:: :.: ..: .  ..:   .::: . .. : :
NP_004 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
      170       180       190       200       210       220        

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pF1KB5 VAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEP
         . . :       : .....:..     .: ... ..      :: . . .: .  .. 
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pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
          .  .  .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :  ..: :: : :.  .:   .
NP_004 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
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pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
           . . :: .  .     ::.:.. .: . : :..   :.....  :.   :   .  
NP_004 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
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pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
        :: ::..   :.::.   . . .. .  . :..:. : .:. .   .: .: : :.   
NP_004 KGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVA-AFAQFGSD-LDAAT
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pF1KB5 KLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVPLKET-IKGFQQILAGEYDH
       .  .::. .. ..:.:    :.    ::: ...:  : :  :. . :  :.. .    .:
NP_004 QQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAF---LSH
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pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS               
       .  :   ..: :     .:: :..:.                  
NP_004 VVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
          520            530       540       550   

>>NP_001001937 (OMIM: 164360,615228,616045) ATP synthase  (553 aa)
 initn: 277 init1: 214 opt: 377  Z-score: 432.9  bits: 89.8 E(85289): 2.3e-17
Smith-Waterman score: 397; 24.1% identity (55.2% similar) in 560 aa overlap (7-526:5-535)

               10        20        30         40        50         
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
             ::::: . .  ::         : :. : :  ..   .:.. :...   :.:.:
NP_001   MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
                 10                 20        30        40         

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pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
           .    ..:: ..:...:         :.  . .  .::..:    .  .  .. .:
NP_001 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
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pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
         ..: .... :.. :.. :. :  .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .: 
NP_001 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
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pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
          .  .:: ..     .: . ::::.:: :.: ..: .  ..:   .::: . .. : :
NP_001 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
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pF1KB5 VAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEP
         . . :       : .....:..     .: ... ..      :: . . .: .  .. 
NP_001 QKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA------DAMKYTIVVSATASDA
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pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
          .  .  .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :  ..: :: : :.  .:   .
NP_001 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
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pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
           . . :: .  .     ::.:.. .: . : :..   :.....  :.   :   .  
NP_001 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
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pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
        :: ::..   :.::.   . . .. .  . :..:. : .:. .   .: .: : :.   
NP_001 KGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVA-AFAQFGSD-LDAAT
             410         420       430       440        450        

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pF1KB5 KLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVPLKET-IKGFQQILAGEYDH
       .  .::. .. ..:.:    :.    ::: ...:  : :  :. . :  :.. .    .:
NP_001 QQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAF---LSH
       460       470       480       490       500       510       

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pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKAD-KLAEEHSS               
       .  :   ..: :     .:: :..:.                  
NP_001 VVSQHQALLGTI-----RADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
          520            530       540       550   

>>XP_016881278 (OMIM: 164360,615228,616045) PREDICTED: A  (586 aa)
 initn: 277 init1: 214 opt: 377  Z-score: 432.5  bits: 89.8 E(85289): 2.4e-17
Smith-Waterman score: 396; 24.0% identity (55.1% similar) in 546 aa overlap (7-513:5-526)

               10        20        30         40        50         
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAA-PTAVHPVRDYAAQTSPSPKAGAA
             ::::: . .  ::         : :. : :  ..   .:.. :...   :.:.:
XP_016   MLSVRVAAAVVRALPRR---------AGLVSRNALGSSFIAARNFHASNTHLQKTGTA
                 10                 20        30        40         

      60           70                 80        90           100   
pF1KB5 TGRIVA---VIGAVVDVQFDE---------GLPPILNALEVQGRE----TRLVLEVAQHL
           .    ..:: ..:...:         :.  . .  .::..:    .  .  .. .:
XP_016 EMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNL
      50        60        70        80        90       100         

           110       120        130       140       150       160  
pF1KB5 GESTVRTIAMDGTEGLVR-GQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQ
         ..: .... :.. :.. :. :  .:: . .::: : :::.....:. :: .::: .: 
XP_016 EPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKT
     110        120       130       140       150       160        

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB5 FAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN
          .  .:: ..     .: . ::::.:: :.: ..: .  ..:   .::: . .. : :
XP_016 RRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIIN
      170       180       190       200       210       220        

                   230       240       250       260       270     
pF1KB5 VAKAHGG-------YSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEP
         . . :       : .....:..     .: ... ..      :: . . .: .  .. 
XP_016 QKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDA------DAMKYTIVVSATASDA
      230       240       250       260             270       280  

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pF1KB5 PGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTL
          .  .  .: ...:::::. :. .:.. :.. . . :  ..: :: : :.  .:   .
XP_016 APLQYLAPYSGCSMGEYFRDN-GKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDV
            290       300        310       320       330       340 

         340       350           360       370       380       390 
pF1KB5 ATDMGTMQERITTTKK----GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAE
           . . :: .  .     ::.:.. .: . : :..   :.....  :.   :   .  
XP_016 FYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFY
             350       360       370       380       390       400 

             400       410       420        430       440       450
pF1KB5 LGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKI-LQDYKSLQDIIAILGMDELSEED
        :: ::..   :.::.   . . .. .  . :..:. : .:. .   .: .: : :.   
XP_016 KGIRPAINVGLSVSRV--GSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVA-AFAQFGSD-LDAAT
             410         420       430       440        450        

              460               470       480        490       500 
pF1KB5 KLTVSRARKIQRFLSQ----PF----QVAEVFTGHMGKLVPLKET-IKGFQQILAGEYDH
       .  .::. .. ..:.:    :.    ::: ...:  : :  :. . :  :.. .    .:
XP_016 QQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAF---LSH
       460       470       480       490       500       510       

             510       520                                         
pF1KB5 LPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHSS                                
       .  :   ..: :                                                
XP_016 VVSQHQALLGTIRYECNCWHLFLKLCLRYEVKIIFKSVVRLVIKTFSRSELTTCFYFQIG
          520       530       540       550       560       570    

>>NP_001684 (OMIM: 124480,606939,616455) V-type proton A  (511 aa)
 initn: 384 init1: 140 opt: 368  Z-score: 423.1  bits: 87.9 E(85289): 7.9e-17
Smith-Waterman score: 445; 25.7% identity (54.8% similar) in 513 aa overlap (15-499:8-503)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPVRDYAAQTSPSPKA-GAA
                     : .   .:   .: .   . :   :.   :.: .:   . :. ...
NP_001        MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPAVGAREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGV
                      10        20        30        40        50   

      60        70         80        90       100       110        
pF1KB5 TGRIVAVIGAVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEG
       .: .:     ..: :.: .    .  .:    ...  ::::.   : ..:  . ..:: :
NP_001 NGPLV-----ILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVS---GSKAVVQV-FEGTSG
                 60        70        80        90           100    

      120        130       140       150        160       170      
pF1KB5 LVRGQKVLD-SGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIK-TKQFAPIHAEAPEFMEM
       .   .   . .:  .. ::. . :::..:  :.::: :::.  ...:  : ..  . .  
NP_001 IDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-RGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCR
          110       120       130       140        150       160   

        180       190       200       210       220            230 
pF1KB5 SVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN---VAKAHG--GYS
          .:.. :::...: .   :.: :: .:..::. .. .  ..  .   : :..    ::
NP_001 IYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYS
           170       180       190       200       210       220   

                   240       250       260       270       280     
pF1KB5 ------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALT
             :::..:   . .  .  .. :.: ..      .: :  .  :.:   :  .   
NP_001 EENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMD------NVCLFLNLANDPTIERIITPRL
           230       240       250             260       270       

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB5 GLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQER
       .::.::..  :  . ::... ..  ...:  ::::   ..:.  :.   . ::..:. ::
NP_001 ALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYER
       280       290       300       310       320       330       

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB5 ITTT--KKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDS
          .  ..::::..  . .: ::.: : :  :    ..   ..: . .  ::: .. : :
NP_001 AGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPS
       340       350       360       370       380       390       

           410           420       430       440       450         
pF1KB5 TSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARK
        ::.:   :    . ..: ::.  .       :..: . :..: . :. .: : .   .:
NP_001 LSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQK
       400       410       420       430       440       450       

     460         470            480       490       500       510  
pF1KB5 IQR-FLSQ-PFQVAEVF-TGHMG----KLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGP
       ..: :..: :..   :: :  .:    .. : :: .: . :   .:.             
NP_001 FERNFIAQGPYENRTVFETLDIGWQLLRIFP-KEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH     
       460       470       480        490       500       510      

            520         
pF1KB5 IEEAVAKADKLAEEHSS

>>NP_001683 (OMIM: 192132,267300) V-type proton ATPase s  (513 aa)
 initn: 373 init1: 147 opt: 361  Z-score: 415.0  bits: 86.4 E(85289): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 442; 26.2% identity (55.5% similar) in 503 aa overlap (26-499:12-497)

               10        20        30        40         50         
pF1KB5 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPV-RDYAAQTSPSPKAGAA
                                :: ..  : ::   .. : :.: ..    :..   
NP_001               MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITH----PRVTYR
                             10        20        30            40  

      60          70         80        90       100       110      
pF1KB5 TGRIVAVIG--AVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGT
       :  . .: :  .:.: :.: .    .  .:    ...  :::::   : ...  . ..::
NP_001 T--VCSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVA---GTKAIVQV-FEGT
               50        60        70        80           90       

         120       130       140       150        160       170    
pF1KB5 EGL-VRGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPI-KTKQFAPIHAEAPEFM
        :. .:      .:  .. ::. . :::..:  :.::: .::.  ...:  :...  .  
NP_001 SGIDARKTTCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-KGPVVMAEDFLDINGQPINPH
        100       110       120       130        140       150     

          180       190       200       210       220              
pF1KB5 EMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNV-----AKAHGG
            .:.. :::. .:..   :.: :: .:..::. .. .  ..  ..     .::   
NP_001 SRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLD
         160       170       180       190       200       210     

     230             240       250       260       270       280   
pF1KB5 YS------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVA
       :       :::..:   . .  .  .. ..:..      ..: :  .  :.:   :  . 
NP_001 YHDDNFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTM------GNVCLFLNLANDPTIERIITP
         220       230       240             250       260         

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB5 LTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQ
         .::.::..  :  . ::... ..  ...:  ::::   ..:.  :.   . ::..:. 
NP_001 RLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIY
     270       280       290       300       310       320         

             350       360       370       380       390       400 
pF1KB5 ERITTT--KKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPL
       ::   .  . ::::..  . .: ::.: : :  :    ..   ..: . .  ::: .. :
NP_001 ERAGRVEGRGGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVL
     330       340       350       360       370       380         

             410           420       430       440       450       
pF1KB5 DSTSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRA
        : ::.:   :    . ..: ::.  .       :..: . :..: . :. :: : .   
NP_001 PSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFL
     390       400       410       420       430       440         

       460         470         480         490       500       510 
pF1KB5 RKIQR-FLSQ-PFQVAEVFTG-HMG-KLVPL--KETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVG
       .:... :..: :..   :: .  .: ::. .  :: .: . : .  :.            
NP_001 QKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAP
     450       460       470       480       490       500         

             520         
pF1KB5 PIEEAVAKADKLAEEHSS
                         
NP_001 DTAL              
     510                 

>>XP_011531209 (OMIM: 192132,267300) PREDICTED: V-type p  (553 aa)
 initn: 373 init1: 147 opt: 357  Z-score: 409.9  bits: 85.6 E(85289): 4.3e-16
Smith-Waterman score: 438; 26.8% identity (56.4% similar) in 429 aa overlap (96-499:120-537)

          70        80        90       100       110        120    
pF1KB5 VIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGL-VRGQK
                                     :::::   : ...  . ..:: :. .:   
XP_011 NISVSATWVFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVA---GTKAIVQV-FEGTSGIDARKTT
      90       100       110       120          130        140     

          130       140       150        160       170       180   
pF1KB5 VLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPI-KTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQEIL
          .:  .. ::. . :::..:  :.::: .::.  ...:  :...  .       .:..
XP_011 CEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-KGPVVMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMI
         150       160       170        180       190       200    

           190       200       210       220            230        
pF1KB5 VTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNV-----AKAHGGYS------V
        :::. .:..   :.: :: .:..::. .. .  ..  ..     .::   :       :
XP_011 QTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAIV
          210       220       230       240       250       260    

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB5 FAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEY
       ::..:   . .  .  .. ..:...      .: :  .  :.:   :  .   .::.::.
XP_011 FAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTMG------NVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEF
          270       280             290       300       310        

            300       310       320       330       340         350
pF1KB5 FRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTT--K
       .  :  . ::... ..  ...:  ::::   ..:.  :.   . ::..:. ::   .  .
XP_011 LAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGR
      320       330       340       350       360       370        

              360       370       380       390       400       410
pF1KB5 KGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDP
        ::::..  . .: ::.: : :  :    ..   ..: . .  ::: .. : : ::.:  
XP_011 GGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKS
      380       390       400       410       420       430        

                  420       430       440       450       460      
pF1KB5 NI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQR-FLS
        :    . ..: ::.  .       :..: . :..: . :. :: : .   .:... :..
XP_011 AIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFIN
      440       450       460       470       480       490        

          470         480         490       500       510       520
pF1KB5 Q-PFQVAEVFTG-HMG-KLVPL--KETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKA
       : :..   :: .  .: ::. .  :: .: . : .  :.                     
XP_011 QGPYENRSVFESLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL     
      500       510       520       530       540       550        

                
pF1KB5 DKLAEEHSS

>>NP_001681 (OMIM: 607027) V-type proton ATPase catalyti  (617 aa)
 initn: 147 init1: 147 opt: 337  Z-score: 386.1  bits: 81.3 E(85289): 9e-15
Smith-Waterman score: 395; 26.6% identity (59.4% similar) in 394 aa overlap (97-466:141-522)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB5 IGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVL
                                     :.:..:.  . .  :. ...  :.. . .:
NP_001 SQTQSIYIPRGVNVSALSRDIKWDFTPCKNLRVGSHITGGDIYGIVSENS--LIKHKIML
              120       130       140       150       160          

           130         140       150       160       170       180 
pF1KB5 ---DSGAPIKI-PVGP-ETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAPIHAEAPEFMEMSVEQE
          . :.   : : :  .:   ....  : . :.  .   :  :..   :   .. ... 
NP_001 PPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGVKEK--FTMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHP
      170       180       190       200         210       220      

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB5 ILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTR
       .: :: .:.: : : ..::  .. :. : ::::. . : .    ...   ...: :::  
NP_001 LL-TGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKY---SNSDVIIYVGCGERGN
         230       240       250       260          270       280  

             250          260       270       280       290        
pF1KB5 EGNDLYHEMIESGV-INLK--DATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEG
       : ... ... :  . .. :  .  ...::: .  : : .::     ::.:..:::::. :
NP_001 EMSEVLRDFPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDM-G
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