Result of FASTA (ccds) for pF1KB3240
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3240, 873 aa
  1>>>pF1KB3240 873 - 873 aa - 873 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2681+/-0.0011; mu= 15.3075+/- 0.067
 mean_var=191.3232+/-40.033, 0's: 0 Z-trim(109.5): 14  B-trim: 475 in 1/51
 Lambda= 0.092724
 statistics sampled from 10902 (10907) to 10902 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.335), width:  16
 Scan time:  3.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8           ( 873) 5719 778.4       0
CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8           ( 837)  600 93.6 1.6e-18
CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20         ( 956)  511 81.7 6.8e-15


>>CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8                (873 aa)
 initn: 5719 init1: 5719 opt: 5719  Z-score: 4146.5  bits: 778.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5719; 100.0% identity (100.0% similar) in 873 aa overlap (1-873:1-873)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MASRRKSTTPCMVLASEQDPDLELISDLDEGPPVLTPVENTRAESISSDEEVHESVDSDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MASRRKSTTPCMVLASEQDPDLELISDLDEGPPVLTPVENTRAESISSDEEVHESVDSDN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 QQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTKRYDALSEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTKRYDALSEH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVSSSGISISK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVSSSGISISK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 TPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASESNTSTSIVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASESNTSTSIVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 RIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 RIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 NTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 HTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQTCQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPVTAPIALTVAGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQTCQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPVTAPIALTVAGV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 PSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 VSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYNQRNSKSNQCLHLNNDSSTTIII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYNQRNSKSNQCLHLNNDSSTTIII
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 DSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFLNSSVLTDEELNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFLNSSVLTDEELNR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETSPADESGAPKSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETSPADESGAPKSGS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 TGKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TGKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 KWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGSKRINNWDRGPSLIKFKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGSKRINNWDRGPSLIKFKT
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 GTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVREWFAERQRRSELGIELFEENEEEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVREWFAERQRRSELGIELFEENEEEDE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870   
pF1KB3 VIDDQEEDEEETDDSDTWEPPRHVKRKLSKSDD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VIDDQEEDEEETDDSDTWEPPRHVKRKLSKSDD
              850       860       870   

>>CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8                (837 aa)
 initn: 1730 init1: 464 opt: 600  Z-score: 445.9  bits: 93.6 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 1887; 39.9% identity (66.4% similar) in 890 aa overlap (1-858:1-811)

               10           20        30             40        50  
pF1KB3 MASRRKSTTPCMVLAS---EQDPDLELISDLDEG-----PPVLTPVENTRAESISSDEEV
       :::.::::::::: .:   :::   :.    ..:     : :      .. :. :...::
CCDS63 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB3 HESVDSDNQQNKKVEGGYECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLTK
        :  .  ..:.::..:::::::: ..: .:: :: ::: .::::.::  :::.:::: ::
CCDS63 IEVKSMGESQSKKLQGGYECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTTK
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB3 RYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEVS
       .::.::.:: :.:::: :::: ..::::::..::.:.  .   :..      .. .:  :
CCDS63 KYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITT-----SGPGTGDS
              130       140       150       160            170     

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB3 SSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPDREEIVENPSSSASES
       .::::.:::::::  : :.. :.          ::.. : :: :  :. ::.   .:   
CCDS63 DSGISVSKTPIMKPGKPKADAKK----------VPKKPE-EITP--ENHVEG---TARLV
         180       190                 200          210            

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB3 NTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLPGLAQVITAVSAQQNSNLIPKVLIPVNSIPTYNAA
       . .. :..:.             .   :..:. .:.   : ::.::: .:.:.   ::.:
CCDS63 TDTAEILSRLGGV--------ELLQDTLGHVMPSVQLPPNINLVPKVPVPLNTTK-YNSA
     220       230               240       250       260        270

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB3 LDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKIWFSAQRLKHGVSWTPEEVEEAR
       ::.:  ..:..:::::::..:.. :.: .:. ::.:.:::..::::::.::.::::::::
CCDS63 LDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLKHGISWSPEEVEEAR
              280       290       300       310       320       330

            360       370       380          390       400         
pF1KB3 RKQFNGTVHTVPQTITVIPTHISTGSNGLPSILQT---CQIVGQPGLVLTQVAGTNTLPV
       .:.::::...:: ::::.:....  .   : ::::   :::.:: .::::::.. .:   
CCDS63 KKMFNGTIQSVPPTITVLPAQLAPTKVTQP-ILQTALPCQILGQTSLVLTQVTSGSTTVS
              340       350       360        370       380         

     410       420       430       440       450       460         
pF1KB3 TAPIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAETKPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRA
        .::.:.:::: .... .   .: : :  . .:  : ::     :  .  ..: :     
CCDS63 CSPITLAVAGVTNHGQKRPLVTPQAAPEPK-RPHIAQVPEPPP-KVANPPLTPAS---DR
     390       400       410        420       430        440       

     470       480       490       500       510        520        
pF1KB3 KKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKITGLTKGEIKKWFSDTRYN-QRNSKSNQCL
       ::::::.:.::.:.:..::: :.:. ::...:::...:::::::: ::  ::.      .
CCDS63 KKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEIKKWFSDHRYRCQRG-----IV
          450       460       470       480       490              

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB3 HLNNDSSTTIIIDSSDETTESPTVGTAQPKQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFL
       :....:       ..:.     ......  .... .:::.::::::::  :...:. :::
CCDS63 HITSESL------AKDQL----AIAASRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFL
     500             510           520       530       540         

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB3 NSSVLTDEELNRLRAQTKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGETS
       .::  :. ::.:::..:::.:::::.::.:..: .   :. . .:  ..:.. ...:  .
CCDS63 KSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDSWFSERRKLRDSMEQAV-LDSMGSGKKGQDVGAPN
     550       560       570       580       590        600        

      650            660          670       680       690       700
pF1KB3 PA----DE-SGAPKSGST---GKICKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLA
        :    :. :::  ..:    .    :. ::.:.:.:.:.:::::.:.:::.:: ..::.
CCDS63 GALSRLDQLSGAQLTSSLPSPSPAIAKSQEQVHLLRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLV
      610       620       630       640       650       660        

              710       720       730       740       750       760
pF1KB3 RTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKWYYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRP
       ::.:: :: ..:   :.:..::.  ::    .. .: ... ...  .: ...   :    
CCDS63 RTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADDHGYDAVARKAT-KPMAES---P----
      670       680       690       700       710           720    

              770       780       790       800       810          
pF1KB3 RGSKRINNWDRGPSLIKFKTGTAILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVR-----
                         :.:  .. .::   : : :.::..::.. ..: : ..     
CCDS63 ------------------KNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
                                730       740       750       760  

            820       830       840           850       860        
pF1KB3 ---EWFAERQRRSELGIELFEENEEEDEVIDDQE----EDEEETDDSDTWEPPRHVKRKL
          :  ..:.. :    .  .:::: . :.:  :    :..  .: ::.:          
CCDS63 KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEE-SSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSE
            770       780        790       800       810       820 

      870              
pF1KB3 SKSDD           
                       
CCDS63 LAESDSDCVPAEAGQA
             830       

>>CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20              (956 aa)
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CCDS13 PGHVVGQPEGTGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAV
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CCDS13 KVVNAAQSLLTACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKV
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