Result of FASTA (omim) for pF1KB6016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6016, 941 aa
  1>>>pF1KB6016 941 - 941 aa - 941 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4894+/-0.00035; mu= 11.9983+/- 0.022
 mean_var=149.8984+/-30.790, 0's: 0 Z-trim(119.3): 83  B-trim: 251 in 1/55
 Lambda= 0.104755
 statistics sampled from 32987 (33081) to 32987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.388), width:  16
 Scan time: 11.820

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001171827 (OMIM: 300263,300560) histone lysine  ( 878) 2065 324.5 1.5e-87
NP_001171826 (OMIM: 300263,300560) histone lysine  ( 948) 2051 322.4 6.9e-87
XP_005262057 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist ( 984) 2051 322.4 7.1e-87
XP_016884851 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1024) 2044 321.3 1.5e-86
NP_055922 (OMIM: 300263,300560) histone lysine dem (1024) 2044 321.3 1.5e-86
XP_005262054 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 2044 321.3 1.6e-86
XP_005262056 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 2044 321.3 1.6e-86
XP_016884850 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 2044 321.3 1.6e-86
NP_001171825 (OMIM: 300263,300560) histone lysine  (1060) 2044 321.3 1.6e-86
XP_011529080 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1085) 2044 321.3 1.6e-86
XP_005262053 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1085) 2044 321.3 1.6e-86
NP_005383 (OMIM: 604351) lysine-specific demethyla (1096) 1934 304.7 1.6e-81
XP_005252108 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-spec (1097) 1934 304.7 1.6e-81
XP_006717206 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-spec (1062) 1238 199.5 7.4e-50
NP_001005366 (OMIM: 609078) lysine-specific demeth (1265)  620 106.2 1.1e-21
XP_005254013 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1299)  620 106.2 1.1e-21
XP_005254012 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1305)  620 106.2 1.1e-21
NP_115979 (OMIM: 609078) lysine-specific demethyla (1336)  620 106.2 1.1e-21
XP_011537171 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1337)  620 106.2 1.2e-21
XP_011537170 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1339)  620 106.2 1.2e-21
XP_011537169 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1353)  620 106.2 1.2e-21
XP_006718543 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1067)  615 105.4 1.6e-21
XP_011543162 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1134)  615 105.4 1.7e-21
XP_016872880 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145)  615 105.4 1.7e-21
XP_016872881 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145)  615 105.4 1.7e-21
NP_036440 (OMIM: 605657) lysine-specific demethyla (1162)  615 105.4 1.7e-21
NP_071388 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator ( 562)  254 50.6 2.6e-05
NP_542986 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator ( 562)  254 50.6 2.6e-05
NP_542987 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator (1189)  254 50.9 4.7e-05
NP_001180299 (OMIM: 604140) death-inducer oblitera (1189)  254 50.9 4.7e-05
XP_011526811 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2240)  254 51.0 7.7e-05
NP_149072 (OMIM: 604140) death-inducer obliterator (2240)  254 51.0 7.7e-05
NP_001180298 (OMIM: 604140) death-inducer oblitera (2240)  254 51.0 7.7e-05
XP_011526809 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276)  254 51.1 7.8e-05
XP_011526808 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276)  254 51.1 7.8e-05
XP_011526810 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276)  254 51.1 7.8e-05
XP_011526807 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276)  254 51.1 7.8e-05
XP_011526806 (OMIM: 604140) PREDICTED: death-induc (2276)  254 51.1 7.8e-05
XP_016881207 (OMIM: 609150) PREDICTED: CXXC-type z ( 656)  225 46.3 0.00061
NP_055408 (OMIM: 609150) CXXC-type zinc finger pro ( 656)  225 46.3 0.00061
XP_011524242 (OMIM: 609150) PREDICTED: CXXC-type z ( 660)  225 46.3 0.00062
NP_001095124 (OMIM: 609150) CXXC-type zinc finger  ( 660)  225 46.3 0.00062
XP_011522826 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2188)  231 47.6 0.00084
XP_016879843 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2327)  231 47.6 0.00088
XP_005257217 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2961)  231 47.7  0.0011
XP_011522825 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (2977)  231 47.7  0.0011
XP_005257216 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3015)  231 47.7  0.0011
XP_011522824 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3031)  231 47.7  0.0011
XP_005257215 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3032)  231 47.7  0.0011
XP_005257214 (OMIM: 601819) PREDICTED: nucleosome- (3094)  231 47.7  0.0011


>>NP_001171827 (OMIM: 300263,300560) histone lysine deme  (878 aa)
 initn: 2089 init1: 1635 opt: 2065  Z-score: 1692.8  bits: 324.5 E(85289): 1.5e-87
Smith-Waterman score: 2080; 44.2% identity (69.3% similar) in 796 aa overlap (37-813:5-787)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
                                     ::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
NP_001                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
                                         10        20        30    

         70        80        90       100        110       120     
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
NP_001 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
           40        50        60        70            80        90

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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
NP_001 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
NP_001 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
NP_001 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
              220       230       240       250       260       270

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
NP_001 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
NP_001 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
              340       350       360       370       380       390

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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .:.   .: ::
NP_001 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
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pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
         .  :.  . :.  .:   : : ::   .: .:   .. . ..     :. .:..:. :
NP_001 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRL---SLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAE
              460         470       480          490       500     

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pF1KB6 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
           : . :.    :... .:. . .    .. . .   .  .:  ..:  .   : .: 
NP_001 RKGKESSALGPA--GQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLD
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pF1KB6 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDIS
         .:         .  ..:   .:    . .. ..  : .    ...:.   :.   .:.
NP_001 GNESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAE-QVMEDEFDLDSDDELQID
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pF1KB6 ESEDSGPECTALKSIFTTE--ESESSGDEKK----QEITSNFKEESNVMRNFLQKSQK-P
       :   .      ..  :  .  ...  .: ..     :.  ...:. .. .....  .   
NP_001 ERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGYQ
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pF1KB6 SRSEIPIK--RECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDP
       . .  : .   : :.: ::.: :::::: ::.:. :.      ..:.   .:.  :  . 
NP_001 TATPAPAQGASEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS
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pF1KB6 SSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKC
       ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . . .. . . :.              
NP_001 SSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPS
             750       760       770       780       790       800 

       830       840       850       860       870       880       
pF1KB6 IRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSF
                                                                   
NP_001 LESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAA
             810       820       830       840       850       860 

>>NP_001171826 (OMIM: 300263,300560) histone lysine deme  (948 aa)
 initn: 2243 init1: 1633 opt: 2051  Z-score: 1680.9  bits: 322.4 E(85289): 6.9e-87
Smith-Waterman score: 2165; 42.0% identity (67.4% similar) in 955 aa overlap (37-935:5-919)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
                                     ::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
NP_001                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
                                         10        20        30    

         70        80        90       100        110       120     
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
NP_001 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
           40        50        60        70            80        90

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
NP_001 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
NP_001 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
NP_001 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
NP_001 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
NP_001 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKS
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .: .      .
NP_001 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGACLN
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pF1KB6 QGIPIVCPVSRSSNEATSPYH------SRRKMRKL-RDHNVRTPSNLDILELHTREVLK-
       ..      .. ..::  ::        : .....: ... ..  ...:  .: ...:.. 
NP_001 DSDDDSPDLDLDGNE--SPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMED
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pF1KB6 RLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEW--RAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFA
       ....   .:  .. .: :: .  :      :.   :::  .       .:.    :.:  
NP_001 EFDLDSDDELQIDERL-GKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCS-----DPNRV----REP--
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pF1KB6 DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGV-EHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSS
        .  .  . .   :.  .. .. :. ..::. :. .  .... ..:   .. .:  .  :
NP_001 GEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPS
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pF1KB6 GYSDIS--------ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNF
           :.        .: .:.:  ..:.. .:  ...:::.      .:..   ::     
NP_001 TQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS-----SSGLGTVSNS----
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pF1KB6 LQKSQK-PSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQ---IQSTDCSGE
          ::. :..   ::::     : .:::  .. :.      ..:..       : . . .
NP_001 -PASQRTPGKR--PIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQD-SLGACFKDAEYIYPSLESDDD
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pF1KB6 RNSLQD-PSSCHGSNH-----EVR---QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDT
         .:.. :.. ..:.      ..:    : . :.::. : .: . .  : ...       
NP_001 DPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAA-------
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pF1KB6 SRFHPQDLSRSQKC--IRKEGS-SEISQ-RVQSRNY---VDSSGSSLQNGKYMQNSNLTS
       ...  :.:...::   :.:.   .:. : : :. :    : .   .       ..: :  
NP_001 AKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPP
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pF1KB6 GA--CQISNGSLSPE----RP----VGETSFSV-PLHP-----TKRPASNPPPISNQATK
            .  .:::. .    ::    ..... :. :. :      .::. .    :::: .
NP_001 PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQ--SNQAGQ
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pF1KB6 GKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV                       
       :::::::.::::::::.:::..:::                             
NP_001 GKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
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>>XP_005262057 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone   (984 aa)
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Smith-Waterman score: 2165; 42.0% identity (67.4% similar) in 955 aa overlap (37-935:41-955)

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XP_005 GRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
XP_005 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
XP_005 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
XP_005 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
XP_005 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
XP_005 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
XP_005 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKS
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .: .      .
XP_005 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGACLN
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pF1KB6 QGIPIVCPVSRSSNEATSPYH------SRRKMRKL-RDHNVRTPSNLDILELHTREVLK-
       ..      .. ..::  ::        : .....: ... ..  ...:  .: ...:.. 
XP_005 DSDDDSPDLDLDGNE--SPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMED
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pF1KB6 RLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEW--RAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFA
       ....   .:  .. .: :: .  :      :.   :::  .       .:.    :.:  
XP_005 EFDLDSDDELQIDERL-GKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCS-----DPNRV----REP--
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pF1KB6 DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGV-EHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSS
        .  .  . .   :.  .. .. :. ..::. :. .  .... ..:   .. .:  .  :
XP_005 GEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPS
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pF1KB6 GYSDIS--------ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNF
           :.        .: .:.:  ..:.. .:  ...:::.      .:..   ::     
XP_005 TQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS-----SSGLGTVSNS----
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pF1KB6 LQKSQK-PSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQ---IQSTDCSGE
          ::. :..   ::::     : .:::  .. :.      ..:..       : . . .
XP_005 -PASQRTPGKR--PIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQD-SLGACFKDAEYIYPSLESDDD
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pF1KB6 RNSLQD-PSSCHGSNH-----EVR---QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDT
         .:.. :.. ..:.      ..:    : . :.::. : .: . .  : ...       
XP_005 DPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAA-------
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pF1KB6 SRFHPQDLSRSQKC--IRKEGS-SEISQ-RVQSRNY---VDSSGSSLQNGKYMQNSNLTS
       ...  :.:...::   :.:.   .:. : : :. :    : .   .       ..: :  
XP_005 AKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPP
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pF1KB6 GA--CQISNGSLSPE----RP----VGETSFSV-PLHP-----TKRPASNPPPISNQATK
            .  .:::. .    ::    ..... :. :. :      .::. .    :::: .
XP_005 PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQ--SNQAGQ
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pF1KB6 GKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV                       
       :::::::.::::::::.:::..:::                             
XP_005 GKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
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>>XP_016884851 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone   (1024 aa)
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       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
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       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
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       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
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       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
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        :   . :  .      :  : .   .:.:.:         :. :.   :.     :.  
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       .      ..:.   .:.  :  . ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . .
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        .. . . :.                                                  
XP_016 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
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NP_055                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
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       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
NP_055 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
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NP_055 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
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pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
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NP_055 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
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pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
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NP_055 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
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pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
       : ::..::   :.    :..:  .:   :..   :..  :..    .  ...:.:  :  
NP_055 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
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pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
          .:..   .   :     .:  :..  :: .. .. :     ..  .::.:.   : :
NP_055 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
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pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
        :    .: .  .... ..:. :.. .  .     : :.: ::.: :::::: ::.:. :
NP_055 GK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSS
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       .      ..:.   .:.  :  . ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . .
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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
        .. . . :.                                                  
NP_055 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
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>>XP_005262054 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone   (1049 aa)
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XP_005                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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                                     ::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
XP_016                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
XP_016 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
           40        50        60        70            80        90

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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
XP_016 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
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       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
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       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
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       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .:.   .: ::
XP_016 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
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pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
         .  :.  . :.  .:   : : ::   .: .:   ..:    ..:   ::  .   : 
XP_016 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
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pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
        :   . :  .      :  : .   .:.:.:         :. :.   :.     :.  
XP_016 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
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pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
       : ::..::   :.    :..:  .:   :..   :..  :..    .  ...:.:  :  
XP_016 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
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pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
          .:..   .   :     .:  :..  :: .. .. :     ..  .::.:.   : :
XP_016 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
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pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
        :    .: .  .... ..:. :.. .  .     : :.: ::.: :::::: ::.:. :
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pF1KB6 TC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLR
       .      ..:.   .:.  :  . ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . .
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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
        .. . . :.                                                  
XP_016 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
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pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
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NP_001 GRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
NP_001 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
NP_001 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
NP_001 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
NP_001 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
NP_001 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
NP_001 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .:.   .: ::
NP_001 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
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pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
         .  :.  . :.  .:   : : ::   .: .:   ..:    ..:   ::  .   : 
NP_001 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
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pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
        :   . :  .      :  : .   .:.:.:         :. :.   :.     :.  
NP_001 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
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pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
       : ::..::   :.    :..:  .:   :..   :..  :..    .  ...:.:  :  
NP_001 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
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pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
          .:..   .   :     .:  :..  :: .. .. :     ..  .::.:.   : :
NP_001 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
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pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
        :    .: .  .... ..:. :.. .  .     : :.: ::.: :::::: ::.:. :
NP_001 GK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSS
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pF1KB6 TC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLR
       .      ..:.   .:.  :  . ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . .
NP_001 SSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEE
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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
        .. . . :.                                                  
NP_001 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
              840       850       860       870       880       890

>>XP_011529080 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone   (1085 aa)
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Smith-Waterman score: 2107; 45.6% identity (68.5% similar) in 820 aa overlap (37-813:41-840)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
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XP_011 GRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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