Result of FASTA (ccds) for pF1KB6016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6016, 941 aa
  1>>>pF1KB6016 941 - 941 aa - 941 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1083+/-0.000851; mu= 14.3456+/- 0.052
 mean_var=134.8576+/-27.262, 0's: 0 Z-trim(111.5): 44  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.110443
 statistics sampled from 12399 (12437) to 12399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.382), width:  16
 Scan time:  4.410

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7         ( 941) 6384 1029.1       0
CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX          ( 878) 2065 340.9 6.3e-93
CCDS55418.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX          ( 948) 2051 338.7 3.1e-92
CCDS14355.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX          (1024) 2044 337.6 7.2e-92
CCDS55420.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX          (1060) 2044 337.7 7.4e-92
CCDS35069.1 PHF2 gene_id:5253|Hs108|chr9           (1096) 1934 320.1 1.4e-86
CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12        (1265)  620 110.8 1.7e-23
CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12        (1336)  620 110.8 1.8e-23
CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11        (1162)  615 110.0 2.8e-23


>>CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7              (941 aa)
 initn: 6384 init1: 6384 opt: 6384  Z-score: 5500.6  bits: 1029.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6384; 99.9% identity (99.9% similar) in 941 aa overlap (1-941:1-941)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAGAAAAVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAGAAAAVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 WFHGSCVGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQAGTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WFHGSCVGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQAGTR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TFIKELRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TFIKELRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DVERYVGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVERYVGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VPDIAKKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VPDIAKKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 FYLIKPTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FYLIKPTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 DCMAFGGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELRED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DCMAFGGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELRED
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 GFQPQTYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFQPQTYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 KPVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRRKMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KPVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRRKMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS43 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTRVKSELRSRSSGYSDIS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB6 KRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHGSNHEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHGSNHEVR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB6 QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB6 QSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSFSVPLHPTKRPASN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSFSVPLHPTKRPASN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940 
pF1KB6 PPPISNQATKGKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPPISNQATKGKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
              910       920       930       940 

>>CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX               (878 aa)
 initn: 2089 init1: 1635 opt: 2065  Z-score: 1781.9  bits: 340.9 E(32554): 6.3e-93
Smith-Waterman score: 2080; 44.2% identity (69.3% similar) in 796 aa overlap (37-813:5-787)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
                                     ::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
CCDS55                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
                                         10        20        30    

         70        80        90       100        110       120     
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
CCDS55 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
           40        50        60        70            80        90

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
              100       110       120       130       140       150

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
              160       170       180       190       200       210

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
              220       230       240       250       260       270

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
              280       290       300       310       320       330

         370       380       390       400       410       420     
pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
              340       350       360       370       380       390

         430       440       450       460       470           480 
pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .:.   .: ::
CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
              400       410       420       430       440       450

             490       500        510       520       530       540
pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
         .  :.  . :.  .:   : : ::   .: .:   .. . ..     :. .:..:. :
CCDS55 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRL---SLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAE
              460         470       480          490       500     

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
           : . :.    :... .:. . .    .. . .   .  .:  ..:  .   : .: 
CCDS55 RKGKESSALGPA--GQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLD
         510         520       530       540       550       560   

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDIS
         .:         .  ..:   .:    . .. ..  : .    ...:.   :.   .:.
CCDS55 GNESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAE-QVMEDEFDLDSDDELQID
           570       580       590       600        610       620  

              670         680           690       700       710    
pF1KB6 ESEDSGPECTALKSIFTTE--ESESSGDEKK----QEITSNFKEESNVMRNFLQKSQK-P
       :   .      ..  :  .  ...  .: ..     :.  ...:. .. .....  .   
CCDS55 ERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGYQ
            630       640       650       660       670       680  

           720         730       740         750       760         
pF1KB6 SRSEIPIK--RECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDP
       . .  : .   : :.: ::.: :::::: ::.:. :.      ..:.   .:.  :  . 
CCDS55 TATPAPAQGASEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS
            690       700        710       720       730       740 

     770         780       790       800       810       820       
pF1KB6 SSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKC
       ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . . .. . . :.              
CCDS55 SSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPS
             750       760       770       780       790       800 

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pF1KB6 IRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSF
                                                                   
CCDS55 LESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAA
             810       820       830       840       850       860 

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                                     ::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
CCDS55                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
                                         10        20        30    

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       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
CCDS55 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
           40        50        60        70            80        90

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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
              280       290       300       310       320       330

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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKS
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .: .      .
CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGACLN
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pF1KB6 QGIPIVCPVSRSSNEATSPYH------SRRKMRKL-RDHNVRTPSNLDILELHTREVLK-
       ..      .. ..::  ::        : .....: ... ..  ...:  .: ...:.. 
CCDS55 DSDDDSPDLDLDGNE--SPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMED
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pF1KB6 RLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEW--RAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFA
       ....   .:  .. .: :: .  :      :.   :::  .       .:.    :.:  
CCDS55 EFDLDSDDELQIDERL-GKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCS-----DPNRV----REP--
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pF1KB6 DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGV-EHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSS
        .  .  . .   :.  .. .. :. ..::. :. .  .... ..:   .. .:  .  :
CCDS55 GEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPS
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pF1KB6 GYSDIS--------ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNF
           :.        .: .:.:  ..:.. .:  ...:::.      .:..   ::     
CCDS55 TQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS-----SSGLGTVSNS----
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pF1KB6 LQKSQK-PSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQ---IQSTDCSGE
          ::. :..   ::::     : .:::  .. :.      ..:..       : . . .
CCDS55 -PASQRTPGKR--PIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQD-SLGACFKDAEYIYPSLESDDD
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pF1KB6 RNSLQD-PSSCHGSNH-----EVR---QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDT
         .:.. :.. ..:.      ..:    : . :.::. : .: . .  : ...       
CCDS55 DPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAA-------
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pF1KB6 SRFHPQDLSRSQKC--IRKEGS-SEISQ-RVQSRNY---VDSSGSSLQNGKYMQNSNLTS
       ...  :.:...::   :.:.   .:. : : :. :    : .   .       ..: :  
CCDS55 AKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPP
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pF1KB6 GA--CQISNGSLSPE----RP----VGETSFSV-PLHP-----TKRPASNPPPISNQATK
            .  .:::. .    ::    ..... :. :. :      .::. .    :::: .
CCDS55 PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQ--SNQAGQ
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pF1KB6 GKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV                       
       :::::::.::::::::.:::..:::                             
CCDS55 GKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
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CCDS14                           MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
CCDS14 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
           40        50        60        70            80        90

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pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS14 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
CCDS14 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS14 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
CCDS14 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
CCDS14 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .:.   .: ::
CCDS14 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
              400       410       420       430       440       450

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pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
         .  :.  . :.  .:   : : ::   .: .:   ..:    ..:   ::  .   : 
CCDS14 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
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pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
        :   . :  .      :  : .   .:.:.:         :. :.   :.     :.  
CCDS14 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
      510       520       530       540       550       560        

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pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
       : ::..::   :.    :..:  .:   :..   :..  :..    .  ...:.:  :  
CCDS14 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
      570       580       590       600       610       620        

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pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
          .:..   .   :     .:  :..  :: .. .. :     ..  .::.:.   : :
CCDS14 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
           630          640        650       660       670         

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pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
        :    .: .  .... ..:. :.. .  .     : :.: ::.: :::::: ::.:. :
CCDS14 GK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSS
     680          690        700       710       720        730    

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pF1KB6 TC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLR
       .      ..:.   .:.  :  . ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . .
CCDS14 SSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEE
          740       750       760       770       780       790    

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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
        .. . . :.                                                  
CCDS14 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
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CCDS55 GRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
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       :::::..:.:::::::::: :::: :.:::::.  . ::  .    .:::..:. ::..:
CCDS55 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
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       ::::.: :.::.:.:  :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
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pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
       ::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
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pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
       .::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
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pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
       ::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.::::::::::  ::.::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
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pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
       ::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::.  .: 
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
       .:::.: :::. :.. : .:: . .:  :::..::  .:::.:.. :: .:.   .: ::
CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
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pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLR--DHNVRTPSNLDILELHTREVLKR
         .  :.  . :.  .:   : : ::   .: .:   ..:    ..:   ::  .   : 
CCDS55 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAERKG
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pF1KB6 LE---MCPWEE------DILSSKL--NGKFNKH--------LQPSST-VPEWRAKDND--
        :   . :  .      :  : .   .:.:.:         :. :.   :.     :.  
CCDS55 KESSALGPAGQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLDGNESP
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pF1KB6 LRLLLTNG---RII---KDERQPFA---DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVE
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CCDS55 LALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMEDEFDLDSDDELQIDERLG--
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pF1KB6 GVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDISESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDE
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CCDS55 ---KEKATLIIRPKF---PRKL-PRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVE
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pF1KB6 KKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS
        :    .: .  .... ..:. :.. .  .     : :.: ::.: :::::: ::.:. :
CCDS55 GK---LGNGSGAGGIL-DLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSS
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pF1KB6 TC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLR
       .      ..:.   .:.  :  . ::  :  ::  . :     .:..   . .::. . .
CCDS55 SSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEE
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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
        .. . . :.                                                  
CCDS55 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
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pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
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CCDS35                           MATVPVYCVCRLPYDVTRFMIECDACKDWFHGSC
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pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKEL
       :::::..: :::.::::::   ::.: .::.:.::.:   .  :  :::: :.. :::::
CCDS35 VGVEEEEAPDIDIYHCPNCEKTHGKSTLKKKRTWHKHGPGQAPD-VKPVQNGSQLFIKEL
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pF1KB6 RSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERYV
       :::.::::.... .. :::::  :.:.:::  ::.::: : ::: .:.::: : ::: ::
CCDS35 RSRTFPSAEDVVARVPGSQLTLGYMEEHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYV
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pF1KB6 GGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIAK
       : .. .:: ::..: : :: :...: :... :: .:::: .::::::.:: .:: :::.:
CCDS35 GPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDYYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVK
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pF1KB6 KLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIKP
       ::::::::::::... :: : ::::. :.::::::::: ::.:.::::: ::: ::::.:
CCDS35 KLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRP
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pF1KB6 TDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAFG
       .. :.. :: : :. ..::.::.:.:::::::.::::.:::.:.:::.:.::  ::.::.
CCDS35 ASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVDKCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFA
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pF1KB6 GNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQT
       :.:::.:.. ::.: ::.:.:::  .: .:: ::. ::...:.:::..:  ...: :   
CCDS35 GHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSLTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPP
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pF1KB6 YLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKSQ
       .::::.: :. :.. : ::. ..::  :.:.. .:..:::.:.: :: . :. .: :. .
CCDS35 HLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHEDELPEHFKPSQLIKDLAKEIR-LSENASKAVRPE
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pF1KB6 GIPI-----VCPVSRSSNEATSPYHS----------------------------------
          .     ::  .: ..:  :: ..                                  
CCDS35 VNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATPPQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPP
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pF1KB6 ---------------RRKMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLEMCPWEEDILSSK
                      ..: .: :.    :  :::.:: ::.:.: ..:  : ..   ...
CCDS35 KPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASPTIPNLDLLEAHTKEALTKME--PPKKGKATKS
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pF1KB6 LNGKFNK---HLQ------------PSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQ
       . .  ::   :.:             :..  .:. :..    ::   .  : :..:.: .
CCDS35 VLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGN
              580       590       600       610       620       630

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pF1KB6 SLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEH---EESQKPLNGFFTSVKS--EL---
       .  .  : .  .:.   .  ..   : :: :. .   :.. ::.   .  :..  ::   
CCDS35 K-DNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFGALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKID
               640       650       660       670       680         

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pF1KB6 -----RSRSSGYSDISESEDSG---PE-CTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEES
            :....   :.:   :.    :   :  :   .. .:..:.:: . .: .. :   
CCDS35 EFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTKPKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPGR
     690       700       710       720       730       740         

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       :.            . ..:: :.. .  :   . . :.: ::.: :::::::::.:. : 
CCDS35 NARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYNPSSQPPASPSTQE-AIQGMLSMANLQASD
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       .:::                                                        
CCDS35 SCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGKSAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDA
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 initn: 913 init1: 620 opt: 620  Z-score: 535.3  bits: 110.8 E(32554): 1.7e-23
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CCDS41                       MEAEKDSGRRLRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFS
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        :  :::... .  ...  :.:.... .:...... ::..  . : ::...:.: :.: :
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       . : ..  ..::.:.::.          ...  .  : :.:::::.:.  .:::::::::
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       :::::::. : :::.:: :: .::: :: :  :  ::..:.::.:..: .  .:::.:.:
CCDS41 TSVWYHVFRGGKIFWLIPPTLHNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFF
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       .:.:::::: :  : ..::::.::..:. :::: ::.: : ..   :..::.  .::.: 
CCDS41 IPSGWIHAVYTPVDSLVFGGNILHSFNVPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVL
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CCDS41 ERYVYCVTQRSHLTQEYQRESMLIDAPRKPSIDGFSSDSWLEMEEEACDQQPQEEEEKDE
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>>CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12             (1336 aa)
 initn: 913 init1: 620 opt: 620  Z-score: 535.0  bits: 110.8 E(32554): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 935; 41.7% identity (73.8% similar) in 321 aa overlap (101-406:48-366)

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CCDS41 RHAAEKQKKKTVIYTKCFEFESATQRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQ
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       .. .  ...  :.:.... .:...... ::..  . : ::...:.: :.: ::.  ::. 
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pF1KB6 KVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPN--RPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIAKK
       ...::.::  :  ..:.. ..:.:. .:.  : :. :::::::: ::. .::. : ..  
CCDS41 RLVDVMDVNTQKGTEMSMSQFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLVKRPTVVDL
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       ..::.:.::.          ...  .  : :.:::::.:.  .::::::::::::::::.
CCDS41 VDWVDNMWPQHLKEKQTEATNAIAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGGTSVWYHVF
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CCDS41 RGGKIFWLIPPTLHNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFFIPSGWIHA
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       : :  : ..::::.::..:. :::: ::.: : ..   :..::.  .::.:         
CCDS41 VYTPVDSLVFGGNILHSFNVPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVLERYVYCVT
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CCDS41 QRSHLTQEYQRESMLIDAPRKPSIDGFSSDSWLEMEEEACDQQPQEEEEKDEEGEGRDRA
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>>CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11             (1162 aa)
 initn: 751 init1: 615 opt: 615  Z-score: 531.5  bits: 110.0 E(32554): 2.8e-23
Smith-Waterman score: 911; 40.7% identity (69.4% similar) in 327 aa overlap (95-406:12-336)

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CCDS44                    MEPEEERIRYSQRLRGTMRRRYE--DDGISDDEIEGKRTFD
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pF1KB6 KELRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVE
        : . ..     ...  :.:.... .:... :.  :..  . : ::...:.: :.: ::.
CCDS44 LEEKLHTNKYNANFVTFMEGKDFNVEYIQRGGLRDPLIFKNSDGLGIKMPDPDFTVNDVK
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pF1KB6 RYVGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPN--RPKVLNVISLEFSDTKMSELVEV
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CCDS44 MCVGSRRMVDVMDVNTQKGIEMTMAQWTRYYETPEEEREKLYNVISLEFSHTRLENMVQR
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pF1KB6 PDIAKKLSWVENYWP----------DDSVFPK--PFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTS
       :. .  ..::.:.::           ....    : :::::::.:.  :::::.::::::
CCDS44 PSTVDFIDWVDNMWPRHLKESQTESTNAILEMQYPKVQKYCLMSVRGCYTDFHVDFGGTS
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CCDS44 VWYHIHQGGKVFWLIPPTAHNLELYENWLLSGKQGDIFLGDRVSDCQRIELKQGYTFVIP
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CCDS44 SGWIHAVYTPTDTLVFGGNFLHSFNIPMQLKIYNIEDRTRVPNKFRYPFYYEMCWYVLER
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CCDS44 YVYCITNRSHLTKEFQKESLSMDLELNGLESGNGDEEAVDREPRRLSSRRSVLTSPVANG
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941 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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