seq1 = pF1KB8986.tfa, 1161 bp seq2 = pF1KB8986/gi568815595r_39165445.tfa (gi568815595r:39165445_39381695), 216251 bp >pF1KB8986 1161 >gi568815595r:39165445_39381695 (Chr3) (complement) 1-87 (100001-100087) 98% -> 88-1161 (115178-116251) 99% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGAGAACCCCTGGAGGCGTTGAAGTTGGCAGACTTGGATTTCAGGAA ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGAGAGAACCCCTGGAGGCGTTTAAGTTGGCAGACTTGGATTTCAGGAA 50 . : . : . : . : . : 51 GAGCTCTCTGGCTTCTGGGTGGAGAATGGCCAGTGGG GCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 100051 GAGCTCTCTGGCTTCTGGGTGGAGAATGGCCAGTGGGGTA...CAGGCCT 100 . : . : . : . : . : 92 TCACCATGGATCAGTTCCCTGAATCAGTGACAGAAAACTTTGAGTACGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115182 TCACCATGGATCAGTTCCCTGAATCAGTGACAGAAAACTTTGAGTACGAT 150 . : . : . : . : . : 142 GATTTGGCTGAGGCCTGTTATATTGGGGACATCGTGGTCTTTGGGACTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115232 GATTTGGCTGAGGCCTGTTATATTGGGGACATCGTGGTCTTTGGGACTGT 200 . : . : . : . : . : 192 GTTCCTGTCCATATTCTACTCCGTCATCTTTGCCATTGGCCTGGTGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115282 GTTCCTGTCCATATTCTACTCCGTCATCTTTGCCATTGGCCTGGTGGGAA 250 . : . : . : . : . : 242 ATTTGTTGGTAGTGTTTGCCCTCACCAACAGCAAGAAGCCCAAGAGTGTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115332 ATTTGTTGGTAGTGTTTGCCCTCACCAACAGCAAGAAGCCCAAGAGTGTC 300 . : . : . : . : . : 292 ACCGACATTTACCTCCTGAACCTGGCCTTGTCTGATCTGCTGTTTGTAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115382 ACCGACATTTACCTCCTGAACCTGGCCTTGTCTGATCTGCTGTTTGTAGC 350 . : . : . : . : . : 342 CACTTTGCCCTTCTGGACTCACTATTTGATAAATGAAAAGGGCCTCCACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115432 CACTTTGCCCTTCTGGACTCACTATTTGATAAATGAAAAGGGCCTCCACA 400 . : . : . : . : . : 392 ATGCCATGTGCAAATTCACTACCGCCTTCTTCTTCATCGGCTTTTTTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115482 ATGCCATGTGCAAATTCACTACCGCCTTCTTCTTCATCGGCTTTTTTGGA 450 . : . : . : . : . : 442 AGCATATTCTTCATCACCGTCATCAGCATTGATAGGTACCTGGCCATCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115532 AGCATATTCTTCATCACCGTCATCAGCATTGATAGGTACCTGGCCATCGT 500 . : . : . : . : . : 492 CCTGGCCGCCAACTCCATGAACAACCGGACCGTGCAGCATGGCGTCACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115582 CCTGGCCGCCAACTCCATGAACAACCGGACCGTGCAGCATGGCGTCACCA 550 . : . : . : . : . : 542 TCAGCCTAGGCGTCTGGGCAGCAGCCATTTTGGTGGCAGCACCCCAGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115632 TCAGCCTAGGCGTCTGGGCAGCAGCCATTTTGGTGGCAGCACCCCAGTTC 600 . : . : . : . : . : 592 ATGTTCACAAAGCAGAAAGAAAATGAATGCCTTGGTGACTACCCCGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115682 ATGTTCACAAAGCAGAAAGAAAATGAATGCCTTGGTGACTACCCCGAGGT 650 . : . : . : . : . : 642 CCTCCAGGAAATCTGGCCCGTGCTCCGCAATGTGGAAACAAATTTTCTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115732 CCTCCAGGAAATCTGGCCCGTGCTCCGCAATGTGGAAACAAATTTTCTTG 700 . : . : . : . : . : 692 GCTTCCTACTCCCCCTGCTCATTATGAGTTATTGCTACTTCAGAATCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115782 GCTTCCTACTCCCCCTGCTCATTATGAGTTATTGCTACTTCAGAATCATC 750 . : . : . : . : . : 742 CAGACGCTGTTTTCCTGCAAGAACCACAAGAAAGCCAAAGCCATTAAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115832 CAGACGCTGTTTTCCTGCAAGAACCACAAGAAAGCCAAAGCCATTAAACT 800 . : . : . : . : . : 792 GATCCTTCTGGTGGTCATCGTGTTTTTCCTCTTCTGGACACCCTACAACA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115882 GATCCTTCTGGTGGTCATCGTGTTTTTCCTCTTCTGGACACCCTACAACG 850 . : . : . : . : . : 842 TTATGATTTTCCTGGAGACGCTTAAGCTCTATGACTTCTTTCCCAGTTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115932 TTATGATTTTCCTGGAGACGCTTAAGCTCTATGACTTCTTTCCCAGTTGT 900 . : . : . : . : . : 892 GACATGAGGAAGGATCTGAGGCTGGCCCTCAGTGTGACTGAGATGGTTGC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 115982 GACATGAGGAAGGATCTGAGGCTGGCCCTCAGTGTGACTGAGACGGTTGC 950 . : . : . : . : . : 942 ATTTAGCCATTGTTGCCTGAATCCTCTCATCTATGCATTTGCTGGGGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116032 ATTTAGCCATTGTTGCCTGAATCCTCTCATCTATGCATTTGCTGGGGAGA 1000 . : . : . : . : . : 992 AGTTCAGAAGATACCTTTACCACCTGTATGGGAAATGCCTGGCTGTCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116082 AGTTCAGAAGATACCTTTACCACCTGTATGGGAAATGCCTGGCTGTCCTG 1050 . : . : . : . : . : 1042 TGTGGGCGCTCAGTCCACGTTGATTTCTCCTCATCTGAATCACAAAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116132 TGTGGGCGCTCAGTCCACGTTGATTTCTCCTCATCTGAATCACAAAGGAG 1100 . : . : . : . : . : 1092 CAGGCATGGAAGTGTTCTGAGCAGCAATTTTACTTACCACACGAGTGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116182 CAGGCATGGAAGTGTTCTGAGCAGCAATTTTACTTACCACACGAGTGATG 1150 . : . : 1142 GAGATGCATTGCTCCTTCTC |||||||||||||||||||| 116232 GAGATGCATTGCTCCTTCTC