Result of FASTA (omim) for
pF1KB9746
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9746, 542 aa
1>>>pF1KB9746 542 - 542 aa - 542 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9291+/-0.000837; mu= 18.9869+/- 0.052
mean_var=331.4508+/-71.588, 0's: 0 Z-trim(108.7): 2048 B-trim: 53 in 1/52
Lambda= 0.070447
statistics sampled from 14581 (16863) to 14581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.478), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 8.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2193 238.8 4.7e-62
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2193 238.8 4.7e-62
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2193 238.8 4.7e-62
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NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2193 238.8 4.8e-62
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2193 238.9 4.8e-62
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 2186 238.0 7.2e-62
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 2186 238.0 7.2e-62
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 2186 238.1 7.5e-62
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NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 2186 238.1 7.5e-62
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 2140 233.2 1.7e-60
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 2140 233.2 1.7e-60
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 2143 234.0 1.8e-60
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2143 234.0 1.8e-60
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2143 234.0 1.8e-60
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 2143 234.0 1.8e-60
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2143 234.0 1.8e-60
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 2140 233.3 1.8e-60
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 2140 233.3 1.8e-60
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2140 233.8 2.3e-60
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2140 233.8 2.4e-60
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2114 231.1 1.4e-59
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2114 231.1 1.4e-59
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2114 231.1 1.4e-59
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2114 231.1 1.4e-59
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2114 231.1 1.4e-59
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2114 231.1 1.4e-59
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2114 231.1 1.5e-59
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 2097 229.1 4.2e-59
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 2097 229.2 4.4e-59
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 2097 229.2 4.4e-59
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 2090 228.1 6e-59
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 2090 228.1 6e-59
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 2090 228.2 6.1e-59
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 2090 228.2 6.2e-59
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 2090 228.2 6.2e-59
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 2090 228.2 6.2e-59
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 2090 228.2 6.2e-59
>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
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10 20 30 40
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPS-FALHQKI-SRQKPRECR
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>>NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
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pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPS-FALHQKI-SRQKPRECR
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NP_001 VFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]