Result of SIM4 for pF1KB9738

seq1 = pF1KB9738.tfa, 1509 bp
seq2 = pF1KB9738/gi568815587r_512648.tfa (gi568815587r:512648_715261), 202614 bp

>pF1KB9738 1509
>gi568815587r:512648_715261 (Chr11)

(complement)

1-20  (99898-99917)   100% ->
21-183  (100003-100165)   100% ->
184-394  (100255-100465)   99% ->
395-453  (100728-100786)   100% ->
454-679  (100863-101088)   100% ->
680-766  (101225-101311)   100% ->
767-847  (101397-101477)   100% ->
848-1237  (101667-102056)   100% ->
1238-1356  (102145-102263)   100% ->
1357-1509  (102462-102614)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTGGCTCCTGAGAG         GGCAGCCCCACGCGTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  99898 ATGGCCTTGGCTCCTGAGAGGTA...CAGGGCAGCCCCACGCGTGCTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CGGAGAGTGGCTCCTTGGAGAGATCAGCAGCGGCTGCTATGAGGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 CGGAGAGTGGCTCCTTGGAGAGATCAGCAGCGGCTGCTATGAGGGGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTGGCTGGACGAGGCCCGCACCTGTTTCCGCGTGCCCTGGAAGCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100074 AGTGGCTGGACGAGGCCCGCACCTGTTTCCGCGTGCCCTGGAAGCACTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGCGCAAGGACCTGAGCGAGGCCGACGCGCGCATCTTCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100124 GCGCGCAAGGACCTGAGCGAGGCCGACGCGCGCATCTTCAAGGTG...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GCCTGGGCTGTGGCCCGCGGCAGGTGGCCGCCTAGCAGCAGGGGAGGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100254 GGCCTGGGCTGTGGCCCGCGGCAGGTGGCCGCCTAGCAGCAGGGGAGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCCCGCCCCCCGAGGCTGAGACTGCGGAGCGCGCCGGCTGGAAAACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100304 GCCCGCCCCCCGAGGCTGAGACTGCGGAGCGCGCCGGCTGGAAAACCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCCGCTGCGCACTGCGCAGCACGCGTCGCTTCGTGATGCTGCGAGATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100354 TTCCGCTGCGCACTGCGCAGCACGCGTCGCTTCGTGATGCTGCGGGATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTCGGGGGACCCGGCCGACCCGCACAAGGTGTACGCGCTCAGCCGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100404 CTCGGGGGACCCGGCCGACCCGCACAAGGTGTACGCGCTCAGCCGGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTGCTGGCGAG         AAGGCCCAGGCACGGACCAGACTGAGGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100454 TGTGCTGGCGAGGTG...CAGAAGGCCCAGGCACGGACCAGACTGAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGGCCCCCGCAGCTGTCCCACCACCACAG         GGTGGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100757 GAGGCCCCCGCAGCTGTCCCACCACCACAGGTA...CAGGGTGGGCCCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGGGCCATTCCTGGCACACACACATGCTGGACTCCAAGCCCCAGGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100874 AGGGCCATTCCTGGCACACACACATGCTGGACTCCAAGCCCCAGGCCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCCTGCCCCAGCTGGTGACAAGGGGGACCTCCTGCTCCAGGCAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100924 TCCCTGCCCCAGCTGGTGACAAGGGGGACCTCCTGCTCCAGGCAGTGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGAGCTGCCTGGCAGACCATCTGCTGACAGCGTCATGGGGGGCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100974 CAGAGCTGCCTGGCAGACCATCTGCTGACAGCGTCATGGGGGGCAGATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGTCCCAACCAAGGCTCCTGGAGAGGGACAAGAAGGGCTTCCCCTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101024 AGTCCCAACCAAGGCTCCTGGAGAGGGACAAGAAGGGCTTCCCCTGACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGGCCTGTGCTGGAG         GCCCAGGGCTCCCTGCTGGGGAGCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101074 GGGCCTGTGCTGGAGGTG...CAGGCCCAGGGCTCCCTGCTGGGGAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TACGGGTGGGCAGTAGAGACGACCCCCAGCCCCGGGCCCCAGCCCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TACGGGTGGGCAGTAGAGACGACCCCCAGCCCCGGGCCCCAGCCCGCGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACTAACGACAG         GCGAGGCCGCGGCCCCAGAGTCCCCGCACC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACTAACGACAGGTG...CAGGCGAGGCCGCGGCCCCAGAGTCCCCGCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGGCAGAGCCGTACCTGTCACCCTCCCCAAGCGCCTGCACCGCGGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101427 AGGCAGAGCCGTACCTGTCACCCTCCCCAAGCGCCTGCACCGCGGTGCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 G         AGCCCAGCCCAGGGGCGCTGGACGTGACCATCATGTACAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101477 GGTG...CAGAGCCCAGCCCAGGGGCGCTGGACGTGACCATCATGTACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGGCCGCACGGTGCTGCAGAAGGTGGTGGGACACCCGAGCTGCACGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101707 GGGCCGCACGGTGCTGCAGAAGGTGGTGGGACACCCGAGCTGCACGTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TATACGGCCCCCCAGACCCAGCTGTCCGGGCCACAGACCCCCAGCAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101757 TATACGGCCCCCCAGACCCAGCTGTCCGGGCCACAGACCCCCAGCAGGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GCATTCCCCAGCCCTGCCGAGCTCCCGGACCAGAAGCAGCTGCGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101807 GCATTCCCCAGCCCTGCCGAGCTCCCGGACCAGAAGCAGCTGCGCTACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAGGAACTGCTGCGGCACGTGGCCCCTGGGTTGCACCTGGAGCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101857 GGAGGAACTGCTGCGGCACGTGGCCCCTGGGTTGCACCTGGAGCTTCGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101907 GGCCACAGCTGTGGGCCCGGCGCATGGGCAAGTGCAAGGTGTACTGGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTGGGCGGACCCCCAGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101957 GTGGGCGGACCCCCAGGCTCCGCCAGCCCCTCCACCCCAGCCTGCCTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCCTCGGAACTGTGACACCCCCATCTTCGACTTCAGAGTCTTCTTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102007 GCCTCGGAACTGTGACACCCCCATCTTCGACTTCAGAGTCTTCTTCCAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238          AGCTGGTGGAATTCCGGGCACGGCAGCGCCGTGGCTCCCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102057 GTC...CAGAGCTGGTGGAATTCCGGGCACGGCAGCGCCGTGGCTCCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CGCTATACCATCTACCTGGGCTTCGGGCAGGACCTGTCAGCTGGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102186 CGCTATACCATCTACCTGGGCTTCGGGCAGGACCTGTCAGCTGGGAGGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CAAGGAGAAGAGCCTGGTCCTGGTGAAG         CTGGAACCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102236 CAAGGAGAAGAGCCTGGTCCTGGTGAAGGTG...CAGCTGGAACCCTGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGTGCCGAGTGCACCTAGAGGGCACGCAGCGTGAGGGTGTGTCTTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102475 TGTGCCGAGTGCACCTAGAGGGCACGCAGCGTGAGGGTGTGTCTTCCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GATAGCAGCAGCCTCAGCCTCTGCCTGTCCAGCGCCAACAGCCTCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102525 GATAGCAGCAGCCTCAGCCTCTGCCTGTCCAGCGCCAACAGCCTCTATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CGACATCGAGTGCTTCCTTATGGAGCTGGAGCAGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102575 CGACATCGAGTGCTTCCTTATGGAGCTGGAGCAGCCCGCC

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