seq1 = pF1KA2033.tfa, 2238 bp seq2 = pF1KA2033/gi568815579r_52604752.tfa (gi568815579r:52604752_53015326), 410575 bp >pF1KA2033 2238 >gi568815579r:52604752_53015326 (Chr19) (complement) 9-142 (207188-207320) 97% -> 143-852 (213625-214337) 86% <- 853-955 (214841-214944) 84% -> 956-1104 (215281-215429) 87% <- 1105-1174 (215598-215667) 87% -> 1175-1252 (216173-216249) 83% == 1310-1369 (248221-248280) 90% -> 1370-1445 (248453-248524) 84% -> 1446-1542 (248604-248705) 83% <- 1543-1601 (249038-249100) 81% -> 1602-1740 (249185-249323) 85% == 1785-1800 (250124-250139) 100% <- 1801-1873 (309116-309188) 89% -> 1874-1982 (309358-309462) 86% <- 1983-2046 (309547-309610) 87% <- 2047-2129 (309943-310030) 80% -> 2130-2232 (310114-310216) 86% 0 . : . : . : . : . : 9 TTCTCAGGGTCTATTGACATTCAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCAGG ||-|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 207188 TT TCAGGGTCTATTGACATTCAGGGACGTGGCCATAGAATTCTCTCAGG 50 . : . : . : . : . : 59 AGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGACTCTATACAGGGACGTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| 207237 AGGAGTGGAAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGACTCTTTACAGGGATGTG 100 . : . : . : . : . : 109 ATGCTGGAGAATTATAGGAACCTGGTCTCCCTGG ATATCTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 207287 ATGCTGGAGAATTATAGGAACCTGGTCTCCCTGGGTG...TAGATATCTC 150 . : . : . : . : . : 150 TTCCAAATGCACGATGAAG GAGTTCTTGTCAACAGCGCAAGGCAACAGA ||||||||||| |||||||- |-||||| ||||||| ||||||||| | | 213632 TTCCAAATGCATGATGAAGACA TTCTTCTCAACAGGGCAAGGCAATACA 200 . : . : . : . : . : 199 GAAGTGTTCCATGCAGGGACATTGCAAATACATGAAAGTCATCACAATGG |||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| 213681 GAAGCGTTCCACACAGGGACATTGCAAAGACAAGCAAGTCATCACATTGG 250 . : . : . : . : . : 249 AGATTTTTGCTACCAGGATGTTGATAAAGATATTCATGACTATGAATTTC ||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||| || | |||| 213731 AGATTTTTGCTTCCAGAAAATTGAGAAAGACATTCATGGCTTCCAGTTTC 300 . : . : . : . : . : 299 AATGGCAAGAAGATGAAAGAAATGGCCATGAAGCACCCATGACAAAAATC | ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| 213781 AGTGGAAAGAAGATGAAACAAATGACCATGCAGCACCCATGACAGAAATC 350 . : . : . : . : . : 349 AAAAAGTTGACAGGTAGTACAGAACGATATGATCAAAGTCATGCTAGAAA ||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||| |||| 213831 AAAGAGTTGACTGGTAGTACAGGCCAACATGATCAAAGGCATGCTGGAAA 400 . : . : . : . : . : 399 CAAGCCTATTAAAGATCAGCTTGGATCAAGCTTTCATTCGCATCTGCCTG ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 213881 CAAGCATATTAAAGATCAGCTTGGATTAAGCTTTCATTCGCATCTGCCTG 450 . : . : . : . : . : 449 AAATGCACATATTTCAGACCGAAGAGAAAATTGATAATCAAGTTGTGAAG || |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| 213931 AACTGCACATATTTCAGCCTGAAGGGAAAATTGGTAATCAAGTTGAGAAG 500 . : . : . : . : . : 499 TCTATCCACGATGCTTCCTTGGTTTCAACAGCCCAAAGAATTTCTTGTAG |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| 213981 TCTATCAACAATGCTTCCTCAGTTTCAACATCCCAAAGAATTTGTTGTAG 550 . : . : . : . : . : 549 GCCCAAAACCCATATATCTAATAACCATGGGAATAATT TCTGGAATTCT ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||- || -||||| 214031 GCCCAAAACCCATATTTCTAATAAGTATGGAAATAATTCCCTCC ATTCT 600 . : . : . : . : . : 598 TCATTACTCACACAAAAACAGGAA GTACACATGAGAGAAAAATCTTTCC |||||||||||||||||||-||||-||||||||||||||||||||||||| 214080 TCATTACTCACACAAAAAC GGAATGTACACATGAGAGAAAAATCTTTCC 650 . : . : . : . : . : 647 AATGTAATGAGAGTGGCAAAGCCTTTAATTACAGCTCACTCTTAAGGAAA |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| 214129 AATGTATTGAGAGTGGCAAATCCTTTAATTGTAGCTCACTTTTAAAAAAA 700 . : . : . : . : . : 697 CATCAGATAATCCATTTAG CAGACA AATATAAATGTGATGTATGTGG |||||||||| ||| ||||-- ||| |-||| |||||||||||||| ||| 214179 CATCAGATAACCCACTTAGAAGAGAAACAATGTAAATGTGATGTATATGG 750 . : . : . : . : . : 744 CAAGCTCTTTAATCAGAAGCGAAACCTAGCATGCCATCGTAGATGTCACA |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| 214229 CAAGGTATTTAATCAGAAGCGATACCTTGCATGCCATCGTAGATCTCACA 800 . : . : . : . : . : 794 CTGGTGAGAATCCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTCAGTCAG || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| 214279 TTGATGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGATCTTTGGTCAC 850 . : . : . : . : . : 844 ACGTCATCC CTTACATGCCATCGTAGACTTCATACTGGAG | |||||<<<...<<<-||| || |||||| |||||||||||||| || 214329 AATACATCCCTC...AACTCTTGCACGCCATCATAGACTTCATACTGCAG 900 . : . : . : . : . : 884 AGAAACCTTACAAATGTGAAGAATGTGACAAAGCTTTCCATTTCAAATCA ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| 214873 AGAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGACAAAGTTTTCAGGTGCAAATCA 950 . : . : . : . : . : 934 ATACTTGAAAGACATAGGATAA TTCATACTGAAGAGAAAC -| -|||||||||||||||| |>>>...>>>||||||||| |||||||| 214923 CAC CTTGAAAGACATAGGAGGATTC...GAGTTCATACTGGAGAGAAAC 1000 . : . : . : . : . : 974 CATATAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTTAGGCAGA AGTCAATC C | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||-|-||-|||-| 215299 CTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTCCGTCAGACA TC ATCGC 1050 . : . : . : . : . : 1022 TTACACGCCATCATCGACTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAAT ||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| 215347 TTATAATCCATCGTAGGCTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAAT 1100 . : . : . : . : . : 1072 GAGTGTGGCAAGACCTTTAGTCACAAGTCATCC CTTACATG ||||||||||||||||| ||||| | |||||||<<<...<<<||| || 215397 GAGTGTGGCAAGACCTTCAGTCAGATGTCATCCCTC...AACCTTGTATA 1150 . : . : . : . : . : 1113 CCATCATAGACTTCATACTGGAGAGAAACCCT ACAAATGTAATGAGTGT ||||||||||||||||| |||||||||||| |-|-|| |||||||||||| 215606 CCATCATAGACTTCATAGTGGAGAGAAACCTTGA AAGTGTAATGAGTGT 1200 . : . : . : . : . : 1162 GGCAAGACCTTTA GTCA CAAGTCATCCCTTACATGCCATC ||||||||||| |>>>...>>>-|||-|-||||| |||| || | |||| 215655 GGCAAGACCTTCAGTC...TAA TCAAC AGTCACACCTTGCAAGTCATC 1250 . : . : . : . : . : 1202 GTAGACTTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGAAGAATGTGACAAA ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| 216199 ATAGTCTTCATACTGCAGAGAAATCTTACAAATGTGAAGACTGTGACAAA 1300 1252 G | 216249 G 0 . : . : . : . : . : 1310 CTTACAAGTGTAATGAGTGTGGAAAGACCTTTAG CCGGACATCATCCCT |||||||||||||||||||||||||| |||| ||-| || -||||||||| 248221 CTTACAAGTGTAATGAGTGTGGAAAGTCCTTCAGTCAGGT ATCATCCCT 50 . : . : . : . : . : 1359 TACATGCCATC GTAGACGTCATACTGGAGAGCAACCTTACA |||||||||||>>>...>>>--|-| -||||||||||||| ||||||||| 248270 TACATGCCATCGTA...TAG A AT TCATACTGGAGAGAAACCTTACA 100 . : . : . : . : . : 1400 AATGTGAAGAATGTGACAAAGCTTTCCGTTTCAAATCAAACCTTGA ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||>>>. 248479 AATGTGAAGAATGTGACAAAGTTTTCAGTCGGAAATCAACCCTTGAGTC. 150 . : . : . : . : . : 1446 AAGACATAGGAGAATTCATACTGGAGAGAAACCATACAAG ..>>>-----|||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| 248529 ..CAGCTGGCAAGACATAAAAGAATTCACACTGGAGAGAAAACTTACAAG 200 . : . : . : . : . : 1486 TGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTTAGTCGGAAGTCATACCTCACATGCCA ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| 248649 TGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTCAGTCACAAGTCATCCCTTGTATGCCA 250 . : . : . : . : . : 1536 TCATAGA CTTCATACTGGAGAGAAAGCTTACAAGTGT |||||||<<<...<<<---- |||||| |||||||||| ||||||||||| 248699 TCATAGACTT...TACTAGAATTCATAGTGGAGAGAAACCTTACAAGTGT 300 . : . : . : . : . : 1573 AATGAGTGCAGCAAGACCTTTAGT TGGAA GTCATCCCTT |||||||||||||||||||| ||-||-| >>>...>>>||||| ||||- 249072 AATGAGTGCAGCAAGACCTTCCGTCTG AGGTC...GAGGTCATACCTTC 350 . : . : . : . : . : 1612 ACCTGCCATCGTAGACTTCATTCTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAAGGA | -|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || 249196 AT TGCCATCGTAGACTTCATAGTGGTGAGAAACCTTACAAGTGTAATGA 400 . : . : . : . : . : 1662 GTGTGGCAAGACCTTCAATCAGCAGTTAACCCTTAAACGCCATCGTAGAC ||||||||||||||||| ||| || | ||||| | ||||||||||| 249245 GTGTGGCAAGACCTTCAGTCACAAGCCATCCCTTGTTCACCATCGTAGAC 450 . : . : . 1712 TTCATAGTGGAGAGAACCCTTACAAATGT |||||| ||||||||| ||||||||||| 249295 TTCATACTGGAGAGAAATCTTACAAATGT 0 . : . : . : . : . : 1785 ACATCAGAAAATTCAT ACTGAACAGAATCCTTACAAGTGTA ||||||||||||||||<<<...<<<|||| |||| ||||||||||||| 250124 ACATCAGAAAATTCATTTT...CACACTGTTGAGAAACCTTACAAGTGTA 50 . : . : . : . : . : 1826 ATGAGTGTGGCAAGACCTTCAGTC GGACGTCATCCCTTACATGCCATC | ||||||||||||||||||||||-|||-|||||||||||| |||||||> 309141 AAGAGTGTGGCAAGACCTTCAGTCAGGA GTCATCCCTTACCTGCCATCG 100 . : . : . : . : . : 1874 GTAGACTTCATACCGGAGAGAAACCTTACAAATGTGAAGAAT >>...>>>--|-|-||||||| |||||||||||||||||||||||||||| 309190 TA...TAG A A TTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAATGTGAAGAAT 150 . : . : . : . : . : 1916 GTGACAAAGCTTTCCGT GTGAAATCAAACCTTGA AGGACATAGGAGAA ||||||||| |||| ||-|-|||||||| | ||||-| -||||| ||||| 309396 GTGACAAAGTTTTCAGTCG GAAATCAACCATTGAGAC ACATAAGAGAA 200 . : . : . : . : . : 1964 TTCATACTGGAGAGAAACC TTACAAGTGTAATGAGTGTGGC |||||||||||||||||||<<<...<<<||| || ||||||||||||||| 309444 TTCATACTGGAGAGAAACCATA...AACTTATAAATGTAATGAGTGTGGC 250 . : . : . : . : . : 2005 AAGACCTTTAGTCGGAAGTCATATTTTGTATGCCATCATAGA |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||<<<...<< 309569 AAGACCTTCAGTCACAAGTCATCCCTTGTATGCCATCATAGACTT...TA 300 . : . : . : . : . : 2047 CTTCATACTGGAGAGAAACCTTATAAGTGTAATGAGTGTGGCAAG <---- |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| 309942 CTAGAATTCATAGTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGCAGCAAG 350 . : . : . : . : . : 2092 AACTTTAGTCAGAAGTCATCCCTTATATGCCACCATAG AC | ||| ||||| | ||||| |||| ||||||| |||||->>>...>>>|| 309992 ACCTTCAGTCACAGGTCATACCTTGTATGCCATCATAGAGTT...TAGAC 400 . : . : . : . : . : 2132 TTCATACTGGAGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGACCTTT |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| 310116 TTCATAGTGGTGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAATACCTTC 450 . : . : . : . : . : 2182 AGTCAGAAGTCAAACCTTACATGCCATCGTAGACTTCATACTGGAGAAAA |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| || 310166 CGTCACTGCTCATCCCTTATATACCATCGTAGACTTCATACTGGAGAGAA 500 2232 A | 310216 A