Result of FASTA (ccds) for pF1KB7685
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7685, 348 aa
  1>>>pF1KB7685 348 - 348 aa - 348 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7381+/-0.00109; mu= 6.0164+/- 0.064
 mean_var=241.1763+/-50.237, 0's: 0 Z-trim(111.2): 889  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.082586
 statistics sampled from 11213 (12222) to 11213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.375), width:  16
 Scan time:  2.920

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6        ( 348) 2451 305.0 5.9e-83
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6        ( 406) 1193 155.2 8.5e-38
CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6      ( 389) 1160 151.3 1.3e-36
CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6          ( 394) 1139 148.8 7.2e-36
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18         ( 368) 1098 143.9   2e-34
CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18      ( 335)  919 122.5 5.1e-28
CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6         ( 445)  824 111.3 1.6e-24
CCDS11913.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18      ( 333)  806 109.0 5.7e-24
CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6       ( 390)  660 91.7 1.1e-18
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6        ( 538)  660 91.9 1.3e-18
CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6        (1325)  646 90.7 7.5e-18
CCDS59001.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6       ( 247)  630 87.9 9.7e-18
CCDS32814.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18       ( 275)  627 87.6 1.3e-17
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18       ( 534)  627 87.9   2e-17
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6       ( 545)  625 87.7 2.4e-17
CCDS12939.1 ZNF444 gene_id:55311|Hs108|chr19       ( 327)  613 86.0 4.7e-17
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6         ( 578)  589 83.5 4.9e-16
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502)  584 82.8 6.8e-16
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7           ( 446)  574 81.5 1.4e-15
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  571 81.3 2.3e-15
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  571 81.4 2.4e-15
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  571 81.4 2.4e-15
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682)  571 81.4 2.4e-15
CCDS82246.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18      ( 210)  559 79.4 3.1e-15
CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 350)  562 80.0 3.3e-15
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19       ( 594)  566 80.7 3.3e-15
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544)  565 80.6 3.4e-15
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22         ( 446)  561 80.0 4.2e-15
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 527)  562 80.2 4.3e-15
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7        ( 563)  562 80.2 4.5e-15
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8         ( 496)  561 80.0 4.5e-15
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8         ( 536)  561 80.1 4.7e-15
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9       ( 744)  563 80.5 4.9e-15
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751)  563 80.5   5e-15
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19       ( 670)  561 80.2 5.5e-15
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17     ( 522)  559 79.8 5.5e-15
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 539)  559 79.9 5.6e-15
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 560)  559 79.9 5.7e-15
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 511)  558 79.7 5.9e-15
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 521)  558 79.7   6e-15
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19        ( 533)  558 79.7   6e-15
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19       ( 610)  559 79.9 6.1e-15
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470)  556 79.4 6.6e-15
CCDS41300.1 ZSCAN20 gene_id:7579|Hs108|chr1        (1043)  562 80.6 6.7e-15
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568)  557 79.6 6.8e-15
CCDS10504.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16        ( 407)  554 79.1 7.1e-15
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604)  557 79.7 7.1e-15
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620)  557 79.7 7.2e-15
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  557 79.7 7.8e-15
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 819)  558 79.9   8e-15


>>CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6             (348 aa)
 initn: 2451 init1: 2451 opt: 2451  Z-score: 1602.9  bits: 305.0 E(32554): 5.9e-83
Smith-Waterman score: 2451; 100.0% identity (100.0% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREALT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREALT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 QLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 RELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEAGKPQRNGDKTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEAGKPQRNGDKTR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 TKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRERRRYKCDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRERRRYKCDE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 CGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340        
pF1KB7 FSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
              310       320       330       340        

>>CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6             (406 aa)
 initn: 2760 init1: 561 opt: 1193  Z-score: 792.0  bits: 155.2 E(32554): 8.5e-38
Smith-Waterman score: 1193; 51.3% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (8-348:5-351)

               10         20        30        40        50         
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAE-DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREAL
              :.:  : :.:.: :  : :..  .  .   .:  :: ::..:::..:::::::
CCDS46    MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETPGPREAL
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 TQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDL
       ..: :::.:::::: :::::::.::::::::.:::..:::::: ::::.:::::.:.:::
CCDS46 SRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAVAVVEDL
        60        70        80        90       100       110       

     120       130        140       150       160          170     
pF1KB7 ERELDEPGKQVPGNSE-RRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA---GKPQRN
       :.::.:::.:.: . . . ..:.. .  :    :   .::.:  :::. :.    . :..
CCDS46 EQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQFQEQ
       120       130       140       150       160       170       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB7 GDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRE---
         ..  .:.:: .:... :. : ::.  ..:..:.    : ..  . ....: :: .   
CCDS46 DGESIPENQELASKQEILKEMEHLGD--SKLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTG
       180       190       200         210       220       230     

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPY
       .::..:.::::::..:: : .:.: :::::::.:.:::::: .:: :  :.: ::: :::
CCDS46 ERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPY
         240       250       260       270       280       290     

            300       310       320       330       340            
pF1KB7 KCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY    
       .:::::: ::. .:: .:.:::::::::::  ::. : .:: :..::::::..: :    
CCDS46 QCKECGKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEKRYQCRE
         300       310       320       330       340       350     

CCDS46 CGKAFIQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
         360       370       380       390       400      

>>CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6           (389 aa)
 initn: 1796 init1: 564 opt: 1160  Z-score: 771.0  bits: 151.3 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 1160; 51.1% identity (75.3% similar) in 352 aa overlap (8-348:11-361)

                  10            20        30        40        50   
pF1KB7    MTTALEPEDQKGLLIIKA----EDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAP
                 : :.::: .:.    :.:  : .:. .. .:: ::..:..::..:::..:
CCDS47 MAITLTLQTAEMQEGLLAVKVKEEEEEHSCGPESGLSRNNPHTREIFRRRFRQFCYQESP
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB7 GPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAV
       :::::: .: :::.:::::: :::::::.::::::::.:::..:::::: :.: .:::::
CCDS47 GPREALQRLQELCHQWLRPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVRQHRPVSGEEAV
               70        80        90       100       110       120

           120       130        140       150       160            
pF1KB7 TVLEDLERELDEPGKQVPGNS-ERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLE---QEA
       :::::::::::.::.:: ... :..... .: .: :   :: . :..  . ::    .:.
CCDS47 TVLEDLERELDDPGEQVLSHAHEQEEFVKEKATP-GAAQESSNDQFQTLEEQLGYNLREV
              130       140       150        160       170         

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB7 GKPQRNGDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQ
          :.   :. : : ::  :... .. . : ..  . : .  : :.  :  . ::: : :
CCDS47 CPVQEIDGKAGTWNVELAPKREISQEVKSLIQVLGKQNGNITQIPEYGDTCDREGRLEKQ
     180       190       200       210       220       230         

     230          240       250       260       270       280      
pF1KB7 QRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVH
       .     .: : :.::::::...: : .:.:::::::::.:::::.:: ::: :. :.:.:
CCDS47 RVSSSVERPYICSECGKSFTQNSILIEHQRTHTGEKPYECDECGRAFSQRSGLFQHQRLH
     240       250       260       270       280       290         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB7 TGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANK
       :: : :.:. ::: ::  .::..: :::::::::.:..:.. :   :.::.::::::...
CCDS47 TGEKRYQCSVCGKAFSQNAGLFHHLRIHTGEKPYQCNQCNKSFSRRSVLIKHQRIHTGER
     300       310       320       330       340       350         

                                     
pF1KB7 LY                            
        :                            
CCDS47 PYECEECGKNFIYHCNLIQHRKVHPVAESS
     360       370       380         

>>CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6               (394 aa)
 initn: 2199 init1: 534 opt: 1139  Z-score: 757.4  bits: 148.8 E(32554): 7.2e-36
Smith-Waterman score: 1139; 50.3% identity (74.9% similar) in 350 aa overlap (7-346:16-364)

                        10          20        30        40         
pF1KB7          MTTALEPEDQKGLLIIKAE--DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
                      ::  . :: .:.:  .:   :.:  .. .:  ::..:.:::.:::
CCDS46 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB7 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
       :..::::::::.: ::: :::::.  ::::::::::::::::::::.::.::: : ::.:
CCDS46 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQE-
       :::: .::::::::::: ... .. .:...:  ...::..    ::.: .::. ::  . 
CCDS46 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQ-TPLTLQSQPKEPQLTCDS
              130       140       150       160        170         

      170          180       190       200        210       220    
pF1KB7 AGKPQRNGDK---TRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEI-NDRLNKDTPQHPKSKDIIENEG
       : : .  :.    :.:...::  ..: ::  :  :.. :..  . . : :.  .. :.. 
CCDS46 AQKCHSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKD
     180       190       200       210       220       230         

          230          240       250       260       270       280 
pF1KB7 RSEWQQRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIG
       : : :  .   . ..:::::::::..:: : .:.: ::::.::.:.:::::: . : :..
CCDS46 RIERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFN
     240       250       260       270       280       290         

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB7 HHRVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRI
       :. .:.  : :.:::::: ::  .::::::::: :::::.:..:.. .   : ::.::: 
CCDS46 HRGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRS
     300       310       320       330       340       350         

                                          
pF1KB7 HTANKLY                            
       ::...                              
CCDS46 HTGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
     360       370       380       390    

>>CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18              (368 aa)
 initn: 1246 init1: 533 opt: 1098  Z-score: 731.4  bits: 143.9 E(32554): 2e-34
Smith-Waterman score: 1098; 50.0% identity (71.0% similar) in 348 aa overlap (7-347:17-362)

                         10        20          30        40        
pF1KB7           MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYWGQDSSS--QKCSPHRRELYRQHFRKLC
                       :.... .: .: :.   :...::   .  :   :..::.::.. 
CCDS11 MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDP-EIFRQRFRQFG
               10        20        30        40         50         

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB7 YQDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPET
       :::.::::::..:: :::: ::::: :::::::.:.:::::..::::.::.::: ::::.
CCDS11 YQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVRDHHPEN
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KB7 GEEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQ-
       :::::::::::: :::.::. :    ..:..:.. ..   .     . .:   ..::.  
CCDS11 GEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEDMVSQEEAQGLPSSELDAVENQLKWA
     120       130       140       150       160       170         

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB7 --EAGKPQRNGDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGR
         :  . ..  :  ::.:  :  :...:.  :   :.   ::  .::  :  .    .::
CCDS11 SWELHSLRHCDDDGRTENGALAPKQELPSALES-HEVPGTLNMGVPQIFKYGETCFPKGR
     180       190       200       210        220       230        

         230         240       250       260       270       280   
pF1KB7 SEWQQRERRRYK--CDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHH
        : ..   :. .  :::::: ::..: :  :.: :.::::: : :::::: . : :. :.
CCDS11 FERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQ
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KB7 RVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHT
       ::::: ::::: :::: ::  .:::.::::::::::::: .::. .  :: :.:::: :.
CCDS11 RVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHN
      300       310       320       330       340       350        

                 
pF1KB7 ANKLY     
       :.::      
CCDS11 AEKLLNVVKV
      360        

>>CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18           (335 aa)
 initn: 1452 init1: 492 opt: 919  Z-score: 616.6  bits: 122.5 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 919; 46.7% identity (69.6% similar) in 319 aa overlap (8-318:17-333)

                        10        20          30        40         
pF1KB7          MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYW--GQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
                       :. .:.:  : :..      ::: .  : .  : .::.::.. :
CCDS82 MSAKLGKSSSLLTQTSEECNGILTEKMEEEEQTCDPDSSLHWSSSYSPETFRQQFRQFGY
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB7 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
       ::.:::.:::..:::::. ::::: :::::::.::::::::.::::.:::::. ::::.:
CCDS82 QDSPGPHEALSRLWELCHLWLRPEVHTKEQILELLVLEQFLAILPKELQAWVQKHHPENG
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA
       ::.::.:::.::::: : .   :  .:.:.. .::::     :  . :: : : ::.  .
CCDS82 EETVTMLEDVERELDGPKQIFFG--RRKDMIAEKLAPSEITEELPSSQLMPVKKQLQGAS
              130       140         150       160       170        

     170          180       190       200       210       220      
pF1KB7 GKPQ--RNGDKT-RTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRS
        . :  :  :.  .: : .  ...      :.  .... :. .  :    .   :..:: 
CCDS82 WELQSLRPHDEDIKTTNVKSASRQKTSLGIELHCNVSNILHMNGSQSSTYRGTYEQDGRF
      180       190       200       210       220       230        

        230          240       250       260       270       280   
pF1KB7 EWQQRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHH
       : .: .   ... ::::::: ::.:: :  :.: :.:.::: ::::.::: . . :: :.
CCDS82 EKRQGNPSWKKQQKCDECGKIFSQSSALILHQRIHSGKKPYACDECAKAFSRSAILIQHR
      240       250       260       270       280       290        

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB7 RVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHT
       :.::: :::::..::: ::  ..:..:.. :  .:                         
CCDS82 RTHTGEKPYKCHDCGKAFSQSSNLFRHRKRHIRKKVP                       
      300       310       320       330                            

            
pF1KB7 ANKLY

>>CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6              (445 aa)
 initn: 2199 init1: 534 opt: 824  Z-score: 554.0  bits: 111.3 E(32554): 1.6e-24
Smith-Waterman score: 983; 44.6% identity (65.8% similar) in 377 aa overlap (7-322:16-391)

                        10          20        30        40         
pF1KB7          MTTALEPEDQKGLLIIKAE--DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
                      ::  . :: .:.:  .:   :.:  .. .:  ::..:.:::.:::
CCDS56 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
       :..::::::::.: ::: :::::.  ::::::::::::::::::::.::.::: : ::.:
CCDS56 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB7 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA
       :::: .::::::::::: ... .. .:...:  ...::..    ::.: .::. ::  ..
CCDS56 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQ-TPLTLQSQPKEPQLTCDS
              130       140       150       160        170         

     170                                                           
pF1KB7 GK-----------------------------------------PQRNG------------
       ..                                         :: .:            
CCDS56 AQKCHSIGETDLIRSLRRRAVLIPLGAHLFSTDTFLFSKPVVIPQLKGGGETWPNNRGVL
     180       190       200       210       220       230         

          180       190       200        210       220       230   
pF1KB7 -DK-TRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEI-NDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRE-
        :. :.:...::  ..: ::  :  :.. :..  . . : :.  .. :.. : : :  . 
CCDS56 RDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKDRIERQWGNL
     240       250       260       270       280       290         

              240       250       260       270       280       290
pF1KB7 --RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVK
         . ..:::::::::..:: : .:.: ::::.::.:.:::::: . : :..:. .:.  :
CCDS56 LGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFNHRGIHNIQK
     300       310       320       330       340       350         

              300       310       320       330       340          
pF1KB7 PYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY  
        :.:::::: ::  .::::::::: :::::.:                            
CCDS56 RYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRSHTGERPHQC
     360       370       380       390       400       410         

CCDS56 IECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
     420       430       440     

>>CCDS11913.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18           (333 aa)
 initn: 998 init1: 492 opt: 806  Z-score: 543.8  bits: 109.0 E(32554): 5.7e-24
Smith-Waterman score: 806; 46.4% identity (68.4% similar) in 291 aa overlap (8-290:17-305)

                        10        20          30        40         
pF1KB7          MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYW--GQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
                       :. .:.:  : :..      ::: .  : .  : .::.::.. :
CCDS11 MSAKLGKSSSLLTQTSEECNGILTEKMEEEEQTCDPDSSLHWSSSYSPETFRQQFRQFGY
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB7 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
       ::.:::.:::..:::::. ::::: :::::::.::::::::.::::.:::::. ::::.:
CCDS11 QDSPGPHEALSRLWELCHLWLRPEVHTKEQILELLVLEQFLAILPKELQAWVQKHHPENG
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA
       ::.::.:::.::::: : .   :  .:.:.. .::::     :  . :: : : ::.  .
CCDS11 EETVTMLEDVERELDGPKQIFFG--RRKDMIAEKLAPSEITEELPSSQLMPVKKQLQGAS
              130       140         150       160       170        

     170          180       190       200       210       220      
pF1KB7 GKPQ--RNGDKT-RTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRS
        . :  :  :.  .: : .  ...      :.  .... :. .  :    .   :..:: 
CCDS11 WELQSLRPHDEDIKTTNVKSASRQKTSLGIELHCNVSNILHMNGSQSSTYRGTYEQDGRF
      180       190       200       210       220       230        

        230          240       250       260       270       280   
pF1KB7 EWQQRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHH
       : .: .   ... ::::::: ::.:: :  :.: :.:.::: ::::.::: . . :: :.
CCDS11 EKRQGNPSWKKQQKCDECGKIFSQSSALILHQRIHSGKKPYACDECAKAFSRSAILIQHR
      240       250       260       270       280       290        

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB7 RVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHT
       :.::  :                                                     
CCDS11 RTHTDSKYEHAIAEAQKNMYFKTRLKCPRSLSGGR                         
      300       310       320       330                            

>>CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6            (390 aa)
 initn: 2044 init1: 574 opt: 660  Z-score: 449.0  bits: 91.7 E(32554): 1.1e-18
Smith-Waterman score: 679; 46.5% identity (69.1% similar) in 243 aa overlap (129-348:38-278)

      100       110       120       130            140          150
pF1KB7 AWVRAHHPETGEEAVTVLEDLERELDEPGKQVP----GNSERRD-ILMDKLAPLGR---P
                                     :::    :.  :.: .. ..:.: ..    
CCDS56 PGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQPLQDRVLQVPVLAHGGCCREDKVVASRLTPESQGLLK
        10        20        30        40        50        60       

              160       170                   180       190        
pF1KB7 YESLTVQLHPKKTQLEQEAG-----KPQRN-------GDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEF
        :.... : :. :: ..  :     . :.:       ::. .::...:   :..: .:: 
CCDS56 VEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELP-EKEH
        70        80        90       100       110       120       

      200       210       220       230          240       250     
pF1KB7 LGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRER---RRYKCDECGKSFSHSSDLSKHR
        :.:. .: .:  : :   .  :.::: . .:..    ::. : ::::::..:: :::::
CCDS56 -GKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHR
         130       140       150       160       170       180     

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB7 RTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHT
       : :::::::.:.:::::::  : :. :.::::: :::.:.:::: ::  . ::.::: ::
CCDS56 RIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHT
         190       200       210       220       230       240     

         320       330       340                                   
pF1KB7 GEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY                           
       ::::::::.::. :  : .:..:.::::..: :                           
CCDS56 GEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKN
         250       260       270       280       290       300     

CCDS56 VQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNAC
         310       320       330       340       350       360     

>>CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6             (538 aa)
 initn: 2389 init1: 574 opt: 660  Z-score: 447.4  bits: 91.9 E(32554): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 975; 44.8% identity (63.9% similar) in 382 aa overlap (42-348:47-426)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB7 GLLIIKAEDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREALTQLWELCRQWLR
                                     ..:: . : .: ::::::..: :::::::.
CCDS46 EDQMELLVIKVEEEEAGFPSSPDLGSEGSRERFRGFRYPEAAGPREALSRLRELCRQWLQ
         20        30        40        50        60        70      

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB7 PECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDLERELDEPGKQVP
       :: :.:::::.::::::::.::: .::.::: .:::.:::.:..:: :::.::::. :: 
CCDS46 PEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEVVVLLEYLERQLDEPAPQVS
         80        90       100       110       120       130      

             140                               150                 
pF1KB7 GNSERRDILMDKLAPL------------------------GRPYESLTVQ----------
       : .. ...:  :.: :                        ..: .. ..:          
CCDS46 GVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQPLQDRVLQVPVLAHGGCC
        140       150       160       170       180       190      

                                 160       170                     
pF1KB7 --------------------------LHPKKTQLEQEAG-----KPQRN-------GDKT
                                 : :. :: ..  :     . :.:       ::. 
CCDS46 REDKVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEK
        200       210       220       230       240       250      

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 RTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRER---RRY
       .::...:   :..: .::  :.:. .: .:  : :   .  :.::: . .:..    ::.
CCDS46 QTKSRDLPPAEELP-EKEH-GKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRH
        260       270         280       290       300       310    

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 KCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKE
        : ::::::..:: :::::: :::::::.:.:::::::  : :. :.::::: :::.:.:
CCDS46 ICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEE
          320       330       340       350       360       370    

        300       310       320       330       340                
pF1KB7 CGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY        
       ::: ::  . ::.::: ::::::::::.::. :  : .:..:.::::..: :        
CCDS46 CGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKA
          380       390       400       410       420       430    

CCDS46 FRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTG
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348 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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