Result of FASTA (omim) for pF1KE2418
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2418, 839 aa
  1>>>pF1KE2418     839 - 839 aa - 839 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  65089639 residues in 91964 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1200+/-0.000426; mu= 11.4371+/- 0.026
 mean_var=117.4843+/-23.218, 0's: 0 Z-trim(114.4): 72  B-trim: 443 in 1/52
 Lambda= 0.118327
 statistics sampled from 25141 (25213) to 25141 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.274), width:  16
 Scan time:  6.470

The best scores are:                                      opt bits E(91964)
NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1       0
NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1       0
NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1       0
NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 5554 960.1       0
NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 837) 2306 405.6  5e-112
XP_016875263 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 2306 405.7 5.2e-112
XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 2306 405.7 5.2e-112
NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 871) 2306 405.7 5.2e-112
XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 922) 2306 405.7 5.4e-112
XP_005256733 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 763) 2122 374.2 1.3e-102
NP_057197 (OMIM: 606676) transient receptor potent ( 764) 2121 374.0 1.5e-102
XP_006721604 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 733) 2111 372.3 4.7e-102
XP_011522224 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 719) 2027 358.0 9.6e-98
XP_011536936 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 793) 1977 349.5 3.9e-95
XP_016880219 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 679) 1878 332.5 4.1e-90
XP_006721606 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 680) 1877 332.4 4.7e-90
NP_001170899 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 824) 1856 328.8 6.6e-89
XP_011536933 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 875) 1856 328.8 6.9e-89
XP_011536937 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 695) 1675 297.9 1.1e-79
XP_005256735 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 548) 1480 264.5 9.8e-70
XP_016880221 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 585) 1476 263.9 1.7e-69
XP_011522225 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 531) 1474 263.5 1.9e-69
XP_016880220 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 629) 1475 263.7   2e-69
XP_005256734 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 630) 1474 263.6 2.2e-69
NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient r ( 790) 1380 247.6 1.8e-64
NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transien ( 791) 1380 247.6 1.8e-64
NP_001170904 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 764) 1274 229.5   5e-59
XP_011536935 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 815) 1274 229.5 5.3e-59
XP_011522227 (OMIM: 606676) transient receptor pot ( 334)  942 172.6 2.9e-42
NP_671737 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 811)  840 155.4 1.1e-36
XP_011536934 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 862)  840 155.4 1.1e-36
NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potent ( 729)  517 100.2 3.8e-20
NP_061116 (OMIM: 606680) transient receptor potent ( 765)  499 97.2 3.4e-19
NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor  ( 759)  189 44.2  0.0028
XP_005247796 (OMIM: 602343) short transient recept ( 661)  188 44.0  0.0028
XP_005247795 (OMIM: 602343) short transient recept ( 695)  188 44.0   0.003
XP_016862610 (OMIM: 602343) short transient recept ( 732)  188 44.1  0.0031
NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793)  188 44.1  0.0033


>>NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potential   (839 aa)
 initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554  Z-score: 5129.4  bits: 960.1 E(91964):    0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
              790       800       810       820       830         

>>NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potential   (839 aa)
 initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554  Z-score: 5129.4  bits: 960.1 E(91964):    0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
              790       800       810       820       830         

>>NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potential   (839 aa)
 initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554  Z-score: 5129.4  bits: 960.1 E(91964):    0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_542 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_542 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
              790       800       810       820       830         

>>NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potential   (839 aa)
 initn: 5554 init1: 5554 opt: 5554  Z-score: 5129.4  bits: 960.1 E(91964):    0
Smith-Waterman score: 5554; 99.8% identity (99.9% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VDCPHEEGELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AVAQNNCQDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DNTKFVTSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_061 RLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEIL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SVLGGVYFFFRGIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVAS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 IILLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKA
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 FRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KE2 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
              790       800       810       820       830         

>>NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,184095  (837 aa)
 initn: 1935 init1: 1324 opt: 2306  Z-score: 2132.8  bits: 405.6 E(91964): 5e-112
Smith-Waterman score: 2306; 49.1% identity (77.3% similar) in 721 aa overlap (98-813:100-807)

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NP_001 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
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NP_001 L
        

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pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
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pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
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pF1KE2 LALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKN
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XP_016 LVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCAN
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pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
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pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
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XP_016 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
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pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK   
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XP_016 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
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XP_016 L
        

>>XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,184095  (871 aa)
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pF1KE2 GELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAVAQNNC
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XP_005 MDSLFDYGTYRHHSSDNKRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGST
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pF1KE2 QDLESLLLFLQKSKKHLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSL
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XP_005 ADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNM
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pF1KE2 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPG-F
       .:..:. . : ::.::::::::::::    : ::: .::::.: :.: ::.  : . : :
XP_005 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
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XP_005 YFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFV
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pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
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pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
       :::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: .  :::.:: :::.:.::.:
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       :: .:    ::.: . :   :.:::..:::.:..: ::. ..   ::.:..::..... :
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pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
       : ::: .:.  :... :....::.:.  ..:.:. :........::.. .. :.: :::.
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pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
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       ::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.::   .:::::
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       ::... :: . ::  : :::::::::::. :: :.::::::::. :  .   .::   .:
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pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK   
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XP_005 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
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XP_005 L
        

>>NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,184095,18  (871 aa)
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pF1KE2 TSMYNEILILGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHL
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NP_067 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
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pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
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NP_067 SRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRD
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pF1KE2 KWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGG
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pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
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pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
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NP_067 MKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFII
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pF1KE2 LLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFR
       ::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.::   .:::::
NP_067 LLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFR
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pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
       ::... :: . ::  : :::::::::::. :: :.::::::::. :  .   .::   .:
NP_067 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
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pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK   
       .   .:..  .:: . : .    ....:.::                             
NP_067 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
        820         830           840       850       860       870

NP_067 L
        

>>XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,184095  (922 aa)
 initn: 1935 init1: 1324 opt: 2306  Z-score: 2132.2  bits: 405.7 E(91964): 5.4e-112
Smith-Waterman score: 2306; 49.1% identity (77.3% similar) in 721 aa overlap (98-813:185-892)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE2 GELDSCPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRLYDRRSIFEAVAQNNC
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XP_011 REFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQP-KDEGGYF
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XP_011 TKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHL
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pF1KE2 SRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTC-EKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQD
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XP_011 SRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNS-KIENRHEMLAVEPINELLRD
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XP_011 KWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTG
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pF1KE2 VYFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFS
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XP_011 VLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFA
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XP_011 LVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCAN
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pF1KE2 DSLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFII
        .. .:. ..      :.::  ::  ... .  :.:::.::::::::.  .  . .::::
XP_011 MKVCNEDQTNCTVPTYPSCR--DS--ETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFII
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pF1KE2 LLLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFR
       ::..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.::   .:::::
XP_011 LLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFR
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pF1KE2 SGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSR
       ::... :: . ::  : :::::::::::. :: :.::::::::. :  .   .::   .:
XP_011 SGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGR
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pF1KE2 VSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK   
       .   .:..  .:: . : .    ....:.::                             
XP_011 LRRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAP
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XP_011 L
        

>>XP_005256733 (OMIM: 606676) transient receptor potenti  (763 aa)
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                                     .::  .:.::...  .:: .:  .:.:..:
XP_005 QGEDRKFAPQIRVNLNYRKGTGASQPDPNRFDRDRLFNAVSRGVPEDLAGLPEYLSKTSK
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pF1KE2 HLTDNEFKDPETGKTCLLKAMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSLKELVNASYTDSYYKG
       .:::.:. .  ::::::.::.:::.:: :. :  ::.: :.. . . ::::. ::.::.:
XP_005 YLTDSEYTEGSTGKTCLMKAVLNLKDGVNACILPLLQIDRDSGNPQPLVNAQCTDDYYRG
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pF1KE2 QTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFYFGELPLSLAACTNQL
       ..:::::::.:..  : :::::::.:.: : : ::.: .:   ::::::::::::::.: 
XP_005 HSALHIAIEKRSLQCVKLLVENGANVHARACGRFFQKGQGT-CFYFGELPLSLAACTKQW
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pF1KE2 GIVKFLLQNSWQTADISARDSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFVTSMYNEILILGAKLHP
        .:..::.:  : :...: :: ::::::::: ..::.:.:  .:::::. .:  ::.: :
XP_005 DVVSYLLENPHQPASLQATDSQGNTVLHALVMISDNSAENIALVTSMYDGLLQAGARLCP
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pF1KE2 TLKLEELTNKKGMTPLALAAGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSL
       :..::.. : . .::: :::  ::: .. .:::::..     ::::::::: ::::. ::
XP_005 TVQLEDIRNLQDLTPLKLAAKEGKIEIFRHILQREFSG--LSHLSRKFTEWCYGPVRVSL
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pF1KE2 YDLSCIDTCEKNSVLEVIAYSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVY
       :::. .:.::.:::::.::.   ..:.:: :...::::.::: ::: .. . :..:::  
XP_005 YDLASVDSCEENSVLEIIAFHC-KSPHRHRMVVLEPLNKLLQAKWDLLIPK-FFLNFLCN
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pF1KE2 CLYMIIFTMAAYYRPV--DGLPPFKMEKIGDYFRVTGEILSVLGGVYFFFRGIQYFLQRR
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XP_005 LIYMFIFTAVAYHQPTLKKAAPHLKAE-VGNSMLLTGHILILLGGIYLLVGQLWYFWRRH
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XP_005 HTGIYSVMIQKVILRDLLRFLLIYLVFLFGFAVALVSLSQEAWRPEAPTGPNATESVQPM
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XP_005 EGQEDEGNGAQYRGILEASLELFKFTIGMGELAFQEQLHFRGMVLLLLLAYVLLTYILLL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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