Result of SIM4 for pF1KB6374

seq1 = pF1KB6374.tfa, 828 bp
seq2 = pF1KB6374/gi568815597f_27673308.tfa (gi568815597f:27673308_27922326), 249019 bp

>pF1KB6374 828
>gi568815597f:27673308_27922326 (Chr1)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-188  (116255-116324)   100% ->
189-288  (120226-120325)   100% ->
289-426  (128371-128508)   100% ->
427-470  (136939-136982)   100% ->
471-576  (138856-138961)   100% ->
577-649  (144544-144616)   100% ->
650-732  (146343-146425)   100% ->
733-828  (148924-149019)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCATACGGTCCCTTAGACATGTACCGGAACCCGGGGCCCTCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCATACGGTCCCTTAGACATGTACCGGAACCCGGGGCCCTCGGGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCTCCGGGACTTCAGCAGCATCATCCAGACGTGCAGCGGCAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCTCCGGGACTTCAGCAGCATCATCCAGACGTGCAGCGGCAACATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCGGATCAGCCAAGCCA         CTGCTCAGATAAAGAATTTGATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 AGCGGATCAGCCAAGCCAGTG...CAGCTGCTCAGATAAAGAATTTGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCCAGCTAGGAACTAAGCAGGACTCAAGCAAGCTACAGGAAAATCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116278 AGCCAGCTAGGAACTAAGCAGGACTCAAGCAAGCTACAGGAAAATCTGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       GCAACAGTTACAACACTCCACAAATCAGCTCGCCAAGGAAACAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116328 ...TAGGCAACAGTTACAACACTCCACAAATCAGCTCGCCAAGGAAACAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGAATTGCTGAAAGAATTAGGGTCCTTGCCCCTTCCCTTATCTACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120270 ATGAATTGCTGAAAGAATTAGGGTCCTTGCCCCTTCCCTTATCTACTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAACAG         CGCCAGCAGAGACTTCAGAAGGAACGCCTCATGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120320 GAACAGGTT...TAGCGCCAGCAGAGACTTCAGAAGGAACGCCTCATGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGACTTCTCTGCAGCCTTAAACAATTTCCAGGCTGTGCAGAGAAGGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128406 TGACTTCTCTGCAGCCTTAAACAATTTCCAGGCTGTGCAGAGAAGGGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGAAAAGGAAAAGGAGAGTATTGCCAGAGCAAGAGCTGGATCTCGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128456 CTGAAAAGGAAAAGGAGAGTATTGCCAGAGCAAGAGCTGGATCTCGTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCT         GCAGAAGAGAGGCAAAGAGAGGAGCAGCTGGTCTCATT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128506 TCTGTA...TAGGCAGAAGAGAGGCAAAGAGAGGAGCAGCTGGTCTCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGACAG         CCATGAGGAGTGGAACCAGATGCAGAGCCAGGAGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136977 TGACAGGTA...CAGCCATGAGGAGTGGAACCAGATGCAGAGCCAGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATGAGGTGGCCATCACTGAGCAGGATTTGGAACTTATTAAAGAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138891 ATGAGGTGGCCATCACTGAGCAGGATTTGGAACTTATTAAAGAAAGAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACGGCAATTCGGCAGCTGGAG         GCTGACATTTTGGATGTCAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 138941 ACGGCAATTCGGCAGCTGGAGGTG...TAGGCTGACATTTTGGATGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TCAGATATTTAAAGATTTGGCCATGATGATCCATGACCAGGGTGATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144564 TCAGATATTTAAAGATTTGGCCATGATGATCCATGACCAGGGTGATCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTG         ATAGCATAGAAGCCAATGTGGAAAGCTCAGAGGTGCAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144614 TTGGTA...CAGATAGCATAGAAGCCAATGTGGAAAGCTCAGAGGTGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTCGAAAGAGCCACTGAACAGTTACAGCGAGCTGCTTACTATCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 146381 GTCGAAAGAGCCACTGAACAGTTACAGCGAGCTGCTTACTATCAGGTA..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733     AAAAAATCTCGCAAGAAGATGTGTATCCTGGTGCTTGTCCTGTCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146431 .CAGAAAAAATCTCGCAAGAAGATGTGTATCCTGGTGCTTGTCCTGTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGATTATTCTAATCTTGGGACTTATTATCTGGCTAGTTTATAAAACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148970 TGATTATTCTAATCTTGGGACTTATTATCTGGCTAGTTTATAAAACGAAG

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