Result of FASTA (omim) for pF1KE0346
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0346, 635 aa
  1>>>pF1KE0346 635 - 635 aa - 635 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9551+/-0.000331; mu= 17.2556+/- 0.021
 mean_var=81.6199+/-16.791, 0's: 0 Z-trim(117.0): 51  B-trim: 847 in 1/49
 Lambda= 0.141963
 statistics sampled from 28487 (28538) to 28487 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.335), width:  16
 Scan time: 12.230

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004164 (OMIM: 603752) cationic amino acid trans ( 635) 4152 860.0       0
NP_066000 (OMIM: 615720,615725) probable cationic  ( 771) 1202 255.9   4e-67
XP_005273668 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658)  916 197.2 1.5e-49
XP_016869235 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658)  916 197.2 1.5e-49
XP_005273667 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658)  916 197.2 1.5e-49
NP_001008539 (OMIM: 601872) cationic amino acid tr ( 658)  916 197.2 1.5e-49
XP_005273669 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 658)  916 197.2 1.5e-49
NP_001158243 (OMIM: 601872) cationic amino acid tr ( 698)  916 197.3 1.6e-49
NP_003036 (OMIM: 104615) high affinity cationic am ( 629)  913 196.6 2.2e-49
XP_005266564 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 629)  913 196.6 2.2e-49
XP_016876205 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 629)  913 196.6 2.2e-49
NP_116192 (OMIM: 300443) cationic amino acid trans ( 619)  896 193.1 2.4e-48
XP_016885401 (OMIM: 300443) PREDICTED: cationic am ( 619)  896 193.1 2.4e-48
NP_001041629 (OMIM: 300443) cationic amino acid tr ( 619)  896 193.1 2.4e-48
NP_003037 (OMIM: 601872) cationic amino acid trans ( 697)  731 159.4   4e-38
XP_016869236 (OMIM: 601872) PREDICTED: cationic am ( 657)  727 158.5 6.7e-38
XP_016876202 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 643)  700 153.0 3.1e-36
XP_016876203 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 643)  700 153.0 3.1e-36
XP_016876204 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affini ( 643)  700 153.0 3.1e-36
NP_003477 (OMIM: 600182) large neutral amino acids ( 507)  421 95.8   4e-19
XP_016879224 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 509)  421 95.8   4e-19
NP_062823 (OMIM: 607959) asc-type amino acid trans ( 523)  343 79.8 2.6e-14
XP_016881719 (OMIM: 220100,604144) PREDICTED: B(0, ( 399)  314 73.8 1.3e-12
NP_001229965 (OMIM: 220100,604144) B(0,+)-type ami ( 487)  314 73.9 1.5e-12
NP_055085 (OMIM: 220100,604144) B(0,+)-type amino  ( 487)  314 73.9 1.5e-12
XP_011524704 (OMIM: 220100,604144) PREDICTED: B(0, ( 487)  314 73.9 1.5e-12
NP_001119807 (OMIM: 220100,604144) B(0,+)-type ami ( 487)  314 73.9 1.5e-12
NP_036376 (OMIM: 604235) large neutral amino acids ( 535)  314 73.9 1.6e-12
XP_006721349 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 352)  264 63.6 1.4e-09
NP_055146 (OMIM: 607933) cystine/glutamate transpo ( 501)  264 63.6 1.9e-09
XP_011530104 (OMIM: 607933) PREDICTED: cystine/glu ( 506)  264 63.6 1.9e-09
XP_016879226 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 332)  261 62.9   2e-09
XP_006723347 (OMIM: 607959) PREDICTED: asc-type am ( 444)  260 62.8   3e-09
XP_016879340 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 382)  247 60.1 1.7e-08
XP_011525421 (OMIM: 607959) PREDICTED: asc-type am ( 660)  234 57.6 1.7e-07
XP_006723055 (OMIM: 220100,604144) PREDICTED: B(0, ( 260)  217 53.9 8.5e-07
XP_016879225 (OMIM: 600182) PREDICTED: large neutr ( 467)  209 52.4 4.4e-06
XP_011521741 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 307)  198 50.0 1.5e-05
NP_001070253 (OMIM: 605641) Y+L amino acid transpo ( 515)  188 48.1 9.3e-05
XP_011521740 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 515)  188 48.1 9.3e-05
XP_011521736 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 515)  188 48.1 9.3e-05
XP_011521735 (OMIM: 605641) PREDICTED: Y+L amino a ( 515)  188 48.1 9.3e-05
NP_003974 (OMIM: 605641) Y+L amino acid transporte ( 515)  188 48.1 9.3e-05
NP_001119578 (OMIM: 222700,603593) Y+L amino acid  ( 511)  176 45.6 0.00051
XP_011535600 (OMIM: 222700,603593) PREDICTED: Y+L  ( 511)  176 45.6 0.00051
NP_001119577 (OMIM: 222700,603593) Y+L amino acid  ( 511)  176 45.6 0.00051
XP_006720365 (OMIM: 222700,603593) PREDICTED: Y+L  ( 511)  176 45.6 0.00051
XP_011535601 (OMIM: 222700,603593) PREDICTED: Y+L  ( 511)  176 45.6 0.00051


>>NP_004164 (OMIM: 603752) cationic amino acid transport  (635 aa)
 initn: 4152 init1: 4152 opt: 4152  Z-score: 4592.7  bits: 860.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4152; 99.7% identity (99.8% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSIMETSLRRCLSTLDLTLLGVGGMVGSGLYVLTG
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSTMETSLRRCLSTLDLTLLGVGGMVGSGLYVLTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 AVAKEVAGPAVLLSFGVAAVASLLAALCYAEFGARVPRTGSAYLFTYVSMGELWAFLIGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AVAKEVAGPAVLLSFGVAAVASLLAALCYAEFGARVPRTGSAYLFTYVSMGELWAFLIGW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 NVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQVPLLGHYPDFLAAGIILLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQVPLLGHYPDFLAAGIILLA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPHNWSADEGGFAPFGFSGVMAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPHNWSADEGGFAPFGFSGVMAG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 TASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISLAIAAGAYILVSTVLTLMVPWHSLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISLAIAAGAYILVSTVLTLMVPWHSLD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 PDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSLLFSLPRIVYAMATDGLFFQVFAHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_004 PDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSLLFSLPRIVYAMAADGLFFQVFAHV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 HPRTQVPVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSLGTLLAYTFVATSIIVLRFQKSSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HPRTQVPVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSLGTLLAYTFVATSIIVLRFQKSSPP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 SSPGPASPGPLTKQQSSFSDHLQLVGTVHASVPEPGELKPALRPYLGFLDGYSPGAVVTW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSPGPASPGPLTKQQSSFSDHLQLVGTVHASVPEPGELKPALRPYLGFLDGYSPGAVVTW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 ALGVMLASAITIGCVLVFGNSTLHLPHWGYILLLLLTSVMFLLSLLVLGAHQQQYREDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALGVMLASAITIGCVLVFGNSTLHLPHWGYILLLLLTSVMFLLSLLVLGAHQQQYREDLF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 QIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTWVRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHSKENQRELPGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTWVRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHSKENQRELPGL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630     
pF1KE0 NSTHYVVFPRGSLEETVQAMQPPSQAPAQDPGHME
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NSTHYVVFPRGSLEETVQAMQPPSQAPAQDPGHME
              610       620       630     

>>NP_066000 (OMIM: 615720,615725) probable cationic amin  (771 aa)
 initn: 1053 init1: 813 opt: 1202  Z-score: 1326.1  bits: 255.9 E(85289): 4e-67
Smith-Waterman score: 1382; 38.8% identity (66.8% similar) in 659 aa overlap (17-590:25-677)

                       10        20        30                 40   
pF1KE0         MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSIME---------TSLRRCLSTLDLT
                               .. : ::.: :..:         :.: . :.:.:: 
NP_066 MSGFFTSLDPRRVQWGAAWYAMHSRILRTKPVE-SMLEGTGTTTAHGTKLAQVLTTVDLI
               10        20        30         40        50         

            50        60        70        80        90        100  
pF1KE0 LLGVGGMVGSGLYVLTGAVAKEVAGPAVLLSFGVAAVASLLAALCYAEFGARVPRT-GSA
        ::::. ::.:.::..: ::::.:::.:..:: .:::::.:...::::::.:::.: :::
NP_066 SLGVGSCVGTGMYVVSGLVAKEMAGPGVIVSFIIAAVASILSGVCYAEFGVRVPKTTGSA
      60        70        80        90       100       110         

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE0 YLFTYVSMGELWAFLIGWNVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQV
       : ..::..::. ::.::::..:::.:: :: : : :...::. .:.:  .    ::. . 
NP_066 YTYSYVTVGEFVAFFIGWNLILEYLIGTAAGASALSSMFDSLANHTISRWMADSVGTLNG
     120       130       140       150       160       170         

              170       180       190       200       210       220
pF1KE0 PLLGH--YPDFLAAGIILLASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPH
          :.  :::.::  : .... .:. :.. :  .:.......: : .::.: :... . .
NP_066 LGKGEESYPDLLALLIAVIVTIIVALGVKNSIGFNNVLNVLNLAVWVFIMIAGLFFINGK
     180       190       200       210       220       230         

              230       240       250       260       270       280
pF1KE0 NWSADEGGFAPFGFSGVMAGTASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISLAIAA
        :.  :: : : :.:::. :.:.:::::.:::.::...:::.::  :.: ::. ::.:  
NP_066 YWA--EGQFLPHGWSGVLQGAATCFYAFIGFDIIATTGEEAKNPNTSIPYAITASLVICL
     240         250       260       270       280       290       

              290       300       310       320       330       340
pF1KE0 GAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSLLFSL
        ::. ::..::::::....: .: : . :  .:.  : :.:: ::. .... ::. :: .
NP_066 TAYVSVSVILTLMVPYYTIDTESPLMEMFVAHGFYAAKFVVAIGSVAGLTVSLLGSLFPM
       300       310       320       330       340       350       

              350       360       370       380       390       400
pF1KE0 PRIVYAMATDGLFFQVFAHVHPRTQVPVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSLGTLL
       ::..:::: :::.:. .:::   :..::.. .. :.:.:.::::..:..:....:.::::
NP_066 PRVIYAMAGDGLLFRFLAHVSSYTETPVVACIVSGFLAALLALLVSLRDLIEMMSIGTLL
       360       370       380       390       400       410       

              410                                    420       430 
pF1KE0 AYTFVATSIIVLRFQKSSP-----------------------------PSSPGPASPGPL
       :::.:.. ...::.:  :                              : : :    :: 
NP_066 AYTLVSVCVLLLRYQPESDIDGFVKFLSEEHTKKKEGILADCEKEACSPVSEGDEFSGPA
       420       430       440       450       460       470       

                  440            450                          460  
pF1KE0 T-----KQQSSFSDHLQLVG-----TVHASVPEPG-------------------ELKPAL
       :     :.  :..:. .:.:     : ... :. :                   .::  .
NP_066 TNTCGAKNLPSLGDNEMLIGKSDKSTYNVNHPNYGTVDMTTGIEADESENIYLIKLKKLI
       480       490       500       510       520       530       

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       .: :::  .::....:: .::.::..:.:::::::::::.::::::.:::..::::::. 
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XP_005 SIGTLMAYSLVAACVLILRYQPGLSYDQPKCSPEKDGLGSSPRVTSKSESQVT-MLQRQG
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pF1KE0 TVHASVPEPGELKPALRPYLGFLDGYSPGAVVTWALGVMLASAITIGCVLVFG-NSTLHL
           ..     . :.: :        . ...:.. .: .   .. .. . ..: ..  .:
XP_005 FSMRTL-----FCPSLLPT------QQSASLVSFLVGFLAFLVLGLSVLTTYGVHAITRL
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pF1KE0 PHWGYILLLLLTSVMFLLSLLVLGAHQQQYREDLFQIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSY
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pF1KE0 LTWVRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHSKENQRELPGLNSTHYVVFPRGSLEETVQAMQPPSQ
        ::::::::. .:. .::.:::::: :..                               
XP_005 DTWVRFSIWMAIGFLIYFSYGIRHSLEGHLRDENNEEDAYPDNVHAAAEEKSAIQANDHH
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>>NP_001158243 (OMIM: 601872) cationic amino acid transp  (698 aa)
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Smith-Waterman score: 1589; 41.1% identity (72.6% similar) in 627 aa overlap (3-594:40-650)

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pF1KE0                             MARGLPTIASL--ARLCQKLNRLKPLEDSIME
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NP_001 SDKLICRGFIGTPAPPVCDSKFLLSPSSDVRMIPCRAALTFAR-CLIRRKIVTL-DSLED
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NP_001 TKLCRCLSTMDLIALGVGSTLGAGVYVLAGEVAKADSGPSIVVSFLIAALASVMAGLCYA
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pF1KE0 EFGARVPRTGSAYLFTYVSMGELWAFLIGWNVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIR
       :::::::.::::::.:::..::::::. :::..: :.:: ..::::::: .: ..:..: 
NP_001 EFGARVPKTGSAYLYTYVTVGELWAFITGWNLILSYVIGTSSVARAWSGTFDELLSKQIG
       130       140       150       160       170       180       

              160       170       180       190       200       210
pF1KE0 NFTETHVGSWQVPLLGHYPDFLAAGIILLASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIV
       .: .:.    .   :..::::.:. .::: ....: :.. :.:.:..:.:...::.::..
NP_001 QFLRTYF-RMNYTGLAEYPDFFAVCLILLLAGLLSFGVKESAWVNKVFTAVNILVLLFVM
       190        200       210       220       230       240      

              220                               230       240      
pF1KE0 ILGFILAQPHNWSADE------------------------GGFAPFGFSGVMAGTASCFY
       . ::. ..  ::. .:                        ::: :.::.:..::.:.:::
NP_001 VAGFVKGNVANWKISEEFLKNISASAREPPSENGTSIYGAGGFMPYGFTGTLAGAATCFY
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        250       260       270       280       290       300      
pF1KE0 AFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISLAIAAGAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALA
       :::::: ::...::..::....:..:. :: .   ::. ::..::::.:.. ::  : : 
NP_001 AFVGFDCIATTGEEVRNPQKAIPIGIVTSLLVCFMAYFGVSAALTLMMPYYLLDEKSPLP
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        310       320       330       340       350       360      
pF1KE0 DAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSLLFSLPRIVYAMATDGLFFQVFAHVHPRTQV
        ::   :.  : ..:::::.::..: ::. .: .::..:::: :::.:. .:... .:..
NP_001 VAFEYVGWGPAKYVVAAGSLCALSTSLLGSIFPMPRVIYAMAEDGLLFKCLAQINSKTKT
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        370       380       390       400       410                
pF1KE0 PVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSLGTLLAYTFVATSIIVLRFQ--------KSS
       :. .::. : ..:..:.:.::..::...:.:::.::..::. ...::.:        : :
NP_001 PIIATLSSGAVAALMAFLFDLKALVDMMSIGTLMAYSLVAACVLILRYQPGLSYDQPKCS
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pF1KE0 PPSSPGPASPGPLTKQQSSFSDHLQLVGTVHASVPEPGELKPALRPYLGFLDGYSPGAVV
       : ..   .::   .:..:. .  ::  :    ..     . :.: :        . ...:
NP_001 PEKDGLGSSPRVTSKSESQVT-MLQRQGFSMRTL-----FCPSLLPT------QQSASLV
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pF1KE0 TWALGVMLASAITIGCVLVFG-NSTLHLPHWGYILLLLLTSVMFLLSLLVLGAHQQQYRE
       .. .: .   .. .. . ..: ..  .:  :.  :: :.  :.:.  .:..  . :. ..
NP_001 SFLVGFLAFLVLGLSVLTTYGVHAITRLEAWSLALLALFL-VLFVAIVLTIWRQPQNQQK
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       540       550       560       570       580       590       
pF1KE0 DLFQIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTWVRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHSKENQREL
         :..:..:..::.::..:: ::..::  ::::::::. .:. .::.:::::: :..   
NP_001 VAFMVPFLPFLPAFSILVNIYLMVQLSADTWVRFSIWMAIGFLIYFSYGIRHSLEGHLRD
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pF1KE0 PGLNSTHYVVFPRGSLEETVQAMQPPSQAPAQDPGHME       
                                                    
NP_001 ENNEEDAYPDNVHAAAEEKSAIQANDHHPRNLSSPFIFHEKTSEF
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>>NP_003036 (OMIM: 104615) high affinity cationic amino   (629 aa)
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pF1KE0 MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSIMETSLRRCLSTLDLTLLGVGGMVGSGLYVLTG
                 :  . :.. : : .. :  :: : :::.:.::. ::::. .:.:.:::.:
NP_003      MGCKVLLNIGQQMLRRKVVDCSREETRLSRCLNTFDLVALGVGSTLGAGVYVLAG
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pF1KE0 AVAKEVAGPAVLLSFGVAAVASLLAALCYAEFGARVPRTGSAYLFTYVSMGELWAFLIGW
       :::.: ::::...:: .::.::.::.:::.:::::::.::::::..::..::::::. ::
NP_003 AVARENAGPAIVISFLIAALASVLAGLCYGEFGARVPKTGSAYLYSYVTVGELWAFITGW
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pF1KE0 NVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQVP-LLGHYPDFLAAGIILL
       :..: :::: ..::::::. .: .... : .:..::. . ..: .:.. ::..:. :::.
NP_003 NLILSYIIGTSSVARAWSATFDELIGRPIGEFSRTHM-TLNAPGVLAENPDIFAVIIILI
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pF1KE0 ASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPHNWSADE-------------
        ..... :.. :. .:. :. :..::. ::.. ::. .. .::.  :             
NP_003 LTGLLTLGVKESAMVNKIFTCINVLVLGFIMVSGFVKGSVKNWQLTEEDFGNTSGRLCLN
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pF1KE0 ----------GGFAPFGFSGVMAGTASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISL
                 ::: :::::::..:.:.::::::::: ::...::..::....:..:. ::
NP_003 NDTKEGKPGVGGFMPFGFSGVLSGAATCFYAFVGFDCIATTGEEVKNPQKAIPVGIVASL
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pF1KE0 AIAAGAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSL
        :   ::. ::..::::.:.  :: .: : ::: . :.. : . ::.::.::... ::. 
NP_003 LICFIAYFGVSAALTLMMPYFCLDNNSPLPDAFKHVGWEGAKYAVAVGSLCALSASLLGS
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pF1KE0 LFSLPRIVYAMATDGLFFQVFAHVHPRTQVPVAGTLAFGLLTAFLALLLDLESLVQFLSL
       .: .::..:::: :::.:. .:.:. ::..:. .::: : ..: .:.:.::..::...:.
NP_003 MFPMPRVIYAMAEDGLLFKFLANVNDRTKTPIIATLASGAVAAVMAFLFDLKDLVDLMSI
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pF1KE0 GTLLAYTFVATSIIVLRFQKSSPPSSPGPASPGPLTKQQSSFSDHLQLVGTVHASV---P
       ::::::..::. ..:::.:    : .:. .     :... . .:. .:..:  ...   :
NP_003 GTLLAYSLVAACVLVLRYQ----PEQPNLVYQMASTSDELDPADQNELASTNDSQLGFLP
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pF1KE0 EPG--ELKPALRPYLGFLDGYSPGAVVTWALGVMLASAITIGCVLVFGNSTLHLPHWGYI
       :     ::  : :  ..  .   : .:. . ... .  ::.  : :.:  .:     : .
NP_003 EAEMFSLKTILSPK-NMEPSKISGLIVNISTSLIAVLIITFCIVTVLGREALTK---GAL
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pF1KE0 LLLLLTSVMFLLSLLVLGA--HQQQYREDL-FQIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTW
         ..: .   ::  .: :.  .: . .  : :..:..:..: ::: .:. ::..:.  ::
NP_003 WAVFLLAGSALLCAVVTGVIWRQPESKTKLSFKVPFLPVLPILSIFVNVYLMMQLDQGTW
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pF1KE0 VRFSIWLLMGLAVYFGYGIRHSKENQRELPGLNSTHYVVFPRGSLEETVQAMQPPSQAPA
       :::..:.:.:. .:::::. ::.:                                    
NP_003 VRFAVWMLIGFIIYFGYGLWHSEEASLDADQARTPDGNLDQCK                 
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>>XP_005266564 (OMIM: 104615) PREDICTED: high affinity c  (629 aa)
 initn: 1523 init1: 854 opt: 913  Z-score: 1007.5  bits: 196.6 E(85289): 2.2e-49
Smith-Waterman score: 1551; 42.0% identity (73.1% similar) in 614 aa overlap (11-592:6-610)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MARGLPTIASLARLCQKLNRLKPLEDSIMETSLRRCLSTLDLTLLGVGGMVGSGLYVLTG
                 :  . :.. : : .. :  :: : :::.:.::. ::::. .:.:.:::.:
XP_005      MGCKVLLNIGQQMLRRKVVDCSREETRLSRCLNTFDLVALGVGSTLGAGVYVLAG
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       :::.: ::::...:: .::.::.::.:::.:::::::.::::::..::..::::::. ::
XP_005 AVARENAGPAIVISFLIAALASVLAGLCYGEFGARVPKTGSAYLYSYVTVGELWAFITGW
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pF1KE0 NVLLEYIIGGAAVARAWSGYLDSMFSHSIRNFTETHVGSWQVP-LLGHYPDFLAAGIILL
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XP_005 NLILSYIIGTSSVARAWSATFDELIGRPIGEFSRTHM-TLNAPGVLAENPDIFAVIIILI
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pF1KE0 ASAFVSCGARVSSWLNHTFSAISLLVILFIVILGFILAQPHNWSADE-------------
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pF1KE0 ----------GGFAPFGFSGVMAGTASCFYAFVGFDVIAASSEEAQNPRRSVPLAIAISL
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XP_005 NDTKEGKPGVGGFMPFGFSGVLSGAATCFYAFVGFDCIATTGEEVKNPQKAIPVGIVASL
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pF1KE0 AIAAGAYILVSTVLTLMVPWHSLDPDSALADAFYQRGYRWAGFIVAAGSICAMNTVLLSL
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XP_005 LICFIAYFGVSAALTLMMPYFCLDNNSPLPDAFKHVGWEGAKYAVAVGSLCALSASLLGS
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XP_005 MFPMPRVIYAMAEDGLLFKFLANVNDRTKTPIIATLASGAVAAVMAFLFDLKDLVDLMSI
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pF1KE0 GTLLAYTFVATSIIVLRFQKSSPPSSPGPASPGPLTKQQSSFSDHLQLVGTVHASV---P
       ::::::..::. ..:::.:    : .:. .     :... . .:. .:..:  ...   :
XP_005 GTLLAYSLVAACVLVLRYQ----PEQPNLVYQMASTSDELDPADQNELASTNDSQLGFLP
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pF1KE0 EPG--ELKPALRPYLGFLDGYSPGAVVTWALGVMLASAITIGCVLVFGNSTLHLPHWGYI
       :     ::  : :  ..  .   : .:. . ... .  ::.  : :.:  .:     : .
XP_005 EAEMFSLKTILSPK-NMEPSKISGLIVNISTSLIAVLIITFCIVTVLGREALTK---GAL
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pF1KE0 LLLLLTSVMFLLSLLVLGA--HQQQYREDL-FQIPMVPLIPALSIVLNICLMLKLSYLTW
         ..: .   ::  .: :.  .: . .  : :..:..:..: ::: .:. ::..:.  ::
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