seq1 = pF1KB6856.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KB6856/gi568815596f_3475610.tfa (gi568815596f:3475610_3680879), 205270 bp

>pF1KB6856 582
>gi568815596f:3475610_3680879 (Chr2)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-147  (100208-100279)   100% ->
148-291  (100878-101021)   100% ->
292-356  (102101-102165)   100% ->
357-507  (104501-104651)   100% ->
508-582  (105196-105270)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAGTTCGAGCGCCAAGATCGTGAAGCCCAATGGCGAGAAGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAGTTCGAGCGCCAAGATCGTGAAGCCCAATGGCGAGAAGCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGTTCGAGTCCGGCATCTCCCAG         GCTCTTCTGGAGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 CGAGTTCGAGTCCGGCATCTCCCAGGTG...TAGGCTCTTCTGGAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATGAACTCGGACCTCAAGGCTCAGCTCAGGGAGCTGAATATTACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100224 AGATGAACTCGGACCTCAAGGCTCAGCTCAGGGAGCTGAATATTACGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTAAG         GAAATTGAAGTTGGTGGTGGTCGGAAAGCTATCAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100274 GCTAAGGTA...TAGGAAATTGAAGTTGGTGGTGGTCGGAAAGCTATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATCTTTGTTCCCGTTCCTCAACTGAAATCTTTCCAGAAAATCCAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100913 AATCTTTGTTCCCGTTCCTCAACTGAAATCTTTCCAGAAAATCCAAGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGCTAGTACGCGAATTGGAGAAAAAGTTCAGTGGGAAGCATGTCGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100963 GGCTAGTACGCGAATTGGAGAAAAAGTTCAGTGGGAAGCATGTCGTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCGCTCAG         AGGAGAATTCTGCCTAAGCCAACTCGAAAAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101013 ATCGCTCAGGTA...CAGAGGAGAATTCTGCCTAAGCCAACTCGAAAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGTACAAAAAATAAGCAAAAGCGTCCCAGGAG         CCGTACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102133 CCGTACAAAAAATAAGCAAAAGCGTCCCAGGAGGTG...TAGCCGTACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGACAGCTGTGCACGATGCCATCCTTGAGGACTTGGTCTTCCCAAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104509 TGACAGCTGTGCACGATGCCATCCTTGAGGACTTGGTCTTCCCAAGCGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTGTGGGCAAGAGAATCCGCGTCAAACTAGATGGCAGCCGGCTCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104559 ATTGTGGGCAAGAGAATCCGCGTCAAACTAGATGGCAGCCGGCTCATAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGTTCATTTGGACAAAGCACAGCAGAACAATGTGGAACACAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104609 GGTTCATTTGGACAAAGCACAGCAGAACAATGTGGAACACAAGGTA...T

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    508   GTTGAAACTTTTTCTGGTGTCTATAAGAAGCTCACGGGCAAGGATGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105194 AGGTTGAAACTTTTTCTGGTGTCTATAAGAAGCTCACGGGCAAGGATGTT

    600     .    :    .    :    .
    556 AATTTTGAATTCCCAGAGTTTCAATTG
        |||||||||||||||||||||||||||
 105244 AATTTTGAATTCCCAGAGTTTCAATTG