Result of FASTA (ccds) for pF1KB7337
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7337, 1043 aa
  1>>>pF1KB7337 1043 - 1043 aa - 1043 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5776+/-0.00111; mu= 15.5594+/- 0.066
 mean_var=100.5729+/-20.370, 0's: 0 Z-trim(105.0): 71  B-trim: 39 in 1/49
 Lambda= 0.127889
 statistics sampled from 8125 (8194) to 8125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.252), width:  16
 Scan time:  3.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33119.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19      (1043) 7056 1313.4       0
CCDS82401.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19      (1036) 6974 1298.3       0
CCDS7776.1 NLRP14 gene_id:338323|Hs108|chr11       (1093) 2117 402.2 3.2e-111
CCDS54319.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19        (1040) 1727 330.2 1.4e-89
CCDS54318.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19        (1039) 1719 328.7 3.9e-89
CCDS12913.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19        (1062) 1719 328.7   4e-89
CCDS12937.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19       (1048) 1571 301.4 6.5e-81
CCDS12934.1 NLRP9 gene_id:338321|Hs108|chr19       ( 991) 1411 271.9 4.8e-72
CCDS82402.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19       (1029) 1201 233.2 2.3e-60
CCDS74458.1 NLRP11 gene_id:204801|Hs108|chr19      ( 934) 1199 232.8 2.7e-60
CCDS12935.1 NLRP11 gene_id:204801|Hs108|chr19      (1033) 1199 232.8 2.9e-60
CCDS12864.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19       (1061)  954 187.6 1.2e-46
CCDS62785.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19       (1062)  938 184.6 9.4e-46
CCDS12938.1 NLRP5 gene_id:126206|Hs108|chr19       (1200)  719 144.3 1.5e-33
CCDS60680.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11       ( 891)  695 139.8 2.6e-32
CCDS7693.1 NLRP6 gene_id:171389|Hs108|chr11        ( 892)  695 139.8 2.6e-32
CCDS62784.1 NLRP12 gene_id:91662|Hs108|chr19       (1004)  647 130.9 1.3e-29
CCDS1632.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1         (1036)  639 129.5 3.7e-29
CCDS46183.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19       (1037)  639 129.5 3.7e-29
CCDS7697.1 RNH1 gene_id:6050|Hs108|chr11           ( 461)  614 124.7 4.6e-28
CCDS12912.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19       (1009)  605 123.2 2.8e-27
CCDS44347.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1        ( 979)  551 113.2 2.8e-24
CCDS33109.1 NLRP7 gene_id:199713|Hs108|chr19       ( 980)  544 111.9 6.7e-24
CCDS12936.1 NLRP4 gene_id:147945|Hs108|chr19       ( 994)  528 109.0 5.3e-23
CCDS44346.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1        ( 979)  512 106.0   4e-22
CCDS1633.1 NLRP3 gene_id:114548|Hs108|chr1         ( 922)  453 95.1 7.3e-19
CCDS32537.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1375)  396 84.7 1.5e-15
CCDS42245.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1429)  396 84.7 1.5e-15
CCDS42246.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1473)  396 84.7 1.6e-15
CCDS58508.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1399)  394 84.3 1.9e-15
CCDS42244.1 NLRP1 gene_id:22861|Hs108|chr17        (1443)  394 84.3   2e-15
CCDS7784.1 NLRP10 gene_id:338322|Hs108|chr11       ( 655)  372 80.1 1.7e-14
CCDS73817.1 NLRC3 gene_id:197358|Hs108|chr16       (1065)  318 70.2 2.6e-11


>>CCDS33119.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19           (1043 aa)
 initn: 7056 init1: 7056 opt: 7056  Z-score: 7035.5  bits: 1313.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7056; 100.0% identity (100.0% similar) in 1043 aa overlap (1-1043:1-1043)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQAQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQAQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEELQRLLDPNRTRAQAQTIVLVGRAGVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEELQRLLDPNRTRAQAQTIVLVGRAGVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 KTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIRYMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIRYMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTDWYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTDWYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 ITIKTWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLRVYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNETLFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ITIKTWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLRVYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNETLFH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 SCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTTTSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPGQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTTTSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPGQW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 RALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPFIDSLYEFNILQKINDCGGCTTFTHLSFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPFIDSLYEFNILQKINDCGGCTTFTHLSFQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 EFFAAMSFVLEEPREFPPHSTKPQEMKMLLQHVLLDKEAYWTPVVLFFFGLLNKNIAREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EFFAAMSFVLEEPREFPPHSTKPQEMKMLLQHVLLDKEAYWTPVVLFFFGLLNKNIAREL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 EDTLHCKISPRVMEELLKWGEELGKAESASLQFHILRLFHCLHESQEEDFTKKMLGRIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDTLHCKISPRVMEELLKWGEELGKAESASLQFHILRLFHCLHESQEEDFTKKMLGRIFE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 VDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSVSSHILERDLEILETSKFDSRMHAWNSICS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSVSSHILERDLEILETSKFDSRMHAWNSICS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 TLVTNENLHELDLSNSKLHASSVKGLCLALKNPRCKVQKLTCKSVTPEWVLQDLIIALQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TLVTNENLHELDLSNSKLHASSVKGLCLALKNPRCKVQKLTCKSVTPEWVLQDLIIALQG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 NSKLTHLNFSSNKLGMTVPLILKALRHSACNLKYLCLEKCNLSAASCQDLALFLTSIQHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NSKLTHLNFSSNKLGMTVPLILKALRHSACNLKYLCLEKCNLSAASCQDLALFLTSIQHV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 TRLCLGFNRLQDDGIKLLCAALTHPKCALERLELWFCQLAAPACKHLSDALLQNRSLTHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TRLCLGFNRLQDDGIKLLCAALTHPKCALERLELWFCQLAAPACKHLSDALLQNRSLTHL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 NLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPDGNLQSLNLSGCSFTREGCGELANALSHNHNVKILDLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPDGNLQSLNLSGCSFTREGCGELANALSHNHNVKILDLG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 ENDLQDDGVKLLCEALKPHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSSKSLVNLNLLGNEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENDLQDDGVKLLCEALKPHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSSKSLVNLNLLGNEL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040   
pF1KB7 DTDGVKMLCKALKKSTCRLQKLG
       :::::::::::::::::::::::
CCDS33 DTDGVKMLCKALKKSTCRLQKLG
             1030      1040   

>>CCDS82401.1 NLRP13 gene_id:126204|Hs108|chr19           (1036 aa)
 initn: 6967 init1: 6967 opt: 6974  Z-score: 6953.8  bits: 1298.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6974; 99.4% identity (99.6% similar) in 1039 aa overlap (1-1039:1-1036)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQAQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQAQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEELQRLLDPNRTRAQAQTIVLVGRAGVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEELQRLLDPNRTRAQAQTIVLVGRAGVG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 KTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIRYMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIRYMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTDWYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTDWYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ITIKTWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLRVYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNETLFH
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTTTSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPGQW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPFIDSLYEFNILQKINDCGGCTTFTHLSFQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS82 EDTLHCKISPRVMEELLKWGEELGKAESASLQFHILRLFHCLHESQEEDFTKKMLGRIFE
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CCDS82 VDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSVSSHILERDLEILETSKFDSRMHAWNSICS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TLVTNENLHELDLSNSKLHASSVKGLCLALKNPRCKVQKLTCKSVTPEWVLQDLIIALQG
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CCDS82 NSKLTHLNFSSNKLGMTVPLILKALRHSACNLKYLCLEKCNLSAASCQDLALFLTSIQHV
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pF1KB7 TRLCLGFNRLQDDGIKLLCAALTHPKCALERLELWFCQLAAPACKHLSDALLQNRSLTHL
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CCDS82 NLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPDGNLQSLNLSGCSFTREGCGELANALSHNHNVKILDLG
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pF1KB7 ENDLQDDGVKLLCEALKPHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSSKSLVNLNLLGNEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ENDLQDDGVKLLCEALKPHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSSKSLVNLNLLGNEL
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pF1KB7 DTDGVKMLCKALKKSTCRLQKLG
       :::::::::  .:: :: .    
CCDS82 DTDGVKMLC--FKK-TCTM    
               1030           

>>CCDS7776.1 NLRP14 gene_id:338323|Hs108|chr11            (1093 aa)
 initn: 1546 init1: 829 opt: 2117  Z-score: 2110.3  bits: 402.2 E(32554): 3.2e-111
Smith-Waterman score: 2203; 38.6% identity (65.7% similar) in 1041 aa overlap (16-1043:14-992)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
                      ::: ::  :.. .:. ::: :  .. :.    :.  .   :: ..
CCDS77   MADSSSSSFFPDFGLLLYLEELNKEELNTFKLFL--KETME----PEHGLT--PWNEV
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pF1KB7 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQE
       . :   .:. :. ...:  .::.: : ::  ::: .:::... :.. ..::         
CCDS77 KKARREDLANLMKKYYPGEKAWSVSLKIFGKMNLKDLCERAKEEINWSAQT---------
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pF1KB7 DLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQAQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKY
                :         :.. .  : .:.   : ..: .                  :
CCDS77 --------IG---------PDDAKAGETQEDQEAVLGDGTE------------------Y
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pF1KB7 RENMKAELLETWDNISW---PKDHVYIRNTSKDEHEELQRLLDPN-RTRAQAQTIVLVGR
       :. .: ..  :::. :    :.:  . .. .. ... :..:.: . .: :: : .:: : 
CCDS77 RNRIKEKFCITWDKKSLAGKPED--FHHGIAEKDRKLLEHLFDVDVKTGAQPQIVVLQGA
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pF1KB7 AGVGKTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIRYMKETTFAELISLDWPDFDAPI
       ::::::::. .::: ::.: :.::::.:::::. ..:  .:: .::.::: :::. ..::
CCDS77 AGVGKTTLVRKAMLDWAEGSLYQQRFKYVFYLNGREINQLKERSFAQLISKDWPSTEGPI
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pF1KB7 EEFMSQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTDWYQELPVTKILHSLLKKELVPL
       ::.: :: .::::::.:.:. ..  . :     . : :: :: ::. .. :::.: ..: 
CCDS77 EEIMYQPSSLLFIIDSFDELNFAFEEPEF----ALCEDWTQEHPVSFLMSSLLRKVMLPE
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pF1KB7 ATLLITIKTWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLRVYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNE
       :.::.: .    . ::  : :  .:.. :.. :  . :... :.:.  . :....:..::
CCDS77 ASLLVTTRLTTSKRLKQLLKNHHYVELLGMSEDAREEYIYQFFEDKRWAMKVFSSLKSNE
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pF1KB7 TLFHSCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTTTSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSW
        ::  :..:.:::..:.::::   .  :.    ::::.:.. ..:.::.   :: .. : 
CCDS77 MLFSMCQVPLVCWAACTCLKQQMEKGGDVTLTCQTTTALFTCYISSLFTP--VDGGSPSL
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pF1KB7 PGQ--WRALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPFIDSLYEFNILQKINDCGGCTTF
       :.:   : ::..: .:.:.:...: .:. .  ::    ..:... ::.::  .  .: .:
CCDS77 PNQAQLRRLCQVAAKGIWTMTYVFYRENLRRLGLTQSDVSSFMDSNIIQKDAEYENCYVF
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pF1KB7 THLSFQEFFAAMSFVLEEPREFPPHSTKP-QEMKMLLQHVLLDKEAYWTPVVLFFFGLLN
       :::  ::::::: ..:.   :    : .: ...: ::: .   :. . : .  :.:::::
CCDS77 THLHVQEFFAAMFYMLKGSWEAGNPSCQPFEDLKSLLQSTSY-KDPHLTQMKCFLFGLLN
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pF1KB7 KNIARELEDTLHCKISPRVMEELLKWGEELGKAESASLQFHILRLFHCLHESQEEDFTKK
       .. ...:: :..::.: ..  .::.  : ::... .  :. .:.:::::.:.:.. : ..
CCDS77 EDRVKQLERTFNCKMSLKIKSKLLQCMEVLGNSDYSPSQLGFLELFHCLYETQDKAFISQ
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pF1KB7 MLGRIF-EVDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSVSSHILERDLEI-LETSKFDS-
        . : : .: .:: :  .: .::::::::. :  .::::.  . .. :.  : :. .:. 
CCDS77 AM-RCFPKVAINICEKIHLLVSSFCLKHCRCLRTIRLSVTVVFEKKILKTSLPTNTWDGD
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pF1KB7 RM-HAWNSICSTLVTNENLHELDLSNSKLHASSVKGLCLALKNPRCKVQKLTCKSVTPEW
       :. : :...::.: :::.:.:::: .:.:  :... :   :..: ::.:::  : .:   
CCDS77 RITHCWQDLCSVLHTNEHLRELDLYHSNLDKSAMNILHHELRHPNCKLQKLLLKFITFPD
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pF1KB7 VLQDLIIALQGNSKLTHLNFSSNKLGMT-VPLILKALRHSACNLKYLCLEKCNLSAASCQ
         ::.  .:  :..: ::..... .: . :  . .::.:  :.:. : ::.:::..  : 
CCDS77 GCQDISTSLIHNKNLMHLDLKGSDIGDNGVKSLCEALKHPECKLQTLRLESCNLTVFCCL
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pF1KB7 DLALFLTSIQHVTRLCLGFNRLQDDGIKLLCAALTHPKCALERLELWFCQLAAPACKHLS
       ...  :   : .  : :. : : :::..::: :: :::: :::: :  : :.  .:..::
CCDS77 NISNALIRSQSLIFLNLSTNNLLDDGVQLLCEALRHPKCYLERLSLESCGLTEAGCEYLS
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pF1KB7 DALLQNRSLTHLNLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPDGNLQSLNLSGCSFTREGCGELANAL
        ::..:. :::: :. : : : :::.. .:: . . .:.:: :  : ::  .   :...:
CCDS77 LALISNKRLTHLCLADNVLGDGGVKLMSDALQHAQCTLKSLVLRRCHFTSLSSEYLSTSL
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pF1KB7 SHNHNVKILDLGENDLQDDGVKLLCEALK-PHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSS
        ::...  :::: : :::.::::::.... :   :. : :  : ::.:::  : ::. ..
CCDS77 LHNKSLTHLDLGSNWLQDNGVKLLCDVFRHPSCNLQDLELMGCVLTNACCLDLASVILNN
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pF1KB7 KSLVNLNLLGNELDTDGVKMLCKALKKSTCRLQKLG                        
        .: .:.: .:.:. ::::.:: ::.  .: .:.::                        
CCDS77 PNLRSLDLGNNDLQDDGVKILCDALRYPNCNIQRLGLEYCGLTSLCCQDLSSALICNKRL
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CCDS77 IKMNLTQNTLGYEGIVKLYKVLKSPKCKLQVLGLCKEAFDEEAQKLLEAVGVSNPHLIIK
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>>CCDS54319.1 NLRP2 gene_id:55655|Hs108|chr19             (1040 aa)
 initn: 897 init1: 717 opt: 1727  Z-score: 1721.8  bits: 330.2 E(32554): 1.4e-89
Smith-Waterman score: 1735; 32.8% identity (62.0% similar) in 1053 aa overlap (5-1042:1-994)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
           ...  . : :  :   :  :.: .: .::       :.  .:  . .. .::  ..
CCDS54     MVSSAQMGFN--LQALLEQLSQDELSKFKY------LITTFSLAH-ELQKIPHKEV
                   10          20              30         40       

               70        80        90       100        110         
pF1KB7 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKEN-VQTQELQDPTQ
         ::  .:  .:  :  .  .  . : .:. :.  .: :... :..:  ... . . : .
CCDS54 DKADGKQLVEILTTHCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLS
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CCDS54 LGKTTLAQKLMLDWAEDNLIH-KFKYAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPH
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CCDS54 LLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFLEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAAL
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CCDS54 FQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVPTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGA------QLRG
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CCDS54 ALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLS
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CCDS54 LAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTK
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CCDS54 LLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDLCSALS
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CCDS54 CNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEIEEKNP
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CCDS54 QLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
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CCDS54 QDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNK
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CCDS54 DDIPHILAQARKILFVIDGFDEL--GAAPGALIED--ICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVM
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CCDS54 FIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLSGVERLRNPDLIQAGYYSFGL
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pF1KB7 LNKNIARELEDTLHCKISPRVMEELLK--WGEELGKAESASLQFHILRLFHCLHESQEED
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CCDS54 ANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGGHSTVTDLQ----ELLGCLYESQEEE
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CCDS54 LVKEVMAQFKEISLH-LNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKENLPENVTASESDAEV
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CCDS54 -ERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVV
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CCDS54 FKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCS
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CCDS54 ATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTE
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pF1KB7 PACKHLSDALLQNRSLTHLNLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPDGNLQSLNLSGCSFTREGC
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CCDS54 CDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDL
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CCDS54 CSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEI
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CCDS54 EEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
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CCDS12 -SLGITRKERPPLDVDEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKP----DKDNRCR
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       :   .:... : :   ::: :   .. .  .... :  . .:    .  . :.:: : ::
CCDS12 Y--ILKTKFREMWK--SWPGDSKEVQ-VMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAG
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       .::::::.. :: ::.  :.. .:.:.:::::...  .   .::::.  :::...  : .
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       ...: .:.::.::::.:  .. . .  ..:   : :: .. ::  .: :::.. ..: :.
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CCDS12 LLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFLEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAAL
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pF1KB7 FHSCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTTTSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPG
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CCDS12 FQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVPTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGA------QLRG
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pF1KB7 QWRALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPFIDSLYEFNILQKINDCGGCTTFTHLS
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CCDS12 ALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLS
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CCDS12 FQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLSGVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKR
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CCDS12 AKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGGHSTVTDLQ----ELLGCLYESQEEELVKEV
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       .... :..:. :.  ..  ::::.:::. :.:. :.: .. :       : : :. : :.
CCDS12 MAQFKEISLH-LNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKENLPENVTASESDAEV-ERSQ
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CCDS12 DDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKNIS
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CCDS12 PADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCSATTQQ
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CCDS12 WADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTEANCKD
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       :. .:. .: :::: :.:: . . :::::::.:  :. .::.: : .:..: .:: .:..
CCDS12 LAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTK
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pF1KB7 ALSHNHNVKILDLGENDLQDDGVKLLCEAL-KPHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLS
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CCDS12 LLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDLCSALS
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CCDS12 CNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKIDDFNDELNKLLEEIEEKNP
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CCDS12 QLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
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CCDS12 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFK---
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         : :.   :.  : .: : : ....:.  ..  :: :.::  .:: :. .::  ::  .
CCDS12 --QLLLTELST--GTMP-ITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDK
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CCDS12 MCVVVRREINAILPTLE---P--EDLNV-----GETQV------NLEE-----GESGKI-
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CCDS12 ---------------------RRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQGVHRHEEYL
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pF1KB7 QRLLDPNRTRA-QAQTIVLVGRAGVGKTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIR
         :: :.: .. : .:... :  :.::: :: ..:..:: . .. ..   .::. :... 
CCDS12 PCLLLPKRPQGRQPKTVAIQGAPGIGKTILAKKVMFEWARNKFYAHKRWCAFYFHCQEVN
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pF1KB7 YMKETTFAELISLDWPDFDAPIEEFMSQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTD
          . .:.:::   ::  .  . ..::.:..::...:::::.  . .  . :.: :   :
CCDS12 QTTDQSFSELIEQKWPGSQDLVSKIMSKPDQLLLLLDGFEEL--TSTLIDRLEDLS--ED
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pF1KB7 WYQELPVTKILHSLLKKELVPLATLLITIK--TWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLR
       : :.:: . .: :::.: ..: ::::: :.  .:  .  :  :  : .: . ::.  .  
CCDS12 WRQKLPGSVLLSSLLSKTMLPEATLLIMIRFTSW--QTCKPLLKCPSLVTLPGFNTMEKI
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pF1KB7 VYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNETLFHSCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTT
        ::. .:  . : ...:.   .:  ::  : .:.::: ::: :::   :  .: .   ..
CCDS12 KYFQMYFGHTEEGDQVLSFAMENTILFSMCRVPVVCWMVCSGLKQQMERGNNLTQSCPNA
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pF1KB7 TSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWPGQWRALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPF
       ::... ..:.:: :   ...     .: ..:: :: ...:  .....::: :   :.   
CCDS12 TSVFVRYISSLFPTRAENFSRKIHQAQLEGLCHLAADSMWHRKWVLGKEDLEEAKLDQTG
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pF1KB7 IDSLYEFNILQKINDCGGCTTFTHLSFQEFFAAMSFVLEEPREFPP-HSTKPQEMKMLLQ
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CCDS12 VTAFLGMSILRRIAGEEDHYVFTLVTFQEFFAALFYVLCFPQRLKNFHVLSHVNIQRLIA
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           .: .: . . ::.::.::.  :  .:....::.:    ..:::    : : .  : 
CCDS12 SPRGSK-SYLSHMGLFLFGFLNEACASAVEQSFQCKVSFGNKRKLLKVIPLLHKCDPPSP
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pF1KB7 QFHILRLFHCLHESQEEDFTKKMLGRIFEVDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSV
          . .::.:::: .:: :... :.   .: : : ...:.:.:.::::.:. :....:.:
CCDS12 GSGVPQLFYCLHEIREEAFVSQALNDYHKVVLRIGNNKEVQVSAFCLKRCQYLHEVELTV
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       . ...  ..  : .:.  .        .: : ...::...::..:. : ..:: :    .
CCDS12 TLNFM--NVWKLSSSSHPGSEAPESNGLHRWWQDLCSVFATNDKLEVLTMTNSVLGPPFL
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       :.:  ::..:.::.:::  . :.   . :::: .: ::..: .:...  .. . .: :. 
CCDS12 KALAAALRHPQCKLQKLLLRRVNSTMLNQDLIGVLTGNQHLRYLEIQHVEVESKAVKLLC
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       ..::   : :. : :: :  .     ::.  : .  :.  : :  : :.. :   : .: 
CCDS12 RVLRSPRCRLQCLRLEDCLATPRIWTDLGNNLQGNGHLKTLILRKNSLENCGAYYLSVA-
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             :::: .  :.:.  .:. :.. : :.. ::::.:..:.:.:::.: . .:: . 
CCDS12 -----QLERLSIENCNLTQLTCESLASCLRQSKMLTHLSLAENALKDEGAKHIWNALPHL
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          :: : :  :..: . : .. .:: .:...: :::. :.:.:::: ::::::: :  .
CCDS12 RCPLQRLVLRKCDLTFNCCQDMISALCKNKTLKSLDLSFNSLKDDGVILLCEALKNPDCT
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       :. : : .: .:. ::: . :.: ... : .:.:  : . . :.  ::.:....  :   
CCDS12 LQILELENCLFTSICCQAMASMLRKNQHLRHLDLSKNAIGVYGILTLCEAFSSQKKREEV
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pF1KB7 LG                                
                                         
CCDS12 IFCIPAWTRITSFSPTPHPPDFTGKSDCLSQINP
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>>CCDS12934.1 NLRP9 gene_id:338321|Hs108|chr19            (991 aa)
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Smith-Waterman score: 1787; 33.1% identity (61.5% similar) in 1035 aa overlap (16-1043:10-948)

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pF1KB7 MNFSVITCPNGGTNQGLLPYLMALDQYQLEEFKLCLEPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANL
                      ::: ::  : . .. .::  :. : :  :   :      ::::.:
CCDS12       MAESFFSDFGLLWYLKELRKEEFWKFKELLK-QPLEKFELKP------IPWAEL
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pF1KB7 RAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTSLCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQE
       . :.  ... :::.:.:  :::.:.:..:  .:  .:  :.. ::.              
CCDS12 KKASKEDVAKLLDKHYPGKQAWEVTLNLFLQINRKDLWTKAQEEMR--------------
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CCDS12 -------------------------------------------NKLNP-----------Y
                                                                   

              190          200       210       220       230       
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       :..::  .   :..   .  : .: : ..: :.:..::.   :   . :. .:.:: :  
CCDS12 RKHMKETFQLIWEKETCLHVP-EHFY-KETMKNEYKELN---DAYTAAARRHTVVLEGPD
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pF1KB7 GVGKTTLAMQAMLHWANGVLFQQRFSYVFYLSCHKIRYMKETTFAELISLDWPDFDAPIE
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CCDS12 GIGKTTLLRKVMLDWAEGNLWKDRFTFVFFLNVCEMNGIAETSLLELLSRDWPESSEKIE
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pF1KB7 EFMSQPEKLLFIIDGFEEIIISESRSESLDDGSPCTDWYQELPVTKILHSLLKKELVPLA
       ...::::..:::.::::.. .. . . .:.:     :: :. :.  :: :::.:...: .
CCDS12 DIFSQPERILFIMDGFEQLKFNLQLKADLSD-----DWRQRQPMPIILSSLLQKKMLPES
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pF1KB7 TLLITIKTWFVRDLKASLVNPCFVQITGFTGDDLRVYFMRHFDDSSEVEKILQQLRKNET
       .:::..    ..     : .: .... ::. .. . ::   : ..:.. :... .: :  
CCDS12 SLLIALGKLAMQKHYFMLRHPKLIKLLGFSESEKKSYFSYFFGEKSKALKVFNFVRDNGP
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pF1KB7 LFHSCSAPMVCWTVCSCLKQPKVRYYDLQSITQTTTSLYAYFFSNLFSTAEVDLADDSWP
       ::  :  :..:: ::.:.::   :  ::.  .:.:: ::: :....:...  ..      
CCDS12 LFILCHNPFTCWLVCTCVKQRLERGEDLEINSQNTTYLYASFLTTVFKAGSQSFPPKVNR
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pF1KB7 GQWRALCSLAIEGLWSMNFTFNKEDTEIEGLEVPFIDSLYEFNILQKINDCGGCTTFTHL
       .. ..::.:: ::.:...:.:.. : . .::          . .::. .::    .: ::
CCDS12 ARLKSLCALAAEGIWTYTFVFSHGDLRRNGLSESEGVMWVGMRLLQRRGDC---FAFMHL
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pF1KB7 SFQEFFAAMSFVLEEPREFPPHSTKPQEMKMLLQHVLLDKEAYWTPVVLFFFGLLNKNIA
        .::: ::: ..:..:.. :  .     . .:..  ... ..  : : .:.::. ...:.
CCDS12 CIQEFCAAMFYLLKRPKDDPNPAIG--SITQLVRASVVQPQTLLTQVGIFMFGISTEEIV
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pF1KB7 RELEDTLHCKISPRVMEELLKWGEELGKAESASLQFHILRLFHCLHESQEEDFTKKMLGR
         :: ..   .:  . .:. .  : :.. :.    . . .::  : :.::..:. :... 
CCDS12 SMLETSFGFPLSKDLKQEITQCLESLSQCEADREAIAFQELFIGLFETQEKEFVTKVMNF
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pF1KB7 IFEVDLNILEDEELQASSFCLKHCKRLNKLRLSVSSHILERDLEILETSKFDSRMHAWNS
       . :: . : . :.:  .:::::::..:. ::. : . :.  :   .  : .. ..  :  
CCDS12 FEEVFIYIGNIEHLVIASFCLKHCQHLTTLRMCVEN-IFPDDSGCI--SDYNEKLVYWRE
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pF1KB7 ICSTLVTNENLHELDLSNSKLHASSVKGLCLALKNPRCKVQKLTCKSVTPEWVLQD--LI
       .:: ..::.:.. ::. :..:   :.  :: :: .: ::..::   ::   .  .:  :.
CCDS12 LCSMFITNKNFQILDMENTSLDDPSLAILCKALAQPVCKLRKLIFTSV---YFGHDSELF
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pF1KB7 IALQGNSKLTHLNFSSNKLGMT-VPLILKALRHSACNLKYLCLEKCNLSAASCQDLALFL
        :.  : .:  :.. ...:... .  . ..:.:  :... : : ::..:.  :.:.:  :
CCDS12 KAVLHNPHLKLLSLYGTSLSQSDIRHLCETLKHPMCKIEELILGKCDISSEVCEDIASVL
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pF1KB7 TSIQHVTRLCLGFNRLQDDGIKLLCAALTHPKCALERLELWFCQLAAPACKHLSDALLQN
       .  ... .: :  : :.:.:. ::: :: : .:::::: : .: :.. .:  .:..:: .
CCDS12 ACNSKLKHLSLVENPLRDEGMTLLCEALKHSHCALERLMLMYCCLTSVSCDSISEVLLCS
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pF1KB7 RSLTHLNLSKNSLRDEGVKFLCEALGRPDGNLQSLNLSGCSFTREGCGELANALSHNHNV
       .::. :.:..:.:.:.::  :: :: .:  ... : : :: .: ..: ..: .:  : ..
CCDS12 KSLSLLDLGSNALEDNGVASLCAALKHPGCSIRELWLMGCFLTSDSCKDIAAVLICNGKL
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pF1KB7 KILDLGENDLQDDGVKLLCEALK-PHRALHTLGLAKCNLTTACCQHLFSVLSSSKSLVNL
       : : ::.:.. : ::. :: ::. ::  :. :::  : .: :::. . ..: . :.: .:
CCDS12 KTLKLGHNEIGDTGVRQLCAALQHPHCKLECLGLQTCPITRACCDDIAAALIACKTLRSL
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pF1KB7 NLLGNELDTDGVKMLCKALKKSTCRLQKLG                              
       ::    ::.:.: .::.::..  : :: ::                              
CCDS12 NLDWIALDADAVVVLCEALSHPDCALQMLGLHKSGFDEETQKILMSVEEKIPHLTISHGP
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>>CCDS82402.1 NLRP8 gene_id:126205|Hs108|chr19            (1029 aa)
 initn: 1884 init1: 656 opt: 1201  Z-score: 1197.3  bits: 233.2 E(32554): 2.3e-60
Smith-Waterman score: 1571; 31.9% identity (59.9% similar) in 1048 aa overlap (7-1038:30-992)

                                       10        20        30      
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                                    .: :..  ..:.. :.  ... .:..::   
CCDS82 MSDVNPPSDTPIPFSSSSTHSSHIPPWTFSCYPGSPCENGVMLYMRNVSHEELQRFK---
               10        20        30        40        50          

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pF1KB7 EPQQLMDFWSAPQGHFPRIPWANLRAADPLNLSFLLDEHFPKGQAWKVVLGIFQTMNLTS
         : :.   :.  : .: : : ....:.  ..  :: :.::  .:: :. .::  ::  .
CCDS82 --QLLLTELST--GTMP-ITWDQVETASWAEVVHLLIERFPGRRAWDVTSNIFAIMNCDK
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pF1KB7 LCEKVRAEMKENVQTQELQDPTQEDLEMLEAAAGNMQTQGCQDPNQEELDELEEETGNVQ
       .:  :: :..  . : :   :  :::..     :. :.      : ::      :.:.. 
CCDS82 MCVVVRREINAILPTLE---P--EDLNV-----GETQV------NLEE-----GESGKI-
            120          130              140                  150 

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pF1KB7 AQGCQDPNQEEPEMLEEADHRRKYRENMKAELLETWDNISWPKDHVYIRNTSKDEHEE-L
                            :.:. :.  ...  ::  .:: ..  .   .  .::: :
CCDS82 ---------------------RRYKSNVMEKFFPIWDITTWPGNQRDFFYQGVHRHEEYL
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CCDS74 HEPTCQISHLSLMKCDLRASECEEIASLLISGGSLRKLTLSSNPLRSDGMNILCDALLHP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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