Result of FASTA (ccds) for pF1KA1565
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1565, 1275 aa
  1>>>pF1KA1565 1275 - 1275 aa - 1275 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8315+/-0.00179; mu= -10.7471+/- 0.105
 mean_var=514.6587+/-111.337, 0's: 0 Z-trim(107.7): 201  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.056535
 statistics sampled from 9571 (9733) to 9571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.299), width:  16
 Scan time:  5.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32078.2 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14          (1377) 8007 669.7 1.4e-191
CCDS32079.1 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14          (2090) 5290 448.3  1e-124
CCDS82605.1 NINL gene_id:22981|Hs108|chr20         (1033) 1248 118.3   1e-25
CCDS33452.1 NINL gene_id:22981|Hs108|chr20         (1382) 1182 113.0 5.4e-24


>>CCDS32078.2 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14               (1377 aa)
 initn: 5517 init1: 5449 opt: 8007  Z-score: 3552.7  bits: 669.7 E(32554): 1.4e-191
Smith-Waterman score: 8007; 99.9% identity (99.9% similar) in 1246 aa overlap (1-1245:1-1246)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA1 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA1 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 KEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEE
              790       800       810       820       830       840

               850       860       870       880       890         
pF1KA1 M-QKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQR
       : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MWQKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQR
              850       860       870       880       890       900

     900       910       920       930       940       950         
pF1KA1 LTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQ
              910       920       930       940       950       960

     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KA1 QENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKS
              970       980       990      1000      1010      1020

    1020      1030      1040      1050      1060      1070         
pF1KA1 SLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

    1080      1090      1100      1110      1120      1130         
pF1KA1 QEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQLLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQLLW
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

    1140      1150      1160      1170      1180      1190         
pF1KA1 QENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECD
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

    1200      1210      1220      1230      1240      1250         
pF1KA1 QFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQLMENSVVGSSREGCSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::              
CCDS32 QFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQLMEMQHLRSTATPSPSP
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

    1260      1270                                                 
pF1KA1 PEIVCEDAAPEVHCDA                                            
                                                                   
CCDS32 HAWDLQLLQQQACPMVPREQFLQLQRQLLQAERINQHLQEELENRTSETNTPQGNQEQLV
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

>>CCDS32079.1 NIN gene_id:51199|Hs108|chr14               (2090 aa)
 initn: 7766 init1: 5202 opt: 5290  Z-score: 2352.7  bits: 448.3 E(32554): 1e-124
Smith-Waterman score: 5345; 70.9% identity (84.1% similar) in 1261 aa overlap (1-1244:1-1208)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVHFDQFKEALILILSRTLSNEEHFQEPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQESVEEF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEVTVIEPLDEEARPSHIPAGDCSEHWKTQRSEEYEAEGQLRFWNPDDLNASQSGSSPPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEMLEEVFHNLDPDGTMSVE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTTTSSAMTSTIGFRVFSCLDD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLTELTLALENELLVTKNSIHQA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLMASEVDDHHAAIERRNEYNLR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIEKAKTEENYIRDRLALSLKEN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLDPSSAEFFLQEERLTQMRNEY
              490       500       510       520       530       540

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pF1KA1 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSEECNP
              550       560       570       580       590       600

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pF1KA1 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHEN
              610       620       630       640       650       660

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pF1KA1 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKEAHHEATCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLR
              670       680       690       700       710       720

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pF1KA1 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA1 KEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENSILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEE
       ::::::::::::::::::::   ::.. : .   ..: .  . :             :. 
CCDS32 KEELRKELLEKHQRELQEGR---EKMETECNRRTSQIEAQFQSDC------------QKV
              790       800          810       820                 

              850        860       870       880       890         
pF1KA1 MQKTETVKQE-NAAVQKMVENLKKQISELKIKNQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQR
        .. :.. :  ..  .. ...:..:  : :   .: ..:. ::.:. .. :: :.:  .:
CCDS32 TERCESALQSLEGRYRQELKDLQEQQREEK---SQWEFEKDELTQECAEAQELLKETLKR
         830       840       850          860       870       880  

     900       910       920       930       940       950         
pF1KA1 LTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQ
               ::  .    .:::. . . ::.:.   :. . :...:: .: .:.      .
CCDS32 --------EKTTSLVLTQEREMLEKTYKEHLNSMVVERQQLLQDLE-DLRNVS------E
                    890       900       910       920              

     960       970       980       990      1000       1010        
pF1KA1 QENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEK-EALSEELNSCVDKLAK
        .. ::.:.. ..:. :.  .: . ....    . .:.: ... : :  : ..  ... .
CCDS32 TQQSLLSDQILELKSSHK-RELRE-REEVLCQAGASEQLASQRLERLEMEHDQERQEMMS
       930       940        950        960       970       980     

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pF1KA1 SSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQEKVQNLEDTVQNVNLQMS--------R
       . :  . :   :   .. ... : .....   : :......... ... .:        .
CCDS32 KLLAMENI--HKATCETADRERAEMSTEISRLQSKIKEMQQATSPLSMLQSGCQVIGEEE
         990        1000      1010      1020      1030      1040   

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pF1KA1 MKSD--LRVTQQEKEALKQE---VMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHPSGLHNQQKRLSWD
       ...:  : . :: .. :...   ..::..  ..:  ..   ..::. : :... ..:   
CCDS32 VEGDGALSLLQQGEQLLEENGDVLLSLQRAHEQAVKENV--KMATEISRLQQRLQKLEPG
          1050      1060      1070      1080        1090      1100 

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pF1KA1 K-LDHLMNEEQ-QLLWQENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGT
         ..  ..:   ... .  :. . ..:..... ...  . :.. :.:   . . :. .::
CCDS32 LVMSSCLDEPATEFFGNTAEQTEQFLQQNRTKQVEGVTR-RHVLSDLEDDEVRDLGSTGT
            1110      1120      1130      1140       1150      1160

          1190      1200      1210      1220      1230      1240   
pF1KA1 MNPTEQEKLSLKRECDQFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGLKKKQVKLDEQL
        .  .::           . :.: :.  :  .. ::.  :: . :.  ::..  .:.:::
CCDS32 SSVQRQE----------VKIEESEAS--VEGFSELENSEET-RTESWELKNQISQLQEQL
                       1170        1180       1190      1200       

          1250      1260      1270                                 
pF1KA1 MENSVVGSSREGCSSLPEIVCEDAAPEVHCDA                            
       :                                                           
CCDS32 MMLCADCDRASEKKQDLLFDVSVLKKKLKMLERIPEASPKYKLLYEDVSRENDCLQEELR
      1210      1220      1230      1240      1250      1260       

>--
 initn: 2627 init1: 2578 opt: 2939  Z-score: 1316.4  bits: 256.5 E(32554): 5.3e-67
Smith-Waterman score: 2939; 68.8% identity (80.6% similar) in 763 aa overlap (510-1245:1229-1959)

     480       490       500       510       520          530      
pF1KA1 NSRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLD--P-SSAEFFLQEERLTQM
                                     .:: .:.  :.  : .: .. :  : ... 
CCDS32 QISQLQEQLMMLCADCDRASEKKQDLLFDVSVLKKKLKMLERIPEASPKYKLLYEDVSRE
     1200      1210      1220      1230      1240      1250        

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pF1KA1 RNEYERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPLKNSPSEEVEANSGGIEPEHGLGSE
        .  ... :... . ::   . .:  :.  :.::  . .  :::  .  ..:  .   . 
CCDS32 NDCLQEELRMMETRYDEALENNKELTAE--VFRLQDELKKMEEVTETFLSLEKSYDEVKI
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pF1KA1 ECNPLN-MSIEAELVIEQMKEQH-HRDICCLRLELEDKVRHYEKQLDETVVSCKKAQENM
       : . :: . .. .  ::...:.  .:  :::    : .... : . : .... ... :. 
CCDS32 ENEGLNVLVLRLQGKIEKLQESVVQRCDCCL---WEASLENLEIEPDGNILQLNQTLEEC
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pF1KA1 KQRHENETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAVLKE--AH-----HEATCRHEEEKK-QLQV
         : ..  :..:    . :.:   :.:.. .:..  ::     : .   :.:. . : ::
CCDS32 VPRVRSVHHVIE----ECKQENQYLEGNTQLLEKVKAHEIAWLHGTIQTHQERPRVQNQV
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pF1KA1 KLEEEKTHL--QEKLRLQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEEKVRGLTQELEQ
        :::. : :  :.: ..::.  .        : .: :.  ::           ::..:  
CCDS32 ILEENTTLLGFQDK-HFQHQATI--------AELELEKTKLQE----------LTRKL--
    1430      1440       1450              1460                    

          770           780       790              800       810   
pF1KA1 FHQEQLTSLVEKHTL----EKEELRKELLEKHQ---RELQEG----RYESEKLQQENSIL
         .:..: ::... .    ::::  : ...  :    :.:.     ::::::::::::::
CCDS32 --KERVTILVKQKDVLSHGEKEEELKAMMHDLQITCSEMQQKVELLRYESEKLQQENSIL
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

           820       830       840        850       860       870  
pF1KA1 RNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEEM-QKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKN
       :::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEEMWQKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIKN
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pF1KA1 QQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEEREQEKFNLKEELER
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pF1KA1 CKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQKISSVL
       1650      1660      1670      1680      1690      1700      

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pF1KA1 SYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQLVASQE
       1710      1720      1730      1740      1750      1760      

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pF1KA1 KVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQQEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQQEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPEIATHP
       1770      1780      1790      1800      1810      1820      

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pF1KA1 SGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQLLWQENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGLHNQQKRLSWDKLDHLMNEEQQLLWQENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLP
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pF1KA1 KHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECDQFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHQKHLNPSGTMNPTEQEKLSLKRECDQFQKEQSPANRKVSQMNSLEQELETIHLENEGL
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pF1KA1 KKKQVKLDEQLMENSVVGSSREGCSSLPEIVCEDAAPEVHCDA                 
       :::::::::::::                                               
CCDS32 KKKQVKLDEQLMEMQHLRSTATPSPSPHAWDLQLLQQQACPMVPREQFLQLQRQLLQAER
       1950      1960      1970      1980      1990      2000      

>>CCDS82605.1 NINL gene_id:22981|Hs108|chr20              (1033 aa)
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Smith-Waterman score: 1636; 33.6% identity (64.8% similar) in 1064 aa overlap (1-1031:1-1021)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MDEVEQDQHEARLKELFDSFDTTGTGSLGQEELTDLCHMLSLEEVAPVLQQTLLQDNLLG
       ::: :.... ..:.:...: :::::: : ..:::.::  : ::.  ::: :::: .. ..
CCDS82 MDE-EENHYVSQLREVYSSCDTTGTGFLDRQELTQLCLKLHLEQQLPVLLQTLLGNDHFA
                10        20        30        40        50         

               70            80         90       100       110     
pF1KA1 RVHFDQFKEALILILSRTL----SNEEHFQ-EPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQE
       ::.:..:::... .:: .     :.:.  . :   :    :::: :.: ::::: ::. .
CCDS82 RVNFEEFKEGFVAVLSSNAGVRPSDEDSSSLESAASSAIPPKYVNGSKWYGRRSRPELCD
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KA1 SVEEFPEVTVIEPLDEEARPSHI-----------PAGDC-SEHWKTQRSEEYEAEGQLRF
       .. :  .:   :   . .  ::.           : .:  .:  :  ..: .::.:::. 
CCDS82 AATEARRVP--EQQTQASLKSHLWRSASLESVESPKSDEEAESTKEAQNELFEAQGQLQT
     120         130       140       150       160       170       

           170       180       190       200       210       220   
pF1KA1 WNPDDLNASQSGSSPPQDWIEEKLQEVCEDLGITRDGHLNRKKLVSICEQYGLQNVDGEM
       :. .:... :.. ::  :  : ... : :.::.  .:::....:. .:.. :::... : 
CCDS82 WDSEDFGSPQKSCSPSFDTPESQIRGVWEELGVGSSGHLSEQELAVVCQSVGLQGLEKEE
       180       190       200       210       220       230       

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pF1KA1 LEEVFHNLDPDGT--MSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTT
       ::..:..:: ::   .:.:.:  :::..  .:   .::  .  :    .:  .::: .::
CCDS82 LEDLFNKLDQDGDGKVSLEEFQLGLFSHEPALLLESSTRVKPSKAWSHYQVPEESGCHTT
       240       250       260       270       280       290       

             290        300       310       320       330       340
pF1KA1 TSSAMTSTIG-FRVFSCLDDGMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLT
       :.:...:  . .:.:: .::: : :  ...:  : .:::.:..:::..::::.: ..:: 
CCDS82 TTSSLVSLCSSLRLFSSIDDGSGFAFPDQVLAMWTQEGIQNGREILQSLDFSVDEKVNLL
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KA1 ELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLM
       ::: ::.:::... ....::::: .. :. .   .:.:..::..: :.::..::: .  .
CCDS82 ELTWALDNELMTVDSAVQQAALACYHQELSYQQGQVEQLARERDKARQDLERAEKRNLEF
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pF1KA1 ASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIE
       ..:.:: :...:. .: ....:.. :.::.. :..:.. ::: . .:: .::  :: .. 
CCDS82 VKEMDDCHSTLEQLTEKKIKHLEQGYRERLSLLRSEVEAERELFWEQAHRQRAALEWDVG
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pF1KA1 KAKTEENYIRDRLALSLKENSRLENELLENAEKLAEYENLTNKLQRNLENVLAEKFGDLD
       . ..::  .:..:.:.:::::::..:..: .:::.. : :. :::..:: :: .:   :.
CCDS82 RLQAEEAGLREKLTLALKENSRLQKEIVEVVEKLSDSERLALKLQKDLEFVLKDK---LE
       480       490       500       510       520       530       

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pF1KA1 PSSAEFFLQEERLTQMRNEYERQCRVLQDQVDELQSELEEYRAQGRVLRLPL-KNSPSEE
       :.:::.. ::::.. . .::: .:: :::. ::::.:::     :   :::  ..:::  
CCDS82 PQSAELLAQEERFAAVLKEYELKCRDLQDRNDELQAELE-----GLWARLPKNRHSPSW-
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pF1KA1 VEANSGGIEPEHGLG----SEECNPLNMSIEAELVIEQMKEQHHRDICCLRLELEDKVRH
         . .:  .   :::    :   :   .:::.::..::.:: :..:   :: .:: :: .
CCDS82 --SPDGRRRQLPGLGPAGISFLGNSAPVSIETELMMEQVKE-HYQD---LRTQLETKVNY
        590       600       610       620        630          640  

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pF1KA1 YEKQLDETVVSCKKAQENMKQRHENETHTLEKQISDLKNEIAELQGQAAV--LKEAHHEA
       ::...     . .: ...:.: .. :. .:: : .::. :. : ..: ..  :.:  .. 
CCDS82 YEREIAALKRNFEKERKDMEQARRREVSVLEGQKADLE-ELHE-KSQEVIWGLQEQLQD-
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pF1KA1 TCRHEEEKKQLQVKLEEEKTHLQEKLRLQHEMELKARLTQAQASFEREREGLQSSAWTEE
       : :  : .   :. :    :.    : :.:. .:.    : .  :.:  :  ...   ..
CCDS82 TARGPEPE---QMGLAPCCTQALCGLALRHHSHLQ----QIRLEFHRLSE--ENTLLKND
     700          710       720       730           740         750

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pF1KA1 --KVRGLTQELEQFHQEQLTSLVEKHTLEKEELRKELLEKHQRELQEGRYESEKLQQENS
         .::   .  :. :. :  . .:    .::.  .:. :  .:. :. . .  .:. .  
CCDS82 LGRVRQELEAAESTHDAQ-RKEIEVLKKDKEKACSEM-EVLNRQNQNYKDQLSQLNVRVL
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pF1KA1 ILRNEITTLNEEDSISNLKLGTLNGSQEEMQKTETVKQENAAVQKMVENLKKQISELKIK
        : .: .: . ..    . .  :. : ::. ..   .:..  .::    :. ..  :. .
CCDS82 QLGQEASTHQAQNEEHRVTIQMLTQSLEEVVRSG--QQQSDQIQK----LRVELECLNQE
      810       820       830       840         850           860  

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pF1KA1 NQQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKE----PGNSALEEREQEKFNLK
       .:.:.:  .::.:   ..:...:  . :: .   :. .:    : . . : ..  ... .
CCDS82 HQSLQLPWSELTQTLEESQDQVQGAHLRLRQAQAQHLQEVRLVPQDRVAELHRLLSLQGE
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pF1KA1 EELERCKVQSSTLVSSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQLHRCPDLSDFQQK
       .  .:  .:     ..:.:   .:.    :... . ::.....:.:.  .    ::.  :
CCDS82 QARRRLDAQREEHEKQLKATEERVEEAEMILKNMEMLLQEKVDKLKEQFEKNTKSDLLLK
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pF1KA1 ISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAKSSLLEHRIATMKQEQKSWEHQSASLKSQL
          .   : .:..  .: .:: .  ..:  .: :::... ....                
CCDS82 --ELYVENAHLVRALQA-TEEKQRGAEK--QSRLLEEKVRALNKLVSRIAPAALSV    
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pF1KA1 VASQEKVQNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQQEKEALKQEVMSLHKQLQNAGGKSWAPE

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CCDS33 MDE-EENHYVSQLREVYSSCDTTGTGFLDRQELTQLCLKLHLEQQLPVLLQTLLGNDHFA
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pF1KA1 RVHFDQFKEALILILSRTL----SNEEHFQ-EPDCSLEAQPKYVRGGKRYGRRSLPEFQE
       ::.:..:::... .:: .     :.:.  . :   :    :::: :.: ::::: ::. .
CCDS33 RVNFEEFKEGFVAVLSSNAGVRPSDEDSSSLESAASSAIPPKYVNGSKWYGRRSRPELCD
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pF1KA1 SVEEFPEVTVIEPLDEEARPSHI-----------PAGDC-SEHWKTQRSEEYEAEGQLRF
       .. :  .:   :   . .  ::.           : .:  .:  :  ..: .::.:::. 
CCDS33 AATEARRVP--EQQTQASLKSHLWRSASLESVESPKSDEEAESTKEAQNELFEAQGQLQT
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       :. .:... :.. ::  :  : ... : :.::.  .:::....:. .:.. :::... : 
CCDS33 WDSEDFGSPQKSCSPSFDTPESQIRGVWEELGVGSSGHLSEQELAVVCQSVGLQGLEKEE
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pF1KA1 LEEVFHNLDPDGT--MSVEDFFYGLFKNGKSLTPSASTPYRQLKRHLSMQSFDESGRRTT
       ::..:..:: ::   .:.:.:  :::..  .:   .::  .  :    .:  .::: .::
CCDS33 LEDLFNKLDQDGDGKVSLEEFQLGLFSHEPALLLESSTRVKPSKAWSHYQVPEESGCHTT
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KA1 TSSAMTSTIG-FRVFSCLDDGMGHASVERILDTWQEEGIENSQEILKALDFSLDGNINLT
       :.:...:  . .:.:: .::: : :  ...:  : .:::.:..:::..::::.: ..:: 
CCDS33 TTSSLVSLCSSLRLFSSIDDGSGFAFPDQVLAMWTQEGIQNGREILQSLDFSVDEKVNLL
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pF1KA1 ELTLALENELLVTKNSIHQAALASFKAEIRHLLERVDQVVREKEKLRSDLDKAEKLKSLM
       ::: ::.:::... ....::::: .. :. .   .:.:..::..: :.::..::: .  .
CCDS33 ELTWALDNELMTVDSAVQQAALACYHQELSYQQGQVEQLARERDKARQDLERAEKRNLEF
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pF1KA1 ASEVDDHHAAIERRNEYNLRKLDEEYKERIAALKNELRKEREQILQQAGKQRLELEQEIE
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CCDS33 VKEMDDCHSTLEQLTEKKIKHLEQGYRERLSLLRSEVEAERELFWEQAHRQRAALEWDVG
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       : :  : .   :. :    :.    : :.:. .:.    .:.: .  :  :: .      
CCDS33 TARGPEPE---QMGLAPCCTQALCGLALRHHSHLQQIRREAEAELSGELSGLGALPARRD
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pF1KA1 -SAWTEEKVRGL----TQELEQFHQEQLTSLVEKHTLEKEELRKEL-LEKHQRELQEG-R
        .   ::  .:     .:. ::.. :.  .:    . .. ..   : ::... :: .: :
CCDS33 LTLELEEPPQGPLPRGSQRSEQLELERALKLQPCASEKRAQMCVSLALEEEELELARGKR
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pF1KA1 YESEKLQQENSILRNE--ITTLNEEDSISNLKL--------------GTLNGSQE-----
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CCDS33 VDGPSLEAEMQALPKDGLVAGSGQEGTRGLLPLRPGCGERPLAWLAPGDGRESEEAAGAG
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pF1KA1 ----EMQKTETVKQENAA------------------------VQKMVENLKKQISELKIK
           . : ::....   :                        : :  : .  . . :.  
CCDS33 PRRRQAQDTEATQSPAPAPAPASHGPSERWSRMQPCGVDGDIVPKEPEPFGASAAGLEQP
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pF1KA1 N-QQLDLENTELSQKNSQNQEKLQELNQRLTEMLCQKEKEPGNSALEERE-------QEK
       . ..: : .::  .  ::.: .. :   :     :. . :  ..  :::        ::.
CCDS33 GARELPLLGTE--RDASQTQPRMWEPPLR-PAASCRGQAERLQAIQEERARSWSRGTQEQ
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pF1KA1 FNLKEE-----LER-CKVQSSTLV--SSLEAELSEVKIQTHIVQQENHLLKDELEKMKQL
        . ..      ::  :. .:  ..  .:: ..:. .  :     ::.    .: :    :
CCDS33 ASEQQARAEGALEPGCHKHSVEVARRGSLPSHLQLADPQGS--WQEQLAAPEEGETKIAL
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pF1KA1 HRCPDLSDFQQKISSVLSYNEKLLKEKEALSEELNSCVDKLAK-SSLLEHRIATMKQEQK
       .:  :  :.. :.  . .  . : :. . : :.      .:.. ..::.. .. ..:: .
CCDS33 EREKD--DMETKLLHLEDVVRALEKHVD-LRENDRLEFHRLSEENTLLKNDLGRVRQELE
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pF1KA1 SWEHQSASLKSQ---LVASQEKV-----------QNLEDTVQNVNLQMSRMKSDLRVTQQ
       . :    . ...   :  ..::.           :: .: ....:... .. ..  . : 
CCDS33 AAESTHDAQRKEIEVLKKDKEKACSEMEVLNRQNQNYKDQLSQLNVRVLQLGQEASTHQA
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       ..:  .  .. : ..:...  .:.. . .:      :.  ::...   : :..: . ..:
CCDS33 QNEEHRVTIQMLTQSLEEVVRSGQQQSDQIQKLRVELECLNQEHQSLQLPWSELTQTLEE
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pF1KA1 EQQLLWQENERLQTMVQNTKAELTHSREKVRQLESNLLPKHQKHLNPSGTMNPTEQEKLS
        :. .   . ::.      .:.  : .: :: . .. . . .. :. .:     :: .  
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       :  . .. .:. . ....: . . . ...: .      :..:  :: ::. .:.      
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