Result of FASTA (ccds) for pF1KB6155
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6155, 597 aa
  1>>>pF1KB6155 597 - 597 aa - 597 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2529+/-0.000805; mu= 10.4713+/- 0.049
 mean_var=120.4384+/-24.154, 0's: 0 Z-trim(112.1): 14  B-trim: 122 in 2/49
 Lambda= 0.116867
 statistics sampled from 12919 (12932) to 12919 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.397), width:  16
 Scan time:  4.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7036.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9          ( 597) 4103 702.8 3.2e-202
CCDS48062.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9         ( 590) 4030 690.5 1.6e-198
CCDS48061.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9         ( 606) 3581 614.8  1e-175
CCDS48063.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9         ( 521) 2543 439.8 4.2e-123
CCDS5579.1 POR gene_id:5447|Hs108|chr7             ( 680)  946 170.6   6e-42
CCDS11223.1 NOS2 gene_id:4843|Hs108|chr17          (1153)  676 125.1 4.8e-28
CCDS5912.1 NOS3 gene_id:4846|Hs108|chr7            (1203)  609 113.9 1.2e-24
CCDS41842.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12          (1434)  599 112.2 4.6e-24
CCDS55890.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12          (1468)  599 112.2 4.7e-24


>>CCDS7036.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9               (597 aa)
 initn: 4103 init1: 4103 opt: 4103  Z-score: 3744.1  bits: 702.8 E(32554): 3.2e-202
Smith-Waterman score: 4103; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       
pF1KB6 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
              550       560       570       580       590       

>>CCDS48062.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9              (590 aa)
 initn: 2675 init1: 2675 opt: 4030  Z-score: 3677.7  bits: 690.5 E(32554): 1.6e-198
Smith-Waterman score: 4030; 98.8% identity (98.8% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-590)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::       ::::::::::::::::::::::
CCDS48 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLL-------ILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
              370       380       390              400       410   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
           420       430       440       450       460       470   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
           480       490       500       510       520       530   

              550       560       570       580       590       
pF1KB6 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
           540       550       560       570       580       590

>>CCDS48061.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9              (606 aa)
 initn: 3581 init1: 3581 opt: 3581  Z-score: 3268.3  bits: 614.8 E(32554): 1e-175
Smith-Waterman score: 4075; 98.5% identity (98.5% similar) in 606 aa overlap (1-597:1-606)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510                520       530 
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQ---------EQKVYVQHRLREL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         :::::::::::::
CCDS48 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQPPALFSALQEQKVYVQHRLREL
              490       500       510       520       530       540

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB6 GSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRF
              550       560       570       580       590       600

             
pF1KB6 QTETWA
       ::::::
CCDS48 QTETWA
             

>>CCDS48063.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9              (521 aa)
 initn: 3461 init1: 2543 opt: 2543  Z-score: 2323.5  bits: 439.8 E(32554): 4.2e-123
Smith-Waterman score: 3397; 93.7% identity (93.7% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
       :::::::::::::::::                                  :::::::::
CCDS48 GSALLPVCLGDDQHELG----------------------------------LPSKFTLLF
              130                                         140      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
        150       160       170       180       190       200      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
        210       220       230       240       250       260      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
        270       280       290       300       310       320      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
        330       340       350       360       370       380      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
        390       400       410       420       430       440      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
        450       460       470       480       490       500      

              550       560       570       580       590       
pF1KB6 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
       ::                                                       
CCDS48 RQATPSPCQRTSRKP                                          
        510       520                                           

>>CCDS5579.1 POR gene_id:5447|Hs108|chr7                  (680 aa)
 initn: 784 init1: 311 opt: 946  Z-score: 866.6  bits: 170.6 E(32554): 6e-42
Smith-Waterman score: 1049; 33.1% identity (64.0% similar) in 614 aa overlap (6-597:83-680)

                                        10        20        30     
pF1KB6                          MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
                                     ..:..:::::::.. ..::...:.:   : 
CCDS55 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHR--YGM
             60        70        80        90       100         110

          40               50        60        70        80        
pF1KB6 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
       : .. :   : ...:     :.. ::.:  :: :.::: :: ..:. .. . ..    : 
CCDS55 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
              120       130       140       150       160          

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB6 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
        . :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .:  :  .  : ..
CCDS55 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
       170       180       190       200       210       220       

      150       160       170       180          190       200     
pF1KB6 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
       .:  :   .    :.        .  .. :.    .. :    .:  :.    .:.:: .
CCDS55 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
         230           240        250       260       270       280

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB6 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
       .: :::: . .:....  .. . ..: :.::  : : . .:: : . :.:..: :... .
CCDS55 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
              290       300        310       320       330         

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB6 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
       .:: : : .. :.  . . ..   .: : :.:  ...::::.. :: . .  ::  . . 
CCDS55 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
     340       350       360       370       380       390         

          330         340       350       360       370       380  
pF1KB6 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
        :.: :  .  ::..:.:  . .  . :: :: .: : :      : :.: .:.: .. :
CCDS55 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
     400       410       420       430       440         450       

            390       400       410       420          430         
pF1KB6 AFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
        .:::::  .::. ..: ..::...:.  .  .:. ..:: . .: :.  : . ::..::
CCDS55 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
       460       470       480       490       500       510       

     440       450       460       470       480            490    
pF1KB6 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN-----FLFFGCRWRDQDFY
        ... .:    ::::::::::::::: . ::::.   : :.     .:..:::  :.:. 
CCDS55 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
       520       530       540       550       560       570       

          500        510       520       530       540       550   
pF1KB6 WEAEWQELEKRDCLT-LIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAK
       .. :  ....   :: :  :::::: .:::::: :..    .:.:..  ::..:. :.:.
CCDS55 YREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIE-GGAHIYVCGDAR
       580       590       600       610       620        630      

           560       570       580       590       
pF1KB6 SMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
       .:  ::......:  : :..   .:. :. .:.   :.. ..:.
CCDS55 NMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
        640       650       660       670       680

>>CCDS11223.1 NOS2 gene_id:4843|Hs108|chr17               (1153 aa)
 initn: 391 init1: 180 opt: 676  Z-score: 617.0  bits: 125.1 E(32554): 4.8e-28
Smith-Waterman score: 749; 28.6% identity (58.8% similar) in 611 aa overlap (5-594:538-1126)

                                         10        20        30    
pF1KB6                           MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLG
                                     .. .::...:: .. ..  ::       ..
CCDS11 PKRREIPLKVLVKAVLFACMLMRKTMASRVRVTILFATETGKSEALAWDLG-ALFSCAFN
       510       520       530       540       550        560      

           40        50        60        70         80        90   
pF1KB6 CRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFR-KNLPSTALCQMDFA
        .:  .:.: .  : .: :.. : .: :.:: : : ... . .:  :.: .    .. .:
CCDS11 PKVVCMDKYRLSCLEEERLLLVVTSTFGNGDCPGNGEKLKKSLFMLKELNN----KFRYA
        570       580       590       600       610           620  

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB6 VLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRV
       :.:::.: : .:   :. . ..: .::.: : :.  ::.    : . :   :  . .  .
CCDS11 VFGLGSSMYPRFCAFAHDIDQKLSHLGASQLTPMGEGDELS--GQEDAFRSWAVQTFKAA
            630       640       650       660         670       680

           160       170         180       190       200       210 
pF1KB6 LGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFT--LLFLQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLA
          .      ..    . .:. .:  . .  .     ...: .    .      .. :  
CCDS11 CETFD-----VRGKQHIQIPKLYTSNVTWDPHHYRLVQDSQPLDLSKALSSMHAKNVFTM
                   690       700       710       720       730     

             220       230        240       250       260          
pF1KB6 PMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDIL-GSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ--VLGL
        . : : . .:.  . . :.:..   :.:...  :. . . :.:. : :: . .  : : 
CCDS11 RLKSRQNLQSPTSSRATILVELSCEDGQGLNYLPGEHLGVCPGNQPALVQGILERVVDGP
         740       750       760       770       780       790     

      270       280          290       300       310       320     
pF1KB6 DPDQLFMLQPREPDVS---SPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHEL
        : :   :.  . . :   :  ::: :::. . ....:::.. : . ... :: .. .: 
CCDS11 TPHQTVRLEALDESGSYWVSDKRLP-PCSLSQALTYFLDITTPPTQLLLQKLAQVATEEP
         800       810       820        830       840       850    

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB6 EREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFS
       ::..: :     ..   ... : :  :.:::: .::  .  .   .::. .:...:: .:
CCDS11 ERQRL-EALCQPSEYSKWKFTNSP--TFLEVLEEFP--SLRVSAGFLLSQLPILKPRFYS
           860       870         880         890       900         

         390       400       410         420       430       440   
pF1KB6 IASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKE-P-RRGLCSSWLASLDPGQGPVRVPLWVRPGS-
       :.::    :..... :::: ..::  . : ..:.::.:: :: : : :  :: .:: .: 
CCDS11 ISSSRDHTPTEIHLTVAVVTYHTRDGQGPLHHGVCSTWLNSLKP-QDP--VPCFVRNASG
     910       920       930       940       950          960      

            450       460       470       480             490      
pF1KB6 LAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGNF------LFFGCRWRDQDFYWE
       . .:: :. : :..:::::.::::.  :.:. ..:  .       : ::::  :.:  ..
CCDS11 FHLPEDPSHPCILIGPGTGIAPFRSFWQQRLHDSQHKGVRGGRMTLVFGCRRPDEDHIYQ
        970       980       990      1000      1010      1020      

        500       510         520       530        540       550   
pF1KB6 AEWQELEKRDCLTLI-PAFSR-EQEQKVYVQHRLRE-LGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAK
        :  :. ..  :  .  :.::   . :::::  ::. :.: : ..: .. ...:. :...
CCDS11 EEMLEMAQKGVLHAVHTAYSRLPGKPKVYVQDILRQQLASEVLRVLHKEPGHLYVCGDVR
       1030      1040      1050      1060      1070      1080      

           560       570       580       590                       
pF1KB6 SMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA                
        :  ::...: ..   .  :   ..  :. .:.. .:.. .                   
CCDS11 -MARDVAHTLKQLVAAKLKLNEEQVEDYFFQLKSQKRYHEDIFGAVFPYEAKKDRVAVQP
        1090      1100      1110      1120      1130      1140     

CCDS11 SSLEMSAL
        1150   

>>CCDS5912.1 NOS3 gene_id:4846|Hs108|chr7                 (1203 aa)
 initn: 531 init1: 174 opt: 609  Z-score: 555.7  bits: 113.9 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 733; 29.3% identity (55.9% similar) in 651 aa overlap (11-594:525-1158)

                                   10        20        30        40
pF1KB6                     MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQAL
                                     ::.:: ::. ...:::   :. .  ::  .
CCDS59 TFKEVANAVKISASLMGTVMAKRVKATILYGSETGRAQSYAQQLGR-LFRKAFDPRVLCM
          500       510       520       530       540        550   

               50        60        70                              
pF1KB6 DSYPVVNLINEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNF---------------------------
       : : ::.: .: ::. : .: :.::::.: ..:                           
CCDS59 DEYDVVSLEHETLVLVVTSTFGNGDPPENGESFAAALMEMSGPYNSSPRPEQHKSYKIRF
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pF1KB6 ------------WRFIFRKNLPST----ALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLL
                   ::   ::.  .:    ::  . : :.:::. .: .:   :. .  :: 
CCDS59 NSISCSDPLVSSWRRK-RKESSNTDSAGALGTLRFCVFGLGSRAYPHFCAFARAVDTRLE
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pF1KB6 QLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFT
       .:::  :: .  ::.    : . :   : .  .. .   .            .  : : .
CCDS59 ELGGERLLQLGQGDEL--CGQEEAFRGWAQAAFQAACETFCVGEDAKAAARDIFSP-KRS
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pF1KB6 LLFLQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILG
           .   :. .:: ..  ::  .   . : : : . : . . . .  . . :...:  :
CCDS59 WKRQRYRLSAQAEGLQLL-PGLIHV-HRRKMFQATIRSVENLQSSKSTRATILVRLDTGG
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pF1KB6 S-GISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDP--------DQLFMLQPREPD---VSS
       . :...  :: . . : :  . :. . . .   :        .::   .:  :    : .
CCDS59 QEGLQYQPGDHIGVCPPNRPGLVEALLSRVEDPPAPTEPVAVEQLEKGSPGGPPPGWVRD
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         290       300       310       320       330       340     
pF1KB6 PTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEY
       : ::: ::..:. .. .:::.: :  ....::. :. .  :...:  .:.   . : ...
CCDS59 P-RLP-PCTLRQALTFFLDITSPPSPQLLRLLSTLAEEPREQQELEALSQDPRRYEEWKW
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pF1KB6 CNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQ
          :  :.:::: .::  ..:.:   ::  .:...:: .:..:.  :::..... :::. 
CCDS59 FRCP--TLLEVLEQFP--SVALPAPLLLTQLPLLQPRYYSVSSAPSTHPGEIHLTVAVLA
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pF1KB6 FQTR--LKEPRRGLCSSWLASLDPGQGPVRVPLWVRPG-SLAFPETPDTPVIMVGPGTGV
       ..:.  :   . :.::.::..: ::. :  :: ..: . :. .:  :. : :.::::::.
CCDS59 YRTQDGLGPLHYGVCSTWLSQLKPGD-P--VPCFIRGAPSFRLPPDPSLPCILVGPGTGI
             970       980          990      1000      1010        

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pF1KB6 APFRAAIQERV----AQG--QTGNFLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCL-TLIPAFS
       ::::.  :::.    ..:   :   : ::::  . :  .. : :. ..:  .  .. :::
CCDS59 APFRGFWQERLHDIESKGLQPTPMTLVFGCRCSQLDHLYRDEVQNAQQRGVFGRVLTAFS
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pF1KB6 REQEQ-KVYVQHRLR-ELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGL
       :: .. :.:::  :: ::.. : ..:  . ..... :.. .: ..: .... :.  :: .
CCDS59 REPDNPKTYVQDILRTELAAEVHRVLCLERGHMFVCGDV-TMATNVLQTVQRILATEGDM
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           580       590                                           
pF1KB6 CSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA                                    
          .:.  .. :.. .:.. .                                       
CCDS59 ELDEAGDVIGVLRDQQRYHEDIFGLTLRTQEVTSRIRTQSFSLQERQLRGAVPWAFDPPG
      1140      1150      1160      1170      1180      1190       

>>CCDS41842.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12               (1434 aa)
 initn: 346 init1: 148 opt: 599  Z-score: 545.4  bits: 112.2 E(32554): 4.6e-24
Smith-Waterman score: 693; 28.1% identity (55.8% similar) in 654 aa overlap (12-594:766-1398)

                                  10        20        30        40 
pF1KB6                    MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALD
                                     ..:: .:  .. :  :  .. .  .:....
CCDS41 FKKLAEAVKFSAKLMGQAMAKRVKATILYATETGKSQAYAKTLC-EIFKHAFDAKVMSME
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pF1KB6 SYPVVNLINEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFW---------------------RFI---
        : .:.: .: ::. : .: :.::::.: ..:                      ::    
CCDS41 EYDIVHLEHETLVLVVTSTFGNGDPPENGEKFGCALMEMRHPNSVQEERKSYKVRFNSVS
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pF1KB6 --------------FRKNLPSTA-LCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGS
                     .: :. :.. : .. :.:.:::. .: .:   .. .   : .::: 
CCDS41 SYSDSQKSSGDGPDLRDNFESAGPLANVRFSVFGLGSRAYPHFCAFGHAVDTLLEELGGE
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pF1KB6 ALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPS--------
        .: .  ::.    : . :   : . ..  .  ..     ..    .  : :        
CCDS41 RILKMREGDEL--CGQEEAFRTWAKKVFKAACDVFCVGDDVNIEKANNSLISNDRSWKRN
          920         930       940       950       960       970  

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pF1KB6 KFTLLFLQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFD
       :: : :. :::   ..:   .:        ...   : ..: : . .:.  ... .... 
CCDS41 KFRLTFVAEAPEL-TQGLSNVH--------KKRVSAARLLSRQNLQSPKSSRSTIFVRLH
            980        990              1000      1010      1020   

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pF1KB6 ILGSG-ISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDP--DQLF---MLQPREPDV-----
         ::  ...  :: . . :.:    :. . . :   :  .:.    .:. :.  .     
CCDS41 TNGSQELQYQPGDHLGVFPGNHEDLVNALIERLEDAPPVNQMVKVELLEERNTALGVISN
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pF1KB6 -SSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEEL
        ..  ::: ::.. .  ..::::.. :    .. .: :.  : :...:: .:..  . : 
CCDS41 WTDELRLP-PCTIFQAFKYYLDITTPPTPLQLQQFASLATSEKEKQRLLVLSKGLQEYEE
          1090       1100      1110      1120      1130      1140  

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB6 FEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVA
       ... . :  ::.::: .::  .  .:   ::  . ...:: .::.::   .:..... ::
CCDS41 WKWGKNP--TIVEVLEEFP--SIQMPATLLLTQLSLLQPRYYSISSSPDMYPDEVHLTVA
             1150        1160      1170      1180      1190        

            410         420       430       440        450         
pF1KB6 VVQFQTRLKE-P-RRGLCSSWLASLDPGQGPVRVPLWVRPG-SLAFPETPDTPVIMVGPG
       .:...::  : : ..:.:::::  .   :.   :: .:: . :. .:..:..: :.::::
CCDS41 IVSYRTRDGEGPIHHGVCSSWLNRI---QADELVPCFVRGAPSFHLPRNPQVPCILVGPG
     1200      1210      1220         1230      1240      1250     

     460       470         480           490        500       510  
pF1KB6 TGVAPFRAAIQERV--AQGQTGN----FLFFGCRWRDQD-FYWEAEWQELEKRDCLTLIP
       ::.::::.  :.:    : .  :     : ::::    : .: :   :  .:     :  
CCDS41 TGIAPFRSFWQQRQFDIQHKGMNPCPMVLVFGCRQSKIDHIYREETLQAKNKGVFRELYT
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

            520        530        540       550       560       570
pF1KB6 AFSREQEQ-KVYVQHRLRE-LGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEE
       :.::: .. : :::  :.: :.  :.. : .::...:. :.. .: ::: .:.. :. ..
CCDS41 AYSREPDKPKKYVQDILQEQLAESVYRALKEQGGHIYVCGDV-TMAADVLKAIQRIMTQQ
        1320      1330      1340      1350       1360      1370    

              580       590                                        
pF1KB6 GGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA                                 
       : : . ::.....:...  :.. .                                    
CCDS41 GKLSAEDAGVFISRMRDDNRYHEDIFGVTLRTYEVTNRLRSESIAFIEESKKDTDEVFSS
         1380      1390      1400      1410      1420      1430    

>>CCDS55890.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12               (1468 aa)
 initn: 346 init1: 148 opt: 599  Z-score: 545.3  bits: 112.2 E(32554): 4.7e-24
Smith-Waterman score: 655; 29.6% identity (57.6% similar) in 564 aa overlap (64-594:898-1432)

            40        50        60        70        80         90  
pF1KB6 GCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTA-LCQMDF
                                     :: ::         .: :. :.. : .. :
CCDS55 GLAAARDSQHRSYKVRFNSVSSYSDSQKSSGDGPD---------LRDNFESAGPLANVRF
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            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 AVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDR
       .:.:::. .: .:   .. .   : .:::  .: .  ::.    : . :   : . ..  
CCDS55 SVFGLGSRAYPHFCAFGHAVDTLLEELGGERILKMREGDEL--CGQEEAFRTWAKKVFKA
      920       930       940       950         960       970      

            160       170               180       190       200    
pF1KB6 VLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPS--------KFTLLFLQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPS
       .  ..     ..    .  : :        :: : :. :::   ..:   .:        
CCDS55 ACDVFCVGDDVNIEKANNSLISNDRSWKRNKFRLTFVAEAPEL-TQGLSNVH--------
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