Result of FASTA (ccds) for pF1KB7012
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7012, 1040 aa
  1>>>pF1KB7012 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8707+/-0.00118; mu= 10.1931+/- 0.070
 mean_var=227.4470+/-49.283, 0's: 0 Z-trim(109.1): 189  B-trim: 37 in 1/49
 Lambda= 0.085042
 statistics sampled from 10441 (10646) to 10441 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time:  4.000

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1           (1040) 6996 872.9       0
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12          (1018) 3362 427.0 9.9e-119
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12          (1007) 3356 426.3 1.6e-118
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3          (1028) 3084 392.9 1.8e-108
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        (1026) 3057 389.6 1.8e-107
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        (1100) 3054 389.3 2.5e-107
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3        (1026) 3050 388.7 3.3e-107
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3          (1028) 2912 371.8 4.2e-102
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        ( 911) 2653 340.0 1.4e-92
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3         ( 698) 2192 283.3 1.3e-75
CCDS58225.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12         ( 627) 2090 270.7 6.8e-72
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3          (1208) 1415 188.2   9e-47
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7          (1192) 1270 170.4   2e-41
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1248) 1217 163.9 1.9e-39
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1253) 1217 163.9 1.9e-39
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1257) 1217 163.9 1.9e-39
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1240) 1209 162.9 3.7e-39
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3          (1171) 1169 158.0 1.1e-37
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3           (1224) 1169 158.0 1.1e-37
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7           (1183) 1159 156.8 2.5e-37
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7         (2213) 1110 151.1 2.5e-35
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         ( 619)  767 108.4 4.9e-23
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1169)  699 100.3 2.5e-20
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1174)  699 100.3 2.5e-20
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3            (1114)  611 89.5 4.2e-17
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1408)  609 89.4 5.9e-17
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1450)  609 89.4   6e-17
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1461)  609 89.4   6e-17
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3           (1115)  606 88.9 6.5e-17
CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15        ( 814)  542 80.9 1.2e-14
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15        (1150)  529 79.5 4.6e-14
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1070)  521 78.5 8.7e-14
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6           (1078)  521 78.5 8.7e-14
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1014)  467 71.8 8.3e-12
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1551)  466 71.9 1.2e-11
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21         (2012)  468 72.3 1.2e-11
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1606)  466 71.9 1.2e-11
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910)  465 71.9 1.5e-11
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15       (1250)  453 70.2 3.1e-11


>>CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1                (1040 aa)
 initn: 6996 init1: 6996 opt: 6996  Z-score: 4654.5  bits: 872.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6996; 99.9% identity (99.9% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 LRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040
pF1KB7 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
       ::::::::::::::::::::
CCDS14 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
             1030      1040

>>CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12               (1018 aa)
 initn: 2772 init1: 1723 opt: 3362  Z-score: 2245.1  bits: 427.0 E(32554): 9.9e-119
Smith-Waterman score: 3362; 50.5% identity (75.1% similar) in 1003 aa overlap (10-1000:9-992)

               10        20        30             40        50     
pF1KB7 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTT-----FGPVFEDQPLSVLFPEESTEE
                ::.... .. ..  .:    :  ..     :::.::.::.....:::: : 
CCDS87  MKMWLLVSHLVIISITTCLAEFTWYRRYGHGVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEG
                10        20        30        40        50         

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB7 QVLLACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASN
       .: : :::::::  .:.:.::. .. :  ..:...::::::: :: : .:::.: :::::
CCDS87 KVSLNCRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASN
      60        70        80         90       100       110        

         120       130       140       150       160        170    
pF1KB7 PVGTVVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFP
         : : : :: : ::.:. :  :::  :...:: :..: :.:: :.:  :::::::::::
CCDS87 NYGMVRSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFP
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220        230   
pF1KB7 NFIPTDGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAED
        ::  : :.:::::.:::::: ..::: :::::...:     ::::::::  :  .  . 
CCDS87 VFITMDKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPS--ITKSVFSKFIPLIPIPERT
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CCDS87 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
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CCDS87 VATGKPIPTIRWLKNG--------YAYHKGELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
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CCDS87 ELKILALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIW
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CCDS87 EDGSLEINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATM
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CCDS87 QCAASFDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCT
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CCDS87 AQTIVDNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTI
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CCDS87 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
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CCDS87 APNVAPSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDT
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CCDS87 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
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pF1KB7 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
       ..: :: :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
CCDS87 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
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CCDS87 GACNSAGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYK
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CCDS87 VLYRPDGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISGAPTLSP
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CCDS87 SLLGLLLPAFGILVYLEF              
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CCDS87 RSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFPVFITM
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CCDS87 ADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSGAVLKI
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CCDS87 FNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPCVATGK
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pF1KB7 PRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQ
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CCDS87 PIPTIRWLKNGYAYHK--------GELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANAELKIL
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pF1KB7 ALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTL
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CCDS87 ALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIWEDGSL
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pF1KB7 IIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHAS
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CCDS87 EINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATMQCAAS
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CCDS87 FDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCTAQTIV
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CCDS87 DNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTILSDDW
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CCDS87 KDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGAAPNVA
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pF1KB7 PSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVY
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CCDS87 PSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDTGRYVH
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pF1KB7 SNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTW
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CCDS87 KDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSEISVHW
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pF1KB7 EPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNR
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CCDS87 EHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEVGACNS
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CCDS87 AGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYKVLYRP
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CCDS87 DGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISGAPTLSPSLLGL
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CCDS87 LLPAFGILVYLEF              
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CCDS33             MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITL
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CCDS33 HCEARGNPSPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGT
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CCDS33 IVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEE
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CCDS33 DSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMV--TNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYE
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CCDS33 PKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPN
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CCDS33 FQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPK
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CCDS33 PSYRWLKNGAALVLEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVAS
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       ::::  ::...:. .  :. . . :.:::.:.:.  :.::   . .  :...  :: : :
CCDS33 APDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKI
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pF1KB7 RNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHD
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CCDS33 ANVTKADAGTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHD
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pF1KB7 PTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDS
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CCDS33 PLLDIIFTWYFNGALADFKKDGSHFEKVGGSSS-GDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDS
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pF1KB7 ASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQ
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CCDS33 VSSAADLIVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQT
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pF1KB7 VRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPS
       : : :  :.:...:: :. :.::..:::::.::: .: :::: :: :.::.::.: : ::
CCDS33 VTTVPEVIDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPS
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CCDS33 EVNGGGGSRSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRN
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pF1KB7 ESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEP
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CCDS33 ESIVPYSPYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNT
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CCDS33 IPWKLSNGHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSA
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CCDS33 GAGPFSATVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTS
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pF1KB7 -QNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAE-VHIVRNGGTSMM
        ::....  : . ...  . .:. ::    ......:  ::::  .: ..: :  . .  
CCDS33 SQNNVQVLNTNKTSAE--LVLPIKEDY---IIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDAR
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pF1KB7 VENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
         . :.  . :: .     : .::.      
CCDS33 GSTSAISNV-HPMSSYMPIVLFLIVYVLW  
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>>CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11             (1026 aa)
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CCDS53             MASSWKLMLFLSVTMCLSESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALN
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CCDS53 CEVRGNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSI
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CCDS53 LSREATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAED
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CCDS53 SRRFISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEP
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pF1KB7 SIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVS
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CCDS53 KIEVHFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQ
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pF1KB7 FEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPT
       ..: : :::.::::.:... .:.. : . :.:.. ..::. : :: ::: : :.::::::
CCDS53 LDDAGIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPT
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CCDS53 YRWLKNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAP
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pF1KB7 DFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRN
        : :: ... : ...  :..: :.:...:: .. :.:: . . ...:... :::.: : :
CCDS53 TFALNQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILN
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pF1KB7 ISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPT
        :.::::::.: .:: .:.:.  . :::.. :.: :.:. .....:....:.:.: :: .
CCDS53 ASKSDEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDAS
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pF1KB7 MDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSAS
       .:.:: :::   ::::.. :::..   .. . .:: : :  : :.:.: : .::..::.:
CCDS53 LDVTFYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVS
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pF1KB7 KEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVR
        :: .:::::::::: :.:..: ..:  :::: . ::::::..:.::::.: .  :. :.
CCDS53 DEAELLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVK
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pF1KB7 TNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGL
       : :  : :. :.:... :.::..:::::.:.: .:::.:: ::  ::: ::.:..::...
CCDS53 TVPEIITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNV
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pF1KB7 SGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNES
       :: .:   ::.. : :.:.:.:::.::::...:: .:.  :.   : ...:. :.: .::
CCDS53 SGRSGRRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDES
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pF1KB7 VRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQ
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CCDS53 VPPLTPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIK
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CCDS53 PPSSEVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHS
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CCDS53 NSQVIETQKLQAVVPLP-DAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVPSYSGGKIT----SAQ
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CCDS53 STLHSLSTSSSSVTLLLALMIPSTSW
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CCDS53 ISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEV
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CCDS53 HFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDA
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CCDS53 GIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWL
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pF1KB7 RNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFRL
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CCDS53 KNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFAL
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pF1KB7 NPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISRS
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CCDS53 NQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKS
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pF1KB7 FTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEAT
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CCDS53 FYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAE
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pF1KB7 VLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNPA
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CCDS53 LLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPE
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pF1KB7 NIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGGG
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CCDS53 IITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRS
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pF1KB7 TPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDMN
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CCDS53 TPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIKESL-
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pF1KB7 GILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPASP
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CCDS53 GRPQGFEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYGPPSS
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CCDS53 EVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHSNSQV
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pF1KB7 HLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPA-EVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
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CCDS53 IETQKLQAVVPLP-DAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVPSYSGGKIT----SAQSTLH
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pF1KB7 PGTVISHSVAMLILIGSLEL  
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CCDS53 SLSTSSSSVTLLLALMIPSTSW
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CCDS43 VKGNPKPHIRWKLNGTDVDTGMDFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVS
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CCDS43 REAKLQFAYLDNFKTRTRSTVSVRRGQGMVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSY--QDNR
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pF1KB7 HFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAPSI
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CCDS43 RFVSQETGNLYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTV--TNHKVLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKI
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CCDS43 EVQFPETVPTAKGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHKSNGILEIPNFQQ
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pF1KB7 EDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTV
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CCDS43 EDAGLYECVAENSRGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTY
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pF1KB7 RWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPD
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CCDS43 KWLKNGEPLLTRDRIQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPD
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pF1KB7 FRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNI
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CCDS43 FSRTLLKRVTLVKVGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINV
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pF1KB7 SRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTM
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CCDS43 TKSDAGSYTCIATNHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSL
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CCDS43 DIVFTWSFNGHLIDFDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSA
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       .: ..:.:: :::: .::::: :. :.:.. ..:: :  . ::: : :::.::. . . .
CCDS43 SSATVNVTTRKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSS
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        ..  :.:. .:. .: :  . ...:.  . ::::  .:                     
CCDS43 TSVIETNKTSVELSLPFDEDY-IIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSN
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CCDS43 ACTLSAISTIMISLTARSSL  
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CCDS25 FQQEDEGFYECIASNLRGRNLAKGQLIFYAPPEWEQKIQNTHLSIYDNLLWECKASGKPN
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CCDS25 PWYTWLKNGERLNPEERIQIENGTLIITMLNVSDSGVYQCAAENKYQIIYANAELRVLAS
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CCDS25 APDFSKSPVKKKSFVQVGGDIVIGCKPNAFPRAAISWKRGTETLRQSKRIFLLEDGSLKI
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CCDS25 YNITRSDAGSYTCIATNQFGTAKNTGSLIVKERTVITVPPSKMDVTVGESIVLPCQVSHD
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CCDS25 PSIEVVFVWFFNGDVIDLKKGVAHFERIG-GESVGDLMIRNIQLHHSGKYLCTVQTTLES
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CCDS25 LSAVADIIVRGPPGPPEDVQVEDISSTTSQLSWRAGPDNNSPIQIFTIQTRTPFSVGWQA
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CCDS25 VATVPEILNGKTYNATVVGLSPWVEYEFRVVAGNSIGIGEPSEPSELLRTKASVPVVAPV
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CCDS25 IAWNRNTGRVLGYEVLYWTDDSKESMIGKIRVSGNVTTKNITGLKANTIYFASVRAYNTA
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CCDS25 RQSKTHILETNNTSAE--LLVPFEEDY---LIEIRTVSDGGDGSSSEEIRIPKM--SSLS
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CCDS25 SRGIQFLEPSTHFLSIVIVIFHCFAIQPLI     
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CCDS58 PSWLGAAQNYYSPINLYHSSDAFKQDESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVR
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CCDS58 GNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSRE
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CCDS58 ATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRF
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       .:: ::::::.....::.:.: ::. . .  ..  :.:  . :.:  . .   . :.:..
CCDS58 ISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEV
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pF1KB7 RFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVSFEDE
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CCDS58 HFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDA
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