FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0011, 813 aa 1>>>pF1KE0011 813 - 813 aa - 813 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5403+/-0.000548; mu= 2.3700+/- 0.034 mean_var=276.4156+/-57.843, 0's: 0 Z-trim(115.6): 151 B-trim: 605 in 2/54 Lambda= 0.077142 statistics sampled from 26005 (26156) to 26005 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16 Scan time: 13.660 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002378 (OMIM: 159350) colorectal mutant cancer ( 829) 5057 577.3 9.4e-164 NP_001078846 (OMIM: 159350) colorectal mutant canc (1019) 5057 577.4 1.1e-163 XP_016864963 (OMIM: 159350) PREDICTED: colorectal ( 841) 4280 490.8 1e-137 XP_005272048 (OMIM: 159350) PREDICTED: colorectal ( 851) 4280 490.8 1e-137 XP_016864962 (OMIM: 159350) PREDICTED: colorectal (1041) 4280 490.9 1.2e-137 XP_016883107 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2198) 273 45.3 0.0036 XP_011526821 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2240) 273 45.3 0.0037 XP_011526820 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2319) 273 45.3 0.0038 XP_016883106 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2332) 273 45.3 0.0038 XP_011526819 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2355) 273 45.3 0.0038 XP_005260320 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2370) 273 45.3 0.0038 XP_006723757 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2404) 273 45.3 0.0039 XP_006723756 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 273 45.3 0.0039 XP_006723755 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 273 45.3 0.0039 XP_005260319 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 273 45.3 0.0039 XP_006723754 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 273 45.3 0.0039 NP_009117 (OMIM: 609689) centrosome-associated pro (2442) 273 45.3 0.0039 XP_006723753 (OMIM: 609689) PREDICTED: centrosome- (2442) 273 45.3 0.0039 >>NP_002378 (OMIM: 159350) colorectal mutant cancer prot (829 aa) initn: 5057 init1: 5057 opt: 5057 Z-score: 3060.9 bits: 577.3 E(85289): 9.4e-164 Smith-Waterman score: 5057; 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99.8% identity (100.0% similar) in 810 aa overlap (4-813:210-1019) 10 20 30 pF1KE0 MGLLHSAALASLKGDIVELNKRLQQTERERDLL :::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HQQAALHKLLTQSPHIGNSVGGSYLELANTLHSAALASLKGDIVELNKRLQQTERERDLL 180 190 200 210 220 230 40 50 60 70 80 90 pF1KE0 EKKLAKAQCEQSHLMREHEDVRERTTLRYEERITELHSVIAELNKKIDRLQGTTIREEDE :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EKKLAKAQCEQSHLMREHEDVQERTTLRYEERITELHSVIAELNKKIDRLQGTTIREEDE 240 250 260 270 280 290 100 110 120 130 140 150 pF1KE0 YSELRSELSQSQHEVNEDSRSMDQDQTSVSIPENQSTMVTADMDNCSDLNSELQRVLTGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 YSELRSELSQSQHEVNEDSRSMDQDQTSVSIPENQSTMVTADMDNCSDLNSELQRVLTGL 300 310 320 330 340 350 160 170 180 190 200 210 pF1KE0 ENVVCGRKKSSCSLSVAEVDRHIEQLTTASEHCDLAIKTVEEIEGVLGRDLYPNLAEERS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ENVVCGRKKSSCSLSVAEVDRHIEQLTTASEHCDLAIKTVEEIEGVLGRDLYPNLAEERS 360 370 380 390 400 410 220 230 240 250 260 270 pF1KE0 RWEKELAGLREENESLTAMLCSKEEELNRTKATMNAIREERDRLRRRVRELQTRLQSVQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RWEKELAGLREENESLTAMLCSKEEELNRTKATMNAIREERDRLRRRVRELQTRLQSVQA 420 430 440 450 460 470 280 290 300 310 320 330 pF1KE0 TGPSSPGRLTSTNRPINPSTGELSTSSSSNDIPIAKIAERVKLSKTRSESSSSDRPVLGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TGPSSPGRLTSTNRPINPSTGELSTSSSSNDIPIAKIAERVKLSKTRSESSSSDRPVLGS 480 490 500 510 520 530 340 350 360 370 380 390 pF1KE0 EISSIGVSSSVAEHLAHSLQDCSNIQEIFQTLYSHGSAISESKIREFEVETERLNSRIEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EISSIGVSSSVAEHLAHSLQDCSNIQEIFQTLYSHGSAISESKIREFEVETERLNSRIEH 540 550 560 570 580 590 400 410 420 430 440 450 pF1KE0 LKSQNDLLTITLEECKSNAERMSMLVGKYESNATALRLALQYSEQCIEAYELLLALAESE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LKSQNDLLTITLEECKSNAERMSMLVGKYESNATALRLALQYSEQCIEAYELLLALAESE 600 610 620 630 640 650 460 470 480 490 500 510 pF1KE0 QSLILGQFRAAGVGSSPGDQSGDENITQMLKRAHDCRKTAENAAKALLMRLDGSCGGAFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::: NP_001 QSLILGQFRAAGVGSSPGDQSGDENITQMLKRAHDCRKTAENAAKALLMKLDGSCGGAFA 660 670 680 690 700 710 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 VAGCSVQPWESLSSNSHTSTTSSTASSCDTEFTKEDEQRLKDYIQQLKNDRAAVKLTMLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 VAGCSVQPWESLSSNSHTSTTSSTASSCDTEFTKEDEQRLKDYIQQLKNDRAAVKLTMLE 720 730 740 750 760 770 580 590 600 610 620 630 pF1KE0 LESIHIDPLSYDVKPRGDSQRLDLENAVLMQELMAMKEEMAELKAQLYLLEKEKKALELK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LESIHIDPLSYDVKPRGDSQRLDLENAVLMQELMAMKEEMAELKAQLYLLEKEKKALELK 780 790 800 810 820 830 640 650 660 670 680 690 pF1KE0 LSTREAQEQAYLVHIEHLKSEVEEQKEQRMRSLSSTSSGSKDKPGKECADAASPALSLAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LSTREAQEQAYLVHIEHLKSEVEEQKEQRMRSLSSTSSGSKDKPGKECADAASPALSLAE 840 850 860 870 880 890 700 710 720 730 740 750 pF1KE0 LRTTCSENELAAEFTNAIRREKKLKARVQELVSALERLTKSSEIRHQQSAEFVNDLKRAN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LRTTCSENELAAEFTNAIRREKKLKARVQELVSALERLTKSSEIRHQQSAEFVNDLKRAN 900 910 920 930 940 950 760 770 780 790 800 810 pF1KE0 SNLVAAYEKAKKKHQNKLKKLESQMMAMVERHETQVRMLKQRIALLEEENSRPHTNETSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SNLVAAYEKAKKKHQNKLKKLESQMMAMVERHETQVRMLKQRIALLEEENSRPHTNETSL 960 970 980 990 1000 1010 >>XP_016864963 (OMIM: 159350) PREDICTED: colorectal muta (841 aa) initn: 4243 init1: 4243 opt: 4280 Z-score: 2593.5 bits: 490.8 E(85289): 1e-137 Smith-Waterman score: 4999; 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