Result of FASTA (ccds) for pF1KB6529
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6529, 365 aa
  1>>>pF1KB6529 365 - 365 aa - 365 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3574+/-0.00147; mu= 1.2549+/- 0.084
 mean_var=274.0131+/-66.232, 0's: 0 Z-trim(106.2): 633  B-trim: 256 in 2/47
 Lambda= 0.077480
 statistics sampled from 8092 (8864) to 8092 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.272), width:  16
 Scan time:  2.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6          ( 365) 2426 285.3 5.8e-77
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22        ( 367) 1601 193.0 3.4e-49
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360) 1506 182.4 5.2e-46
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360) 1487 180.3 2.3e-45
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22        ( 364) 1485 180.1 2.7e-45
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 307) 1165 144.2 1.4e-34
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 379) 1005 126.4 3.9e-29
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22         ( 360)  985 124.2 1.8e-28
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 357)  946 119.8 3.6e-27
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 382)  936 118.7 8.2e-27
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5           ( 424)  936 118.8 8.8e-27
CCDS77688.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22        ( 357)  929 117.9 1.4e-26
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 384)  923 117.3 2.3e-26
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 427)  923 117.3 2.4e-26
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 384)  920 116.9 2.9e-26
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 427)  920 117.0 3.1e-26
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 382)  918 116.7 3.3e-26
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5           ( 424)  918 116.8 3.6e-26
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4         ( 422)  913 116.2 5.2e-26
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4          ( 426)  913 116.2 5.3e-26
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4         ( 464)  913 116.3 5.5e-26
CCDS47356.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 242)  803 103.6 1.8e-22
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17          ( 527)  743 97.3 3.2e-20
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8        ( 544)  736 96.6 5.6e-20
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 335)  727 95.3 8.2e-20
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17         ( 677)  727 95.7 1.3e-19
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17         ( 816)  727 95.8 1.5e-19
CCDS78103.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 214)  698 91.8 5.8e-19
CCDS60527.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10         ( 308)  701 92.4 5.8e-19
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  695 91.7 9.2e-19
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298)  672 89.1 5.4e-18
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6            ( 632)  622 83.9 4.2e-16
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15         ( 721)  619 83.6 5.8e-16
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  594 80.5 2.5e-15
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 292)  591 80.0 2.8e-15
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297)  591 80.0 2.8e-15
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 583)  595 80.8 3.2e-15
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6             ( 623)  595 80.9 3.4e-15
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 648)  595 80.9 3.5e-15
CCDS82937.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4         ( 319)  589 79.9 3.5e-15
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18         ( 587)  593 80.6 3.8e-15
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7            ( 326)  579 78.7 7.7e-15
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496)  579 79.0   1e-14
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502)  579 79.0   1e-14
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570)  579 79.0 1.1e-14
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  572 78.0 1.4e-14
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4           ( 493)  567 77.6 2.5e-14
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4          ( 570)  567 77.7 2.8e-14
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523)  560 76.9 4.5e-14
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523)  560 76.9 4.5e-14


>>CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6               (365 aa)
 initn: 2426 init1: 2426 opt: 2426  Z-score: 1495.2  bits: 285.3 E(32554): 5.8e-77
Smith-Waterman score: 2426; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 EFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEMT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVTG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 QALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRRR
              310       320       330       340       350       360

            
pF1KB6 SGMKL
       :::::
CCDS48 SGMKL
            

>>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22             (367 aa)
 initn: 1498 init1: 970 opt: 1601  Z-score: 996.7  bits: 193.0 E(32554): 3.4e-49
Smith-Waterman score: 1601; 67.1% identity (88.8% similar) in 347 aa overlap (6-351:8-353)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB6   MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSR
              ..:::.:.:.:::::.  .: .   :::::::.::::.: :.: ::::::: :
CCDS14 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB6 PFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIM
       :::::.::::::::: :::::.:::::::::::::  .: .: ::::::::: ::: :.:
CCDS14 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
               70        80        90       100       110       120

      120        130       140       150       160       170       
pF1KB6 GME-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADA
         : ..:..::.:::::::::.:::.::..::::::::::::::::::::::::::.::.
CCDS14 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 EMTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILK
       ::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::.::::::::.:.:::: .:.:
CCDS14 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 VTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRL
       :::.: .::::.:..  ::.:...::.  .:::....  ::: :..:::::: ::...:.
CCDS14 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 TAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDS
       ::..::.::.:: ..: :.: ..:. .:::..    :.::::.  :::...:.:      
CCDS14 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQK-YDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGA
              310       320        330       340       350         

       360     
pF1KB6 RRRSGMKL
               
CCDS14 RVSKETPL
     360       

>>CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6               (360 aa)
 initn: 1436 init1: 912 opt: 1506  Z-score: 939.5  bits: 182.4 E(32554): 5.2e-46
Smith-Waterman score: 1506; 62.2% identity (86.9% similar) in 344 aa overlap (9-351:8-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
               ::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
CCDS48  MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
       :: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : :::  .: .::..:.  
CCDS48 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
       ........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
CCDS48 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
       ::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::.::: : :..:::  ::...
CCDS48 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLV
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
       :.::.:...:.....:..::::: : :. .:...:  :.: :.::::::: :: :::.::
CCDS48 GTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITA
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
       ::::.: .:  ..::..:  :. :.:.:.: . : .::::.  : :...: :        
CCDS48 AQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEM
     300       310       320        330       340       350        

     360     
pF1KB6 RSGMKL
             
CCDS48 ES    
      360    

>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6               (360 aa)
 initn: 1400 init1: 893 opt: 1487  Z-score: 928.0  bits: 180.3 E(32554): 2.3e-45
Smith-Waterman score: 1487; 61.3% identity (86.0% similar) in 344 aa overlap (9-351:8-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
               ::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
CCDS48  MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
       :: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : :::  .: .::..:.  
CCDS48 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
       ........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
CCDS48 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
       ::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::.::: : :...:: ::...:
CCDS48 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLT
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
       :.: . ..... .. :..::::: : :. .:...:  :.: :.::::::: :: :::.::
CCDS48 GTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITA
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
       ::::.: .:  ..::..:  :. :.:.:.: . : .::::.  : :...: :        
CCDS48 AQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEM
     300       310       320        330       340       350        

     360     
pF1KB6 RSGMKL
             
CCDS48 ES    
      360    

>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22             (364 aa)
 initn: 1362 init1: 908 opt: 1485  Z-score: 926.7  bits: 180.1 E(32554): 2.7e-45
Smith-Waterman score: 1485; 60.5% identity (86.2% similar) in 347 aa overlap (6-351:5-350)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
            . :::.:..:::.::.:.   .   :::::::::::: : :  .:::.:::::::
CCDS14  MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMGM
       :: : :.:.:::: ::::..::::::::::::::.:...: . :::  .: .::..:.  
CCDS14 QSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKC
      60        70        80        90       100       110         

               130       140       150       160       170         
pF1KB6 E-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
       . .:.:..:.::::.:.:::::::::..::::::.:.::::::::.::::::::.:: ::
CCDS14 QALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEM
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
       ::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.: ::.:: :.::.::: .:..:.
CCDS14 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVV
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
       :.:. : . :.... :..::::::  :.::....:  :.: : ::: .:: :: :.:..:
CCDS14 GTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSA
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB6 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
       :.::.: .:  ..:::.: ::. :.:.:.: .. :..:::.  :.:...:.:        
CCDS14 AEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPG
     300       310       320        330       340       350        

     360     
pF1KB6 RSGMKL
             
CCDS14 SLEIEQ
      360    

>>CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6               (307 aa)
 initn: 1154 init1: 668 opt: 1165  Z-score: 734.3  bits: 144.2 E(32554): 1.4e-34
Smith-Waterman score: 1165; 66.4% identity (90.3% similar) in 247 aa overlap (9-254:8-254)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
               ::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
CCDS48  MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110          
pF1KB6 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
       :: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : :::  .: .::..:.  
CCDS48 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
      60        70        80        90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
       ........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
CCDS48 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
       ::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::.::: : :..:::  ::...
CCDS48 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLV
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB6 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
       :.::.:...:.....                                             
CCDS48 GTPGAELLKKISSESLSTCWRRCLYWTQIRELQRPKPLHMPTLLSTTILMMNQWPILMIS
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16              (379 aa)
 initn: 881 init1: 498 opt: 1005  Z-score: 636.5  bits: 126.4 E(32554): 3.9e-29
Smith-Waterman score: 1005; 45.1% identity (76.3% similar) in 337 aa overlap (22-351:40-373)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB6          MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKV
                                     :. :..  ..: :::: : :: :.    .:
CCDS10 GGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPR-YTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRV
      10        20        30        40         50        60        

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB6 AIKKLSRPFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQ
       ::::.: ::. . . .:. ::. .: ...::::::. :..  ::.:. . : :.:. .:.
CCDS10 AIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQDLME
       70         80        90       100        110       120      

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 TDLQKIM-GMEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFG
       ::: :.. ....:...: :..::.:.::::::::.:.::::::.:: .:  :.::: :::
CCDS10 TDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKICDFG
        130       140       150       160       170       180      

                    180       190       200       210       220    
pF1KB6 LARHADAE------MTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFK
       ::: :: :      .: ::.::::::::..:.   :....::::::::.::::... .: 
CCDS10 LARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFP
        190       200       210       220       230       240      

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB6 GKDYLDQLTQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADL
       :: :::::..:: . : :. : .. . .  :..:.::::.  .  ...:::... .: ::
CCDS10 GKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKALDL
        250       260       270       280       290       300      

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB6 LEKMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYK
       :..:: .. .::.:. .::.::..: . :: .:  :..::  ..: . :  .. :. :..
CCDS10 LDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKELIFQ
        310       320       330       340       350       360      

          350       360     
pF1KB6 EIVNFSPIARKDSRRRSGMKL
       : . :.:              
CCDS10 ETARFQPGVLEAP        
        370                 

>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22              (360 aa)
 initn: 873 init1: 483 opt: 985  Z-score: 624.7  bits: 124.2 E(32554): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 985; 44.4% identity (74.7% similar) in 340 aa overlap (22-354:23-359)

                10        20        30        40        50         
pF1KB6  MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRP
                             :. :.. ...: :::: :::: :. .  .:::::.: :
CCDS13 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPR-YTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKIS-P
               10        20         30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB6 FQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG
       :. . . .:. ::. .: ...:::.::. :..  : ..... : :.:. .:.::: :.. 
CCDS13 FEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIR-APTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLK
       60        70        80        90        100       110       

     120        130       140       150       160       170        
pF1KB6 ME-FSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAE
        . .:...: :..::.:.::::::::.:.::::::.:: .:  :.::: :::::: :: .
CCDS13 TQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLKICDFGLARVADPD
       120       130       140       150       160       170       

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB6 ------MTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQL
             .: ::.::::::::..:.   :....::::::::.::::... .: :: :::::
CCDS13 HDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQL
       180       190       200       210       220       230       

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB6 TQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELD
       ..:: . : :. : .. . .  :..:. :::.  .  ...::: :. .: :::.::: ..
CCDS13 NHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFN
       240       250       260       270       280       290       

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB6 VDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPI
         ::. . :::.::..: . :: .:  :. ::  ..: . :  .. :. :..: . :.: 
CCDS13 PHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPG
       300       310       320       330       340       350       

            360     
pF1KB6 ARKDSRRRSGMKL
        :           
CCDS13 YRS          
       360          

>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16              (357 aa)
 initn: 875 init1: 470 opt: 946  Z-score: 601.2  bits: 119.8 E(32554): 3.6e-27
Smith-Waterman score: 946; 46.6% identity (77.7% similar) in 309 aa overlap (22-323:40-344)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB6          MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKV
                                     :. :..  ..: :::: : :: :.    .:
CCDS42 GGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPR-YTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRV
      10        20        30        40         50        60        

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB6 AIKKLSRPFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQ
       ::::.: ::. . . .:. ::. .: ...::::::. :..  ::.:. . : :.:. .:.
CCDS42 AIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQDLME
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              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 TDLQKIM-GMEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFG
       ::: :.. ....:...: :..::.:.::::::::.:.::::::.:: .:  :.::: :::
CCDS42 TDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKICDFG
        130       140       150       160       170       180      

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pF1KB6 LARHADAE------MTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFK
       ::: :: :      .: ::.::::::::..:.   :....::::::::.::::... .: 
CCDS42 LARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFP
        190       200       210       220       230       240      

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pF1KB6 GKDYLDQLTQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADL
       :: :::::..:: . : :. : .. . .  :..:.::::.  .  ...:::... .: ::
CCDS42 GKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKALDL
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pF1KB6 LEKMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYK
       :..:: .. .::.:. .::.::..: . :: .:. .:.:                     
CCDS42 LDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEV-GQSPAAVGLGAGEQGGT        
        310       320       330       340        350               

          350       360     
pF1KB6 EIVNFSPIARKDSRRRSGMKL

>>CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5               (382 aa)
 initn: 1061 init1: 606 opt: 936  Z-score: 594.8  bits: 118.7 E(32554): 8.2e-27
Smith-Waterman score: 1105; 48.3% identity (76.7% similar) in 356 aa overlap (9-349:10-363)

                10        20        30        40        50         
pF1KB6  MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRP
                ::. .:  ... . : : .   .:::: : ::.:.:   : .::.::::::
CCDS43 MSDSKCDSQFYSVQVADSTFTVLKRYQQLKPIGSGAQGIVCAAFDTVLGINVAVKKLSRP
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB6 FQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG
       ::..  ::::::::.::: ..:.:.:.::.:::: ..:..: : :::: .:...: ... 
CCDS43 FQNQTHAKRAYRELVLLKCVNHKNIISLLNVFTPQKTLEEFQDVYLVMELMDANLCQVIH
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pF1KB6 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHA--DA
       ::...:...::.:::: :.:..::::..::::::.:..:. :: :::::::::: :  . 
CCDS43 MELDHERMSYLLYQMLCGIKHLHSAGIIHRDLKPSNIVVKSDCTLKILDFGLARTACTNF
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pF1KB6 EMTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILK
        :: :::::.::::::::. : :...:::::::::::::.  :.:: :.::.:: .....
CCDS43 MMTPYVVTRYYRAPEVILG-MGYKENVDIWSVGCIMAEMVLHKVLFPGRDYIDQWNKVIE
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pF1KB6 VTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPR------------ASPQAADLL
         :.:..::..::.  ....:... :. :   : .:::              . :: :::
CCDS43 QLGTPSAEFMKKLQP-TVRNYVENRPKYPGIKFEELFPDWIFPSESERDKIKTSQARDLL
     240       250        260       270       280       290        

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pF1KB6 EKMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEE-ETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYK
        ::: .: :::... .:: ::..  . :: : :.   : .: .::... ...:::. :::
CCDS43 SKMLVIDPDKRISVDEALRHPYITVWYDPAEAEAPPPQIYDAQLEEREHAIEEWKELIYK
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       :....                   
CCDS43 EVMDWEERSKNGVVKDQPSAQMQQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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