Result of FASTA (ccds) for pF1KB6564
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6564, 400 aa
  1>>>pF1KB6564 400 - 400 aa - 400 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7057+/-0.00093; mu= 6.9714+/- 0.055
 mean_var=246.8607+/-54.926, 0's: 0 Z-trim(112.7): 629  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.081630
 statistics sampled from 12660 (13410) to 12660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.412), width:  16
 Scan time:  2.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19        ( 400) 2665 327.0 1.9e-89
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15        ( 393) 2130 264.0 1.8e-70
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15        ( 412)  781 105.1 1.2e-22
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15        ( 448)  781 105.2 1.3e-22
CCDS42051.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15        ( 438)  760 102.7   7e-22
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17        ( 334)  640 88.4 1.1e-17
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17        ( 318)  620 86.0 5.2e-17
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17        ( 347)  620 86.1 5.5e-17
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17        ( 399)  612 85.2 1.2e-16
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17        ( 410)  612 85.2 1.2e-16
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17        ( 278)  606 84.3 1.5e-16
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19        ( 419)  579 81.4 1.8e-15
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19        ( 435)  579 81.4 1.8e-15
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19        ( 426)  543 77.1 3.4e-14
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 519)  509 73.2 6.1e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20          ( 487)  508 73.1 6.4e-13
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 491)  508 73.1 6.4e-13
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2          ( 426)  476 69.2   8e-12
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13          ( 443)  469 68.4 1.5e-11
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13         ( 431)  464 67.8 2.1e-11
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX         ( 416)  445 65.6 9.9e-11


>>CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19             (400 aa)
 initn: 2665 init1: 2665 opt: 2665  Z-score: 1719.3  bits: 327.0 E(32554): 1.9e-89
Smith-Waterman score: 2665; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MLARRKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLARRKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 KAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 GTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400
pF1KB6 KMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
              370       380       390       400

>>CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15             (393 aa)
 initn: 2120 init1: 1539 opt: 2130  Z-score: 1378.8  bits: 264.0 E(32554): 1.8e-70
Smith-Waterman score: 2130; 80.4% identity (92.0% similar) in 398 aa overlap (2-399:1-391)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MLARRKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQ
        . ..::. : . .::.  .: . .. ...:.::  ::::::::::::::.:::::::::
CCDS10  MPKKKPT-P-IQLNPA-PDGSAVNGTSSAETNLEALQKKLEELELDEQQRKRLEAFLTQ
                  10         20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 KAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
       : :::::::::::.:::::::::::: ::.:.::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS10 KQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQ
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::::.:::::::::..:
CCDS10 VLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKG
        120       130       140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 LAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQ
       :.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS10 LTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQ
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 GTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRP
       :::::::::::::::::::.:::::::::::::::: .::  :    ::.     :::: 
CCDS10 GTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCQV----EGDAAETPPRPRT
        240       250       260       270           280       290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADL
       ::::.:..:::::: :::::::::::::::::::.:::. .::.::::::::::::::::
CCDS10 PGRPLSSYGMDSRPPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADL
            300       310       320       330       340       350  

              370       380       390       400 
pF1KB6 KMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV 
       :.:  :.:::::..::::::::::.:. ::::.:::..:  
CCDS10 KQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLNQPSTPTHAAGV
            360       370       380       390   

>>CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15             (412 aa)
 initn: 712 init1: 388 opt: 781  Z-score: 520.0  bits: 105.1 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 863; 40.6% identity (68.3% similar) in 347 aa overlap (52-395:110-412)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB6 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
                                     :.  : : .    :.....:..  . :: :
CCDS55 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
      80        90       100       110       120       130         

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB6 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
       :::.: :. : ::: :.: :.: :.:   ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS55 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
     140       150       160       170       180       190         

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB6 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
       .:::: : :::::::      ...::..::....::..::.::  . .:.::::::::.:
CCDS55 RISICTEFMDGGSLDVY----RKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
     200       210           220       230        240       250    

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
       ::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::::::..: .:...::.::.:.:..:::
CCDS55 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELA
          260       270       280       290       300       310    

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
       .::.: :               .. ..:   :. :                      ..:
CCDS55 LGRFPYPQ--------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
          320                        330                           

             330       340       350       360        370       380
pF1KB6 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
       :. ::.:  : :: : :.  : .:...:. :.: ::   . : .: :: . .. . .  .
CCDS55 LQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVS
         340       350       360       370       380       390     

                390       400
pF1KB6 GWLCKTL--RLNQPGTPTRTAV
        :.:..:  : .: : :     
CCDS55 MWVCRALEERRSQQGPP     
         400       410       

>>CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15             (448 aa)
 initn: 712 init1: 388 opt: 781  Z-score: 519.6  bits: 105.2 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 863; 40.6% identity (68.3% similar) in 347 aa overlap (52-395:146-448)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB6 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
                                     :.  : : .    :.....:..  . :: :
CCDS10 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
         120       130       140       150       160       170     

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB6 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
       :::.: :. : ::: :.: :.: :.:   ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS10 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
         180       190       200       210       220       230     

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB6 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
       .:::: : :::::::      ...::..::....::..::.::  . .:.::::::::.:
CCDS10 RISICTEFMDGGSLDVY----RKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
         240       250           260       270        280       290

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
       ::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::::::..: .:...::.::.:.:..:::
CCDS10 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFMELA
              300       310       320       330       340       350

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
       .::.: :               .. ..:   :. :                      ..:
CCDS10 LGRFPYPQ--------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
                            360                                370 

             330       340       350       360        370       380
pF1KB6 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
       :. ::.:  : :: : :.  : .:...:. :.: ::   . : .: :: . .. . .  .
CCDS10 LQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVS
             380       390       400       410       420       430 

                390       400
pF1KB6 GWLCKTL--RLNQPGTPTRTAV
        :.:..:  : .: : :     
CCDS10 MWVCRALEERRSQQGPP     
             440             

>>CCDS42051.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15             (438 aa)
 initn: 770 init1: 353 opt: 760  Z-score: 506.4  bits: 102.7 E(32554): 7e-22
Smith-Waterman score: 795; 38.9% identity (66.0% similar) in 347 aa overlap (52-395:146-438)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB6 PSPTSEGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAG
                                     :.  : : .    :.....:..  . :: :
CCDS42 NIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHG
         120       130       140       150       160       170     

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB6 NGGVVTKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDG
       :::.: :. : ::: :.: :.: :.:   ...::. ::..:..:.: ::.::::::. ..
CCDS42 NGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEILYKCDSSYIIGFYGAFFVEN
         180       190       200       210       220       230     

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB6 EISICMEHMDGGSLDQVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
       .:::: : :::::::      ...::..::....::..::.::  . .:.::::::::.:
CCDS42 RISICTEFMDGGSLDVY----RKMPEHVLGRIAVAVVKGLTYLW-SLKILHRDVKPSNML
         240       250           260       270        280       290

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMAPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELA
       ::.::..:::::::: ::..:.:...::: .::::::..: .:...::.::.:.:..:  
CCDS42 VNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTYVGTNAYMAPERISGEQYGIHSDVWSLGISFME--
              300       310       320       330       340          

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB6 VGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFEL
                             .. ..:   :. :                      ..:
CCDS42 ----------------------IQKNQG---SLMP----------------------LQL
                            350                                360 

             330       340       350       360        370       380
pF1KB6 LDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFI-KRSEVEEVDFA
       :. ::.:  : :: : :.  : .:...:. :.: ::   . : .: :: . .. . .  .
CCDS42 LQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVS
             370       380       390       400       410       420 

                390       400
pF1KB6 GWLCKTL--RLNQPGTPTRTAV
        :.:..:  : .: : :     
CCDS42 MWVCRALEERRSQQGPP     
             430             

>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17             (334 aa)
 initn: 753 init1: 281 opt: 640  Z-score: 431.3  bits: 88.4 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 697; 37.2% identity (62.8% similar) in 328 aa overlap (66-383:47-328)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KB6 DLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVVTKVQHRPSG
                                     :.: ::.: : ::: :  ::: :..: :::
CCDS11 KEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSG
         20        30        40        50        60        70      

         100       110       120        130       140       150    
pF1KB6 LIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQV-LHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGS
        ::: : :.  ..   ..... .:.. ..  . :. : ::::.. .:.. :::: ::  :
CCDS11 QIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-S
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pF1KB6 LD----QVLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNILVNSRGEIKL
       ::    ::. ... :::.::::........: .:. : ...::::::::.:.:. :..:.
CCDS11 LDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKM
         140       150       160       170       180       190     

              220        230           240       250       260     
pF1KB6 CDFGVSGQLIDSMANSF-VGTRSYMAPER----LQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGRY
       ::::.:: :.::.:... .: . ::::::    :.   :::.:::::.:....:::. :.
CCDS11 CDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRF
         200       210       220       230       240       250     

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB6 PIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAMAIFELLDYI
       :    :.      .: :                                    :. :  .
CCDS11 PY---DS------WGTP------------------------------------FQQLKQV
                  260                                           270

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB6 VNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFIKRSEVEEVDFAGWLCK
       :.:: :.::   :. .: .:...:: ::  ::     : .: :.   : . .: :...  
CCDS11 VEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKL
              280       290       300       310       320       330

         390       400
pF1KB6 TLRLNQPGTPTRTAV
                      
CCDS11 ILGD           
                      

>>CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17             (318 aa)
 initn: 729 init1: 273 opt: 620  Z-score: 418.8  bits: 86.0 E(32554): 5.2e-17
Smith-Waterman score: 693; 35.8% identity (62.5% similar) in 341 aa overlap (57-387:20-314)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB6 EGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVV
                                     :.:   .  :.. ::.  ::::: :  :::
CCDS11            MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
                          10        20        30        40         

         90       100       110       120        130       140     
pF1KB6 TKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQV-LHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISI
        ::.:  :: ::: : :.  ..   ..... .:.. ..  .  : : ::::.. .:.. :
CCDS11 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
      50        60        70        80        90       100         

         150           160       170       180       190       200 
pF1KB6 CMEHMDGGSLDQ----VLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
       ::: ::  :::.    :: .   :::.:::.......:.: .:. : ...::::::::.:
CCDS11 CMELMDT-SLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVL
     110        120       130       140       150       160        

             210       220        230           240       250      
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSF-VGTRSYMAPER----LQGTHYSVQSDIWSMGLS
       .:..:..:.::::.:: :.::.:... .: . ::::::    :.   :.:.::.::.:..
CCDS11 INKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGIT
      170       180       190       200       210       220        

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB6 LVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAM
       ..:.:. :.:            .: :                                  
CCDS11 MIEMAILRFPYES---------WGTP----------------------------------
      230       240                                                

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB6 AIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFIKRSEVEE
         :. :  .:.:: :.::   :.:.: .:. .:: :::::: .   : .: :.   ....
CCDS11 --FQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKK
           250       260       270       280       290       300   

        380       390       400
pF1KB6 VDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
       .:.:... . :             
CCDS11 TDIAAFVKEILGEDS         
           310                 

>>CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17             (347 aa)
 initn: 729 init1: 273 opt: 620  Z-score: 418.4  bits: 86.1 E(32554): 5.5e-17
Smith-Waterman score: 693; 35.8% identity (62.5% similar) in 341 aa overlap (57-387:49-343)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB6 EGASEANLVDLQKKLEELELDEQQKKRLEAFLTQKAKVGELKDDDFERISELGAGNGGVV
                                     :.:   .  :.. ::.  ::::: :  :::
CCDS11 SKRKKDLRISCMSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
       20        30        40        50        60        70        

         90       100       110       120        130       140     
pF1KB6 TKVQHRPSGLIMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQV-LHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISI
        ::.:  :: ::: : :.  ..   ..... .:.. ..  .  : : ::::.. .:.. :
CCDS11 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
       80        90       100       110       120       130        

         150           160       170       180       190       200 
pF1KB6 CMEHMDGGSLDQ----VLKEAKRIPEEILGKVSIAVLRGLAYLREKHQIMHRDVKPSNIL
       ::: ::  :::.    :: .   :::.:::.......:.: .:. : ...::::::::.:
CCDS11 CMELMDT-SLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVL
      140        150       160       170       180       190       

             210       220        230           240       250      
pF1KB6 VNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSF-VGTRSYMAPER----LQGTHYSVQSDIWSMGLS
       .:..:..:.::::.:: :.::.:... .: . ::::::    :.   :.:.::.::.:..
CCDS11 INKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGIT
       200       210       220       230       240       250       

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB6 LVELAVGRYPIPPPDAKELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPRPRPPGRPVSGHGMDSRPAM
       ..:.:. :.:            .: :                                  
CCDS11 MIEMAILRFPYES---------WGTP----------------------------------
       260       270                                               

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB6 AIFELLDYIVNEPPPKLPNGVFTPDFQEFVNKCLIKNPAERADLKMLTNHTFIKRSEVEE
         :. :  .:.:: :.::   :.:.: .:. .:: :::::: .   : .: :.   ....
CCDS11 --FQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKK
            280       290       300       310       320       330  

        380       390       400
pF1KB6 VDFAGWLCKTLRLNQPGTPTRTAV
       .:.:... . :             
CCDS11 TDIAAFVKEILGEDS         
            340                

>>CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17             (399 aa)
 initn: 602 init1: 278 opt: 612  Z-score: 412.6  bits: 85.2 E(32554): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 688; 37.2% identity (61.9% similar) in 341 aa overlap (70-396:100-393)

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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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