Result of FASTA (omim) for
pF1KE0557
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0557, 450 aa
1>>>pF1KE0557 450 - 450 aa - 450 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8554+/-0.000462; mu= 6.0183+/- 0.029
mean_var=181.9762+/-36.789, 0's: 0 Z-trim(115.2): 132 B-trim: 348 in 1/51
Lambda= 0.095075
statistics sampled from 25334 (25475) to 25334 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.299), width: 16
Scan time: 9.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 2901 410.7 4e-114
XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 2864 405.6 1.3e-112
NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 2354 335.7 1.6e-91
NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 2161 309.2 1.5e-83
NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 2025 290.6 6.1e-78
XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1496 218.1 5.3e-56
NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1488 217.0 1.1e-55
NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1473 214.9 4.1e-55
XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1446 211.2 5.1e-54
NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1392 203.8 8.7e-52
NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 1343 197.0 8.9e-50
NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 1341 196.8 1.1e-49
NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1318 193.6 9.3e-49
XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1295 190.4 7.8e-48
XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1295 190.4 8.4e-48
NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1291 189.9 1.2e-47
NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1289 189.6 1.4e-47
XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1286 189.2 1.9e-47
XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1277 187.9 4.4e-47
NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1264 186.2 1.5e-46
NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1218 179.8 1.1e-44
NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1143 169.7 2e-41
NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1088 162.0 3e-39
NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 993 149.0 2.4e-35
XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 993 149.0 2.4e-35
NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 979 147.1 9.1e-35
NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 978 146.9 9.6e-35
NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 958 144.2 6.2e-34
NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 957 144.0 7e-34
NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 956 143.9 7.5e-34
NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 897 135.8 2.2e-31
NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 897 135.8 2.2e-31
XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 891 135.0 3.7e-31
NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 891 135.0 3.8e-31
NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 889 134.7 4.6e-31
XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 889 134.8 5e-31
NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 884 134.0 7.3e-31
NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 875 132.8 1.9e-30
NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 804 123.1 1.5e-27
NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 797 122.1 3e-27
XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 645 101.1 4e-21
XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 645 101.1 4e-21
NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 645 101.1 4e-21
NP_116116 (OMIM: 605338) alpha-internexin [Homo sa ( 499) 544 87.5 9.1e-17
XP_006717563 (OMIM: 116300,193060) PREDICTED: vime ( 466) 543 87.3 9.5e-17
NP_003371 (OMIM: 116300,193060) vimentin [Homo sap ( 466) 543 87.3 9.5e-17
NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 536 86.3 1.9e-16
NP_005373 (OMIM: 162250) neurofilament medium poly ( 916) 536 86.6 3e-16
NP_006149 (OMIM: 162280,607684,607734) neurofilame ( 543) 512 83.1 2e-15
NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 490 80.0 1.4e-14
>>NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cytosk (450 aa)
initn: 2901 init1: 2901 opt: 2901 Z-score: 2169.9 bits: 410.7 E(85289): 4e-114
Smith-Waterman score: 2901; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:1-450)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGGNTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGGNTGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 GNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 GSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 SVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 NAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 EMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 GQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAI
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE0 VVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 VVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
430 440 450
>>XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: keratin, (448 aa)
initn: 2864 init1: 2864 opt: 2864 Z-score: 2142.5 bits: 405.6 E(85289): 1.3e-112
Smith-Waterman score: 2864; 99.6% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (6-450:4-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGGNTGG
..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSPANASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGGNTGG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 NAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 GQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAI
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KE0 VVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
420 430 440
>>NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskeletal (459 aa)
initn: 2434 init1: 1995 opt: 2354 Z-score: 1764.3 bits: 335.7 E(85289): 1.6e-91
Smith-Waterman score: 2354; 81.3% identity (92.5% similar) in 454 aa overlap (1-447:1-446)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLRLSSASRR--SCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSS----
::.:.::.::: :: :::.:: .::..::.::.::. ::::::: :::::::
NP_853 MSVRFSSTSRRLGSCG--GTGSVRLSSGGAGFGAGNTCGVPGIGSGFSCAFGGSSSAGGY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 GGNTGGGNP-CAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
::. :::. ::.:: ::.::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::
NP_853 GGGLGGGSASCAAFTGNEHGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLENVRALEEANADLEQKIKG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
:::::::::::::::::::::::::.::::::..:::::..::: :::::::::::::.:
NP_853 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDELKNQIISATTSNAHVVLQNDNARLTADDFRLKFE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
::::::::::::.:::::::::.:::::::::: ::::::..::::::.:::..::::::
NP_853 NELALHQSVEADINGLRRVLDELTLCRTDLEIQLETLSEELAYLKKNHEEEMKALQCAAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::
NP_853 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISDDAGATT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_853 SARNELIEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
::::::::::::::::::::.::::::::::::: :.::.: ::. : :. :.:.
NP_853 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKVHLEKEIETYCLLIDGEDGSC------SKSKGYGGPGNQT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE0 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
:: .:. .:: :.::.: :.:.:..:.:..::::
NP_853 KDSSKTTIVKTVVEEIDPRGKVLSSRVHTVEEKSTKVNNKNEQRVSS
420 430 440 450
>>NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskeletal (464 aa)
initn: 2041 init1: 1876 opt: 2161 Z-score: 1621.2 bits: 309.2 E(85289): 1.5e-83
Smith-Waterman score: 2161; 74.0% identity (89.9% similar) in 454 aa overlap (1-447:1-450)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGG---SSSGGN
:::..:..::. : : .::.: .::..:. ...:: : :: :: :.:: : ::.
NP_853 MSLQFSNGSRHVCLRSGAGSVRPLNGGAGFAGSSACGGSVAGSEFSCALGGGLGSVPGGS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TGGGN----PCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKG
.:: : ::. .: :::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::.::::
NP_853 HAGGALGNAACIGFAGSEGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDNVRALEEANAELERKIKG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYE
::::.::::::::::::::: :.::::.::.:::.:::..::::::::.:::::::::
NP_853 WYEKYGPGSCRGLDHDYSRYHLTIEDLKNKIISSTTTNANVILQIDNARLAADDFRLKYE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAG
:::.:::.::::.:::::::::.:::::: :.:::.::::::::::::.:::..::::::
NP_853 NELTLHQNVEADINGLRRVLDELTLCRTDQELQYESLSEEMTYLKKNHEEEMKALQCAAG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 GNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATT
:::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.: ::.:
NP_853 GNVNVEMNAAPGVDLAVLLNNMRAEYEALAEQNRKDAEAWFNEKSASLQQQISHDSGAAT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 SARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLH
::..::::.::::::::.::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_853 FARSQLTEMRRTLQTLEIQLQSLMATKHSLECSLTETESNYCTQLAQIQAQIGALEEQLH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQV
::::::::::::::.:::.:.:::::::::: :: :: ..:. ::: .:::. :..
NP_853 QVRTETEGQKLEYEHLLDVKVHLEKEIETYCRLIDGDGNSCS----KSKGFGSGSPGNSS
370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KE0 KDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
:: .:. .:: :.::.:::.:.:..:.::.:::.
NP_853 KDLSKTTLVKTVVEELDQRGKVLSSRIHSIEEKTSKMTNGKTEQRVPF
420 430 440 450 460
>>NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskeletal (468 aa)
initn: 2037 init1: 1851 opt: 2025 Z-score: 1520.3 bits: 290.6 E(85289): 6.1e-78
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSAFGGSSSGG---N
::.:::..::: : : ::: :: ::::.: .:: : :: :.:: .. : :::: :
NP_853 MSFRLSGGSRRICSR--TGSGRLSGGGTGFVAGNVCVGSGARSSFSCTLEGISSGGSFCN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TGGG---NPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGW
.::: . :::: ::..:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
NP_853 SGGGLGSGACAGFLGNEHSLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDHVHALEEANADLEQKIKGW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYEN
::: ::: : :::::::: .:.::: :::..: ::. ::: ::::::::::::::::
NP_853 YEKCEPGSSREHDHDYSRYFSVIEDLKRQIISATICNASIVLQNDNARLTADDFRLKYEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGG
:::::.:::::..::::::::.::: :::::: ::::::.:::::.:.:::.::: .:::
NP_853 ELALHHSVEADTSGLRRVLDELTLCTTDLEIQCETLSEELTYLKKSHEEEMEVLQYTAGG
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 NVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTS
::::::::.::::::::::::::::: ::::::.::::::::.::.::::::. ::.:.
NP_853 NVNVEMNATPGVDLTVLLNNMRAEYEDLAEQNRKDAEAWFNERSATLQQQISDHEGAATA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 ARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQ
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NP_853 ARNELTELKRNLQTLEIELQSLMAVKHSYECSLAETEGNYCNQLQQIQDQIGVMEEQLQQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 VRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVK
.::::::::::::::::.:. :::::. :: :. :.. :: :::: : : :.:.:
NP_853 IRTETEGQKLEYEQLLDVKIFLEKEIDIYCNLLDGEERKSKSTCYKSKGYRPVNSGNQAK
360 370 380 390 400 410
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pF1KE0 DPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
: .. .:: :.::.:: ...:. :.::.::::
NP_853 DSTEETIVKTVVEELDQIGNLLSLRVHSVEEKSSKISNITVEQRVPSKAP
420 430 440 450 460
>>XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) PREDI (624 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSA
::.: :..::: :. :: : :: ...
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XP_005 FGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESN
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110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLT
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XP_005 YELEGKIKEWYEKHG-NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLA
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170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEE
:::::::::::.::.::::::.:::::::::.:: ..:::.: :.:.::..::::::.::
XP_005 ADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEE
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 MQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQ
:. :. .. :.:::::::::::::: ::::::..:: ::::::.:::::::::: : .
XP_005 MKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTE
300 310 320 330 340 350
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pF1KE0 ISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQ
:.... .: ..:.::..:..:.::::::: :: :.::: ::.:::. ::.::.:::::
XP_005 IDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQ
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLI---GGDDGACKSGGYKS
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XP_005 ISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFG
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KE0 KDYGSGNVGSQVKDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
::.:. :
XP_005 GGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGY
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>>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin, (584 aa)
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Smith-Waterman score: 1488; 61.9% identity (83.2% similar) in 399 aa overlap (19-410:83-479)
10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIGSGFSSA
::.: :..::: :. : : :: ...
NP_000 SGGSFSRGSSGGGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFRGSYGSSSFG-GSYGGSFGGGSFGGGS
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 FGGSS-SGGNTGGGNPCAGFTVN---ERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEAN
:::.: .::. :::. .:: . . :::::::::::::::::::::::.:.::::.:
NP_000 FGGGSFGGGGFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESN
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 ADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLT
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NP_000 YELEGKIKEWYEKHG-NSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLA
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pF1KE0 ADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEE
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NP_000 ADDFRLKYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEE
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pF1KE0 MQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQ
:. :. .. :.:::::::::::::: ::::::..:: ::::::.:::::::::: : .
NP_000 MKDLRNVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTE
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pF1KE0 ISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQ
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NP_000 IDNNIEQISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQ
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pF1KE0 IGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLI---GGDDGACKSGGYKS
:.::::::.:.:.::: :. ::.::::::..::.::.:: :. :.. :. ..:: .
NP_000 ISALEEQLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFG
420 430 440 450 460 470
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pF1KE0 KDYGSGNVGSQVKDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
::.:. :
NP_000 GGYGGGSSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGY
480 490 500 510 520 530
>>NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskeletal (525 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIG--SGF
.:: .:::.::: :.::.: :::
NP_061 SLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFG-----GVSGFGRGSGF
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:: :.....:: . ::: : :.. ::.::.:: ::::::::::.:::.:.:::
NP_061 CGSSRFSSGATGGFYSYGGG---MGGGVGDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALE
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110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLD-HDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDN
:::.:::.::: ::.:.:::: : . .:::.:. ::.::.:::::.:. ::. .:.:::
NP_061 EANTDLENKIKEWYDKYGPGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDN
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKN
:::.:::::::::::: :.::::::.::::.:::..:. :.:::.: :...::..::.::
NP_061 ARLAADDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKN
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HKEEMQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSAS
:.:::. .: ..::.:.::::::::.::: :::.:::.:: :::::::.:: ::..:::
NP_061 HEEEMKNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSAS
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQ
:: ::: :.::.:::.::.::.:::::.::::::: :: : ::: .:..::..: :::..
NP_061 LQAQISTDAGAATSAKNEITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSE
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYK
::.::.::::.. :. ::. :. ::.:::::: .:: ::::: :. :. :. . . .
NP_061 IQTQISALEEEICQIWGETKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFG
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440
pF1KE0 SKDYGSGNVGS---------------QVKDPAKAIVVKKVLEE-VDQRSKILTTRLHSLE
... :: :.:: : .: .:. :.: ..:: :: .:...... :.
NP_061 GRNSGSVNMGSRDLVSGDSRSGSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVD--GKVVSSQVSSIS
470 480 490 500 510 520
450
pF1KE0 EKSQSN
:
NP_061 EVKVK
>>XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, type I (494 aa)
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10 20 30 40
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYGGGTSFGTGNSCGISGIG--SGF
.:: .:::.::: :.::.: :::
XP_016 SLSGGSSGAFGGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFG-----GVSGFGRGSGF
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pF1KE0 --SSAFGGSSSGG--NTGGGNPCAGFTVNERGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALE
:: :.....:: . ::: : :.. ::.::.:: ::::::::::.:::.:.:::
XP_016 CGSSRFSSGATGGFYSYGGG---MGGGVGDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALE
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110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLD-HDYSRYFPIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDN
:::.:::.::: ::.:.:::: : . .:::.:. ::.::.:::::.:. ::. .:.:::
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170 180 190 200 210 220
pF1KE0 ARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLDEITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKN
:::.:::::::::::: :.::::::.::::.:::..:. :.:::.: :...::..::.::
XP_016 ARLAADDFRLKYENELCLRQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKN
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 HKEEMQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNNMRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSAS
:.:::. .: ..::.:.::::::::.::: :::.:::.:: :::::::.:: ::..:::
XP_016 HEEEMKNMQGSSGGEVTVEMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSAS
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290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQSLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQ
:: ::: :.::.:::.::.::.:::::.::::::: :: : ::: .:..::..: :::..
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350 360 370 380 390 400
pF1KE0 IQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKLHLEKEIETYCLLIGGDDGACKSGGYK
::.::.::::.. :. ::. :. ::.:::::: .:: ::::: :. :. : . ..
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410 420 430 440 450
pF1KE0 SKDYGSGNVGSQVKDPAKAIVVKKVLEEVDQRSKILTTRLHSLEEKSQSN
: .:
XP_016 MVDVASILTEMTNKKQGSQQAAQSKRLKYLKL
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>>NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cytosk (494 aa)
initn: 1319 init1: 1267 opt: 1392 Z-score: 1050.7 bits: 203.8 E(85289): 8.7e-52
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10 20 30
pF1KE0 MSLRLSSASRRSCPRPTTGSLRLYG-GGTSFGTGNSCG------
.: :::: : . :: ..: : ::..:: : :::
NP_000 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFGASCGGGFSAA
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40 50 60 70
pF1KE0 -----------------ISGIGSGFSSAFGGSSSGG-NTG-GGNPCAG----FTVNERGL
.:.:.:.. :.::.: :: . : ::.: .: .. :. ::
NP_000 SMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGILSGNDGGL
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pF1KE0 LSGNEKVTMQNLNDRLASYLDSVHALEEANADLEQKIKGWYEKFGPGSCRGLDHDYSRYF
:::.:: ::::::::::::::.:.::::::..::.::. ::: : :. . . :::.:.
NP_000 LSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQSDYSKYY
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 PIIDDLKNQIIASTTSNANAVLQIDNARLTADDFRLKYENELALHQSVEADVNGLRRVLD
:.:.::.:.::... .::. .::::::::.:.:::.::::::::.:.::::.::::::::
NP_000 PLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADINGLRRVLD
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 EITLCRTDLEIQYETLSEEMTYLKKNHKEEMQVLQCAAGGNVNVEMNAAPGVDLTVLLNN
:.:: :::::.: :.:.::..:.::::..:.: .. .. :.:.:::.:::::::: :::.
NP_000 ELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVDLTRLLND
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 MRAEYEALAEQNRRDAEAWFNEKSASLQQQISEDVGATTSARNELTEMKRTLQTLEIELQ
:::.::..:::::.:::::: :::. :...:: .. :...:.:...:..:.::::::
NP_000 MRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQNLEIELQ
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 SLLATKHSLECSLTETESNYCAQLAQIQAQIGALEEQLHQVRTETEGQKLEYEQLLDIKL
: :: :.::: ::.:.:..:::::.:.: :. :: :: :::...: :......::..:
NP_000 SQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQRLLNVKA
370 380 390 400 410 420
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pF1KE0 HLEKEIETYCLLIGGD---DGACKSGGYKSKDYGSGNVGSQVKDPAKAIVVKKVLEEVDQ
.:: ::::: :. :. :: .: . . . .... .. :::.:. .: :..:. .
NP_000 RLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESL-FVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKTVVQEMVN
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pF1KE0 RSKILTTRLHSLEEKSQSN
......... .::
NP_000 -GEVVSSQVQEIEELM
480 490
450 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:43:49 2016 done: Sat Nov 5 01:43:50 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]