Result of FASTA (ccds) for pF1KB8573
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8573, 890 aa
  1>>>pF1KB8573 890 - 890 aa - 890 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4055+/-0.00117; mu= 1.3847+/- 0.069
 mean_var=229.4388+/-48.246, 0's: 0 Z-trim(108.5): 102  B-trim: 113 in 2/51
 Lambda= 0.084672
 statistics sampled from 10128 (10222) to 10128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.314), width:  16
 Scan time:  4.760

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4199.1 KIF20A gene_id:10112|Hs108|chr5         ( 890) 5810 723.9 3.2e-208
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10          (1056)  495 74.6   1e-12
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8        (1826)  487 73.8 3.2e-12
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5        (1234)  483 73.2 3.2e-12
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20         ( 747)  478 72.5 3.3e-12
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1           (1770)  478 72.7 6.6e-12
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6        (1749)  476 72.5 7.7e-12
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6        (1757)  476 72.5 7.8e-12
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6        (1770)  476 72.5 7.8e-12
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6        (1805)  476 72.5 7.9e-12
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17        (1103)  457 70.0 2.7e-11
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3         (1388)  459 70.3 2.7e-11
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1           (1153)  457 70.0 2.8e-11
CCDS7407.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10         (1780)  460 70.5   3e-11
CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10        (1820)  459 70.4 3.4e-11
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4          (2580)  458 70.4 4.8e-11
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1         ( 929)  447 68.7 5.4e-11
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1         (1028)  447 68.8 5.9e-11
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1           (1029)  447 68.8 5.9e-11


>>CCDS4199.1 KIF20A gene_id:10112|Hs108|chr5              (890 aa)
 initn: 5810 init1: 5810 opt: 5810  Z-score: 3851.6  bits: 723.9 E(32554): 3.2e-208
Smith-Waterman score: 5810; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSQGILSPPAGLLSDDDVVVSPMFESTAADLGSVVRKNLLSDCSVVSTSLEDKQQVPSED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSQGILSPPAGLLSDDDVVVSPMFESTAADLGSVVRKNLLSDCSVVSTSLEDKQQVPSED
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SMEKVKVYLRVRPLLPSELERQEDQGCVRIENVETLVLQAPKDSFALKSNERGIGQATHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SMEKVKVYLRVRPLLPSELERQEDQGCVRIENVETLVLQAPKDSFALKSNERGIGQATHR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 FTFSQIFGPEVGQASFFNLTVKEMVKDVLKGQNWLIYTYGVTNSGKTHTIQGTIKDGGIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FTFSQIFGPEVGQASFFNLTVKEMVKDVLKGQNWLIYTYGVTNSGKTHTIQGTIKDGGIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 PRSLALIFNSLQGQLHPTPDLKPLLSNEVIWLDSKQIRQEEMKKLSLLNGGLQEEELSTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PRSLALIFNSLQGQLHPTPDLKPLLSNEVIWLDSKQIRQEEMKKLSLLNGGLQEEELSTS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 LKRSVYIESRIGTSTSFDSGIAGLSSISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKRSVYIESRIGTSTSFDSGIAGLSSISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 IWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 VGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRILHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERCKDQKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRILHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERCKDQKS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 GERLKEAGNINTSLHTLGRCIAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GERLKEAGNINTSLHTLGRCIAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 IVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIASQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIASQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 ADTGLDDDIENEADISMYGKEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ADTGLDDDIENEADISMYGKEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 QQREQWCSEHLDTQKELLEEMYEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QQREQWCSEHLDTQKELLEEMYEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 QSVAHQQSGSELALRRSQRLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSVAHQQSGSELALRRSQRLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 PSAKPFTIDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSAKPFTIDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 ILIKQDQTLAELQNNMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQVSAKKRLGTNQENQQPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ILIKQDQTLAELQNNMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQVSAKKRLGTNQENQQPN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890
pF1KB8 QQPPGKKPFLRNLLPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QQPPGKKPFLRNLLPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
              850       860       870       880       890

>>CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10               (1056 aa)
 initn: 646 init1: 199 opt: 495  Z-score: 341.7  bits: 74.6 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 504; 26.9% identity (59.8% similar) in 584 aa overlap (299-867:154-696)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
                                     ::. .:..::::: :.:::.: :.  .:  
CCDS74 EYTWEEDPLAGIIPRTLHQIFEKLTDNGTEFSVKVSLLEIYNEELFDLLNPSSDVSER--
           130       140       150       160       170       180   

      330         340       350       360       370       380      
pF1KB8 LRLCEDQNGNP--YVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSI
       :.. .:  ..    .: :. : :.. .:....:. :  ... :.: .:  ::::::.::.
CCDS74 LQMFDDPRNKRGVIIKGLEEITVHNKDEVYQILEKGAAKRTTAATLMNAYSSRSHSVFSV
             190       200       210       220       230       240 

        390          400       410        420       430       440  
pF1KB8 RILHLQG---EGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIA
        : :..    .:. . ::..:.: ::::::   ..    .: .:::::: :: :::: :.
CCDS74 TI-HMKETTIDGEELVKIGKLNLVDLAGSENIGRSGAVDKRAREAGNINQSLLTLGRVIT
              250       260       270       280       290       300

            450       460       470       480       490       500  
pF1KB8 ALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSA
       :: .    :. .  ::.:.:::::..:  . :: :. .:....: . . .::: . ... 
CCDS74 ALVE----RTPH--VPYRESKLTRILQDSLGGRTRTSIIATISPASLNLEETLSTLEYAH
                    310       320       330       340       350    

            510       520       530          540       550         
pF1KB8 IASQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEK---GAKADTGLDDDIENEADISMYG
        :..... : ..  . . ...:::.. ..   :..   .:.  .:.  . ::   .:   
CCDS74 RAKNILNKPEVNQKLTK-KALIKEYTEEIE-RLKRDLAAAREKNGVYISEENFRVMSGKL
          360       370        380        390       400       410  

     560       570       580       590       600       610         
pF1KB8 KEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLE
         .  :.:: .. .   :.. .   :. . ..  ::. .: ..  :  ...:.: .. :.
CCDS74 TVQEEQIVELIEKIGAVEEELNRVTELFMDNK--NEL-DQCKSDLQNKTQELETTQKHLQ
            420       430       440          450       460         

     620       630       640       650       660       670         
pF1KB8 EMYEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQR
       :    ::...::    .    ..  .::...  . : .. .... .. :: .  : :.. 
CCDS74 ET---KLQLVKEE---YITSALESTEEKLHDAASKLLNTVEETT-KDVSGLHSKLDRKK-
     470             480       490       500        510       520  

     680       690       700       710       720       730         
pF1KB8 LAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPFTIDVDKKLEEG--
        :..  . . :.. .:      .:::    .........   : .   ..: : :  .  
CCDS74 -AVDQHNAEAQDIFGK------NLNSL---FNNMEELIKDGSSKQKAMLEVHKTLFGNLL
              530             540          550       560       570 

       740        750       760       770       780       790      
pF1KB8 QKNIRLLRT-ELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQNNM
       ....  : :     :: :: :  .    :: .... . .   ...  ..  .: :: :  
CCDS74 SSSVSALDTITTVALG-SLTSIPENV--STHVSQIFNMILKEQSLAAESKTVLQELIN--
             580        590         600       610       620        

        800       810        820         830       840       850   
pF1KB8 VLVKLDLRKKAACI-AEQYHTVLKLQGQVSA--KKRLGTNQENQQPNQQPPGKKPFLRNL
        ..: :: ..   : .    ..::...:..   :  : . .. .. ...  :   ::  :
CCDS74 -VLKTDLLSSLEMILSPTVVSILKINSQLKHIFKTSLTVADKIEDQKKELDG---FLSIL
         630       640       650       660       670          680  

           860       870       880       890                       
pF1KB8 LPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY                       
              : .: ::                                              
CCDS74 CNNLHELQENTICSLVESQKQCGNLTEDLKTIKQTHSQELCKLMNLWTERFCALEEKCEN
            690       700       710       720       730       740  

>>CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8             (1826 aa)
 initn: 557 init1: 230 opt: 487  Z-score: 333.0  bits: 73.8 E(32554): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 509; 26.6% identity (58.4% similar) in 579 aa overlap (299-862:144-653)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
                                     :.. .:..::::: . :::.: .   .:::
CCDS55 MGTADQPGLIPRLCSGLFERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKG---SRQT
           120       130       140       150       160          170

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
       :.. : .  .:::  :. . : . ..  .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: .
CCDS55 LKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITL
              180       190       200       210       220       230

      390          400       410        420       430       440    
pF1KB8 LHLQGE---GDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
        :   .   :    :...::: :::::::  :   .:.::::..::: :: :::  :.::
CCDS55 THTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISAL
              240       250       260       270       280       290

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
        ... ...:...::.::: :: ...  . : ... :...:.: :..::::: . ...  :
CCDS55 ADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRA
              300       310       320       330       340       350

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
       ...:.           :. ..:         . .:.    : ...:.        .:.: 
CCDS55 KHIVN-----------HAVVNE---------DPNARIIRDLREEVEKL-------REQLT
                         360                370              380   

          570       580       590       600       610       620    
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEMYEE
       .. ::::.  ::.: :. .   .: .:.     :.... :.  .:.   ::.:      :
CCDS55 KA-EAMKSPELKDRLEESE---KLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQER---QKQL------E
            390       400          410       420                430

          630       640       650       660       670       680    
pF1KB8 KLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLAASA
       .:.:      :. .  :.  :.:   ..   . : .. ...          . . : .::
CCDS55 SLGI------SLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYL--------KEHTLIGSA
                    440       450       460               470      

          690         700       710       720           730        
pF1KB8 STQQLQEVKAKL--QQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPF----TIDVDKKLEEGQ
       ..:..:     .  ..:  ...:      . : :: :  ... :    ...   .:..:.
CCDS55 NSQDIQLCGMGILPEHCIIDITS------EGQVMLTPQKNTRTFVNGSSVSSPIQLHHGD
        480       490             500       510       520       530

          740       750       760       770       780       790    
pF1KB8 K----NIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQN
       .    : ...: .: :   . ..:::    .  . : ...    :    ..... .:.. 
CCDS55 RILWGNNHFFRLNLPK---KKKKAEREDEDQDPSMKNENSSEQLDVDGDSSSEVSSEVNF
              540          550       560       570       580       

          800       810        820       830       840       850   
pF1KB8 NMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLK-LQGQVSAKKRLGTNQENQQPNQQPPGKKPFLRNL
       :.  .....  ::    . ....:. :. :   .::  .  : :.   .   .. . : :
CCDS55 NYEYAQMEVTMKALGSNDPMQSILNSLEQQHEEEKR--SALERQRLMYEHELEQ-LRRRL
       590       600       610       620         630        640    

           860       870       880       890                       
pF1KB8 LPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY                       
        :.  .:.:                                                   
CCDS55 SPEKQNCRSMDRFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREANYIA
          650       660       670       680       690       700    

>>CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5             (1234 aa)
 initn: 428 init1: 138 opt: 483  Z-score: 332.8  bits: 73.2 E(32554): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 493; 25.2% identity (60.3% similar) in 564 aa overlap (295-847:130-671)

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB8 SSISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQR
                                     ....:.. .:..::::: . ::: :   .:
CCDS47 GAYTAEQENEPTVGIIPRVIQLLFKEIDKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCP---SR
     100       110       120       130       140       150         

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB8 KRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIF
       ..  . . :: . .  .  :.   :  : .. . :. : .... ::: .:..:::::.::
CCDS47 EKAQINIREDPKEGIKIVGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIF
        160       170       180       190       200       210      

          390       400       410       420        430       440   
pF1KB8 SIRILHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERCKDQKS-GERLKEAGNINTSLHTLGRCIAA
       .: : . .         :.: : ::::::: :  :. :.::::. ::: .:  ::  :.:
CCDS47 TISIEQRKKSDKNCSFRSKLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISA
        220       230       240       250       260       270      

           450       460       470       480       490       500   
pF1KB8 LRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAI
       : ...    : ..::.:::::::..:  . : ... ::. :.:  :. .::: . ...  
CCDS47 LGDDK----KGSFVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLSTLRYADR
        280           290       300       310       320       330  

           510       520        530       540       550       560  
pF1KB8 ASQLVHAPPMQLGFPSLH-SFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEE
       : .. . : ...   . . . .:..  :..  : . :.. : :  .:. : .      :.
CCDS47 ARKIKNKPIVNIDPHTAELNHLKQQVQQLQVLLLQ-AHGGT-LPGSINAEPS------EN
            340       350       360        370        380          

            570       580       590       600       610       620  
pF1KB8 LLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEMY
       : ...:  ..:.  :..:::.  .        .:.:..   ::  .:.:... : :..  
CCDS47 LQSLMEKNQSLV--EENEKLSRCLSKAAGQTAQMLERIILTEQ-VNEKLNAKLEELRQHV
          390         400       410       420        430       440 

            630       640       650       660       670       680  
pF1KB8 EEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLAA
         ::. :.. . .. ..:..:  : : .:. :. .  ...::   .. . :...  .. .
CCDS47 ACKLD-LQKLVETLEDQELKENVEIICNLQQLITQLSDETVACTAAAIDTAVEEEAQVET
              450       460       470       480       490       500

            690               700       710        720       730   
pF1KB8 SASTQQLQEV--------KAKLQQCKAELNSTTEELHKY-QKMLEPPPSAKPFTIDVDKK
       :  :.. ...        .:....  .:::..    .   .:: .   . .:. .. . .
CCDS47 SPETSRSSDAFTTQHALHQAQMSKEVVELNNALALKEALVRKMTQNDNQLQPIQFQYQDN
              510       520       530       540       550       560

           740       750       760       770       780       790   
pF1KB8 LEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQ
       ... . ..  :. : ..: . ::.:..   ..  . . .. :   .  .    . : : :
CCDS47 IKNLELEVINLQKEKEELVRELQTAKKNVNQAKLSEHRHKLLQELEGQIADLKKKLNE-Q
              570       580       590       600       610          

           800       810       820       830       840       850   
pF1KB8 NNMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQVSAKKRLGTNQENQQPNQQPPGKKPFLRNL
       .... .: . .. .. . ..   ..: : .:.  ...  . :. .  .:   :.      
CCDS47 SKLLKLKESTERTVSKLNQEIW-MMKNQ-RVQLMRQMKEDAEKFRQWKQKKDKEVIQLKE
     620       630       640         650       660       670       

           860       870       880       890                       
pF1KB8 LPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY                       
                                                                   
CCDS47 RDRKRQYELLKLERNFQKQSSVLRRKTEEAAAANKRLKDALQKQREVTDKRKETQSHGKE
       680       690       700       710       720       730       

>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20              (747 aa)
 initn: 598 init1: 140 opt: 478  Z-score: 332.6  bits: 72.5 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 513; 30.3% identity (62.8% similar) in 449 aa overlap (296-718:135-570)

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB8 SISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRK
                                     : .. .  :..:::.: . :::   ..: :
CCDS13 TMEGIRGDPEKRGVIPNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLL--SKDQTK
          110       120       130       140       150         160  

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB8 RQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFS
       :  :.: :  . . :::::. . .....:  ....:: .:.: ..:..:..:::::.:: 
CCDS13 R--LELKERPDTGVYVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFV
              170       180       190       200       210       220

             390       400       410        420       430       440
pF1KB8 IRI----LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSER-CKDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRC
       : :    . :.::. :  ....:.: :::::::  :   .::::::: .:: :: .::  
CCDS13 ITIECSEVGLDGENHI--RVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNV
              230         240       250       260       270        

              450       460       470       480       490       500
pF1KB8 IAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKF
       :.:: ..     :.. .:.:::::::..:  . : ... :..::.: . . .::: . ..
CCDS13 ISALVDG-----KSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRY
      280            290       300       310       320       330   

              510         520       530       540       550        
pF1KB8 SAIASQLVHAPPMQLGFP--SLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMY
       .  :... . : ..   :  .:   ..:.  ... .::: . .     .  .. .  .  
CCDS13 ANRAKNIKNKPRVNED-PKDALLREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGG
           340        350       360       370       380       390  

      560       570            580         590         600         
pF1KB8 GKEELLQVVEAM-----KTLLLKERQEKLQLEMH--LRDE--ICNEMVEQMQQREQWCSE
       :.::  .  :.      :    .:.::::..: .  ..:.  . .: .. ....:.   :
CCDS13 GEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKM-E
            400       410       420       430       440       450  

     610       620             630          640       650       660
pF1KB8 HLDTQKELLEEM------YEEKLNILKESL---TSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQ
        :  .:.  : .      .: :: .  ...   :.  :. .... ..: : .   .: .:
CCDS13 DLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQ
             460       470       480       490       500       510 

              670        680       690       700       710         
pF1KB8 QSVAHQQSGSELALRRSQ-RLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEP
       :  ....   ::    :. .  .. .:..:... .:::  :::...  ::  : .. :: 
CCDS13 QMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQ
             520       530       540       550       560       570 

     720       730       740       750       760       770         
pF1KB8 PPSAKPFTIDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCD
                                                                   
CCDS13 TQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVS
             580       590       600       610       620       630 

>>CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1                (1770 aa)
 initn: 497 init1: 201 opt: 478  Z-score: 327.2  bits: 72.7 E(32554): 6.6e-12
Smith-Waterman score: 478; 24.5% identity (58.7% similar) in 567 aa overlap (297-844:138-692)

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB8 ISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKR
                                     . .:. .:..::: : . :::.:    ...
CCDS11 MGKQEESQAGIIPQLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNP----KNK
       110       120       130       140       150       160       

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB8 QTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSI
        .::. :    .:::.::. . : .  .   :. .: : .. :.:..:..:::::..:.:
CCDS11 GNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTI
           170       180       190       200       210       220   

        390          400       410       420        430       440  
pF1KB8 RILHLQGEGDI---VPKISELSLCDLAGSERCKDQKS-GERLKEAGNINTSLHTLGRCIA
        . . . ...    . :.:..:: :::::::  .  . : ::::..::: :: :::. :.
CCDS11 VFTQKKHDNETNLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVIS
           230       240       250       260       270       280   

            450       460       470       480       490       500  
pF1KB8 ALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSA
       :: . .....: ...:.::: :: ...  . : .:. :.. ..:   .::::: . ... 
CCDS11 ALAEVSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYAD
           290       300       310       320       330       340   

             510       520       530          540       550        
pF1KB8 IASQL-VHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEK---GAKADTGLDDDIENEADISMY
        :.:.  .:   .    .:   .::.  ...  :.    :   ::.. .   . .. :. 
CCDS11 RAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLS
           350       360       370       380       390       400   

      560       570       580       590       600       610        
pF1KB8 GKEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKE-L
       ..  : .:.  .. ..     :.   ...  ..:  :. :  ... .  .: .  ..: :
CCDS11 SQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRK-TEAIRMEREAL
           410       420       430       440       450        460  

       620       630        640       650       660         670    
pF1KB8 LEEMYEEKLNILKESLT-SFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAH--QQSGSELAL
       : ::    . : ... : . .. .   .  ...: . :..:     .     . :.  : 
CCDS11 LAEM---GVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNE-DPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAE
               470       480       490        500       510        

          680       690       700       710       720       730    
pF1KB8 RRSQRLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPFTIDVDKKL
       ::.. . ..:  .. . .  . .. ..:.  : :  .. . ...    ..:  .   ...
CCDS11 RRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRI
      520       530       540       550       560       570        

          740        750        760       770       780       790  
pF1KB8 EEGQKNI-RLLRTELQKLG-ESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAEL
         :.... :. . :  .   :.  :::        .   :. :   . : .::..   .:
CCDS11 IMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEK-QGIDMKQEME-KRL
      580       590       600       610       620        630       

            800       810            820       830       840       
pF1KB8 QNNMVLVKLDLRKKAACIAEQ----YHTVLK-LQGQVSAKKRLGTNQENQQPNQQPPGKK
       :.  .: : . ...:  . ::    :.. :. :: :: ...  . . :... ... :   
CCDS11 QEMEILYKKE-KEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQ
        640        650       660       670       680       690     

       850       860       870       880       890                 
pF1KB8 PFLRNLLPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY                 
                                                                   
CCDS11 HEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSP
         700       710       720       730       740       750     

>>CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6             (1749 aa)
 initn: 543 init1: 219 opt: 476  Z-score: 326.0  bits: 72.5 E(32554): 7.7e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
                                     :.. .:..::::: . :::.: ..   ::.
CCDS47 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
            120       130       140       150       160            

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
       :.. : .  .:::  :. . : . :.  .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS47 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
     170       180       190       200       210       220         

         390       400       410        420       430       440    
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
          :.    :.   :.:..:: :::::::  :   .::::::..::: :: :::  :..:
CCDS47 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
     230       240       250       260       270       280         

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
        ..  ...:...::.::: :: ...  . : ... ::....: :..:.::: . ...  :
CCDS47 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
     290       300       310       320       330       340         

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
       ...:.           :. ..:         . .::.   : ...:.        .:.: 
CCDS47 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
     350                  360                370              380  

          570          580       590       600       610       620 
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
       :. ::::.  :::.   .:::  :. .  :   . .:.. :..:   : .  . :.    
CCDS47 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
             390       400       410       420       430       440 

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
                                                                   
CCDS47 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
             450       460       470       480       490       500 

>>CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6             (1757 aa)
 initn: 543 init1: 219 opt: 476  Z-score: 326.0  bits: 72.5 E(32554): 7.8e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
                                     :.. .:..::::: . :::.: ..   ::.
CCDS54 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
            120       130       140       150       160            

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
       :.. : .  .:::  :. . : . :.  .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS54 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
     170       180       190       200       210       220         

         390       400       410        420       430       440    
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
          :.    :.   :.:..:: :::::::  :   .::::::..::: :: :::  :..:
CCDS54 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
     230       240       250       260       270       280         

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
        ..  ...:...::.::: :: ...  . : ... ::....: :..:.::: . ...  :
CCDS54 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
     290       300       310       320       330       340         

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
       ...:.           :. ..:         . .::.   : ...:.        .:.: 
CCDS54 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
     350                  360                370              380  

          570          580       590       600       610       620 
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
       :. ::::.  :::.   .:::  :. .  :   . .:.. :..:   : .  . :.    
CCDS54 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
             390       400       410       420       430       440 

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
                                                                   
CCDS54 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
             450       460       470       480       490       500 

>>CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6             (1770 aa)
 initn: 543 init1: 219 opt: 476  Z-score: 325.9  bits: 72.5 E(32554): 7.8e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
                                     :.. .:..::::: . :::.: ..   ::.
CCDS54 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
            120       130       140       150       160            

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
       :.. : .  .:::  :. . : . :.  .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS54 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
     170       180       190       200       210       220         

         390       400       410        420       430       440    
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
          :.    :.   :.:..:: :::::::  :   .::::::..::: :: :::  :..:
CCDS54 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
     230       240       250       260       270       280         

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
        ..  ...:...::.::: :: ...  . : ... ::....: :..:.::: . ...  :
CCDS54 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
     290       300       310       320       330       340         

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
       ...:.           :. ..:         . .::.   : ...:.        .:.: 
CCDS54 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
     350                  360                370              380  

          570          580       590       600       610       620 
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
       :. ::::.  :::.   .:::  :. .  :   . .:.. :..:   : .  . :.    
CCDS54 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
             390       400       410       420       430       440 

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
                                                                   
CCDS54 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
             450       460       470       480       490       500 

>>CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6             (1805 aa)
 initn: 543 init1: 219 opt: 476  Z-score: 325.8  bits: 72.5 E(32554): 7.9e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
                                     :.. .:..::::: . :::.: ..   ::.
CCDS47 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
            120       130       140       150       160            

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
       :.. : .  .:::  :. . : . :.  .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS47 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
     170       180       190       200       210       220         

         390       400       410        420       430       440    
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
          :.    :.   :.:..:: :::::::  :   .::::::..::: :: :::  :..:
CCDS47 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
     230       240       250       260       270       280         

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
        ..  ...:...::.::: :: ...  . : ... ::....: :..:.::: . ...  :
CCDS47 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
     290       300       310       320       330       340         

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
       ...:.           :. ..:         . .::.   : ...:.        .:.: 
CCDS47 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
     350                  360                370              380  

          570          580       590       600       610       620 
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
       :. ::::.  :::.   .:::  :. .  :   . .:.. :..:   : .  . :.    
CCDS47 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
             390       400       410       420       430       440 

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
                                                                   
CCDS47 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
             450       460       470       480       490       500 




890 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 20:24:29 2016 done: Sat Nov  5 20:24:29 2016
 Total Scan time:  4.760 Total Display time:  0.210

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com