seq1 = pF1KE9463.tfa, 1002 bp seq2 = pF1KE9463/gi568815595f_151780558.tfa (gi568815595f:151780558_151981545), 200988 bp >pF1KE9463 1002 >gi568815595f:151780558_151981545 (Chr3) 1-15 (99336-99350) 100% -> 16-1002 (100002-100988) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCTGGGGATCATG GCATGGAATGCAACTTGCAAAAACTG |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 99336 ATGCTGGGGATCATGGTA...TAGGCATGGAATGCAACTTGCAAAAACTG 50 . : . : . : . : . : 42 GCTGGCAGCAGAGGCTGCCCTGGAAAAGTACTACCTTTCCATTTTTTATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100028 GCTGGCAGCAGAGGCTGCCCTGGAAAAGTACTACCTTTCCATTTTTTATG 100 . : . : . : . : . : 92 GGATTGAGTTCGTTGTGGGAGTCCTTGGAAATACCATTGTTGTTTACGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100078 GGATTGAGTTCGTTGTGGGAGTCCTTGGAAATACCATTGTTGTTTACGGC 150 . : . : . : . : . : 142 TACATCTTCTCTCTGAAGAACTGGAACAGCAGTAATATTTATCTCTTTAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100128 TACATCTTCTCTCTGAAGAACTGGAACAGCAGTAATATTTATCTCTTTAA 200 . : . : . : . : . : 192 CCTCTCTGTCTCTGACTTAGCTTTTCTGTGCACCCTCCCCATGCTGATAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100178 CCTCTCTGTCTCTGACTTAGCTTTTCTGTGCACCCTCCCCATGCTGATAA 250 . : . : . : . : . : 242 GGAGTTATGCCAATGGAAACTGGATATATGGAGACGTGCTCTGCATAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100228 GGAGTTATGCCAATGGAAACTGGATATATGGAGACGTGCTCTGCATAAGC 300 . : . : . : . : . : 292 AACCGATATGTGCTTCATGCCAACCTCTATACCAGCATTCTCTTTCTCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100278 AACCGATATGTGCTTCATGCCAACCTCTATACCAGCATTCTCTTTCTCAC 350 . : . : . : . : . : 342 TTTTATCAGCATAGATCGATACTTGATAATTAAGTATCCTTTCCGAGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100328 TTTTATCAGCATAGATCGATACTTGATAATTAAGTATCCTTTCCGAGAAC 400 . : . : . : . : . : 392 ACCTTCTGCAAAAGAAAGAGTTTGCTATTTTAATCTCCTTGGCCATTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100378 ACCTTCTGCAAAAGAAAGAGTTTGCTATTTTAATCTCCTTGGCCATTTGG 450 . : . : . : . : . : 442 GTTTTAGTAACCTTAGAGTTACTACCCATACTTCCCCTTATAAATCCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100428 GTTTTAGTAACCTTAGAGTTACTACCCATACTTCCCCTTATAAATCCTGT 500 . : . : . : . : . : 492 TATAACTGACAATGGCACCACCTGTAATGATTTTGCAAGTTCTGGAGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100478 TATAACTGACAATGGCACCACCTGTAATGATTTTGCAAGTTCTGGAGACC 550 . : . : . : . : . : 542 CCAACTACAACCTCATTTACAGCATGTGTCTAACACTGTTGGGGTTCCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100528 CCAACTACAACCTCATTTACAGCATGTGTCTAACACTGTTGGGGTTCCTT 600 . : . : . : . : . : 592 ATTCCTCTTTTTGTGATGTGTTTCTTTTATTACAAGATTGCTCTCTTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100578 ATTCCTCTTTTTGTGATGTGTTTCTTTTATTACAAGATTGCTCTCTTCCT 650 . : . : . : . : . : 642 AAAGCAGAGGAATAGGCAGGTTGCTACTGCTCTGCCCCTTGAAAAGCCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100628 AAAGCAGAGGAATAGGCAGGTTGCTACTGCTCTGCCCCTTGAAAAGCCTC 700 . : . : . : . : . : 692 TCAACTTGGTCATCATGGCAGTGGTAATCTTCTCTGTGCTTTTTACACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100678 TCAACTTGGTCATCATGGCAGTGGTAATCTTCTCTGTGCTTTTTACACCC 750 . : . : . : . : . : 742 TATCACGTCATGCGGAATGTGAGGATCGCTTCACGCCTGGGGAGTTGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100728 TATCACGTCATGCGGAATGTGAGGATCGCTTCACGCCTGGGGAGTTGGAA 800 . : . : . : . : . : 792 GCAGTATCAGTGCACTCAGGTCGTCATCAACTCCTTTTACATTGTGACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100778 GCAGTATCAGTGCACTCAGGTCGTCATCAACTCCTTTTACATTGTGACAC 850 . : . : . : . : . : 842 GGCCTTTGGCCTTTCTGAACAGTGTCATCAACCCTGTCTTCTATTTTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100828 GGCCTTTGGCCTTTCTGAACAGTGTCATCAACCCTGTCTTCTATTTTCTT 900 . : . : . : . : . : 892 TTGGGAGATCACTTCAGGGACATGCTGATGAATCAACTGAGACACAACTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100878 TTGGGAGATCACTTCAGGGACATGCTGATGAATCAACTGAGACACAACTT 950 . : . : . : . : . : 942 CAAATCCCTTACATCCTTTAGCAGATGGGCTCATGAACTCCTACTTTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100928 CAAATCCCTTACATCCTTTAGCAGATGGGCTCATGAACTCCTACTTTCAT 1000 . : 992 TCAGAGAAAAG ||||||||||| 100978 TCAGAGAAAAG