Result of SIM4 for pF1KB8961

seq1 = pF1KB8961.tfa, 1026 bp
seq2 = pF1KB8961/gi568815596f_176022799.tfa (gi568815596f:176022799_176224172), 201374 bp

>pF1KB8961 1026
>gi568815596f:176022799_176224172 (Chr2)

1-787  (100001-100787)   99% ->
788-1026  (101136-101374)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCCAGTGGCACCCTCAGCAACTACTACGTGGACTCGCTTATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTCCAGTGGCACCCTCAGCAACTACTACGTGGACTCGCTTATAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCATGAGGGCGACGAGGTGTTCGCGGCGCGCTTCGGGCCGCCGGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCATGAGGGCGACGAGGTGTTCGCGGCGCGCTTCGGGCCGCCGGGGCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCGCAGGGCCGGCCTGCAGGTGTGGCTGATGGCCCGGCCGCCACCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCGCAGGGCCGGCCTGCAGGTGTGGCTGATGGCCCGGCCGCCACCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGAGTTCGCCTCGTGTAGTTTTGCCCCCAGATCGGCCGTGTTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGAGTTCGCCTCGTGTAGTTTTGCCCCCAGATCGGCCGTGTTCTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCGTGGTCCGCGGTGCCCTCCCAGCCCCCGGCAGCGGCGGCGATGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCGTGGTCCGCGGTGCCCTCCCAGCCCCCGGCAGCGGCGGCGATGAGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTCTACCACCCGTACGTTCCCCCGCCGCCCCTGGCCGCCTCTGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTCTACCACCCGTACGTTCCCCCGCCGCCCCTGGCCGCCTCTGCCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCCCGGCCGCTACGTGCGCTCCTGGATGGAGCCGCTGCCCGGCTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCCCGGCCGCTACGTGCGCTCCTGGATGGAGCCGCTGCCCGGCTTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCGGTGCGGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGTCCGGGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCGGTGCGGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGAGGCGGCGGTCCGGGCCGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTCCCAGCCCTGGCCCCAGCGGCCCAGCCAACGGGCGCCACTACGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTCCCAGCCCTGGCCCCAGCGGCCCAGCCAACGGGCGCCACTACGGGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGCCTGAAACCCGAGCGGCCCCGGCCCCCGCCACGGCAGCCTCCACCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100451 AAGCCTGAAACCCGAGCGGCCCCGGCCCCCGCCACGGCCGCCTCCACCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCCTCCTCCTCCACTTCCTTATCCTCCTCCTCCAAACGGACTGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCCTCCTCCTCCACTTCCTTATCCTCCTCCTCCAAACGGACTGAGTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGTGGCCCGGGAGTCCCAGGGGAGCAGCGGCCCCGAGTTCTCGTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCGTGGCCCGGGAGTCCCAGGGGAGCAGCGGCCCCGAGTTCTCGTGCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCGTTCCTGCAGGAGAAGGCGGCAGCGGCGACGGGGGGAACCGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCGTTCCTGCAGGAGAAGGCGGCAGCGGCGACGGGGGGAACCGGGCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGCAGGGATCGGGGCCGCGACTGGGACGGGCGGCTCGTCGGAGCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGCAGGGATCGGGGCCGCGACTGGGACGGGCGGCTCGTCGGAGCCCTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTTGCAGCGACCACCCGATCCCAGGCTGTTCGCTGAAGGAGGAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTTGCAGCGACCACCCGATCCCAGGCTGTTCGCTGAAGGAGGAGGAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGCATTCGCAGCCGCAGCAGCAGCAACTTGACCCAA         ACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100751 CAGCATTCGCAGCCGCAGCAGCAGCAACTTGACCCAAGTA...TAGACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCCCGCCGCGAACTGGATCCACGCTCGCTCCACCCGGAAAAAGCGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101140 CCCCGCCGCGAACTGGATCCACGCTCGCTCCACCCGGAAAAAGCGCTGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCTACACCAAATACCAGACGCTTGAGCTGGAGAAAGAATTCCTCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101190 CCTACACCAAATACCAGACGCTTGAGCTGGAGAAAGAATTCCTCTTCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATGTACCTCACCCGGGACCGGCGCTACGAGGTGGCCAGGATTCTCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101240 ATGTACCTCACCCGGGACCGGCGCTACGAGGTGGCCAGGATTCTCAACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AACAGAGAGACAGGTCAAAATCTGGTTTCAGAACCGTAGGATGAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101290 AACAGAGAGACAGGTCAAAATCTGGTTTCAGAACCGTAGGATGAAAATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .
    992 AAAAGATGAGCAAGGAGAAATGCCCCAAAGGAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101340 AAAAGATGAGCAAGGAGAAATGCCCCAAAGGAGAC

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