Result of SIM4 for pF1KE0108

seq1 = pF1KE0108.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE0108/gi568815595f_197649972.tfa (gi568815595f:197649972_197881906), 231935 bp

>pF1KE0108 954
>gi568815595f:197649972_197881906 (Chr3)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-235  (106455-106586)   100% ->
236-384  (118468-118616)   99% ->
385-497  (120161-120273)   100% ->
498-594  (123432-123528)   100% ->
595-656  (124178-124239)   100% ->
657-731  (126956-127030)   100% ->
732-858  (128367-128493)   100% ->
859-954  (131840-131935)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCGGTTTGGTACCCGGTTGGTGGGAGCCACGGCGACTTCTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCGGTTTGGTACCCGGTTGGTGGGAGCCACGGCGACTTCTTCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCGAAGGCCCGCAGCAATGAAAACCTCGACAAAATAGATATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCCGAAGGCCCGCAGCAATGAAAACCTCGACAAAATAGATATGTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGG         ATGATATCATCAAGTTGAATCGAAAGGAAGGGAAGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGTG...TAGATGATATCATCAAGTTGAATCGAAAGGAAGGGAAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAATTTTCCAAGACTAAATAGAAGACTCCTCCAGCAAAGTGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106493 CAGAATTTTCCAAGACTAAATAGAAGACTCCTCCAGCAAAGTGGTGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAATTCAGGATGAGAGTGCGATGGGGAATCCAACAGAATTCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 106543 GCAATTCAGGATGAGAGTGCGATGGGGAATCCAACAGAATTCTGGTA...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    236    GTTTTGGTAAGACTAGTCTGAATCATAGAGGAAGAGTAATGCCTGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 118465 TAGGTTTTGGTAAGACTAGTCTGAATCGTAGAGGAAGAGTAATGCCTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAGACGTCCTAATGGAGTTATCACTGGCCTTGCAGCTAGGAAAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118515 AAGAGACGTCCTAATGGAGTTATCACTGGCCTTGCAGCTAGGAAAACGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAATTCGAAAAGGAATTAGTCCTATGAATCGTCCACCTCTAAGTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118565 TGGAATTCGAAAAGGAATTAGTCCTATGAATCGTCCACCTCTAAGTGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AG         AATATAGAACAATATTTTCCAGTGTTAAAAAGGAAGGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118615 AGGTA...TAGAATATAGAACAATATTTTCCAGTGTTAAAAAGGAAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACCTTCTGAGACAAAATGAAGGGCAGAGGAAACCAGTAGCAGTTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120200 AACCTTCTGAGACAAAATGAAGGGCAGAGGAAACCAGTAGCAGTTCTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAGACCTAGCCAGCTAAGCAGAAA         AAATAACATTCCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 120250 GAGACCTAGCCAGCTAAGCAGAAAGTA...CAGAAATAACATTCCAGCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATTTTACCAGGAGTGGAAATAAATTAAATCATCAGAAAGATACTCGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123449 ATTTTACCAGGAGTGGAAATAAATTAAATCATCAGAAAGATACTCGTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCAACTTTTCTTTTCAGAAGAGGCCTGAAG         GTGCAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123499 GCAACTTTTCTTTTCAGAAGAGGCCTGAAGGTA...CAGGTGCAGGCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTGAATACAGAACAACTGCTAGACGATGTAGTAGCAAAGAGAACTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124189 GTTGAATACAGAACAACTGCTAGACGATGTAGTAGCAAAGAGAACTCGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 A         ATGGCGGACTTCCACCACAAATGGAGGGATTTTGACTGTA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124239 AGTA...TAGATGGCGGACTTCCACCACAAATGGAGGGATTTTGACTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCTATTGACAATCCTGGAGCAGTGCAATGCCCAGT         AACTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 126996 TCTATTGACAATCCTGGAGCAGTGCAATGCCCAGTGTA...TAGAACTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAAACCACGATTAACTCGTACTGCTGTACCTTCATTTTTAACAAAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128373 GAAACCACGATTAACTCGTACTGCTGTACCTTCATTTTTAACAAAGCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGCAAAGTGACGTCAAGAAAGTTCCTAAAGGTGTTCCCCTGCAGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128423 AGCAAAGTGACGTCAAGAAAGTTCCTAAAGGTGTTCCCCTGCAGTTTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATAAACAGTGTCGGAAAACAG         ACAGGGATGACGTTGAATGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128473 ATAAACAGTGTCGGAAAACAGGTA...TAGACAGGGATGACGTTGAATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GCGGTTTGGGATCCTGAAGGAACAAAGAGCCACTCTCACATACAACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131860 GCGGTTTGGGATCCTGAAGGAACAAAGAGCCACTCTCACATACAACAAAG

   1000     .    :    .    :    .
    929 GGGGAAGCCGCTTTGTCACCGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||
 131910 GGGGAAGCCGCTTTGTCACCGTGGGA

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