Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5951
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5951, 510 aa
1>>>pF1KB5951 510 - 510 aa - 510 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7405+/-0.00109; mu= -8.4419+/- 0.066
mean_var=465.1205+/-95.166, 0's: 0 Z-trim(116.2): 89 B-trim: 155 in 1/55
Lambda= 0.059469
statistics sampled from 16685 (16772) to 16685 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.801), E-opt: 0.2 (0.515), width: 16
Scan time: 3.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3 ( 510) 3685 330.4 3e-90
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 419) 1547 146.9 4.3e-35
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 437) 1547 146.9 4.4e-35
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 459) 1547 146.9 4.6e-35
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 477) 1547 146.9 4.7e-35
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 374) 1471 140.3 3.6e-33
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 454) 1139 111.9 1.6e-24
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 445) 1121 110.3 4.5e-24
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 484) 1121 110.4 4.8e-24
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 207) 954 95.7 5.4e-20
>>CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3 (510 aa)
initn: 3685 init1: 3685 opt: 3685 Z-score: 1733.8 bits: 330.4 E(32554): 3e-90
Smith-Waterman score: 3685; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (1-510:1-510)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGFYDQQVPFMVPGKSRSEECRGRPVIDRKRKFLDTDLAHDSEELFQDLSQLQEAWLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MDGFYDQQVPFMVPGKSRSEECRGRPVIDRKRKFLDTDLAHDSEELFQDLSQLQEAWLAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AQVPDDEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIKRELHSPSSELSSCSHEQALGANYGEKCLYNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AQVPDDEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIKRELHSPSSELSSCSHEQALGANYGEKCLYNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 CAYDRKPPSGFKPLTPPTTPLSPTHQNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQGVGPAPAPHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CAYDRKPPSGFKPLTPPTTPLSPTHQNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQGVGPAPAPHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMPENQYPSEQRFQRQLSEPCHPFPPQPGVPGDNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMPENQYPSEQRFQRQLSEPCHPFPPQPGVPGDNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHDPLYEHGVPGMPGPPAHGFQSPMGIKQEPRDYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHDPLYEHGVPGMPGPPAHGFQSPMGIKQEPRDYC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VDSEVPNCQSSYMRGGYFSSSHEGFSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQEPTMYREGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VDSEVPNCQSSYMRGGYFSSSHEGFSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQEPTMYREGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 PYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPDALFSMAFPDNQRPFLKAESECHLSEEDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPDALFSMAFPDNQRPFLKAESECHLSEEDT
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB5 LPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAEGFAY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAEGFAY
490 500 510
>>CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1569 init1: 1059 opt: 1547 Z-score: 743.5 bits: 146.9 E(32554): 4.3e-35
Smith-Waterman score: 1733; 59.1% identity (74.0% similar) in 450 aa overlap (69-510:11-419)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 LAHDSEELFQDLSQLQEAWLAEAQVPDDEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIKRELHSPSSE
: : : .:: : :::.: ::: ::
CCDS55 MLQDLSASVFFPPCSQHRTLVAFHGLPLKIKKEPHSPCSE
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 LSS-CSHEQALGANYGEKCLYNYCAYDRKPPSGFKPLTPPT---TPLSPTHQNPLFPPPQ
.:: ::.:: . .:::::::: :::.:: :..: .::: ::.:: :
CCDS55 ISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLH---------
50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 ATLPTSGHAPAAGPVQGVGPAPAPHSLPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMPENQYPS
:: .:.: : :.. .: . :: : . :...::
CCDS55 -------HA-------------SPNSTHTPKPDR-AFPAHLPPSQSI------PDSSYPM
100 110 120
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EQRFQRQLSEPCHPFPPQPGVPGDNRPSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHDPLYEHG
..::.:::::::. ::: : .: ..:: :.:::::: .: ::::::::::::.:::.
CCDS55 DHRFRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPMYQRQMSEPNIPF---PPQGFKQEYHDPVYEHN
130 140 150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 VPGMPGPPA-HGFQSPMGIKQEPRDYCVDSEVPNCQSSYMRG-GYFS--SSHEGFSYEKD
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CCDS55 T--MVGSAASQSFPPPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCMFEKG
190 200 210 220 230
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 PRLYFDDTCVVPERLEGKVKQEPTMYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWT
:: ..::::::::...: .:::: :::::: ::::::::::::::.:::::.:.::::::
CCDS55 PRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWT
240 250 260 270 280 290
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCD
300 310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 PDALFSMAFPDNQRPFLKAESECHLSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAEGFAY
:.:::::::::::::.::.. : :..::::.::.::..: ::. . :. :: ::..:
CCDS55 PEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNPHPYNEGYVY
360 370 380 390 400 410
>>CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (437 aa)
initn: 1642 init1: 1059 opt: 1547 Z-score: 743.3 bits: 146.9 E(32554): 4.4e-35
Smith-Waterman score: 1812; 60.1% identity (76.0% similar) in 459 aa overlap (61-510:21-437)
40 50 60 70 80
pF1KB5 KRKFLDTDLAHDSEELFQDLSQLQEAWLAEAQVPD-DEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIK
::::: :::::::.:...:..:. : :::
CCDS55 MLQDLSASVFFPPCSQHRTLAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLP-LKIK
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 RELHSPSSELSS-CSHEQALGANYGEKCLYNYCAYDRKPPSGFKPLTPPT---TPLSPTH
.: ::: ::.:: ::.:: . .:::::::: :::.:: :..: .::: ::.:: :
CCDS55 KEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLH
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 QNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQGVGPAPAPHSLPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPK
:: .:.: : :.. .: . :: : .
CCDS55 ----------------HA-------------SPNSTHTPKPDR-AFPAHLPPSQSI----
110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 MMPENQYPSEQRFQRQLSEPCHPFPPQPGVPGDNRPSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQE
:...:: ..::.:::::::. ::: : .: ..:: :.:::::: .: ::::::::
CCDS55 --PDSSYPMDHRFRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPMYQRQMSEPNIPF---PPQGFKQE
140 150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 YHDPLYEHGVPGMPGPPA-HGFQSPMGIKQEPRDYCVDSEVPNCQSSYMRG-GYFS--SS
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CCDS55 YHDPVYEHNT--MVGSAASQSFPPPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSR
200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 HEGFSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQEPTMYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDP
:: .:: :: ..::::::::...: .:::: :::::: ::::::::::::::.:::::
CCDS55 TEGCMFEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDP
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 ANAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGE
.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGE
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 RYVYKFVCDPDALFSMAFPDNQRPFLKAESECHLSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSS
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CCDS55 RYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNP
370 380 390 400 410 420
510
pF1KB5 LPYAEGFAY
:: ::..:
CCDS55 HPYNEGYVY
430
>>CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (459 aa)
initn: 1852 init1: 1059 opt: 1547 Z-score: 743.0 bits: 146.9 E(32554): 4.6e-35
Smith-Waterman score: 1971; 58.7% identity (74.5% similar) in 518 aa overlap (1-510:1-459)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGFYDQQVPFMVPGKSRSEECRGRPVIDRKRKFLDTDLAHDSEELFQDLSQLQEAWLAE
::::::::::.:: ...:...: .:. :::::.. ::::::::::::::::::.::::
CCDS55 MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINRDLAHDSEELFQDLSQLQETWLAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 AQVPDDEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIKRELHSPSSELSS-CSHEQALGANYGEKCLYN
...:. : :::.: ::: ::.:: ::.:: . .::::::::
CCDS55 -----------------VAFHGLP-LKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYN
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 YCAYDRKPPSGFKPLTPPT---TPLSPTHQNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQGVGPAP
:::.:: :..: .::: ::.:: : ::
CCDS55 VSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLH----------------HA-------------
110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 APHSLPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMPENQYPSEQRFQRQLSEPCHPFPPQPGVP
.:.: : :.. .: . :: : .:...:: ..::.:::::::. ::: : .:
CCDS55 SPNSTHTPKPDR-AFPAHLPPSQS------IPDSSYPMDHRFRRQLSEPCNSFPPLPTMP
140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GDNRPSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHDPLYEHGVPGMPGPPA-HGFQSPMGIKQE
..:: :.:::::: .: ::::::::::::.:::.. : : : ..: :. ::::
CCDS55 REGRPMYQRQMSEPNIPF---PPQGFKQEYHDPVYEHNT--MVGSAASQSFPPPLMIKQE
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PRDYCVDSEVPNCQSSYMRG-GYFS--SSHEGFSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQE
:::. :::::.:.: ::: :... : :: .:: :: ..::::::::...: .:::
CCDS55 PRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCMFEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQE
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PTMYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQK
: :::::: ::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQK
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPDALFSMAFPDNQRPFLKAESE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::.. :
CCDS55 NRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDME
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510
pF1KB5 CHLSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAEGFAY
:..::::.::.::..: ::. . :. :: ::..:
CCDS55 RHINEEDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNPHPYNEGYVY
430 440 450
>>CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (477 aa)
initn: 1819 init1: 1059 opt: 1547 Z-score: 742.8 bits: 146.9 E(32554): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 2109; 61.3% identity (77.6% similar) in 519 aa overlap (1-510:1-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDGFYDQQVPFMVPGKSRSEECRGRPVIDRKRKFLDTDLAHDSEELFQDLSQLQEAWLAE
::::::::::.:: ...:...: .:. :::::.. ::::::::::::::::::.::::
CCDS55 MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINRDLAHDSEELFQDLSQLQETWLAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 AQVPD-DEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIKRELHSPSSELSS-CSHEQALGANYGEKCLY
::::: :::::::.:...:..:. : :::.: ::: ::.:: ::.:: . .:::::::
CCDS55 AQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLP-LKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLY
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NYCAYDRKPPSGFKPLTPPT---TPLSPTHQNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQGVGPA
: :::.:: :..: .::: ::.:: : ::
CCDS55 NVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLH----------------HA------------
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PAPHSLPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMPENQYPSEQRFQRQLSEPCHPFPPQPGV
.:.: : :.. .: . :: : .:...:: ..::.:::::::. ::: : .
CCDS55 -SPNSTHTPKPDR-AFPAHLPPSQS------IPDSSYPMDHRFRRQLSEPCNSFPPLPTM
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 PGDNRPSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHDPLYEHGVPGMPGPPA-HGFQSPMGIKQ
: ..:: :.:::::: .: ::::::::::::.:::.. : : : ..: :. :::
CCDS55 PREGRPMYQRQMSEPNIPF---PPQGFKQEYHDPVYEHNT--MVGSAASQSFPPPLMIKQ
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EPRDYCVDSEVPNCQSSYMRG-GYFS--SSHEGFSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQ
::::. :::::.:.: ::: :... : :: .:: :: ..::::::::...: .::
CCDS55 EPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCMFEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQ
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 EPTMYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQ
:: :::::: ::::::::::::::.:::::.:.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQ
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPDALFSMAFPDNQRPFLKAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::..
CCDS55 KNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDM
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510
pF1KB5 ECHLSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAEGFAY
: :..::::.::.::..: ::. . :. :: ::..:
CCDS55 ERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNPHPYNEGYVY
440 450 460 470
>>CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (374 aa)
initn: 1523 init1: 1059 opt: 1471 Z-score: 708.9 bits: 140.3 E(32554): 3.6e-33
Smith-Waterman score: 1513; 54.4% identity (66.7% similar) in 456 aa overlap (61-510:21-374)
40 50 60 70 80
pF1KB5 KRKFLDTDLAHDSEELFQDLSQLQEAWLAEAQVPD-DEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIK
::::: :::::::.:...:..:. : :::
CCDS55 MLQDLSASVFFPPCSQHRTLAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLP-LKIK
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB5 RELHSPSSELSS-CSHEQALGANYGEKCLYNYCAYDRKPPSGFKPLTPPTTPLSPTHQNP
.: ::: ::.:: ::.:: . .::::::::
CCDS55 KEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNV----------------------------
50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 LFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQGVGPAPAPHSLPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMP
CCDS55 ------------------------------------------------------------
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 ENQYPSEQRFQRQLSEPCHPFPPQPGVPGDNRPSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHD
::.:::::::. ::: : .: ..:: :.:::::: .: :::::::::::
CCDS55 --------RFRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPMYQRQMSEPNIPF---PPQGFKQEYHD
90 100 110 120 130
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 PLYEHGVPGMPGPPA-HGFQSPMGIKQEPRDYCVDSEVPNCQSSYMRG-GYFS--SSHEG
:.:::.. : : : ..: :. :::::::. :::::.:.: ::: :... : ::
CCDS55 PVYEHNT--MVGSAASQSFPPPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEG
140 150 160 170 180
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pF1KB5 FSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQEPTMYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANA
.:: :: ..::::::::...: .:::: :::::: ::::::::::::::.:::::.:.
CCDS55 CMFEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNS
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYV
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450 460 470 480 490 500
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310 320 330 340 350 360
510
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::..:
CCDS55 NEGYVY
370
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CCDS55 MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINRDLAHDSEELFQDLSQLQETWLAE
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CCDS55 AQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLP-LKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLY
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: :::.:: :..: .::: ::.:: : ::
CCDS55 NVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLH----------------HA------------
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.:.: : :.. .: . :: : .:...:: ..::.:::::::. ::: : .
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CCDS55 PREGRPMYQRQMSEPNIPF---PPQGFKQEYHDPVYEHNT--MVGSAASQSFPPPLMIKQ
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::::. :: : .:: :: ..::::::::...: .::::
CCDS55 EPRDFAYDS--------------------GCMFEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPG
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:::::: ::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::.. : :
CCDS55 PAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERH
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pF1KB5 LSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAEGFAY
..::::.::.::..: ::. . :. :: ::..:
CCDS55 INEEDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNPHPYNEGYVY
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CCDS58 PDFHSENLAFHSPT-TRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYS-SAYD-----
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CCDS58 ---------------------PPRQIAIKS----PAPG---ALGQSPLQ---PFPRAEQR
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CCDS58 NFLRSSGTSQP------HPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQL
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CCDS58 SEP-CP--PYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDS
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pF1KB5 EVPNCQSSYMRGGYFSSSHEG-----FSYEKDPRLYFDDTCVVPERLEGKVKQEPT-MYR
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CCDS58 DVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFR
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::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::.:::::::: :::: . .::
CCDS58 NYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSE
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CCDS58 EDTVPLSHLDESPAYLPELAG-PAQPFGPKGGYSY
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CCDS11 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPT-TRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYH
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CCDS11 HGEQCLYS-SAYD--------------------------PPRQIAI----KSPAPG---A
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CCDS11 LGQSPLQ---PFPRAEQRNFLRSSGTSQP------HPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSF
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CCDS11 TSQGGGREPLPAPYQHQLSEP-CP--PYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRY
200 210 220 230 240 250
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CCDS11 VPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLI
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CCDS11 PDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAG-PAQPFGPKGGYSY
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CCDS59 MYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEG
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pF1KB5 T-MYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQK
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CCDS59 VGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQK
50 60 70 80 90 100
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pF1KB5 NRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPDALFSMAFPDNQRPFLKAESE
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CCDS59 NRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFD
110 120 130 140 150 160
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pF1KB5 CHLSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAE--GFAY
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CCDS59 RPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAG-PAQPFGPKGGYSY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]