Result of FASTA (ccds) for pF1KB7738
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7738, 484 aa
  1>>>pF1KB7738 484 - 484 aa - 484 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3616+/-0.000858; mu= 4.3657+/- 0.051
 mean_var=173.6275+/-35.310, 0's: 0 Z-trim(113.4): 80  B-trim: 11 in 1/51
 Lambda= 0.097334
 statistics sampled from 14000 (14081) to 14000 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.433), width:  16
 Scan time:  3.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 484) 3431 493.8 1.7e-139
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 445) 3173 457.5 1.3e-128
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 477) 1678 247.6 2.1e-65
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 437) 1543 228.7   1e-59
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 207) 1457 216.4 2.4e-56
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 419) 1442 214.5 1.8e-55
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 459) 1438 213.9 2.9e-55
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 374) 1271 190.4 2.8e-48
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3           ( 510) 1121 169.4 7.9e-42
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 454) 1084 164.2 2.6e-40
CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 225)  409 69.2 5.1e-12
CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 354)  408 69.2 8.1e-12
CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11           ( 441)  409 69.4 8.8e-12
CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 485)  409 69.4 9.5e-12
CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21          ( 469)  405 68.9 1.4e-11
CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1            ( 405)  389 66.6 5.8e-11
CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1            ( 431)  389 66.6 6.1e-11
CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX           (  95)  376 64.4 6.3e-11


>>CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17               (484 aa)
 initn: 3431 init1: 3431 opt: 3431  Z-score: 2617.8  bits: 493.8 E(32554): 1.7e-139
Smith-Waterman score: 3431; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (1-484:1-484)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GEQCLYSSAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEQCLYSSAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 HSSVFQQPLDICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSSVFQQPLDICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 AVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 KPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 AWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 VCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKG
              430       440       450       460       470       480

           
pF1KB7 GYSY
       ::::
CCDS11 GYSY
           

>>CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17               (445 aa)
 initn: 3173 init1: 3173 opt: 3173  Z-score: 2422.5  bits: 457.5 E(32554): 1.3e-128
Smith-Waterman score: 3173; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (40-484:1-445)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB7 LDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQ
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                               MDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQ
                                             10        20        30

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB7 VPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYSSA
               40        50        60        70        80        90

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB7 YDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL
              100       110       120       130       140       150

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB7 DICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNG
              160       170       180       190       200       210

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB7 HRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDD
              220       230       240       250       260       270

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB7 VCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEF
              280       290       300       310       320       330

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB7 KLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFS
              340       350       360       370       380       390

     430       440       450       460       470       480    
pF1KB7 LAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
              400       410       420       430       440     

>>CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7                (477 aa)
 initn: 1654 init1: 868 opt: 1678  Z-score: 1287.5  bits: 247.6 E(32554): 2.1e-65
Smith-Waterman score: 1683; 55.1% identity (74.3% similar) in 490 aa overlap (8-484:3-477)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
              :. ::::::  .... : .  ..       :...  .:   :::.::::::..
CCDS55      MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINR-DLAH-DSEELFQDLSQL
                    10        20        30         40         50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
       ::::::::::::.:::::::...:.::::.   .:::::.:: .. . .::.. :. . .
CCDS55 QETWLAEAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSY
            60        70        80        90       100       110   

               130       140       150                160       170
pF1KB7 GEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAE---------QRNFLRSSGTSQ
       ::.:::. ::::   :....   : . ...:..:. .:          .: :      ::
CCDS55 GEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQ
           120       130       140       150       160       170   

              180        190       200        210       220        
pF1KB7 PHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQE
         :  .:  .:   :.. : . :.::       ::  :  ::.:.:::  :.: :.::::
CCDS55 SIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQE
           180         190       200       210        220       230

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 YHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGF-SG
       ::::.::.  .     :.. .. .:   ..::::  ::::::.: .: :.:.. ::: . 
CCDS55 YHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAH
              240           250        260       270       280     

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB7 PSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFL
       ::  .: :   .::  : : ::.:::::::.::::::  : .:::: :::::.:::::::
CCDS55 PSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFL
         290          300       310       320        330       340 

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB7 VALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
       :::::::.:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
             350       360       370       380       390       400 

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB7 MQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLP
       :::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::::.::: ::.:
CCDS55 MQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMP
             410       420       430       440       450       460 

       470       480    
pF1KB7 ELAGPAQPFGPKGGYSY
       : .:  .:   . :: :
CCDS55 E-GGCCNPHPYNEGYVY
              470       

>>CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7                (437 aa)
 initn: 1507 init1: 868 opt: 1543  Z-score: 1185.6  bits: 228.7 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 1548; 56.7% identity (75.1% similar) in 430 aa overlap (68-484:21-437)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB7 KLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKK
                                     :::::.:::::::...:.::::.   .:::
CCDS55           MLQDLSASVFFPPCSQHRTLAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKK
                         10        20        30        40        50

       100       110       120        130       140       150      
pF1KB7 EPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPR
       ::.:: .. . .::.. :. . .::.:::. ::::   :....   : . ...:..:. .
CCDS55 EPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHH
               60        70        80        90       100       110

                 160       170       180        190       200      
pF1KB7 AE---------QRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPL
       :          .: :      ::  :  .:  .:   :.. : . :.::       ::  
CCDS55 ASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQSIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGR
              120       130       140         150       160        

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB7 PAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTD
       :  ::.:.:::  :.: :.::::::::.::.  .     :.. .. .:   ..::::  :
CCDS55 PM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQEYHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRD
      170        180       190       200           210        220  

         270       280        290       300       310       320    
pF1KB7 FAYDSDVTGCASMYLHTEGF-SGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQE
       :::::.: .: :.:.. ::: . ::  .: :   .::  : : ::.:::::::.::::::
CCDS55 FAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQE
            230       240       250          260       270         

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB7 GVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQ
         : .:::: :::::.::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::
CCDS55 P-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQ
     280        290       300       310       320       330        

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB7 KNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::: ::...
CCDS55 KNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDM
      340       350       360       370       380       390        

          450       460       470       480    
pF1KB7 DRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
       .: ..:::::::::.::: ::.:: .:  .:   . :: :
CCDS55 ERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPE-GGCCNPHPYNEGYVY
      400       410       420        430       

>>CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17               (207 aa)
 initn: 1457 init1: 1457 opt: 1457  Z-score: 1125.1  bits: 216.4 E(32554): 2.4e-56
Smith-Waterman score: 1457; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (278-484:1-207)

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB7 NGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFP
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                               MYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFP
                                             10        20        30

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB7 DDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGM
               40        50        60        70        80        90

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB7 EFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEAL
              100       110       120       130       140       150

       430       440       450       460       470       480    
pF1KB7 FSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
              160       170       180       190       200       

>>CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7                (419 aa)
 initn: 1401 init1: 868 opt: 1442  Z-score: 1109.3  bits: 214.5 E(32554): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 1447; 55.5% identity (73.6% similar) in 416 aa overlap (82-484:17-419)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB7 DLFQDLSHFQETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCS
                                     :   .:::.   .:::::.:: .. . .::
CCDS55               MLQDLSASVFFPPCSQHRTLVAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACS
                             10        20        30        40      

             120        130       140       150                160 
pF1KB7 RKPPLPYHHGEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAE---------QRN
       .. :. . .::.:::. ::::   :....   : . ...:..:. .:          .: 
CCDS55 QEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHHASPNSTHTPKPDRA
         50        60        70        80        90       100      

             170       180        190       200        210         
pF1KB7 FLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPLPAPYQHQLSEPCPP
       :      ::  :  .:  .:   :.. : . :.::       ::  :  ::.:.:::  :
CCDS55 FPAHLPPSQSIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIP
        110       120         130       140       150        160   

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB7 YPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMY
       .: :.::::::::.::.  .     :.. .. .:   ..::::  ::::::.: .: :.:
CCDS55 FPPQGFKQEYHDPVYEHNTM----VGSAASQSFP-PPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIY
           170       180           190        200       210        

     280        290       300       310       320       330        
pF1KB7 LHTEGF-SGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRR
       .. ::: . ::  .: :   .::  : : ::.:::::::.::::::  : .:::: ::::
CCDS55 MRQEGFLAHPSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRR
      220       230          240       250       260        270    

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB7 GALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRS
       :.::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS55 GSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRS
          280       290       300       310       320       330    

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB7 LRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSH
       ::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::::
CCDS55 LRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSH
          340       350       360       370       380       390    

      460       470       480    
pF1KB7 LDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
       .::: ::.:: .:  .:   . :: :
CCDS55 FDESMAYMPE-GGCCNPHPYNEGYVY
          400        410         

>>CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7                (459 aa)
 initn: 1534 init1: 868 opt: 1438  Z-score: 1105.6  bits: 213.9 E(32554): 2.9e-55
Smith-Waterman score: 1532; 52.2% identity (70.6% similar) in 490 aa overlap (8-484:3-459)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
              :. ::::::  .... : .  ..       :...  .:   :::.::::::..
CCDS55      MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINR-DLAH-DSEELFQDLSQL
                    10        20        30         40         50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
       :::::::                  .:::.   .:::::.:: .. . .::.. :. . .
CCDS55 QETWLAE------------------VAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSY
            60                          70        80        90     

               130       140       150                160       170
pF1KB7 GEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAE---------QRNFLRSSGTSQ
       ::.:::. ::::   :....   : . ...:..:. .:          .: :      ::
CCDS55 GEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQ
         100       110       120       130       140       150     

              180        190       200        210       220        
pF1KB7 PHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQE
         :  .:  .:   :.. : . :.::       ::  :  ::.:.:::  :.: :.::::
CCDS55 SIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQE
         160         170       180       190        200       210  

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 YHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGF-SG
       ::::.::.  .     :.. .. .:   ..::::  ::::::.: .: :.:.. ::: . 
CCDS55 YHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAH
            220           230        240       250       260       

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB7 PSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFL
       ::  .: :   .::  : : ::.:::::::.::::::  : .:::: :::::.:::::::
CCDS55 PSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFL
       270          280       290       300        310       320   

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB7 VALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
       :::::::.:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
           330       340       350       360       370       380   

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB7 MQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLP
       :::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::::.::: ::.:
CCDS55 MQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMP
           390       400       410       420       430       440   

       470       480    
pF1KB7 ELAGPAQPFGPKGGYSY
       : .:  .:   . :: :
CCDS55 E-GGCCNPHPYNEGYVY
            450         

>>CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7                (374 aa)
 initn: 1507 init1: 868 opt: 1271  Z-score: 980.2  bits: 190.4 E(32554): 2.8e-48
Smith-Waterman score: 1413; 55.3% identity (71.3% similar) in 418 aa overlap (68-484:21-374)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB7 KLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKK
                                     :::::.:::::::...:.::::.   .:::
CCDS55           MLQDLSASVFFPPCSQHRTLAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKK
                         10        20        30        40        50

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB7 EPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYSSAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRA
       ::.:: .. . .::.. :. . .::.:::.  .   ::..            : . ::  
CCDS55 EPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVRFR--RQLS-----------EPCNSFP--
               60        70        80                     90       

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB7 EQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPLDICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPC
                    : :             .: .          :: :.   ::.:.::: 
CCDS55 -------------PLP------------TMPRE----------GR-PM---YQRQMSEPN
                                  100                     110      

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB7 PPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCAS
        :.: :.::::::::.::.  .     :.. .. .:   ..::::  ::::::.: .: :
CCDS55 IPFPPQGFKQEYHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRDFAYDSEVPSCHS
        120       130           140       150        160       170 

       280        290       300       310       320       330      
pF1KB7 MYLHTEGF-SGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQ
       .:.. ::: . ::  .: :   .::  : : ::.:::::::.::::::  : .:::: ::
CCDS55 IYMRQEGFLAHPSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQ
             180       190          200       210        220       

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB7 RRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLS
       :::.::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS55 RRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLS
       230       240       250       260       270       280       

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB7 RSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPL
       ::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::
CCDS55 RSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPL
       290       300       310       320       330       340       

        460       470       480    
pF1KB7 SHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
       ::.::: ::.:: .:  .:   . :: :
CCDS55 SHFDESMAYMPE-GGCCNPHPYNEGYVY
       350        360       370    

>>CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3                (510 aa)
 initn: 1281 init1: 839 opt: 1121  Z-score: 864.4  bits: 169.4 E(32554): 7.9e-42
Smith-Waterman score: 1492; 50.2% identity (67.5% similar) in 526 aa overlap (8-484:3-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
              :. :::::.   .:: ..    . .:    :..:  .:   :::.::::::..
CCDS33      MDGFYDQQVPFMVPGKSRSEECRGRPVIDRKRKFLDT-DLAH-DSEELFQDLSQL
                    10        20        30         40         50   

               70        80        90        100       110         
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPT-TRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYH
       ::.::::::::: ::::::::.:.::..:.:  :.::.: .:: .. . :::..  :  .
CCDS33 QEAWLAEAQVPD-DEQFVPDFQSDNLVLHAPPPTKIKRELHSPSSELS-SCSHEQALGAN
            60         70        80        90       100        110 

     120        130                                 140            
pF1KB7 HGEQCLYS-SAYD--------------------------PPRQIAIKS----PAPG---A
       .::.:::.  :::                          :: : .. .    :: :   .
CCDS33 YGEKCLYNYCAYDRKPPSGFKPLTPPTTPLSPTHQNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQG
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KB7 LGQSPLQ---PFPRAEQRNFLRSSGTSQP------HPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSF
       .: .:     : :  .:..:       ::       : . : .:.   ::. : . :: :
CCDS33 VGPAPAPHSLPEPGPQQQTFAVPRPPHQPLQMPKMMPENQYPSEQR--FQRQLSEPCHPF
             180       190       200       210         220         

         200       210          220       230       240       250  
pF1KB7 TSQGGGREPLPAPYQHQLSEP-CP--PYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRY
         : :        :..:.:::  :  : : :.:::::::::::. : :..    ..: . 
CCDS33 PPQPGVPGDNRPSYHRQMSEPIVPAAPPPPQGFKQEYHDPLYEH-GVPGMPGPPAHGFQS
     230       240       250       260       270        280        

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB7 PGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCV
       : .   ::::  :.  ::.: .: : :..   ::.   :     ..:::  : . ::.::
CCDS33 PMG---IKQEPRDYCVDSEVPNCQSSYMRGGYFSSSHEG-----FSYEKDPRLYFDDTCV
      290          300       310       320            330       340

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB7 VPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLI
       :::..:: .::: .  .::::::::::.::::::::.:::::.:::::::::::::::::
CCDS33 VPERLEGKVKQEPT-MYREGPPYQRRGSLQLWQFLVTLLDDPANAHFIAWTGRGMEFKLI
              350        360       370       380       390         

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB7 EPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAF
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::.::
CCDS33 EPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPDALFSMAF
     400       410       420       430       440       450         

            440       450       460       470        480    
pF1KB7 PDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAG-PAQPFGPKGGYSY
       :::::: :::: .  .:::::.::.:...::::: ..    . :..   :..:
CCDS33 PDNQRPFLKAESECHLSEEDTLPLTHFEDSPAYLLDMDRCSSLPYAE--GFAY
     460       470       480       490       500         510

>>CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7                (454 aa)
 initn: 1555 init1: 868 opt: 1084  Z-score: 837.1  bits: 164.2 E(32554): 2.6e-40
Smith-Waterman score: 1580; 53.4% identity (71.2% similar) in 489 aa overlap (8-484:3-454)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
              :. ::::::  .... : .  ..       :...  .:   :::.::::::..
CCDS55      MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINR-DLAH-DSEELFQDLSQL
                    10        20        30         40         50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
       ::::::::::::.:::::::...:.::::.   .:::::.:: .. . .::.. :. . .
CCDS55 QETWLAEAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSY
            60        70        80        90       100       110   

               130       140       150                160       170
pF1KB7 GEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAE---------QRNFLRSSGTSQ
       ::.:::. ::::   :....   : . ...:..:. .:          .: :      ::
CCDS55 GEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQ
           120       130       140       150       160       170   

              180        190       200        210       220        
pF1KB7 PHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQE
         :  .:  .:   :.. : . :.::       ::  :  ::.:.:::  :.: :.::::
CCDS55 SIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQE
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      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 YHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGP
       ::::.::.  .     :.. .. .:   ..::::  ::::::   ::             
CCDS55 YHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRDFAYDS---GCM------------
              240           250        260          270            

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB7 SPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLV
                 .::  : : ::.:::::::.::::::  : .:::: :::::.::::::::
CCDS55 ----------FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFLV
                        280       290        300       310         

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB7 ALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIM
       ::::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIM
     320       330       340       350       360       370         

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pF1KB7 QKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPE
       ::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::::.::: ::.::
CCDS55 QKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPE
     380       390       400       410       420       430         

      470       480    
pF1KB7 LAGPAQPFGPKGGYSY
        .:  .:   . :: :
CCDS55 -GGCCNPHPYNEGYVY
      440       450    




484 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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