Result of FASTA (ccds) for pF1KB7713
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7713, 423 aa
  1>>>pF1KB7713 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7002+/-0.000735; mu= 13.1644+/- 0.045
 mean_var=125.5054+/-24.722, 0's: 0 Z-trim(114.1): 122  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.114484
 statistics sampled from 14603 (14726) to 14603 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.452), width:  16
 Scan time:  2.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11         ( 423) 2816 475.7 3.8e-134
CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11         ( 422) 2799 472.9 2.6e-133
CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1          ( 470) 1591 273.4 3.3e-73
CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1           ( 435)  981 172.6 6.6e-43
CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1          ( 458)  981 172.6 6.9e-43
CCDS58060.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1          ( 396)  969 170.6 2.4e-42
CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs108|chr14          ( 508)  956 168.5 1.3e-41
CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14           ( 530)  787 140.6 3.4e-33
CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 474)  718 129.2 8.4e-30
CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 481)  718 129.2 8.5e-30
CCDS32096.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 495)  718 129.2 8.7e-30
CCDS12352.1 NR2F6 gene_id:2063|Hs108|chr19         ( 404)  653 118.4 1.3e-26
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11            ( 933)  601 110.1 9.3e-24
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5           ( 777)  589 108.0 3.2e-23
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5          ( 742)  580 106.5 8.6e-23
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5          ( 778)  577 106.1 1.3e-22
CCDS2201.1 NR4A2 gene_id:4929|Hs108|chr2           ( 598)  564 103.8 4.6e-22
CCDS6743.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9           ( 626)  549 101.4 2.6e-21
CCDS6742.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9           ( 637)  549 101.4 2.7e-21
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX              ( 388)  525 97.2 2.9e-20
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX              ( 920)  525 97.5 5.5e-20
CCDS61469.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14          ( 439)  479 89.7 6.1e-18
CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1           ( 348)  464 87.1 2.8e-17
CCDS41430.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 352)  456 85.8 7.1e-17
CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs108|chr6            ( 595)  451 85.2 1.9e-16
CCDS44260.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 339)  445 84.0 2.4e-16
CCDS44261.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 340)  436 82.5 6.9e-16
CCDS41429.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 357)  436 82.5 7.1e-16
CCDS59229.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11           ( 339)  421 80.0 3.8e-15
CCDS6856.1 NR5A1 gene_id:2516|Hs108|chr9           ( 461)  393 75.5 1.2e-13
CCDS6744.1 NR4A3 gene_id:8013|Hs108|chr9           ( 443)  382 73.7 4.1e-13
CCDS8818.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12          ( 598)  380 73.4 6.4e-13
CCDS55828.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12         ( 611)  380 73.4 6.5e-13
CCDS60383.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs108|chr1          ( 469)  378 73.0 6.7e-13
CCDS73471.1 NR4A1 gene_id:3164|Hs108|chr12         ( 652)  380 73.5 6.9e-13
CCDS1400.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs108|chr1           ( 495)  378 73.0   7e-13
CCDS1401.1 NR5A2 gene_id:2494|Hs108|chr1           ( 541)  378 73.1 7.5e-13
CCDS41428.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 314)  371 71.7 1.1e-12
CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1            ( 463)  367 71.2 2.3e-12
CCDS53405.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 296)  363 70.4 2.6e-12
CCDS44262.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1          ( 309)  363 70.4 2.7e-12
CCDS45359.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15         ( 261)  358 69.5 4.2e-12
CCDS45358.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15         ( 281)  358 69.6 4.5e-12
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4           ( 984)  365 71.1 5.2e-12
CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1           ( 340)  357 69.5 5.8e-12
CCDS35172.1 RXRA gene_id:6256|Hs108|chr9           ( 462)  359 69.9 5.8e-12
CCDS4768.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6            ( 533)  352 68.8 1.5e-11
CCDS59007.1 RXRB gene_id:6257|Hs108|chr6           ( 537)  352 68.8 1.5e-11
CCDS10375.1 NR2F2 gene_id:7026|Hs108|chr15         ( 414)  343 67.2 3.4e-11
CCDS11361.1 NR1D1 gene_id:9572|Hs108|chr17         ( 614)  339 66.7 7.2e-11


>>CCDS41667.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11              (423 aa)
 initn: 2816 init1: 2816 opt: 2816  Z-score: 2521.9  bits: 475.7 E(32554): 3.8e-134
Smith-Waterman score: 2816; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGEGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGEGAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 CEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LAVAGGPRKTAAPVNALVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LAVAGGPRKTAAPVNALVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 GLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 EYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEA
              370       380       390       400       410       420

          
pF1KB7 MMD
       :::
CCDS41 MMD
          

>>CCDS60830.1 ESRRA gene_id:2101|Hs108|chr11              (422 aa)
 initn: 1478 init1: 1478 opt: 2799  Z-score: 2506.7  bits: 472.9 E(32554): 2.6e-133
Smith-Waterman score: 2799; 99.8% identity (99.8% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGEGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGEGAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 CEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LAVAGGPRKTAAPVNALVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTI
       ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LAVAGGPRKTA-PVNALVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTI
              190        200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAA
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 GLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALL
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 EYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEA
     360       370       380       390       400       410         

          
pF1KB7 MMD
       :::
CCDS60 MMD
     420  

>>CCDS58061.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1               (470 aa)
 initn: 1632 init1: 736 opt: 1591  Z-score: 1427.8  bits: 273.4 E(32554): 3.3e-73
Smith-Waterman score: 1604; 57.8% identity (78.1% similar) in 434 aa overlap (12-420:43-468)

                                  10        20        30        40 
pF1KB7                    MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGP
                                     .::.::.:: :   : . ..    . : : 
CCDS58 KSDLACVPSAKRLLCRMSNKDRHIDSSCSSFIKTEPSSPASLTDSVNHHSPGGSSDASG-
             20        30        40        50        60        70  

              50                  60                      70       
pF1KB7 APTRCLPGHKEEEDGE----------GAGP--------------GEQGGGKLVLSSLPKR
       . .  . ::..  :.           :.::                :   . .:.:.:::
CCDS58 SYSSTMNGHQNGLDSPPLYPSAPILGGSGPVRKLYDDCSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKR
              80        90       100       110       120       130 

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB7 LCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFT
       :::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::.:::::: 
CCDS58 LCLVCGDIASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGNIEYSCPATNECEITKRRRKSCQACRFM
             140       150       160       170       180       190 

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB7 KCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGPLAVAGGPRKTAAPV-NA
       :::.::::::::::::::::::::::: ...  :. .:  . :   :  :   . :. : 
CCDS58 KCLKVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRIDAENSPYLNPQLVQP---AKKPLLWSDPADNK
             200       210       220       230          240        

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB7 LVSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSD
       .::::::.::::.::::::. ::. . :..::::: :::.:: :.::: :::::.:::.:
CCDS58 IVSHLLVAEPEKIYAMPDPTVPDSDIKALTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSTLSLAD
      250       260       270       280       290       300        

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB7 QMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAAGLGELGAALLQLVRRL
       :::.:::.:::.:.:::. ::: ..:::..:.: ..::. .. ::: .:. :.::::.. 
CCDS58 QMSLLQSAWMEILILGVVYRSLSFEDELVYADDYIMDEDQSKLAGLLDLNNAILQLVKKY
      310       320       330       340       350       360        

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB7 QALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALLEYEAGRAGPGGGAERR
       ....::.::.: :::.:::::::.::::.:::..:...::::: .::::.       . :
CCDS58 KSMKLEKEEFVTLKAIALANSDSMHIEDVEAVQKLQDVLHEALQDYEAGQHME----DPR
      370       380       390       400       410       420        

        380       390       400       410       420   
pF1KB7 RAGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
       :::..:.::::::::. :.. :::..::::::::::::::::::   
CCDS58 RAGKMLMTLPLLRQTSTKAVQHFYNIKLEGKVPMHKLFLEMLEAKV 
          430       440       450       460       470 

>>CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1                (435 aa)
 initn: 1632 init1: 736 opt: 981  Z-score: 883.8  bits: 172.6 E(32554): 6.6e-43
Smith-Waterman score: 1600; 57.7% identity (77.8% similar) in 433 aa overlap (12-420:15-433)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGE
                     .::.::.:: :   : . ..    . : : . .  . ::..  :. 
CCDS15 MSNKDRHIDSSCSSFIKTEPSSPASLTDSVNHHSPGGSSDASG-SYSSTMNGHQNGLDSP
               10        20        30        40         50         

                  60                      70        80        90   
pF1KB7 ----------GAGP--------------GEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGV
                 :.::                :   . .:.:.::::::::::.::::::::
CCDS15 PLYPSAPILGGSGPVRKLYDDCSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKRLCLVCGDIASGYHYGV
      60        70        80        90       100       110         

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB7 ASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDR
       ::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::.:::::: :::.::::::::::::
CCDS15 ASCEACKAFFKRTIQGNIEYSCPATNECEITKRRRKSCQACRFMKCLKVGMLKEGVRLDR
     120       130       140       150       160       170         

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB7 VRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGPLAVAGGPRKTAAPVNALVSHLLVVEPEKLYAMP
       ::::::::::: ...  :. .:  . :       .:   : : .::::::.::::.::::
CCDS15 VRGGRQKYKRRIDAENSPYLNPQLVQP------AKK---PYNKIVSHLLVAEPEKIYAMP
     180       190       200                210       220       230

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB7 DPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGV
       ::. ::. . :..::::: :::.:: :.::: :::::.:::.::::.:::.:::.:.:::
CCDS15 DPTVPDSDIKALTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSTLSLADQMSLLQSAWMEILILGV
              240       250       260       270       280       290

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB7 AQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALA
       . ::: ..:::..:.: ..::. .. ::: .:. :.::::.. ....::.::.: :::.:
CCDS15 VYRSLSFEDELVYADDYIMDEDQSKLAGLLDLNNAILQLVKKYKSMKLEKEEFVTLKAIA
              300       310       320       330       340       350

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB7 LANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALLEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
       ::::::.::::.:::..:...::::: .::::.       . ::::..:.::::::::. 
CCDS15 LANSDSMHIEDVEAVQKLQDVLHEALQDYEAGQHME----DPRRAGKMLMTLPLLRQTST
              360       370       380           390       400      

           400       410       420   
pF1KB7 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
       :.. :::..::::::::::::::::::   
CCDS15 KAVQHFYNIKLEGKVPMHKLFLEMLEAKV 
        410       420       430      

>>CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1               (458 aa)
 initn: 1632 init1: 736 opt: 981  Z-score: 883.5  bits: 172.6 E(32554): 6.9e-43
Smith-Waterman score: 1600; 57.7% identity (77.8% similar) in 433 aa overlap (12-420:38-456)

                                  10        20        30        40 
pF1KB7                    MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGP
                                     .::.::.:: :   : . ..    . : : 
CCDS41 LPESFSLHYEEELLCRMSNKDRHIDSSCSSFIKTEPSSPASLTDSVNHHSPGGSSDASG-
        10        20        30        40        50        60       

              50                  60                      70       
pF1KB7 APTRCLPGHKEEEDGE----------GAGP--------------GEQGGGKLVLSSLPKR
       . .  . ::..  :.           :.::                :   . .:.:.:::
CCDS41 SYSSTMNGHQNGLDSPPLYPSAPILGGSGPVRKLYDDCSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKR
         70        80        90       100       110       120      

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pF1KB7 LCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFT
       :::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::.:::::: 
CCDS41 LCLVCGDIASGYHYGVASCEACKAFFKRTIQGNIEYSCPATNECEITKRRRKSCQACRFM
        130       140       150       160       170       180      

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pF1KB7 KCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGPLAVAGGPRKTAAPVNAL
       :::.::::::::::::::::::::::: ...  :. .:  . :       .:   : : .
CCDS41 KCLKVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRIDAENSPYLNPQLVQP------AKK---PYNKI
        190       200       210       220             230          

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB7 VSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQ
       ::::::.::::.::::::. ::. . :..::::: :::.:: :.::: :::::.:::.::
CCDS41 VSHLLVAEPEKIYAMPDPTVPDSDIKALTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSTLSLADQ
       240       250       260       270       280       290       

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pF1KB7 MSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQ
       ::.:::.:::.:.:::. ::: ..:::..:.: ..::. .. ::: .:. :.::::.. .
CCDS41 MSLLQSAWMEILILGVVYRSLSFEDELVYADDYIMDEDQSKLAGLLDLNNAILQLVKKYK
       300       310       320       330       340       350       

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB7 ALRLEREEYVLLKALALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALLEYEAGRAGPGGGAERRR
       ...::.::.: :::.:::::::.::::.:::..:...::::: .::::.       . ::
CCDS41 SMKLEKEEFVTLKAIALANSDSMHIEDVEAVQKLQDVLHEALQDYEAGQHME----DPRR
       360       370       380       390       400           410   

       380       390       400       410       420   
pF1KB7 AGRLLLTLPLLRQTAGKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
       ::..:.::::::::. :.. :::..::::::::::::::::::   
CCDS41 AGKMLMTLPLLRQTSTKAVQHFYNIKLEGKVPMHKLFLEMLEAKV 
           420       430       440       450         

>>CCDS58060.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1               (396 aa)
 initn: 1356 init1: 736 opt: 969  Z-score: 873.6  bits: 170.6 E(32554): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 1257; 49.9% identity (69.1% similar) in 433 aa overlap (12-420:15-394)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDSPKGSSETETEPPVALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGE
                     .::.::.:: :   : . ..    . : : . .  . ::..  :. 
CCDS58 MSNKDRHIDSSCSSFIKTEPSSPASLTDSVNHHSPGGSSDASG-SYSSTMNGHQNGLDSP
               10        20        30        40         50         

                  60                      70        80        90   
pF1KB7 ----------GAGP--------------GEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGV
                 :.::                :   . .:.:.::::::::::.::::::::
CCDS58 PLYPSAPILGGSGPVRKLYDDCSSTIVEDPQTKCEYMLNSMPKRLCLVCGDIASGYHYGV
      60        70        80        90       100       110         

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB7 ASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDR
       ::::::::::::::::                                       :::::
CCDS58 ASCEACKAFFKRTIQG---------------------------------------VRLDR
     120       130                                              140

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB7 VRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGPLAVAGGPRKTAAPVNALVSHLLVVEPEKLYAMP
       ::::::::::: ...  :. .:  . :       .:   : : .::::::.::::.::::
CCDS58 VRGGRQKYKRRIDAENSPYLNPQLVQP------AKK---PYNKIVSHLLVAEPEKIYAMP
              150       160             170          180       190 

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB7 DPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGV
       ::. ::. . :..::::: :::.:: :.::: :::::.:::.::::.:::.:::.:.:::
CCDS58 DPTVPDSDIKALTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSTLSLADQMSLLQSAWMEILILGV
             200       210       220       230       240       250 

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB7 AQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALA
       . ::: ..:::..:.: ..::. .. ::: .:. :.::::.. ....::.::.: :::.:
CCDS58 VYRSLSFEDELVYADDYIMDEDQSKLAGLLDLNNAILQLVKKYKSMKLEKEEFVTLKAIA
             260       270       280       290       300       310 

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB7 LANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALLEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
       ::::::.::::.:::..:...::::: .::::.       . ::::..:.::::::::. 
CCDS58 LANSDSMHIEDVEAVQKLQDVLHEALQDYEAGQHME----DPRRAGKMLMTLPLLRQTST
             320       330       340           350       360       

           400       410       420   
pF1KB7 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
       :.. :::..::::::::::::::::::   
CCDS58 KAVQHFYNIKLEGKVPMHKLFLEMLEAKV 
       370       380       390       

>>CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs108|chr14               (508 aa)
 initn: 1609 init1: 729 opt: 956  Z-score: 860.5  bits: 168.5 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 1573; 59.0% identity (77.6% similar) in 434 aa overlap (12-420:15-431)

                  10        20                 30                  
pF1KB7    MSSQVVGIEPLYIKAEPASPDS---------PKGSSETE--------------TEPP
                     .::.::.::.:         :.:::..                 ::
CCDS98 MSSDDRHLGSSCGSFIKTEPSSPSSGIDALSHHSPSGSSDASGGFGLALGTHANGLDSPP
               10        20        30        40        50        60

           40        50        60          70        80        90  
pF1KB7 VALAPGPAPTRCLPGHKEEEDGEGAGPGEQGGGK--LVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYG
       .  . : . : :   .:  ::  ..:  :... :   .:...::::::::::.:::::::
CCDS98 MFAGAGLGGTPC---RKSYEDC-ASGIMEDSAIKCEYMLNAIPKRLCLVCGDIASGYHYG
               70            80        90       100       110      

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB7 VASCEACKAFFKRTIQGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLD
       :::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::.:::::: :::.:::::::::::
CCDS98 VASCEACKAFFKRTIQGNIEYSCPATNECEITKRRRKSCQACRFMKCLKVGMLKEGVRLD
        120       130       140       150       160       170      

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB7 RVRGGRQKYKRRPEVDPLPFPGPFPAGPLAVAGGPRKTAAPVNALVSHLLVVEPEKLYAM
       :::::::::::: . .  :. .      : ..   .:   :.. .::.:::.::.:::::
CCDS98 RVRGGRQKYKRRLDSESSPYLS------LQISPPAKK---PLTKIVSYLLVAEPDKLYAM
        180       190             200          210       220       

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB7 PDPAGPDGHLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLG
       : :. :.: . :..::::: :::.:: :.::: :::::::::.::::.:::.:::.:.::
CCDS98 PPPGMPEGDIKALTTLCDLADRELVVIIGWAKHIPGFSSLSLGDQMSLLQSAWMEILILG
       230       240       250       260       270       280       

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB7 VAQRSLPLQDELAFAEDLVLDEEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKAL
       .. :::: .:.:..::: ..::: .: ::: ::  :.:::::: . :..:.::.: ::::
CCDS98 IVYRSLPYDDKLVYAEDYIMDEEHSRLAGLLELYRAILQLVRRYKKLKVEKEEFVTLKAL
       290       300       310       320       330       340       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB7 ALANSDSVHIEDAEAVEQLREALHEALLEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTA
       :::::::..::: :::..:.. ::::: .:: ..       :  :.:.::::::::::::
CCDS98 ALANSDSMYIEDLEAVQKLQDLLHEALQDYELSQRHE----EPWRTGKLLLTLPLLRQTA
       350       360       370       380           390       400   

            400       410       420                                
pF1KB7 GKVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD                             
       .:.. :::.:::.:::::::::::::::                                
CCDS98 AKAVQHFYSVKLQGKVPMHKLFLEMLEAKVGQEQLRGSPKDERMSSHDGKCPFQSAAFTS
           410       420       430       440       450       460   

>>CCDS9762.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14                (530 aa)
 initn: 597 init1: 560 opt: 787  Z-score: 709.4  bits: 140.6 E(32554): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 787; 40.3% identity (64.4% similar) in 357 aa overlap (78-420:148-497)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB7 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
                                     .: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS97 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
       120       130       140       150       160       170       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB7 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
       ::  .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .:  : :   ..:   
CCDS97 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
       180       190       200       210       220        230      

       170       180         190            200       210       220
pF1KB7 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PRKTAAPVNAL-----VSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
       . :       ::    .::  ::     ..::     :  :: .:: ..  .  :..:  
CCDS97 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
        240            250       260       270       280        290

              230       240       250       260       270       280
pF1KB7 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
       .   . .:  : :.:.:  :::::.::::  ::: ::. .:.: :::::..:.  ::.  
CCDS97 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
              300       310       320       330       340       350

              290        300       310       320       330         
pF1KB7 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
         .: :: ::::: .::  . :. :.   ::  . :.. :.:...::. .::. : ::. 
CCDS97 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
              360       370       380       390       400       410

     340           350         360       370       380       390   
pF1KB7 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
         .    .::.. ..: . :. .   : .  ...: ..  .  : . ::. :  .:....
CCDS97 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHASN
              420       430       440       450       460       470

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pF1KB7 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD                              
       : . :. ..: .. ::.. :.::::.:                                 
CCDS97 KGMEHLLNMKCKNVVPVYDLLLEMLNAHVLRGCKSSITGSECSPAEDSKSKEGSQNPQSQ
              480       490       500       510       520       530

>>CCDS61470.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14               (474 aa)
 initn: 560 init1: 560 opt: 718  Z-score: 648.5  bits: 129.2 E(32554): 8.4e-30
Smith-Waterman score: 718; 40.7% identity (63.0% similar) in 327 aa overlap (78-390:148-467)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB7 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
                                     .: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS61 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
       120       130       140       150       160       170       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB7 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
       ::  .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .:  : :   ..:   
CCDS61 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
       180       190       200       210       220        230      

       170       180         190            200       210       220
pF1KB7 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PRKTAAPVNAL-----VSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
       . :       ::    .::  ::     ..::     :  :: .:: ..  .  :..:  
CCDS61 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
        240            250       260       270       280        290

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pF1KB7 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
       .   . .:  : :.:.:  :::::.::::  ::: ::. .:.: :::::..:.  ::.  
CCDS61 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
              300       310       320       330       340       350

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pF1KB7 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
         .: :: ::::: .::  . :. :.   ::  . :.. :.:...::. .::. : ::. 
CCDS61 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
              360       370       380       390       400       410

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pF1KB7 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
         .    .::.. ..: . :. .   : .  ...: ..  .  : . ::. :  .:.   
CCDS61 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARS
              420       430       440       450       460       470

           400       410       420   
pF1KB7 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
                                     
CCDS61 CVYK                          
                                     

>>CCDS55920.1 ESR2 gene_id:2100|Hs108|chr14               (481 aa)
 initn: 560 init1: 560 opt: 718  Z-score: 648.4  bits: 129.2 E(32554): 8.5e-30
Smith-Waterman score: 718; 40.7% identity (63.0% similar) in 327 aa overlap (78-390:148-467)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB7 PGHKEEEDGEGAGPGEQGGGKLVLSSLPKRLCLVCGDVASGYHYGVASCEACKAFFKRTI
                                     .: ::.: :::::::: :::.:::::::.:
CCDS55 PVNRETLKRKVSGNRCASPVTGPGSKRDAHFCAVCSDYASGYHYGVWSCEGCKAFFKRSI
       120       130       140       150       160       170       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB7 QGSIEYSCPASNECEITKRRRKACQACRFTKCLRVGMLKEGVRLDRVRGGRQKYKRRPEV
       ::  .: :::.:.: : : :::.:::::. :: .:::.: : : .:  : :   ..:   
CCDS55 QGHNDYICPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGMVKCGSRRERC-GYRLVRRQRSAD
       180       190       200       210       220        230      

       170       180         190            200       210       220
pF1KB7 DPLPFPGPFPAGPLAVAGG--PRKTAAPVNAL-----VSHLLVVEPEKLYAMPDPAGPDG
       . :       ::    .::  ::     ..::     :  :: .:: ..  .  :..:  
CCDS55 EQLHC-----AGKAKRSGGHAPRVRELLLDALSPEQLVLTLLEAEPPHVL-ISRPSAPFT
        240            250       260       270       280        290

              230       240       250       260       270       280
pF1KB7 HLPAVATLCDLFDREIVVTISWAKSIPGFSSLSLSDQMSVLQSVWMEVLVLGVAQRSLPL
       .   . .:  : :.:.:  :::::.::::  ::: ::. .:.: :::::..:.  ::.  
CCDS55 EASMMMSLTKLADKELVHMISWAKKIPGFVELSLFDQVRLLESCWMEVLMMGLMWRSIDH
              300       310       320       330       340       350

              290        300       310       320       330         
pF1KB7 QDELAFAEDLVLD-EEGARAAGLGELGAALLQLVRRLQALRLEREEYVLLKALALANSDS
         .: :: ::::: .::  . :. :.   ::  . :.. :.:...::. .::. : ::. 
CCDS55 PGKLIFAPDLVLDRDEGKCVEGILEIFDMLLATTSRFRELKLQHKEYLCVKAMILLNSSM
              360       370       380       390       400       410

     340           350         360       370       380       390   
pF1KB7 VHI----EDAEAVEQLREALHEAL--LEYEAGRAGPGGGAERRRAGRLLLTLPLLRQTAG
         .    .::.. ..: . :. .   : .  ...: ..  .  : . ::. :  .:.   
CCDS55 YPLVTATQDADSSRKLAHLLNAVTDALVWVIAKSGISSQQQSMRLANLLMLLSHVRHARW
              420       430       440       450       460       470

           400       410       420   
pF1KB7 KVLAHFYGVKLEGKVPMHKLFLEMLEAMMD
                                     
CCDS55 GEKQFIHLKLS                   
              480                    




423 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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