seq1 = pF1KB6552.tfa, 1182 bp
seq2 = pF1KB6552/gi568815590r_29237029.tfa (gi568815590r:29237029_29450278), 213250 bp

>pF1KB6552 1182
>gi568815590r:29237029_29450278 (Chr8)

(complement)

1-433  (100001-100433)   100% ->
434-579  (110036-110181)   100% ->
580-799  (111778-111997)   100% ->
800-1182  (112868-113250)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGACGATGGAGGAGCTGCGGGAGATGGACTGCAGTGTGCTCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGACGATGGAGGAGCTGCGGGAGATGGACTGCAGTGTGCTCAAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGATGAACCGGGACGAGAATGGCGGCGGCGCGGGCGGCAGCGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGATGAACCGGGACGAGAATGGCGGCGGCGCGGGCGGCAGCGGCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGGCACCCTGGGGCTGCCGAGCGGCGGCAAGTGCCTGCTGCTGGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGGCACCCTGGGGCTGCCGAGCGGCGGCAAGTGCCTGCTGCTGGACTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGACCGTTCCTGGCGCACAGCGCGGGCTACATCCTAGGTTCGGTCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGACCGTTCCTGGCGCACAGCGCGGGCTACATCCTAGGTTCGGTCAACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCTGTAACACCATCGTGCGGCGGCGGGCTAAGGGCTCCGTGAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCTGTAACACCATCGTGCGGCGGCGGGCTAAGGGCTCCGTGAGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCAGATCCTGCCCGCCGAGGAGGAGGTACGCGCCCGCTTGCGCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCAGATCCTGCCCGCCGAGGAGGAGGTACGCGCCCGCTTGCGCTCCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTACTCGGCGGTCATCGTCTACGACGAGCGCAGCCCGCGCGCCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTACTCGGCGGTCATCGTCTACGACGAGCGCAGCCCGCGCGCCGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCCGCGAGGACAGCACCGTGTCGCTGGTGGTGCAGGCGCTGCGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCCGCGAGGACAGCACCGTGTCGCTGGTGGTGCAGGCGCTGCGCCGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGCCGAGCGCACCGACATCTGCCTGCTCAAAG         GCGGCTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100401 ACGCCGAGCGCACCGACATCTGCCTGCTCAAAGGTA...CAGGCGGCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGAGGTTTTCCTCCGAGTACCCAGAATTCTGTTCTAAAACCAAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110044 GAGAGGTTTTCCTCCGAGTACCCAGAATTCTGTTCTAAAACCAAGGCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCAGCCATCCCACCCCCGGTTCCCCCCAGTGCCACAGAGCCCTTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110094 GGCAGCCATCCCACCCCCGGTTCCCCCCAGTGCCACAGAGCCCTTGGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGGCTGCAGCTCCTGTGGGACCCCACTACACGACCAG         GGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 110144 TGGGCTGCAGCTCCTGTGGGACCCCACTACACGACCAGGTA...CAGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGTCCTGTGGAGATCCTTCCCTTCCTCTACCTCGGCAGTGCCTACCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111781 GGTCCTGTGGAGATCCTTCCCTTCCTCTACCTCGGCAGTGCCTACCATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGCCCGGAGAGACATGCTGGACGCCCTGGGCATCACGGCTCTGTTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111831 TGCCCGGAGAGACATGCTGGACGCCCTGGGCATCACGGCTCTGTTGAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCTCCTCGGACTGCCCAAACCACTTTGAAGGACACTATCAGTACAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111881 TCTCCTCGGACTGCCCAAACCACTTTGAAGGACACTATCAGTACAAGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATCCCAGTGGAAGATAACCACAAGGCCGACATCAGCTCCTGGTTCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111931 ATCCCAGTGGAAGATAACCACAAGGCCGACATCAGCTCCTGGTTCATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGCCATAGAGTACATCG         ATGCCGTGAAGGACTGCCGTGGGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 111981 AGCCATAGAGTACATCGGTA...CAGATGCCGTGAAGGACTGCCGTGGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCGTGCTGGTGCACTGCCAGGCGGGCATCTCGCGGTCGGCCACCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112892 GCGTGCTGGTGCACTGCCAGGCGGGCATCTCGCGGTCGGCCACCATCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTGGCCTACCTGATGATGAAGAAACGGGTGAGGCTGGAGGAGGCCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112942 CTGGCCTACCTGATGATGAAGAAACGGGTGAGGCTGGAGGAGGCCTTCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GTTCGTTAAGCAGCGCCGCAGCATCATCTCGCCCAACTTCAGCTTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112992 GTTCGTTAAGCAGCGCCGCAGCATCATCTCGCCCAACTTCAGCTTCATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GGCAGCTGCTGCAGTTCGAGTCCCAGGTGCTGGCCACGTCCTGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113042 GGCAGCTGCTGCAGTTCGAGTCCCAGGTGCTGGCCACGTCCTGTGCTGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GAGGCTGCTAGCCCCTCGGGACCCCTGCGGGAGCGGGGCAAGACCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113092 GAGGCTGCTAGCCCCTCGGGACCCCTGCGGGAGCGGGGCAAGACCCCCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CACCCCCACCTCGCAGTTCGTCTTCAGCTTTCCGGTCTCCGTGGGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113142 CACCCCCACCTCGCAGTTCGTCTTCAGCTTTCCGGTCTCCGTGGGCGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACTCGGCCCCCAGCAGCCTGCCCTACCTGCACAGCCCCATCACCACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113192 ACTCGGCCCCCAGCAGCCTGCCCTACCTGCACAGCCCCATCACCACCTCT

   1200     .
   1174 CCCAGCTGT
        |||||||||
 113242 CCCAGCTGT