Result of SIM4 for pF1KA0749

seq1 = pF1KA0749.tfa, 1971 bp
seq2 = pF1KA0749/gi568815586r_48896743.tfa (gi568815586r:48896743_49099125), 202383 bp

>pF1KA0749 1971
>gi568815586r:48896743_49099125 (Chr12)

(complement)

1-47  (100001-100047)   100% ->
48-1971  (100460-102383)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTTCCAGGCCAGCCACTGGGCTCGCGGGTTCCAGAACCGCAC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100001 ATGGACTTCCAGGCCAGCCACTGGGCTCGCGGGTTCCAGAACCGCACGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     48       GTGTGGGCCGCGCCCGGGATCCCCACAGCCGCCGCCCCGCCGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ...CAGGTGTGGGCCGCGCCCGGGATCCCCACAGCCGCCGCCCCGCCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTGGGCCTCCAGGGTGCTGCAGGAGGCGACCAACTGGCGGGCGGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100504 CCTGGGCCTCCAGGGTGCTGCAGGAGGCGACCAACTGGCGGGCGGGGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGCCGAGGTCCGAGCTCGGGAGCAAGAGAAAAGGAAAGCGGCGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100554 CTGGCCGAGGTCCGAGCTCGGGAGCAAGAGAAAAGGAAAGCGGCGTCGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGCGGGAGGCCAAGGAGACCGAGCGAAAAAGGCGCAAGGCTGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100604 GGAGCGGGAGGCCAAGGAGACCGAGCGAAAAAGGCGCAAGGCTGGTGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCGACGGAGCCCCCCGGGTCGACCCCGCCCGGAGCCCCGCAACGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100654 CCCGACGGAGCCCCCCGGGTCGACCCCGCCCGGAGCCCCGCAACGCCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGGGTGGCCCAGCTGGCAGGGCTCCCTGCTCCCTTGCGGCCGGAGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100704 CGGGTGGCCCAGCTGGCAGGGCTCCCTGCTCCCTTGCGGCCGGAGCGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGCGCCTGTGGGGCGAGCGCCCCGTCCATCCGCGCAGCCGCAGAGCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100754 GGCGCCTGTGGGGCGAGCGCCCCGTCCATCCGCGCAGCCGCAGAGCGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGGGTCGGCGTGGGCGGGGCCCTGGGGAGGTCGGCGGCCCGGGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100804 CAGGGTCGGCGTGGGCGGGGCCCTGGGGAGGTCGGCGGCCCGGGCCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGCTACGAGGCTCACCTGCTGCTGAGAGGTTCTGCCGGGACCGCCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100854 AGCTACGAGGCTCACCTGCTGCTGAGAGGTTCTGCCGGGACCGCCCCACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACGCCGCTGGGACCGGCCGCCACCCTACGTGGCTCCACCTTCTTACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100904 ACGCCGCTGGGACCGGCCGCCACCCTACGTGGCTCCACCTTCTTACGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCCCCCATAGGACCTTGGGGACTAAGAGAGGCCCCGGGAACTCTCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100954 GCCCCCATAGGACCTTGGGGACTAAGAGAGGCCCCGGGAACTCTCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCCACTTCATCAGCCCCAGCTGCGACTCCAGCCAGGACAGACGGAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101004 CCCACTTCATCAGCCCCAGCTGCGACTCCAGCCAGGACAGACGGAGGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CACAAAGAAGAGGCTGGATCCTCGGATCTACCGGGACGTCCTCGGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101054 CACAAAGAAGAGGCTGGATCCTCGGATCTACCGGGACGTCCTCGGGGCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGGGTCTCCGACAGGGGCAAGGTCTCTTGGGGGGATCCCCAGGCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101104 GGGGTCTCCGACAGGGGCAAGGTCTCTTGGGGGGATCCCCAGGCTGTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCGGCCAGAGCAAGGCCAGAGCCCGGCAAGGGGGTCGTGGAGAAAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101154 GCGGCCAGAGCAAGGCCAGAGCCCGGCAAGGGGGTCGTGGAGAAAAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGGGCTGGCTGCTGCTGACCTGAACAGTGGTAGCGACAGCCATCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101204 GGGGCTGGCTGCTGCTGACCTGAACAGTGGTAGCGACAGCCATCCCCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCAAAGCTACAGGGAGCGCAGGCACCGAGATAGCTCCTGCGGGGTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101254 CCAAAGCTACAGGGAGCGCAGGCACCGAGATAGCTCCTGCGGGGTCTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACTGCGGCTCCCTGTGCCCCGCATCCCGCTCCCAGATCCAGGCACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101304 ACTGCGGCTCCCTGTGCCCCGCATCCCGCTCCCAGATCCAGGCACCACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAAGGGCTCGAGGGAAGGGAAAGAAGGAGAACAGATCTGGTTTCCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101354 CAAGGGCTCGAGGGAAGGGAAAGAAGGAGAACAGATCTGGTTTCCCAAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCTGGATTCCCTCCCCTAAAAAGCAGCCGCCCCGCCATAGCCAGACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101404 GCTGGATTCCCTCCCCTAAAAAGCAGCCGCCCCGCCATAGCCAGACACTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCCAGACCCTGGGCTCCCGGAGGCACCGGATGGAGAGAATCTCTGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101454 CCCAGACCCTGGGCTCCCGGAGGCACCGGATGGAGAGAATCTCTGGGTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGGAGAGGGGGCAGGACCGGAGACCCTGGAGGGTTGGAAGGCGACCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101504 TGGAGAGGGGGCAGGACCGGAGACCCTGGAGGGTTGGAAGGCGACCCGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GTGCCCACACCTTGCCCCGCAGTTCCCAGGGCCTGTCCCGTGGGGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101554 GTGCCCACACCTTGCCCCGCAGTTCCCAGGGCCTGTCCCGTGGGGAAGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GTCTTTGTCATTGACGCCACGTGCGTAGTGATACGATCCCAATATGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101604 GTCTTTGTCATTGACGCCACGTGCGTAGTGATACGATCCCAATATGTTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AACCCCCCGAACCCAGCAGGTGCAGCTTTTGCCCTCTGGGGTGACACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101654 AACCCCCCGAACCCAGCAGGTGCAGCTTTTGCCCTCTGGGGTGACACGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TGGTGGGGGATTCCCCCAGCCAATCGAAGCCCGGCAAGGAGGAGGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101704 TGGTGGGGGATTCCCCCAGCCAATCGAAGCCCGGCAAGGAGGAGGGTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GGGGCCACGGTCTTTCCTTCCCCTTGTCAAAAGCGGCTGTCGAGCAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101754 GGGGCCACGGTCTTTCCTTCCCCTTGTCAAAAGCGGCTGTCGAGCAGTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CCTTTTACACCAGCCCGGCGGGGGCCGCGGGGGCGAAGCTGAGGGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101804 CCTTTTACACCAGCCCGGCGGGGGCCGCGGGGGCGAAGCTGAGGGCGGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GGCCGGGGGACTCCACACTGGAGGAGCGCACTTTCCGCATCTTGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101854 GGCCGGGGGACTCCACACTGGAGGAGCGCACTTTCCGCATCTTGGGGCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CCGGCCCCCGAAGTAAACCTGCGGGACGCCCCCACGCAGCCAGGTAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101904 CCGGCCCCCGAAGTAAACCTGCGGGACGCCCCCACGCAGCCAGGTAGCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 AGAGCACCAAGCCTTAGGCCCAGCAGCTTCGGGAGCCCAGGGCAGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101954 AGAGCACCAAGCCTTAGGCCCAGCAGCTTCGGGAGCCCAGGGCAGAGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AGGGGTCGGAAGTGGCGGTGGTCCAGCGGCGCGCCGGCCGGGGCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102004 AGGGGTCGGAAGTGGCGGTGGTCCAGCGGCGCGCCGGCCGGGGCTGGGCG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CGGACCCCAGGGCCCTACGCCGGGGCCCTGCGAGAAGCCGTGTCCCGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102054 CGGACCCCAGGGCCCTACGCCGGGGCCCTGCGAGAAGCCGTGTCCCGTAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 CCGCCGCCACACAGCCCCTGACTCGGACACGGACGAAGCTGAGGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102104 CCGCCGCCACACAGCCCCTGACTCGGACACGGACGAAGCTGAGGAGCTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 GCGTCCATAGCGGCTCCTCTGATGGAAGCGACACAGAAGCCCCGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102154 GCGTCCATAGCGGCTCCTCTGATGGAAGCGACACAGAAGCCCCGGGCGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 TCCTGGCGGAATGAGAGGACCCTGCCCGAGGTTGGAAACAGTTCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102204 TCCTGGCGGAATGAGAGGACCCTGCCCGAGGTTGGAAACAGTTCGCCAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 GGAAGATGGGAAGACAGCGGAACTGAGCGACAGTGTCGGGGAGATCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102254 GGAAGATGGGAAGACAGCGGAACTGAGCGACAGTGTCGGGGAGATCCTAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 ATGTCATAAGCCAAACCGAGGAGGTCCTCTTCGGGGTGAGGGACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102304 ATGTCATAAGCCAAACCGAGGAGGTCCTCTTCGGGGTGAGGGACATCAGA

   1950     .    :    .    :    .    :
   1942 GGGACCCAACAGGGAAATAGGAAGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 102354 GGGACCCAACAGGGAAATAGGAAGAGGCAG

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