seq1 = pF1KE0114.tfa, 924 bp
seq2 = pF1KE0114/gi568815579r_18799682.tfa (gi568815579r:18799682_19019348), 219667 bp

>pF1KE0114 924
>gi568815579r:18799682_19019348 (Chr19)

(complement)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-189  (106303-106365)   98% ->
190-290  (108278-108378)   100% ->
291-443  (112237-112389)   100% ->
444-497  (113720-113773)   100% ->
498-579  (114497-114578)   100% ->
580-735  (115926-116081)   100% ->
736-804  (118900-118968)   98% ->
805-879  (119402-119476)   100% ->
880-924  (119623-119667)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCTCCGGCCCCCGGCCCGGCCTCCGGCGGCTCCGGGGAGGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCTCCGGCCCCCGGCCCGGCCTCCGGCGGCTCCGGGGAGGTAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCTGTTCGACGTAAAGAACGCCTTCTACATCGGCAGCTACCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGCTGTTCGACGTAAAGAACGCCTTCTACATCGGCAGCTACCAGCAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCATAAACGAGGCGCAGCGGGTGAAG         CTGTCAAGCCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| ||||||||||||
 100101 GCATAAACGAGGCGCAGCGGGTGAAGGTG...CAGCTATCAAGCCCAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGAGACGTGGAGAGGGACGTCTTCCTGTATAGAGCGTACCTGGCGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106318 AGAGACGTGGAGAGGGACGTCTTCCTGTATAGAGCGTACCTGGCGCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        AGGAAGTTCGGTGTGGTCCTGGATGAGATCAAGCCCTCCTCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106368 G...CAGAGGAAGTTCGGTGTGGTCCTGGATGAGATCAAGCCCTCCTCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCCCTGAGCTCCAGGCCGTGCGCATGTTTGCTGACTACCTCGCCCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108321 CCCCTGAGCTCCAGGCCGTGCGCATGTTTGCTGACTACCTCGCCCACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTCGGAG         GGACAGCATCGTGGCCGAGCTGGACCGAGAGAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108371 AGTCGGAGGTG...CAGGGACAGCATCGTGGCCGAGCTGGACCGAGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAGCAGGAGCGTGGACGTGACCAACACCACCTTCCTGCTCATGGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112270 GAGCAGGAGCGTGGACGTGACCAACACCACCTTCCTGCTCATGGCCGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCATCTATCTCCACGACCAGAACCCGGATGCCGCCCTGCGTGCGCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112320 CCATCTATCTCCACGACCAGAACCCGGATGCCGCCCTGCGTGCGCTGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGGGGGACAGCCTGGAGTG         CACAGCCATGACAGTGCAGAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 112370 CAGGGGGACAGCCTGGAGTGGTG...CAGCACAGCCATGACAGTGCAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTGCTGAAGCTGGACCGCCTGGACCTCGCCCG         GAAGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 113741 CCTGCTGAAGCTGGACCGCCTGGACCTCGCCCGGTG...CAGGAAGGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGAAGAGAATGCAGGACCTGGACGAGGATGCCACCCTCACCCAGCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114505 TGAAGAGAATGCAGGACCTGGACGAGGATGCCACCCTCACCCAGCTCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACTGCCTGGGTCAGCCTGGCCACG         GGTGGTGAGAAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 114555 ACTGCCTGGGTCAGCCTGGCCACGGTG...CAGGGTGGTGAGAAGCTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGATGCCTACTACATCTTCCAGGAGATGGCTGACAAGTGCTCGCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115943 GGATGCCTACTACATCTTCCAGGAGATGGCTGACAAGTGCTCGCCCACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGCTGCTGCTCAATGGGCAGGCGGCCTGCCACATGGCCCAGGGCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115993 TGCTGCTGCTCAATGGGCAGGCGGCCTGCCACATGGCCCAGGGCCGCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGGCCGCTGAGGGCCTGCTGCAGGAGGCGCTAGACAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 116043 GAGGCCGCTGAGGGCCTGCTGCAGGAGGCGCTAGACAAGGTA...CAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TAGTGGCTACCCGGAGACGCTGGTCAACCTCATCGTCCTGTCCCAGCACC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118902 TAGTGGCTACCCAGAGACGCTGGTCAACCTCATCGTCCTGTCCCAGCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGGCAAGCCCCCTGAG         GTGACAAACCGATACCTGTCCCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118952 TGGGCAAGCCCCCTGAGGTA...CAGGTGACAAACCGATACCTGTCCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CTGAAGGATGCCCACAGGTCCCATCCCTTCATCAAGGAGTACCAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119426 CTGAAGGATGCCCACAGGTCCCATCCCTTCATCAAGGAGTACCAGGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 G         GAGAACGACTTTGACAGGCTGGTGCTACAGTACGCTCCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119476 GGTG...AAGGAGAACGACTTTGACAGGCTGGTGCTACAGTACGCTCCCA

   1000     .
    920 GCGCC
        |||||
 119663 GCGCC