Result of FASTA (omim) for pF1KA0034
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0034, 1675 aa
  1>>>pF1KA0034 1675 - 1675 aa - 1675 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6692+/-0.000538; mu= 23.1852+/- 0.034
 mean_var=86.3192+/-17.944, 0's: 0 Z-trim(108.3): 41  B-trim: 484 in 1/49
 Lambda= 0.138045
 statistics sampled from 16323 (16347) to 16323 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.192), width:  16
 Scan time: 17.920

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004850 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 is (1675) 11076 2217.5       0
NP_001275582 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 (1679) 11054 2213.1       0
XP_005257069 (OMIM: 118955) PREDICTED: clathrin he (1682) 11052 2212.7       0
NP_009029 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 is (1640) 9404 1884.5       0
XP_016884442 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1632) 9336 1871.0       0
NP_001826 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 is (1583) 8587 1721.8       0
XP_016884445 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1546) 8364 1677.4       0
XP_016884443 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1602) 7850 1575.0       0
XP_016884446 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1165) 6640 1333.9       0
XP_016884444 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1568) 6636 1333.2       0
XP_011528703 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin he (1037) 5986 1203.6       0


>>NP_004850 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 isofor  (1675 aa)
 initn: 11076 init1: 11076 opt: 11076  Z-score: 11914.1  bits: 2217.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11076; 100.0% identity (100.0% similar) in 1675 aa overlap (1-1675:1-1675)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670     
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
             1630      1640      1650      1660      1670     

>>NP_001275582 (OMIM: 118955) clathrin heavy chain 1 iso  (1679 aa)
 initn: 10537 init1: 10537 opt: 11054  Z-score: 11890.4  bits: 2213.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11054; 99.7% identity (99.8% similar) in 1679 aa overlap (1-1675:1-1679)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80            90       100       110      
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALK----AGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISL
       :::::::::::::::::::::::    .::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKGIKESGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA0 NTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTVALVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNR
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KA0 VVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVGAMQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTP
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KA0 PTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTGNQPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMN
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KA0 RISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RISGETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNN
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KA0 LAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAGAEELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQ
              370       380       390       400       410       420

        420       430       440       450       460       470      
pF1KA0 YFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YFGILLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLAL
              430       440       450       460       470       480

        480       490       500       510       520       530      
pF1KA0 SVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVYLRANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQML
              490       500       510       520       530       540

        540       550       560       570       580       590      
pF1KA0 VQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQDEEPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVA
              550       560       570       580       590       600

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA0 DAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAILGNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFG
              610       620       630       640       650       660

        660       670       680       690       700       710      
pF1KA0 SLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLSVEDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLG
              670       680       690       700       710       720

        720       730       740       750       760       770      
pF1KA0 SIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SIVNFSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLII
              730       740       750       760       770       780

        780       790       800       810       820       830      
pF1KA0 VCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCDRFDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVV
              790       800       810       820       830       840

        840       850       860       870       880       890      
pF1KA0 RGQFSTDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGQFSTDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRE
              850       860       870       880       890       900

        900       910       920       930       940       950      
pF1KA0 NPYYDSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPYYDSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELW
              910       920       930       940       950       960

        960       970       980       990      1000      1010      
pF1KA0 GSVLLESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSVLLESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNS
              970       980       990      1000      1010      1020

       1020      1030      1040      1050      1060      1070      
pF1KA0 VFSEHRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFSEHRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

       1080      1090      1100      1110      1120      1130      
pF1KA0 VNTSAVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNTSAVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

       1140      1150      1160      1170      1180      1190      
pF1KA0 YMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YMEVVQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

       1200      1210      1220      1230      1240      1250      
pF1KA0 HIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HIQQVGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

       1260      1270      1280      1290      1300      1310      
pF1KA0 CFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CFACVDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGM
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

       1320      1330      1340      1350      1360      1370      
pF1KA0 FTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTELAILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAII
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

       1380      1390      1400      1410      1420      1430      
pF1KA0 TMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TMMNHPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAV
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

       1440      1450      1460      1470      1480      1490      
pF1KA0 NYFSKVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYFSKVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

       1500      1510      1520      1530      1540      1550      
pF1KA0 QRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRLEKHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQW
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

       1560      1570      1580      1590      1600      1610      
pF1KA0 FLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLQEEKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDAS
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

       1620      1630      1640      1650      1660      1670     
pF1KA0 ESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
             1630      1640      1650      1660      1670         

>>XP_005257069 (OMIM: 118955) PREDICTED: clathrin heavy   (1682 aa)
 initn: 10635 init1: 10635 opt: 11052  Z-score: 11888.2  bits: 2212.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11052; 99.6% identity (99.6% similar) in 1682 aa overlap (1-1675:1-1682)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
              190       200       210       220       230       240

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pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
              250       260       270       280       290       300

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pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
              370       380       390       400       410       420

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pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
              670       680       690       700       710       720

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pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
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pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
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pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
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pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVD-------KL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::       ::
XP_005 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDAIKEKVDKL
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

          1620      1630      1640      1650      1660      1670   
pF1KA0 DASESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DASESLRKEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGY
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

         
pF1KA0 SM
       ::
XP_005 SM
         

>>NP_009029 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 isofor  (1640 aa)
 initn: 9446 init1: 9404 opt: 9404  Z-score: 10114.6  bits: 1884.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9404; 85.0% identity (96.4% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1634)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::  
NP_009 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
NP_009 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
       :::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.::::  ::::::.::::::::::::
NP_009 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
       :::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
NP_009 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
       ::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
NP_009 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
NP_009 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
NP_009 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
NP_009 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       :::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
NP_009 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
NP_009 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
       ::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
NP_009 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
       :::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
NP_009 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
NP_009 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       : :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
NP_009 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       :::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
NP_009 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
              850       860       870       880       890       900

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pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
       :: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
NP_009 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
              910       920       930       940       950       960

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pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
        :.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
NP_009 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
       :.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
NP_009 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
NP_009 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
       ::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
NP_009 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

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pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
       .::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
NP_009 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
NP_009 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
       :::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
NP_009 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
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pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
       :. :::::::::::::.::::::::.::.:.  :::::.::.:::::::::::::::.::
NP_009 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQLE
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
       ::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.:
NP_009 KHQLMEFRCIAAYLYKGNNWWAQSVELCKKDHLYKDAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

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pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
        :::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
NP_009 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

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pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
       :.::..::  :.:.                                         
NP_009 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE                                   
             1630      1640                                   

>>XP_016884442 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy   (1632 aa)
 initn: 9397 init1: 9261 opt: 9336  Z-score: 10041.4  bits: 1871.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9336; 84.6% identity (95.9% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1626)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::  
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
               10        20        30        40        50        60

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pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
       :::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.::::  ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
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pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
       :::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
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pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
       ::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
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pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
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pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
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pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
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pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       :::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
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pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
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pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
       ::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
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pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
       :::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
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pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
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pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       : :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
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pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       :::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
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pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
       :: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
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pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
        :.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
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pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
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pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
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XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
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pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
XP_016 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
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       ::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
XP_016 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
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       .::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
XP_016 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
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       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
XP_016 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
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pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
       :::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
XP_016 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
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pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
       :. :::::::::::::.::::::::.::.:.  :::::.::.:::::::::::::::.::
XP_016 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQLE
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       ::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.:
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        :::::.:::::::::::::.::: :::::..:.::::::::        ::::: ::::
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       :.::..::  :.:.                                         
XP_016 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE                                   
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>>NP_001826 (OMIM: 601273) clathrin heavy chain 2 isofor  (1583 aa)
 initn: 9078 init1: 8554 opt: 8587  Z-score: 9235.4  bits: 1721.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8968; 82.1% identity (93.1% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1577)

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       ::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::  
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       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
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       :::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.::::  ::::::.::::::::::::
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       :::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
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       ::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
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       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
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       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
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       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
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       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
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       ::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
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       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
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pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       : :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
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       :::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
NP_001 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
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       :: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
NP_001 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
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pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
        :.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
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pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
NP_001 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
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pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
       :.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
NP_001 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
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pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
NP_001 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
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NP_001 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
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       .::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
NP_001 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
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NP_001 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
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       :. :::::::::::::.::::::::.::.:.  :::::                      
NP_001 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQ----------------------
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                                          ::::.:.::.:.:::..::::::.:
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        :::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
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       :.::..::  :.:.                                         
NP_001 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE                                   
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       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
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       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
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       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
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       :::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
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       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
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XP_016 K-----------------------------------------------------------
                                                                   

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XP_016 -----------------------------------DAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
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XP_016 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
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       :.::..::  :.:.                                         
XP_016 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE                                   
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>>XP_016884443 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy   (1602 aa)
 initn: 9187 init1: 7837 opt: 7850  Z-score: 8442.1  bits: 1575.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9083; 82.9% identity (94.2% similar) in 1634 aa overlap (1-1634:1-1596)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
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XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
       :::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.::::  ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
       :::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::             
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGK-------------
              190       200       210       220                    

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
                                :. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 -------------------------IGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
                                230       240       250       260  

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
            270       280       290       300       310       320  

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
            330       340       350       360       370       380  

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pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
            390       400       410       420       430       440  

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       :::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
            450       460       470       480       490       500  

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
            510       520       530       540       550       560  

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
       ::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
            570       580       590       600       610       620  

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pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
       :::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
            630       640       650       660       670       680  

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
            690       700       710       720       730       740  

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       : :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
            750       760       770       780       790       800  

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       :::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
            810       820       830       840       850       860  

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pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
       :: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
            870       880       890       900       910       920  

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pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
        :.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
            930       940       950       960       970       980  

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pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

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pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
       :.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
           1050      1060      1070      1080      1090      1100  

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pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::.:. :.:::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.:..:::.::::::::::::
XP_016 VQSASRSNNWEDLVKFLQMARKKGRESYIETELIFALAKTSRVSELEDFINGPNNAHIQQ
           1110      1120      1130      1140      1150      1160  

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 VGDRCYDEKMYDAAKLLYNNVSNFGRLASTLVHLGEYQAAVDGARKANSTRTWKEVCFAC
       ::::::.: ::.::::::.:::::.:::::::::::::::::..:::.::::::::::::
XP_016 VGDRCYEEGMYEAAKLLYSNVSNFARLASTLVHLGEYQAAVDNSRKASSTRTWKEVCFAC
           1170      1180      1190      1200      1210      1220  

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 VDGKEFRLAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDRGYFEELITMLEAALGLERAHMGMFTEL
       .::.:::.::.::::::.::::::::. :::::::::::: .::::::::::::::::::
XP_016 MDGQEFRFAQLCGLHIVIHADELEELMCYYQDRGYFEELILLLEAALGLERAHMGMFTEL
           1230      1240      1250      1260      1270      1280  

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pF1KA0 AILYSKFKPQKMREHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAIITMMN
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.
XP_016 AILYSKFKPQKMLEHLELFWSRVNIPKVLRAAEQAHLWAELVFLYDKYEEYDNAVLTMMS
           1290      1300      1310      1320      1330      1340  

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 HPTDAWKEGQFKDIITKVANVELYYRAIQFYLEFKPLLLNDLLMVLSPRLDHTRAVNYFS
       :::.::::::::::::::::::: :::.::::..::::.::::.::::::::: .:..::
XP_016 HPTEAWKEGQFKDIITKVANVELCYRALQFYLDYKPLLINDLLLVLSPRLDHTWTVSFFS
           1350      1360      1370      1380      1390      1400  

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 KVKQLPLVKPYLRSVQNHNNKSVNESLNNLFITEEDYQALRTSIDAYDNFDNISLAQRLE
       :. :::::::::::::.::::::::.::.:.  :::::.::.:::::::::::::::.::
XP_016 KAGQLPLVKPYLRSVQSHNNKSVNEALNHLLTEEEDYQGLRASIDAYDNFDNISLAQQLE
           1410      1420      1430      1440      1450      1460  

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 KHELIEFRRIAAYLFKGNNRWKQSVELCKKDSLYKDAMQYASESKDTELAEELLQWFLQE
       ::.:.::: :::::.:::: : ::::::::: :::::::.:.::.:.:::..::::::.:
XP_016 KHQLMEFRCIAAYLYKGNNWWAQSVELCKKDHLYKDAMQHAAESRDAELAQKLLQWFLEE
           1470      1480      1490      1500      1510      1520  

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KA0 EKRECFGACLFTCYDLLRPDVVLETAWRHNIMDFAMPYFIQVMKEYLTKVDKLDASESLR
        :::::.:::::::::::::.::: :::::..:.:::::::::.:::.::::::: ::::
XP_016 GKRECFAACLFTCYDLLRPDMVLELAWRHNLVDLAMPYFIQVMREYLSKVDKLDALESLR
           1530      1540      1550      1560      1570      1580  

             1630      1640      1650      1660      1670     
pF1KA0 KEEEQATETQPIVYGQPQLMLTAGPSVAVPPQAPFGYGYTAPPYGQPQPGFGYSM
       :.::..::  :.:.                                         
XP_016 KQEEHVTEPAPLVFDFDGHE                                   
           1590      1600                                     

>>XP_016884446 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy   (1165 aa)
 initn: 6670 init1: 6628 opt: 6640  Z-score: 7141.7  bits: 1333.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6640; 85.5% identity (96.3% similar) in 1155 aa overlap (1-1155:1-1154)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::  
XP_016 MAQILPVRFQEHFQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVTIIDMSDPMA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
XP_016 PIRRPISAESAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMAEEVIFWKWVSVNTVA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 LVTDNAVYHWSMEGESQPVKMFDRHSSLAGCQIINYRTDAKQKWLLLTGISAQQNRVVGA
       :::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.::::  ::::::.::::::::::::
XP_016 LVTETAVYHWSMEGDSQPMKMFDRHTSLVGCQVIHYRTDEYQKWLLLVGISAQQNRVVGA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 MQLYSVDRKVSQPIEGHAASFAQFKMEGNAEESTLFCFAVRGQAGGKLHIIEVGTPPTGN
       :::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
XP_016 MQLYSVDRKVSQPIEGHAAAFAEFKMEGNAKPATLFCFAVRNPTGGKLHIIEVGQPAAGN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
       ::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
XP_016 QPFVKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQIGAKHGVIYLITKYGYLHLYDLESGVCICMNRISA
              250       260       270       280       290       300

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pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
              370       380       390       400       410       420

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pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
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pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       :::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
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pF1KA0 EPLADITQIVDVFMEYNLIQQCTAFLLDALKNNRPSEGPLQTRLLEMNLMHAPQVADAIL
       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
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pF1KA0 GNQMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQRALEHFTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSV
       ::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 GNKMFTHYDRAHIAQLCEKAGLLQQALEHYTDLYDIKRAVVHTHLLNPEWLVNFFGSLSV
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pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
       :::.:::.::::::::::::.::::::::::::.::.:.::::::::..:::::::::::
XP_016 EDSVECLHAMLSANIRQNLQLCVQVASKYHEQLGTQALVELFESFKSYKGLFYFLGSIVN
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pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
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pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       : :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
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pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       :::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
              850       860       870       880       890       900

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pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
       :: :::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::: .:::: :::::::. ::
XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
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pF1KA0 LESNPYRRPLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
        :.:: :: :::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETNPSRRQLIDQVVQTALSETRDPEEISVTVKAFMTADLPNELIELLEKIVLDNSVFSE
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pF1KA0 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYINRLDNYDAPDIANIAISNELFEEAFAIFRKFDVNTS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
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pF1KA0 AVQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAKAQLQKGMVKEAIDSYIKADDPSSYMEV
       :.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
XP_016 AIQVLIEHIGNLDRAYEFAERCNEPAVWSQLAQAQLQKDLVKEAINSYIRGDDPSSYLEV
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pF1KA0 VQAANTSGNWEELVKYLQMARKKARESYVETELIFALAKTNRLAELEEFINGPNNAHIQQ
       ::.:. : .:. :..                                             
XP_016 VQSASRS-SWRPLLRGGNVRGCQAAL                                  
              1150      1160                                       

>>XP_016884444 (OMIM: 601273) PREDICTED: clathrin heavy   (1568 aa)
 initn: 8787 init1: 6636 opt: 6636  Z-score: 7135.6  bits: 1333.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8651; 80.1% identity (91.0% similar) in 1635 aa overlap (1-1634:1-1562)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAQILPIRFQEHLQLQNLGINPANIGFSTLTMESDKFICIREKVGEQAQVVIIDMNDPSN
       ::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::  
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pF1KA0 PIRRPISADSAIMNPASKVIALKAGKTLQIFNIEMKSKMKAHTMTDDVTFWKWISLNTVA
       ::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::...: ::::.:.::::
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       :::..:::::::::.:::.::::::.::.:::.:.::::  ::::::.::::::::::::
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       :::::::::::::::::::.::.:::::::. .::::::::. .:::::::::: : .::
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pF1KA0 QPFPKKAVDVFFPPEAQNDFPVAMQISEKHDVVFLITKYGYIHLYDLETGTCIYMNRISG
       ::: ::::::::::::::::::::::. :: :..:::::::.::::::.:.:: :::::.
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pF1KA0 ETIFVTAPHEATAGIIGVNRKGQVLSVCVEEENIIPYITNVLQNPDLALRMAVRNNLAGA
       .::::::::. :.::::::.:::::::::::.::. : :::::::::.::.:::.:::::
XP_016 DTIFVTAPHKPTSGIIGVNKKGQVLSVCVEEDNIVNYATNVLQNPDLGLRLAVRSNLAGA
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 EELFARKFNALFAQGNYSEAAKVAANAPKGILRTPDTIRRFQSVPAQPGQTSPLLQYFGI
       :.::.::::.:::::.:.:::::::.:::::::: .:...:::.::: ::.:::::::::
XP_016 EKLFVRKFNTLFAQGSYAEAAKVAASAPKGILRTRETVQKFQSIPAQSGQASPLLQYFGI
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pF1KA0 LLDQGQLNKYESLELCRPVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKSVDPTLALSVYL
       ::::::::: ::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::..:: :::::::
XP_016 LLDQGQLNKLESLELCHLVLQQGRKQLLEKWLKEDKLECSEELGDLVKTTDPMLALSVYL
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pF1KA0 RANVPNKVIQCFAETGQVQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRNVMRISPDQGQQFAQMLVQDE
       :::::.::::::::::: :::::::::::::::::::::.::.:::.:: ::..::::::
XP_016 RANVPSKVIQCFAETGQFQKIVLYAKKVGYTPDWIFLLRGVMKISPEQGLQFSRMLVQDE
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       ::::.:.::::.::: .::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::.::::::::::
XP_016 EPLANISQIVDIFMENSLIQQCTSFLLDALKNNRPAEGLLQTWLLEMNLVHAPQVADAIL
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       ::.:::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::
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pF1KA0 EDSLECLRAMLSANIRQNLQICVQVASKYHEQLSTQSLIELFESFKSFEGLFYFLGSIVN
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pF1KA0 FSQDPDVHFKYIQAACKTGQIKEVERICRESNCYDPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
       ::::::::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSQDPDVHLKYIQAACKTGQIKEVERICRESSCYNPERVKNFLKEAKLTDQLPLIIVCDR
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pF1KA0 FDFVHDLVLYLYRNNLQKYIEIYVQKVNPSRLPVVIGGLLDVDCSEDVIKNLILVVRGQF
       : :::::::::::::::.::::::::::::: :.::::::::::::.:::.::..:::::
XP_016 FGFVHDLVLYLYRNNLQRYIEIYVQKVNPSRTPAVIGGLLDVDCSEEVIKHLIMAVRGQF
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pF1KA0 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLEARIHEGCEEPATHNALAKIYIDSNNNPERFLRENPYY
       :::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::::.:: ::::: ::
XP_016 STDELVAEVEKRNRLKLLLPWLESQIQEGCEEPATHNALAKIYIDSNNSPECFLRENAYY
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pF1KA0 DSRVVGKYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELINVCNENSLFKSLSRYLVRRKDPELWGSVL
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XP_016 DSSVVGRYCEKRDPHLACVAYERGQCDLELIKVCNENSLFKSEARYLVCRKDPELWAHVL
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       ::::::::::::::::::::::::.::::::: :::.::.:. :.::::..:.:::.:.:
XP_016 HRNLQNLLILTAIKADRTRVMEYISRLDNYDALDIASIAVSSALYEEAFTVFHKFDMNAS
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       :.::::::::::::::::::::::::::::::.::::: .:::::.:::..::::::.::
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