Result of FASTA (ccds) for pF1KA1428
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA1428, 709 aa
  1>>>pF1KA1428 709 - 709 aa - 709 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7440+/-0.00104; mu= 8.8440+/- 0.063
 mean_var=121.7349+/-23.761, 0's: 0 Z-trim(107.5): 29  B-trim: 89 in 1/51
 Lambda= 0.116243
 statistics sampled from 9578 (9599) to 9578 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.295), width:  16
 Scan time:  3.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2882.1 APPL1 gene_id:26060|Hs108|chr3          ( 709) 4599 782.8       0
CCDS9101.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12         ( 664) 2177 376.6 6.5e-104
CCDS58276.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12        ( 670) 2161 373.9 4.2e-103
CCDS58275.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12        ( 621) 1984 344.2 3.4e-94
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1           ( 834)  421 82.2 3.6e-15
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4      ( 786)  356 71.2 6.5e-12
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3         ( 778)  351 70.4 1.1e-11


>>CCDS2882.1 APPL1 gene_id:26060|Hs108|chr3               (709 aa)
 initn: 4599 init1: 4599 opt: 4599  Z-score: 4173.7  bits: 782.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4599; 100.0% identity (100.0% similar) in 709 aa overlap (1-709:1-709)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 TSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 RDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 RDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 YFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRREM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA1 DSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDRQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA1 FYFTQGGNLMSQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 FYFTQGGNLMSQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA1 KDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRPAAGQSRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRPAAGQSRP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA1 PTARTSSSGSLGSESTNLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQAKAFGQGGRRTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 PTARTSSSGSLGSESTNLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQAKAFGQGGRRTN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA1 PFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQILAARAIHNIFRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 PFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQILAARAIHNIFRM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA1 TESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPCVVLYATHQENKRLFGFVLRTSSGRSESNLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 TESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPCVVLYATHQENKRLFGFVLRTSSGRSESNLS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA1 SVCYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELNKQKQIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 SVCYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELNKQKQIE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700         
pF1KA1 KDLEEQSRLIAASSRPNQASSEGQFVVLSSSQSEESDLGEGGKKRESEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 KDLEEQSRLIAASSRPNQASSEGQFVVLSSSQSEESDLGEGGKKRESEA
              670       680       690       700         

>>CCDS9101.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12              (664 aa)
 initn: 2176 init1: 1606 opt: 2177  Z-score: 1979.0  bits: 376.6 E(32554): 6.5e-104
Smith-Waterman score: 2262; 55.0% identity (80.8% similar) in 629 aa overlap (1-625:1-615)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
       ::..::: .::.:.:::::::::.:::::: ....: ::: :::.:.: ::::.  ::. 
CCDS91 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
               10        20        30        40        50        60

               70         80        90       100       110         
pF1KA1 TSKLLKEYEKQRFPLG-GDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFK
        :: :  :::: : :: ::.::.: ::. ::::.:::.  :. :. ::::.:..:: ::.
CCDS91 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVIS-TLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFR
               70        80         90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA1 ERDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMM
       :.:: :. :::..: .:::.:: .. .:::: ::.::.::: :: ..: ..:.::: . .
CCDS91 EKDLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSL
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA1 HYFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRRE
       .:.::::.:::.:..:..::..:. ..::.::: :.: ...... ::....  ::... :
CCDS91 QYYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVE
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA1 MDSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDR
       .... : :. . ..:  ... .:.:: : .   .:::: .:::::: :::::::..::.:
CCDS91 LEAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWER
     240       250       260       270       280       290         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA1 QFYFTQGGNLMSQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAES
        ..:::::::: : :: ::::: .:.::::::::::::::::::::. .::.. ::::::
CCDS91 LYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAES
     300       310       320       330       340       350         

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA1 KKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRPAAGQSR
       .:..:::::.:::::.::::..::: .: ..::.::.::::  :: ...::  :.  :. 
CCDS91 RKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPS--QNL
     360       370       380       390       400       410         

     420       430       440        450       460         470      
pF1KA1 PPTARTSSSGSLGSESTNLAALS-LDSLVAPDTPIQFDIISPVCE--DQPGQAKAFGQGG
         .   . . ..  ..:  :.:   . :.:: :::::::. :. :  ::       ..:.
CCDS91 KNSEMENENDKIVPKAT--ASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQ-------NRGS
       420       430         440       450       460               

        480       490       500       510       520       530      
pF1KA1 RRTNPFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQILAARAIHN
       ::::::::.   .  :.:::.:.:.::::::::: ::.:.  .:.::.:::.::::::::
CCDS91 RRTNPFGETEDESFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHN
      470       480       490       500       510       520        

        540       550       560       570       580       590      
pF1KA1 IFRMTESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPCVVLYATHQENKRLFGFVLRTSSGRSE
       :::::::::.:: . :.::::::::.: .: :  :. .:.::::::: :::.:.  . .:
CCDS91 IFRMTESHLMVTSQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGE
      530       540       550       560       570       580        

        600       610       620       630       640       650      
pF1KA1 SNLSSVCYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELNKQ
        .::.  ::::::.:::::: ...:.:.:                               
CCDS91 ESLST--YIFESNSEGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQ
      590         600       610       620       630       640      

>>CCDS58276.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12             (670 aa)
 initn: 1654 init1: 1084 opt: 2161  Z-score: 1964.4  bits: 373.9 E(32554): 4.2e-103
Smith-Waterman score: 2246; 54.6% identity (80.0% similar) in 635 aa overlap (1-625:1-621)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
       ::..::: .::.:.:::::::::.:::::: ....: ::: :::.:.: ::::.  ::. 
CCDS58 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
               10        20        30        40        50        60

               70         80        90       100       110         
pF1KA1 TSKLLKEYEKQRFPLG-GDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFK
        :: :  :::: : :: ::.::.: ::. ::::.:::.  :. :. ::::.:..:: ::.
CCDS58 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVIS-TLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFR
               70        80         90       100       110         

     120       130             140       150       160       170   
pF1KA1 ERDLKEILTLKEVFQIASND------HDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKK
       :.:: :. :::..: .::::      :: .. .:::: ::.::.::: :: ..: ..:.:
CCDS58 EKDLTEVSTLKDLFGLASNDVCLFLEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRK
     120       130       140       150       160       170         

           180       190       200       210       220       230   
pF1KA1 QHQTMMHYFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSV
       :: . ..:.::::.:::.:..:..::..:. ..::.::: :.: ...... ::....  :
CCDS58 QHLSSLQYYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMV
     180       190       200       210       220       230         

           240       250       260       270       280       290   
pF1KA1 QNVRREMDSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLV
       :... :.... : :. . ..:  ... .:.:: : .   .:::: .:::::: :::::::
CCDS58 QSIQVELEAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLV
     240       250       260       270       280       290         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KA1 SSTWDRQFYFTQGGNLMSQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSS
       ..::.: ..:::::::: : :: ::::: .:.::::::::::::::::::::. .::.. 
CCDS58 TTTWERLYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGI
     300       310       320       330       340       350         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KA1 ILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRP
       ::::::.:..:::::.:::::.::::..::: .: ..::.::.::::  :: ...::  :
CCDS58 ILQAESRKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCP
     360       370       380       390       400       410         

           420       430       440        450       460         470
pF1KA1 AAGQSRPPTARTSSSGSLGSESTNLAALS-LDSLVAPDTPIQFDIISPVCE--DQPGQAK
       .  :.   .   . . ..  ..:  :.:   . :.:: :::::::. :. :  ::     
CCDS58 S--QNLKNSEMENENDKIVPKAT--ASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQ-----
     420         430       440         450       460       470     

              480       490       500       510       520       530
pF1KA1 AFGQGGRRTNPFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQILA
         ..:.::::::::.   .  :.:::.:.:.::::::::: ::.:.  .:.::.:::.::
CCDS58 --NRGSRRTNPFGETEDESFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLA
                480       490       500       510       520        

              540       550       560       570       580       590
pF1KA1 ARAIHNIFRMTESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPCVVLYATHQENKRLFGFVLRT
       :::::::::::::::.:: . :.::::::::.: .: :  :. .:.::::::: :::.:.
CCDS58 ARAIHNIFRMTESHLMVTSQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRV
      530       540       550       560       570       580        

              600       610       620       630       640       650
pF1KA1 SSGRSESNLSSVCYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQ
         . .: .::.  ::::::.:::::: ...:.:.:                         
CCDS58 PESTGEESLST--YIFESNSEGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKY
      590         600       610       620       630       640      

              660       670       680       690       700         
pF1KA1 KELNKQKQIEKDLEEQSRLIAASSRPNQASSEGQFVVLSSSQSEESDLGEGGKKRESEA
                                                                  
CCDS58 VLLNDQPDDDDGNPNEHRGAESEA                                   
        650       660       670                                   

>>CCDS58275.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12             (621 aa)
 initn: 1983 init1: 1413 opt: 1984  Z-score: 1804.6  bits: 344.2 E(32554): 3.4e-94
Smith-Waterman score: 2069; 54.1% identity (80.0% similar) in 586 aa overlap (44-625:1-572)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KA1 EDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHLTSKLLKEYEKQRF
                                     :.:.: ::::.  ::.  :: :  :::: :
CCDS58                               MQRVYGAQNEMCLATQQLSKQLLAYEKQNF
                                             10        20        30

             80        90       100       110       120       130  
pF1KA1 PLG-GDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKERDLKEILTLKEV
        :: ::.::.: ::. ::::.:::.  :. :. ::::.:..:: ::.:.:: :. :::..
CCDS58 ALGKGDEEVIS-TLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFREKDLTEVSTLKDL
               40         50        60        70        80         

            140       150       160       170       180       190  
pF1KA1 FQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMHYFCALNTLQYKK
       : .:::.:: .. .:::: ::.::.::: :: ..: ..:.::: . ..:.::::.:::.:
CCDS58 FGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQYYCALNALQYRK
      90       100       110       120       130       140         

            200       210       220       230       240       250  
pF1KA1 KIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRREMDSDIETMQQTIE
       ..:..::..:. ..::.::: :.: ...... ::....  ::... :.... : :. . .
CCDS58 QMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVELEAEAEKMRVSQQ
     150       160       170       180       190       200         

            260       270       280       290       300       310  
pF1KA1 DLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDRQFYFTQGGNLMSQ
       .:  ... .:.:: : .   .:::: .:::::: :::::::..::.: ..:::::::: :
CCDS58 ELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWERLYFFTQGGNLMCQ
     210       220       230       240       250       260         

            320       330       340       350       360       370  
pF1KA1 ARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAESKKDHEEWICTINN
        :: ::::: .:.::::::::::::::::::::. .::.. ::::::.:..:::::.:::
CCDS58 PRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAESRKENEEWICAINN
     270       280       290       300       310       320         

            380       390       400       410       420       430  
pF1KA1 ISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRPAAGQSRPPTARTSSSGSLG
       ::.::::..::: .: ..::.::.::::  :: ...::  :.  :.   .   . . .. 
CCDS58 ISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPS--QNLKNSEMENENDKIV
     330       340       350       360       370         380       

            440        450       460         470       480         
pF1KA1 SESTNLAALS-LDSLVAPDTPIQFDIISPVCE--DQPGQAKAFGQGGRRTNPFGESGGST
        ..:  :.:   . :.:: :::::::. :. :  ::       ..:.::::::::.   .
CCDS58 PKAT--ASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQ-------NRGSRRTNPFGETEDES
       390         400       410       420              430        

     490       500       510       520       530       540         
pF1KA1 KSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQILAARAIHNIFRMTESHLLVTC
         :.:::.:.:.::::::::: ::.:.  .:.::.:::.:::::::::::::::::.:: 
CCDS58 FPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTESHLMVTS
      440       450       460       470       480       490        

     550       560       570       580       590       600         
pF1KA1 DCLKLIDPQTQVTRLTFPLPCVVLYATHQENKRLFGFVLRTSSGRSESNLSSVCYIFESN
       . :.::::::::.: .: :  :. .:.::::::: :::.:.  . .: .::.  ::::::
CCDS58 QSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLST--YIFESN
      500       510       520       530       540       550        

     610       620       630       640       650       660         
pF1KA1 NEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELNKQKQIEKDLEEQSRL
       .:::::: ...:.:.:                                            
CCDS58 SEGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQPDDDDGNPNEHRG
        560       570       580       590       600       610      

>>CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1                (834 aa)
 initn: 240 init1: 118 opt: 421  Z-score: 385.9  bits: 82.2 E(32554): 3.6e-15
Smith-Waterman score: 421; 24.2% identity (58.4% similar) in 450 aa overlap (10-447:6-437)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
                :: ..:::. :. .   : :.. :   ...: .    . .: .   ....:
CCDS19     MTVEFEECVKDSPRFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLVKLCSGMVEAGKAYVSTSRL
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KA1 TSKLLKEYEKQRFPLGGDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFKE
         . ...  .:       : :.:  ::.:.  ..:. . : .:  :   ..   . .: .
CCDS19 FVSGVRDLSQQ----CQGDTVISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVK
         60            70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KA1 RDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMMH
       .:....   :. :. . .: . .. : ..  ..: .. :. :.:  .  .::  ..  . 
CCDS19 EDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHE-VE-EATGALTLTRKCFRHLALD
            120       130       140        150        160       170

              190       200       210       220       230       240
pF1KA1 YFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRREM
       :   .:.:: :::. .:. .:..:.:: :::..:  .: .::. .. .... ....   .
CCDS19 YVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGY-SLLHQLDPYMKKLAAELDQLV--I
              180       190       200        210       220         

              250       260          270        280       290      
pF1KA1 DSDIETMQQTIEDLEVASDPL---YVPDPDPTKFPVNR-NLTRKAGYLNARNKTGLVSST
       :: .:  ..  .   . .  :   .  : . ..: :.  . .   :::  : ....  .:
CCDS19 DSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGVVMEGYLFKRASNAF--KT
       230       240       250       260       270       280       

        300       310        320       330         340       350   
pF1KA1 WDRQFYFTQGGNLMSQAR-GDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCED--RRYCFQITSFDGKKSS
       :.:...  :...:. : .  :.   .. :.  :::    :::  ::.::.. :    :: 
CCDS19 WNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVK--PCEDIERRFCFEVLS--PTKSC
         290       300       310       320         330         340 

           360       370       380        390       400       410  
pF1KA1 ILQAESKKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEET-AARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLR
       .:::.:.: .. :. ...    . :  :.:.   . :....:  ...   :  . .:  :
CCDS19 MLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAY-RESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTRE--R
             350       360        370       380       390          

                420       430       440       450       460        
pF1KA1 PAAGQSR----PPTARTSSSGSLGSESTNLAALSLDSLVAPDTPIQFDIISPVCEDQPGQ
        . :.:       .: .:. :. :. .   :...:  :.                     
CCDS19 GVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVRSL
      400       410       420       430       440       450        

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA1 AKAFGQGGRRTNPFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQI
                                                                   
CCDS19 TLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPTASSSRQDKEAWIKDKYVEKKFL
      460       470       480       490       500       510        

>>CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4           (786 aa)
 initn:  57 init1:  57 opt: 356  Z-score: 327.4  bits: 71.2 E(32554): 6.5e-12
Smith-Waterman score: 368; 22.5% identity (60.8% similar) in 383 aa overlap (3-367:2-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA1 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
         :.. : . .   :::  :  . . : .    ......: .  . .  : . ::.: . 
CCDS34  MGLQPLEFSDCYLDSPWFRERIRAHEAELERTNKFIKELIKDGKNLIAATKSLSVAQRK
                10        20        30        40        50         

               70            80         90       100       110     
pF1KA1 TSKLLKEYEKQRFPLGGD----DE-VMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPI
        .. :...   .: . ::    ::  ....:..::. . .:   . ... ....... :.
CCDS34 FAHSLRDF---KFEFIGDAVTDDERCIDASLREFSNFLKNLEEQREIMALSVTETLIKPL
      60           70        80        90       100       110      

         120       130       140       150       160       170     
pF1KA1 TQFKERDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQH
        .:....:  .   :. :.  .. . . :...  :: :....... :.  .:  .:.. .
CCDS34 EKFRKEQLGAVKEEKKKFDKETEKNYSLIDKHLNLSAKKKDSHLQ-EADIQVEQNRQHFY
        120       130       140       150       160        170     

         180       190       200       210       220       230     
pF1KA1 QTMMHYFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQN
       .  ..: : :. .: .::. ..::.:...:....:...: : : ......  ..  ..::
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