Result of FASTA (ccds) for pF1KE0482
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0482, 331 aa
  1>>>pF1KE0482 331 - 331 aa - 331 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7197+/-0.000946; mu= 14.6793+/- 0.057
 mean_var=77.1939+/-15.344, 0's: 0 Z-trim(105.9): 24  B-trim: 207 in 2/51
 Lambda= 0.145976
 statistics sampled from 8650 (8664) to 8650 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.266), width:  16
 Scan time:  2.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13922.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22        ( 402) 2036 438.2 5.2e-123
CCDS13924.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22        ( 202) 1231 268.5 3.2e-72
CCDS74851.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22        ( 348) 1216 265.5 4.5e-71
CCDS74852.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22        ( 351) 1216 265.5 4.5e-71
CCDS43014.1 APOL2 gene_id:23780|Hs108|chr22        ( 337) 1041 228.6 5.4e-60
CCDS46702.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22         ( 380)  938 207.0   2e-53
CCDS13926.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22         ( 398)  938 207.0 2.1e-53
CCDS13925.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22         ( 414)  938 207.0 2.2e-53
CCDS13919.1 APOL6 gene_id:80830|Hs108|chr22        ( 343)  530 121.0 1.4e-27
CCDS13920.1 APOL5 gene_id:80831|Hs108|chr22        ( 433)  447 103.6   3e-22


>>CCDS13922.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22             (402 aa)
 initn: 2036 init1: 2036 opt: 2036  Z-score: 2321.9  bits: 438.2 E(32554): 5.2e-123
Smith-Waterman score: 2036; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (4-331:75-402)

                                          10        20        30   
pF1KE0                            MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GYYADARLEVGSTQLRTAGSCSHSFKRSFLEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNE
           50        60        70        80        90       100    

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE0 AWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQ
          110       120       130       140       150       160    

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE0 ESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGV
          170       180       190       200       210       220    

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 GLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNY
          230       240       250       260       270       280    

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE0 YEATQTIGSEIRAIRQARARARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YEATQTIGSEIRAIRQARARARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATT
          290       300       310       320       330       340    

           280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 SGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
          350       360       370       380       390       400  

>>CCDS13924.1 APOL3 gene_id:80833|Hs108|chr22             (202 aa)
 initn: 1231 init1: 1231 opt: 1231  Z-score: 1410.1  bits: 268.5 E(32554): 3.2e-72
Smith-Waterman score: 1231; 100.0% identity (100.0% similar) in 202 aa overlap (130-331:1-202)

     100       110       120       130       140       150         
pF1KE0 RALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGVGLGAAS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13                               MSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGVGLGAAS
                                             10        20        30

     160       170       180       190       200       210         
pF1KE0 AVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNYYEATQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNYYEATQT
               40        50        60        70        80        90

     220       230       240       250       260       270         
pF1KE0 IGSEIRAIRQARARARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATTSGIFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IGSEIRAIRQARARARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATTSGIFLA
              100       110       120       130       140       150

     280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 LDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
              160       170       180       190       200  

>>CCDS74851.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22             (348 aa)
 initn: 1270 init1: 639 opt: 1216  Z-score: 1389.5  bits: 265.5 E(32554): 4.5e-71
Smith-Waterman score: 1216; 60.2% identity (85.1% similar) in 322 aa overlap (4-325:28-345)

                                       10        20        30      
pF1KE0                         MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNEAWK
                                  ::::::::. .::...::::::.::::..::::
CCDS74 MGSWVQLITSVGVQQNHPGWTVAGQFQEKKRFTEEVIEYFQKKVSPVHLKILLTSDEAWK
               10        20        30        40        50        60

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE0 RFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQESI
       ::: .:::::.::::::::::.:  :.::::. .:::..::::::::::::.. ::::::
CCDS74 RFVRVAELPREEADALYEALKNLTPYVAIEDKDMQQKEQQFREWFLKEFPQIRWKIQESI
               70        80        90       100       110       120

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE0 EKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGVGLG
       :.::..:: ::.:::::.:.::::.:::    :.:. :..::::::: ::..::::::::
CCDS74 ERLRVIANEIEKVHRGCVIANVVSGSTG----ILSVIGVMLAPFTAGLSLSITAAGVGLG
              130       140           150       160       170      

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE0 AASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNYYEA
        :::..::..::::..:: :::  :::::::: :.:.......::::::.::.  .. ::
CCDS74 IASATAGIASSIVENTYTRSAELTASRLTATSTDQLEALRDILRDITPNVLSFALDFDEA
        180       190       200       210       220       230      

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE0 TQTIGSEIRAIRQARARARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATTSGI
       :. :.......:...: .  :. .::    .  .. :: .. :: : . :: :. .:::.
CCDS74 TKMIANDVHTLRRSKATVGRPLIAWRYVPINVVETLRTRGAPTRIVRKVARNLGKATSGV
        240       250       260       270       280       290      

        280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 FLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
       ...::::::: .:  ::.:::: ::: ::. :::::::: :::.:.: :      
CCDS74 LVVLDVVNLVQDSLDLHKGAKSESAESLRQWAQELEENLNELTHIHQSLKAG   
        300       310       320       330       340           

>>CCDS74852.1 APOL4 gene_id:80832|Hs108|chr22             (351 aa)
 initn: 1270 init1: 639 opt: 1216  Z-score: 1389.5  bits: 265.5 E(32554): 4.5e-71
Smith-Waterman score: 1216; 60.2% identity (85.1% similar) in 322 aa overlap (4-325:31-348)

                                          10        20        30   
pF1KE0                            MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNE
                                     ::::::::. .::...::::::.::::..:
CCDS74 MEGAALLKIFVVCIWVQQNHPGWTVAGQFQEKKRFTEEVIEYFQKKVSPVHLKILLTSDE
               10        20        30        40        50        60

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE0 AWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQ
       :::::: .:::::.::::::::::.:  :.::::. .:::..::::::::::::.. :::
CCDS74 AWKRFVRVAELPREEADALYEALKNLTPYVAIEDKDMQQKEQQFREWFLKEFPQIRWKIQ
               70        80        90       100       110       120

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE0 ESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGV
       ::::.::..:: ::.:::::.:.::::.:::    :.:. :..::::::: ::..:::::
CCDS74 ESIERLRVIANEIEKVHRGCVIANVVSGSTG----ILSVIGVMLAPFTAGLSLSITAAGV
              130       140       150           160       170      

           160       170       180       190       200       210   
pF1KE0 GLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNY
       ::: :::..::..::::..:: :::  :::::::: :.:.......::::::.::.  ..
CCDS74 GLGIASATAGIASSIVENTYTRSAELTASRLTATSTDQLEALRDILRDITPNVLSFALDF
        180       190       200       210       220       230      

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE0 YEATQTIGSEIRAIRQARARARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATT
        :::. :.......:...: .  :. .::    .  .. :: .. :: : . :: :. .:
CCDS74 DEATKMIANDVHTLRRSKATVGRPLIAWRYVPINVVETLRTRGAPTRIVRKVARNLGKAT
        240       250       260       270       280       290      

           280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 SGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
       ::....::::::: .:  ::.:::: ::: ::. :::::::: :::.:.: :      
CCDS74 SGVLVVLDVVNLVQDSLDLHKGAKSESAESLRQWAQELEENLNELTHIHQSLKAG   
        300       310       320       330       340       350    

>>CCDS43014.1 APOL2 gene_id:23780|Hs108|chr22             (337 aa)
 initn: 1059 init1: 760 opt: 1041  Z-score: 1190.6  bits: 228.6 E(32554): 5.4e-60
Smith-Waterman score: 1041; 52.6% identity (79.3% similar) in 333 aa overlap (1-327:1-333)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNEAWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLR
       :. :.. : :.  :::...::  .:  :::..:::. ::.:::::::::: : .::.:: 
CCDS43 MNPESSIFIEDYLKYFQDQVSRENLLQLLTDDEAWNGFVAAAELPRDEADELRKALNKLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 TYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVS
       .. ...:.  ..::.: :.:::::::..::.... :.::::::. .:.:::: ::.::::
CCDS43 SHMVMKDKNRHDKDQQHRQWFLKEFPRLKRELEDHIRKLRALAEEVEQVHRGTTIANVVS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 SSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGVGLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAE
       .:.:..:::..: :: ::::: : :..:  .:.:::::.::.::: :.::      :.:.
CCDS43 NSVGTTSGILTLLGLGLAPFTEGISFVLLDTGMGLGAAAAVAGITCSVVELVNKLRARAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KE0 ASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNYYEATQTIGSEIRAIRQARARARL----
       :  :  .. .  ::.:: .   :::.:.:..:.:..:: :: .:::::.:::  .:    
CCDS43 ARNLDQSGTNVAKVMKEFVGGNTPNVLTLVDNWYQVTQGIGRNIRAIRRARANPQLGAYA
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE0 --PVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATTSGIFLALDVVNLVYESKHLHE
         : .  :::: .: :.::.. : ..:.:::. :..:.:.::.: ::::.:.:::::: :
CCDS43 PPPHVIGRISAEGGEQVERVVEGPAQAMSRGTMIVGAATGGILLLLDVVSLAYESKHLLE
              250       260       270       280       290       300

          300       310       320       330 
pF1KE0 GAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH
       :::: :::::...::::: .:  ::.:.. :.:    
CCDS43 GAKSESAEELKKRAQELEGKLNFLTKIHEMLQPGQDQ
              310       320       330       

>>CCDS46702.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22              (380 aa)
 initn: 937 init1: 706 opt: 938  Z-score: 1072.5  bits: 207.0 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 938; 47.7% identity (75.1% similar) in 333 aa overlap (1-325:42-374)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLT
                                     :: :.. : :.: :::.:.::  .: .:::
CCDS46 LCIWVQQNVPSGTDTGDPQSKPLGDWAAGTMDPESSIFIEDAIKYFKEKVSTQNLLLLLT
              20        30        40        50        60        70 

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 NNEAWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKR
       .::::. ::.::::::.::: : .:: .:     ..:.  ..: .:.:.:::::::..: 
CCDS46 DNEAWNGFVAAAELPRNEADELRKALDNLARQMIMKDKNWHDKGQQYRNWFLKEFPRLKS
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              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 KIQESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTA
       .....:..:::::.:...::.: ::.::::.: . .:::..:.:. ::::: : ::.:  
CCDS46 ELEDNIRRLRALADGVQKVHKGTTIANVVSGSLSISSGILTLVGMGLAPFTEGGSLVLLE
             140       150       160       170       180       190 

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pF1KE0 AGVGLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLL
        :. :: ..:.::::.: ....    ..:.:  :.  :.:.::  .: . .   :.::: 
CCDS46 PGMELGITAALTGITSSTMDYGKKWWTQAQAHDLVIKSLDKLKEVREFLGENISNFLSLA
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KE0 NNYYEATQTIGSEIRAIRQARAR--------ARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAV
       .: :. :. ::..:::.:.:::         :  : .:  ::: :: :.::.   .   .
CCDS46 GNTYQLTRGIGKDIRALRRARANLQSVPHASASRPRVTEPISAESGEQVERVNEPSILEM
             260       270       280       290       300       310 

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pF1KE0 SRGARILSATTSGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIY
       :::... ...  ..::.:::: :::::::::::::: .::::.. ::::::.:  :.. :
CCDS46 SRGVKLTDVAPVSFFLVLDVVYLVYESKHLHEGAKSETAEELKKVAQELEEKLNILNNNY
             320       330       340       350       360       370 

            330 
pF1KE0 QRLNPCHTH
       . :      
CCDS46 KILQADQEL
             380

>>CCDS13926.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22              (398 aa)
 initn: 937 init1: 706 opt: 938  Z-score: 1072.2  bits: 207.0 E(32554): 2.1e-53
Smith-Waterman score: 938; 47.7% identity (75.1% similar) in 333 aa overlap (1-325:60-392)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLT
                                     :: :.. : :.: :::.:.::  .: .:::
CCDS13 AGARVQQNVPSGTDTGDPQSKPLGDWAAGTMDPESSIFIEDAIKYFKEKVSTQNLLLLLT
      30        40        50        60        70        80         

               40        50        60        70        80        90
pF1KE0 NNEAWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKR
       .::::. ::.::::::.::: : .:: .:     ..:.  ..: .:.:.:::::::..: 
CCDS13 DNEAWNGFVAAAELPRNEADELRKALDNLARQMIMKDKNWHDKGQQYRNWFLKEFPRLKS
      90       100       110       120       130       140         

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 KIQESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTA
       .....:..:::::.:...::.: ::.::::.: . .:::..:.:. ::::: : ::.:  
CCDS13 ELEDNIRRLRALADGVQKVHKGTTIANVVSGSLSISSGILTLVGMGLAPFTEGGSLVLLE
     150       160       170       180       190       200         

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pF1KE0 AGVGLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLL
        :. :: ..:.::::.: ....    ..:.:  :.  :.:.::  .: . .   :.::: 
CCDS13 PGMELGITAALTGITSSTMDYGKKWWTQAQAHDLVIKSLDKLKEVREFLGENISNFLSLA
     210       220       230       240       250       260         

              220       230               240       250       260  
pF1KE0 NNYYEATQTIGSEIRAIRQARAR--------ARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAV
       .: :. :. ::..:::.:.:::         :  : .:  ::: :: :.::.   .   .
CCDS13 GNTYQLTRGIGKDIRALRRARANLQSVPHASASRPRVTEPISAESGEQVERVNEPSILEM
     270       280       290       300       310       320         

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE0 SRGARILSATTSGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIY
       :::... ...  ..::.:::: :::::::::::::: .::::.. ::::::.:  :.. :
CCDS13 SRGVKLTDVAPVSFFLVLDVVYLVYESKHLHEGAKSETAEELKKVAQELEEKLNILNNNY
     330       340       350       360       370       380         

            330 
pF1KE0 QRLNPCHTH
       . :      
CCDS13 KILQADQEL
     390        

>>CCDS13925.1 APOL1 gene_id:8542|Hs108|chr22              (414 aa)
 initn: 937 init1: 706 opt: 938  Z-score: 1072.0  bits: 207.0 E(32554): 2.2e-53
Smith-Waterman score: 938; 47.7% identity (75.1% similar) in 333 aa overlap (1-325:76-408)

                                             10        20        30
pF1KE0                               MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLT
                                     :: :.. : :.: :::.:.::  .: .:::
CCDS13 AGARVQQNVPSGTDTGDPQSKPLGDWAAGTMDPESSIFIEDAIKYFKEKVSTQNLLLLLT
          50        60        70        80        90       100     

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pF1KE0 NNEAWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLRTYAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKR
       .::::. ::.::::::.::: : .:: .:     ..:.  ..: .:.:.:::::::..: 
CCDS13 DNEAWNGFVAAAELPRNEADELRKALDNLARQMIMKDKNWHDKGQQYRNWFLKEFPRLKS
         110       120       130       140       150       160     

              100       110       120       130       140       150
pF1KE0 KIQESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTA
       .....:..:::::.:...::.: ::.::::.: . .:::..:.:. ::::: : ::.:  
CCDS13 ELEDNIRRLRALADGVQKVHKGTTIANVVSGSLSISSGILTLVGMGLAPFTEGGSLVLLE
         170       180       190       200       210       220     

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pF1KE0 AGVGLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEAEASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLL
        :. :: ..:.::::.: ....    ..:.:  :.  :.:.::  .: . .   :.::: 
CCDS13 PGMELGITAALTGITSSTMDYGKKWWTQAQAHDLVIKSLDKLKEVREFLGENISNFLSLA
         230       240       250       260       270       280     

              220       230               240       250       260  
pF1KE0 NNYYEATQTIGSEIRAIRQARAR--------ARLPVTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAV
       .: :. :. ::..:::.:.:::         :  : .:  ::: :: :.::.   .   .
CCDS13 GNTYQLTRGIGKDIRALRRARANLQSVPHASASRPRVTEPISAESGEQVERVNEPSILEM
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            270       280       290       300       310       320  
pF1KE0 SRGARILSATTSGIFLALDVVNLVYESKHLHEGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIY
       :::... ...  ..::.:::: :::::::::::::: .::::.. ::::::.:  :.. :
CCDS13 SRGVKLTDVAPVSFFLVLDVVYLVYESKHLHEGAKSETAEELKKVAQELEEKLNILNNNY
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            330 
pF1KE0 QRLNPCHTH
       . :      
CCDS13 KILQADQEL
         410    

>>CCDS13919.1 APOL6 gene_id:80830|Hs108|chr22             (343 aa)
 initn: 591 init1: 325 opt: 530  Z-score: 608.8  bits: 121.0 E(32554): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 536; 36.8% identity (68.9% similar) in 302 aa overlap (31-325:2-292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MDSEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNEAWKRFVTAAELPRDEADALYEALKKLR
                                     .:.: ..  ... : ::: ::         
CCDS13                              MDNQAERESEAGVGLQRDEDDA---------
                                            10        20           

               70        80         90       100       110         
pF1KE0 TYAAIEDEYVQQKDEQFREW-FLKEFPQVKRKIQESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVV
            ::  .:. : . .:  ::.:::..:. .. .:.::::::. :...:.  : .:.:
CCDS13 --PLCEDVELQDGDLSPEEKIFLREFPRLKEDLKGNIDKLRALADDIDKTHKKFTKANMV
               30        40        50        60        70        80

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pF1KE0 SSSTGAASGIMSLAGLVLAPFTAGTSLALTAAGVGLGAASAVTGITTSIVEHSYTSSAEA
       ..::.. ::.::: ::.::: :.: :: :..:: ::..:..::.:... .:.: .. :.:
CCDS13 ATSTAVISGVMSLLGLALAPATGGGSLLLSTAGQGLATAAGVTSIVSGTLERSKNKEAQA
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pF1KE0 EASRLTATSIDRLKVFKEVMRDITPNLLSLLNNYYEATQTIGSEIRAIRQARARARLP--
       .:  .  :  .. .  .:   : .    ... :  .. .   ...::. . ::  ::   
CCDS13 RAEDILPTYDQEDREDEEEKADYVTAAGKIIYNLRNTLKYAKKNVRAFWKLRANPRLANA
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pF1KE0 ----VTTWRISAGSGGQAERTIAGTTRAVSRGARILSATTSGIFLALDVVNLVYESKHLH
           .:: ..:. :  :.....:::: :....::.:... :.. :. :...:  : :::.
CCDS13 TKRLLTTGQVSSRSRVQVQKAFAGTTLAMTKNARVLGGVMSAFSLGYDLATLSKEWKHLK
              210       220       230       240       250       260

           300       310       320       330                       
pF1KE0 EGAKSASAEELRRQAQELEENLMELTQIYQRLNPCHTH                      
       :::..  ::::: .: :::..: ::::.:. :                            
CCDS13 EGARTKFAEELRAKALELERKLTELTQLYKSLQQKVRSRARGVGKDLTGTCETEAYWKEL
              270       280       290       300       310       320

CCDS13 REHVWMWLWLCVCLCVCVYVQFT
              330       340   

>>CCDS13920.1 APOL5 gene_id:80831|Hs108|chr22             (433 aa)
 initn: 454 init1: 301 opt: 447  Z-score: 512.9  bits: 103.6 E(32554): 3e-22
Smith-Waterman score: 447; 32.0% identity (67.7% similar) in 300 aa overlap (33-325:55-350)

             10        20        30        40        50         60 
pF1KE0 SEKKRFTEEATKYFRERVSPVHLQILLTNNEAWKRFVTAAELPRDEADAL-YEALKKLRT
                                     ..::     . .  :::  : :  ...:  
CCDS13 KEMWLRKVIYGGEVWGKSPEPEFPSLVNLCQSWKINNLMSTVHSDEAGMLSYFLFEEL--
           30        40        50        60        70        80    

              70        80        90       100       110       120 
pF1KE0 YAAIEDEYVQQKDEQFREWFLKEFPQVKRKIQESIEKLRALANGIEEVHRGCTISNVVSS
       .   .: . . .  . .. ::. ::  : .....:..: .::. .. .:.  : ...:.:
CCDS13 MRCDKDSMPDGNLSEEEKLFLSYFPLHKFELEQNIKELNTLADQVDTTHELLTKTSLVAS
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