Result of FASTA (omim) for pF1KB5895
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5895, 499 aa
  1>>>pF1KB5895 499 - 499 aa - 499 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1001+/-0.000421; mu= 19.0256+/- 0.026
 mean_var=65.9754+/-12.874, 0's: 0 Z-trim(110.3): 41  B-trim: 0 in 0/57
 Lambda= 0.157900
 statistics sampled from 18584 (18623) to 18584 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.218), width:  16
 Scan time:  8.290

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000227 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) hepa ( 499) 3359 774.6       0
XP_005254429 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 499) 3359 774.6       0
XP_005254431 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 511) 3170 731.5 1.3e-210
XP_006720565 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 452) 3051 704.4 1.7e-202
XP_016877665 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) P ( 398) 2210 512.8 7.4e-145
NP_006024 (OMIM: 603684) endothelial lipase isofor ( 500) 1392 326.5 1.1e-88
XP_005258447 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 536) 1381 324.0 6.6e-88
XP_011524569 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 420) 1313 308.5 2.5e-83
NP_000228 (OMIM: 144250,238600,609708) lipoprotein ( 475) 1249 293.9 6.7e-79
XP_016881584 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 303)  893 212.7 1.2e-54
NP_000927 (OMIM: 246600,614338) pancreatic triacyl ( 465)  679 164.1 8.1e-40
NP_006220 (OMIM: 604422) inactive pancreatic lipas ( 467)  649 157.2 9.3e-38
NP_001290064 (OMIM: 604422) inactive pancreatic li ( 467)  649 157.2 9.3e-38
XP_011538170 (OMIM: 604422) PREDICTED: inactive pa ( 467)  649 157.2 9.3e-38
NP_005387 (OMIM: 604423) pancreatic lipase-related ( 470)  649 157.2 9.3e-38
NP_001294935 (OMIM: 603684) endothelial lipase iso ( 426)  635 154.0 7.9e-37
XP_011524567 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial ( 462)  635 154.0 8.4e-37
XP_016871828 (OMIM: 604423) PREDICTED: pancreatic  ( 249)  506 124.5 3.6e-28
XP_011538171 (OMIM: 604422) PREDICTED: inactive pa ( 318)  497 122.5 1.8e-27
NP_640341 (OMIM: 604379,607365) lipase member H pr ( 451)  437 108.9 3.1e-23
XP_011510833 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 408)  426 106.4 1.6e-22
XP_011510832 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 408)  426 106.4 1.6e-22
XP_006724028 (OMIM: 145750,609252) PREDICTED: lipa ( 404)  425 106.2 1.9e-22
NP_001289927 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 460)  425 106.2 2.1e-22
NP_945347 (OMIM: 145750,609252) lipase member I is ( 481)  425 106.2 2.2e-22
NP_001289930 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 375)  409 102.5 2.2e-21
NP_001289929 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 454)  396 99.6   2e-20
NP_056984 (OMIM: 607460) phospholipase A1 member A ( 456)  387 97.5 8.4e-20
NP_001280154 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 440)  386 97.3 9.6e-20
XP_006713592 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 421)  331 84.8 5.5e-16
NP_001289928 (OMIM: 145750,609252) lipase member I ( 430)  323 82.9   2e-15
XP_016862061 (OMIM: 607460) PREDICTED: phospholipa ( 283)  263 69.2 1.8e-11
NP_001193890 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 283)  263 69.2 1.8e-11
NP_001193889 (OMIM: 607460) phospholipase A1 membe ( 440)  189 52.4 3.1e-06
XP_016861341 (OMIM: 604379,607365) PREDICTED: lipa ( 417)  152 44.0   0.001


>>NP_000227 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) hepatic   (499 aa)
 initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359  Z-score: 4134.8  bits: 774.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3359; 99.6% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
NP_000 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_000 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
              430       440       450       460       470       480

              490         
pF1KB5 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
       :::::::::::::::::::
NP_000 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
              490         

>>XP_005254429 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI  (499 aa)
 initn: 3359 init1: 3359 opt: 3359  Z-score: 4134.8  bits: 774.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3359; 99.6% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
XP_005 IGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_005 PCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 INQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQ
              430       440       450       460       470       480

              490         
pF1KB5 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
       :::::::::::::::::::
XP_005 EKIFVKCEIKSKTSKRKIR
              490         

>>XP_005254431 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI  (511 aa)
 initn: 3169 init1: 3169 opt: 3170  Z-score: 3902.0  bits: 731.5 E(85289): 1.3e-210
Smith-Waterman score: 3170; 95.9% identity (98.2% similar) in 490 aa overlap (11-499:22-511)

                          10        20         30        40        
pF1KB5            MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQS-LKPEPFGRRAQAVETNKTLHEM
                            .:.  .  .:  . .. .. :::::::::::::::::::
XP_005 MDLITYLNLIFLLLKPQYHPQILITGVTTSSEDMRKAPVSEEPFGRRAQAVETNKTLHEM
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB5 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB5 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
              130       140       150       160       170       180

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB5 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_005 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHM
              190       200       210       220       230       240

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB5 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
              250       260       270       280       290       300

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
              310       320       330       340       350       360

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB5 FKVYHYQLKIQFINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDV
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FKVYHYQFKIQFINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDV
              370       380       390       400       410       420

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB5 DIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
              430       440       450       460       470       480

      470       480       490         
pF1KB5 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRKIR
       :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRKIR
              490       500       510 

>>XP_006720565 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI  (452 aa)
 initn: 3051 init1: 3051 opt: 3051  Z-score: 3756.3  bits: 704.4 E(85289): 1.7e-202
Smith-Waterman score: 3051; 99.6% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (48-499:1-452)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB5 IQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006                               MKTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGF
                                             10        20        30

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB5 NSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNT
               40        50        60        70        80        90

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB5 RLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAG
              100       110       120       130       140       150

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB5 PLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFL
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFL
              160       170       180       190       200       210

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB5 ELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCK
              220       230       240       250       260       270

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB5 KGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFINQTETPIQTTFTMSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
XP_006 KGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQFKIQFINQTETPIQTTFTMSLL
              280       290       300       310       320       330

       380       390       400       410       420       430       
pF1KB5 GTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWENSAVWANVWDTVQTII
              340       350       360       370       380       390

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB5 PWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCEIKSKTSKRK
              400       410       420       430       440       450

         
pF1KB5 IR
       ::
XP_006 IR
         

>>XP_016877665 (OMIM: 125853,151670,612797,614025) PREDI  (398 aa)
 initn: 2204 init1: 2204 opt: 2210  Z-score: 2721.7  bits: 512.8 E(85289): 7.4e-145
Smith-Waterman score: 2210; 92.6% identity (96.0% similar) in 351 aa overlap (11-360:22-370)

                          10        20         30        40        
pF1KB5            MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQS-LKPEPFGRRAQAVETNKTLHEM
                            .:.  .  .:  . .. .. :::::::::::::::::::
XP_016 MDLITYLNLIFLLLKPQYHPQILITGVTTSSEDMRKAPVSEEPFGRRAQAVETNKTLHEM
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB5 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALK
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB5 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYS
              130       140       150       160       170       180

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB5 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_016 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDANFVDAIHTFTREHM
              190       200       210       220       230       240

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB5 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
              250       260       270       280       290       300

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
              310       320       330       340       350       360

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB5 FKVYHYQLKIQFINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDV
       ::   .::.  :                                                
XP_016 FK--GFQLEYTFTAENVKLAEEHKEENKNDHSALSRDKHC                    
                370       380       390                            

>>NP_006024 (OMIM: 603684) endothelial lipase isoform 1   (500 aa)
 initn: 1299 init1: 361 opt: 1392  Z-score: 1713.2  bits: 326.5 E(85289): 1.1e-88
Smith-Waterman score: 1392; 42.9% identity (71.4% similar) in 503 aa overlap (6-494:8-494)

                 10        20        30        40           50     
pF1KB5   MDTSPLCFSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNK-TLHEMK--TRFLLF
              :::     ::  .   : :. .   : ::  . ..  : :  :.:  .:: : 
NP_006 MSNSVPLLCF---WSLCYCF---AAGSPVPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLR
               10              20        30        40        50    

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB5 GETN---QGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPA
          .   .:: . ..: . :..:.:: .    .:::::...:..:::. ..:.::...  
NP_006 TSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-
           60        70        80        90       100       110    

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB5 QPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAH
       . .:: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .: ::.:. ..: ..:::::::::::
NP_006 KDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAH
           120       130       140       150       160       170   

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB5 VSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSV
       :.:.::. . ::  .::::::: :::.:::.   .:::::::.:::..::.::  .:::.
NP_006 VAGYAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSI
           180         190       200       210       220        230

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB5 GIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLH
       ::..:.:: :.:::::.::::: . ..   ::   ...::...:: :::.::::.:::..
NP_006 GIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVN
              240       250       260          270       280       

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB5 AGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVY
           :.:. : : : :..:.::::.:.:::..::....   .......: :::  ::.::
NP_006 QDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVY
       290       300       310       320       330       340       

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 HYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIG
       :::.::. :  ..   :. :: ..: ::.   : .:. . . : .: : .::.  . :.:
NP_006 HYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLG
       350       360       370       380       390       400       

             420        430       440         450       460        
pF1KB5 ELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCS
       .:. :.. ::. :  : :.:   .. .   . ::. :  : .. ::::.::::...:::.
NP_006 DLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCT
       410       420       430          440       450       460    

      470       480           490          
pF1KB5 ENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR 
       :. ..  . : .:  : ::.    .:..::      
NP_006 EDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
          470       480       490       500

>>XP_005258447 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip  (536 aa)
 initn: 1296 init1: 361 opt: 1381  Z-score: 1699.2  bits: 324.0 E(85289): 6.6e-88
Smith-Waterman score: 1381; 44.8% identity (75.2% similar) in 444 aa overlap (59-494:97-530)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB5 PEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIH
                                     ..:: . ..: . :..:.:: .    .:::
XP_005 PRDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTSKDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIH
         70        80        90       100       110       120      

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB5 GWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPVNVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALL
       ::...:..:::. ..:.::...  . .:: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .:
XP_005 GWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-KDANVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARML
        130       140        150       160       170       180     

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB5 RWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNR
        ::.:. ..: ..::::::::::::.:.::. . ::  .::::::: :::.:::.   .:
XP_005 DWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAGYAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKR
         190       200       210       220         230       240   

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB5 LSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGF
       ::::::.:::..::.::  .:::.::..:.:: :.:::::.::::: . ..   ::   .
XP_005 LSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---Y
           250       260        270       280       290            

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB5 NAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHV
       ..::...:: :::.::::.:::..    :.:. : : : :..:.::::.:.:::..::..
XP_005 GTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNA
     300       310       320       330       340       350         

      330       340       350        360       370       380       
pF1KB5 RQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIP
       ..   .......: :::  ::.:::::.::. :  ..   :. :: ..: ::.   : .:
XP_005 KKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLP
     360       370       380       390       400       410         

       390       400       410       420        430       440      
pF1KB5 ITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHS
       . . . : .: : .::.  . :.:.:. :.. ::. :  : :.:   .. .   . ::. 
XP_005 LEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNP
     420       430       440       450       460       470         

          450       460       470       480           490          
pF1KB5 G--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR 
       :  : .. ::::.::::...:::.:. ..  . : .:  : ::.    .:..::      
XP_005 GRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
        480       490       500       510       520       530      

>>XP_011524569 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip  (420 aa)
 initn: 1231 init1: 361 opt: 1313  Z-score: 1617.0  bits: 308.5 E(85289): 2.5e-83
Smith-Waterman score: 1313; 46.0% identity (75.8% similar) in 417 aa overlap (86-494:8-414)

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB5 GETNQGCQIRINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAALKSQPAQPV
                                     :::::...:..:::. ..:.::...  . .
XP_011                        MTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTRE-KDA
                                      10        20        30       

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB5 NVGLVDWITLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSG
       :: .:::. :::. :: :: :::.::. .: .: ::.:. ..: ..::::::::::::.:
XP_011 NVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAG
         40        50        60        70        80        90      

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB5 FAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIK
       .::. . ::  .::::::: :::.:::.   .:::::::.:::..::.::  .:::.::.
XP_011 YAGNFVKGT--VGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-FGLSIGIQ
        100         110       120       130       140        150   

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB5 QPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGT
       .:.:: :.:::::.::::: . ..   ::   ...::...:: :::.::::.:::..   
XP_011 MPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDK
           160       170       180          190       200       210

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB5 QSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQ
        :.:. : : : :..:.::::.:.:::..::....   .......: :::  ::.:::::
XP_011 PSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHYQ
              220       230       240       250       260       270

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 LKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELI
       .::. :  ..   :. :: ..: ::.   : .:. . . : .: : .::.  . :.:.:.
XP_011 MKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGDLL
              280       290       300       310       320       330

          420        430       440         450       460       470 
pF1KB5 MIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENT
        :.. ::. :  : :.:   .. .   . ::. :  : .. ::::.::::...:::.:. 
XP_011 KIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDP
              340       350          360       370       380       

             480           490          
pF1KB5 DDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR 
       ..  . : .:  : ::.    .:..::      
XP_011 ENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
       390       400       410       420

>>NP_000228 (OMIM: 144250,238600,609708) lipoprotein lip  (475 aa)
 initn: 1308 init1: 794 opt: 1249  Z-score: 1537.4  bits: 293.9 E(85289): 6.7e-79
Smith-Waterman score: 1353; 44.3% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (38-495:27-473)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB5 FSILLVLCIFIQSSALGQSLKPEPFGRRAQAVETNKTLHEMKTRFLLFGETNQG---CQI
                                     :..  . . .....: :    . .   :..
NP_000     MESKALLVLTLAVWLQSLTASRGGVAAADQRRDFIDIESKFALRTPEDTAEDTCHL
                   10        20        30        40        50      

           70        80        90       100        110       120   
pF1KB5 RINHPDTLQECGFNSSLPLVMIIHGWSVDGVLENWIWQMVAAL-KSQPAQPVNVGLVDWI
         .  ...  : :: :    :.::::.: :. :.:. ..:::: : .: .  :: .:::.
NP_000 IPGVAESVATCHFNHSSKTFMVIHGWTVTGMYESWVPKLVAALYKREPDS--NVIVVDWL
         60        70        80        90       100         110    

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB5 TLAHDHYTIAVRNTRLVGKEVAALLRWLEESVQLSRSHVHLIGYSLGAHVSGFAGSSIGG
       . :..:: ...  :.:::..:: .. :.::  .   ..:::.:::::::..:.:::  . 
NP_000 SRAQEHYPVSAGYTKLVGQDVARFINWMEEEFNYPLDNVHLLGYSLGAHAAGIAGSLTN-
          120       130       140       150       160       170    

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB5 THKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHMGLSVGIKQPIGHYDF
        .:..:::::: ::: :: .   .:::::::.:::..:::::   : :.::..:.:: :.
NP_000 -KKVNRITGLDPAGPNFEYAEAPSRLSPDDADFVDVLHTFTRGSPGRSIGIQKPVGHVDI
            180       190       200       210       220       230  

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 YPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFIDSLLHAGTQSMAYPCG
       :::::.:::::.. :  : ::..:.. . : .:::::::.::::::::.  . : :: :.
NP_000 YPNGGTFQPGCNIGEAIRVIAERGLGDVDQLVKCSHERSIHLFIDSLLNEENPSKAYRCS
            240       250       260       270       280       290  

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB5 DMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSPFKVYHYQLKIQFIN-
       . ..: .::::::.:.:::.:::.. .   ..:....: ::.: :.::.:::.::.: . 
NP_000 SKEAFEKGLCLSCRKNRCNNLGYEINKVRAKRSSKMYLKTRSQMPYKVFHYQVKIHFSGT
            300       310       320       330       340       350  

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB5 QTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLDVDIGELIMIKFKWEN
       ..::  . .: .:: ::  . ..::.:: . ...::::::::  .::::::.:.:.::..
NP_000 ESETHTNQAFEISLYGTVAESENIPFTLPE-VSTNKTYSFLIYTEVDIGELLMLKLKWKS
            360       370       380        390       400       410 

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB5 SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSGLVLKTIRVKAGETQQRMTFCSENTDDLLLRPTQEK
       .. ..  :.       : ..:   :.... :::::::::... :::..  . : .     
NP_000 DSYFS--WS------DWWSSP---GFAIQKIRVKAGETQKKVIFCSREKVSHLQKGKAPA
                     420          430       440       450       460

            490         
pF1KB5 IFVKCEIKSKTSKRKIR
       .::::. :: ..:    
NP_000 VFVKCHDKSLNKKSG  
              470       

>>XP_016881584 (OMIM: 603684) PREDICTED: endothelial lip  (303 aa)
 initn: 812 init1: 361 opt: 893  Z-score: 1102.0  bits: 212.7 E(85289): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 893; 42.8% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (199-494:1-297)

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB5 LGAHVSGFAGSSIGGTHKIGRITGLDAAGPLFEGSAPSNRLSPDDASFVDAIHTFTREHM
                                     .:::.   .:::::::.:::..::.::  .
XP_016                               MFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRS-F
                                             10        20          

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB5 GLSVGIKQPIGHYDFYPNGGSFQPGCHFLELYRHIAQHGFNAITQTIKCSHERSVHLFID
       :::.::..:.:: :.:::::.::::: . ..   ::   ...::...:: :::.::::.:
XP_016 GLSIGIQMPVGHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIA---YGTITEVVKCEHERAVHLFVD
      30        40        50        60           70        80      

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB5 SLLHAGTQSMAYPCGDMNSFSQGLCLSCKKGRCNTLGYHVRQEPRSKSKRLFLVTRAQSP
       ::..    :.:. : : : :..:.::::.:.:::..::....   .......: :::  :
XP_016 SLVNQDKPSFAFQCTDSNRFKKGICLSCRKNRCNSIGYNAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMP
         90       100       110       120       130       140      

      350        360       370       380       390       400       
pF1KB5 FKVYHYQLKIQ-FINQTETPIQTTFTMSLLGTKEKMQKIPITLGKGIASNKTYSFLITLD
       :.:::::.::. :  ..   :. :: ..: ::.   : .:. . . : .: : .::.  .
XP_016 FRVYHYQMKIHVFSYKNMGEIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTE
        150       160       170       180       190       200      

       410       420        430       440         450       460    
pF1KB5 VDIGELIMIKFKWEN-SAVWANVWDTVQTIIPWSTGPRHSG--LVLKTIRVKAGETQQRM
        :.:.:. :.. ::. :  : :.:   .. .   . ::. :  : .. ::::.::::...
XP_016 EDLGDLLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYL---SQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKL
        210       220       230          240       250       260   

          470       480           490          
pF1KB5 TFCSENTDDLLLRPTQEKIFVKCE----IKSKTSKRKIR 
       :::.:. ..  . : .:  : ::.    .:..::      
XP_016 TFCTEDPENTSISPGRELWFRKCRDGWRMKNETSPTVELP
           270       280       290       300   




499 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 18:37:34 2016 done: Sat Nov  5 18:37:35 2016
 Total Scan time:  8.290 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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