seq1 = pF1KB0407.tfa, 1395 bp seq2 = pF1KB0407/gi568815592r_161250102.tfa (gi568815592r:161250102_162543475), 1293374 bp >pF1KB0407 1395 >gi568815592r:161250102_162543475 (Chr6) (complement) 1-171 (99995-100166) 98% -> 172-412 (280711-280951) 100% -> 413-535 (342224-342346) 100% == 871-933 (974059-974121) 100% -> 934-1083 (994473-994622) 100% -> 1084-1167 (1156599-1156682) 100% -> 1168-1285 (1183271-1183388) 100% -> 1286-1395 (1193265-1193374) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAT AGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCCATGGTTTCCCAGTGGAGG || |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99995 TTGGTCAGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCCATGGTTTCCCAGTGGAGG 50 . : . : . : . : . : 50 TCGATTCTGACACCAGCATCTTCCAGCTCAAGGAGGTGGTTGCTAAGCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100045 TCGATTCTGACACCAGCATCTTCCAGCTCAAGGAGGTGGTTGCTAAGCGA 100 . : . : . : . : . : 100 CAGGGGGTTCCGGCTGACCAGTTGCGTGTGATTTTCGCAGGGAAGGAGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100095 CAGGGGGTTCCGGCTGACCAGTTGCGTGTGATTTTCGCAGGGAAGGAGCT 150 . : . : . : . : . : 150 GAGGAATGACTGGACTGTGCAG AATTGTGACCTGGATCAGC ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 100145 GAGGAATGACTGGACTGTGCAGGTG...CAGAATTGTGACCTGGATCAGC 200 . : . : . : . : . : 191 AGAGCATTGTTCACATTGTGCAGAGACCGTGGAGAAAAGGTCAAGAAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 280730 AGAGCATTGTTCACATTGTGCAGAGACCGTGGAGAAAAGGTCAAGAAATG 250 . : . : . : . : . : 241 AATGCAACTGGAGGCGACGACCCCAGAAACGCGGCGGGAGGCTGTGAGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 280780 AATGCAACTGGAGGCGACGACCCCAGAAACGCGGCGGGAGGCTGTGAGCG 300 . : . : . : . : . : 291 GGAGCCCCAGAGCTTGACTCGGGTGGACCTCAGCAGCTCAGTCCTCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 280830 GGAGCCCCAGAGCTTGACTCGGGTGGACCTCAGCAGCTCAGTCCTCCCAG 350 . : . : . : . : . : 341 GAGACTCTGTGGGGCTGGCTGTCATTCTGCACACTGACAGCAGGAAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 280880 GAGACTCTGTGGGGCTGGCTGTCATTCTGCACACTGACAGCAGGAAGGAC 400 . : . : . : . : . : 391 TCACCACCAGCTGGAAGTCCAG CAGGTAGATCAATCTACAA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 280930 TCACCACCAGCTGGAAGTCCAGGTA...CAGCAGGTAGATCAATCTACAA 450 . : . : . : . : . : 432 CAGCTTTTATGTGTATTGCAAAGGCCCCTGTCAAAGAGTGCAGCCGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 342243 CAGCTTTTATGTGTATTGCAAAGGCCCCTGTCAAAGAGTGCAGCCGGGAA 500 . : . : . : . : . : 482 AACTCAGGGTACAGTGCAGCACCTGCAGGCAGGCAACGCTCACCTTGACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 342293 AACTCAGGGTACAGTGCAGCACCTGCAGGCAGGCAACGCTCACCTTGACC 550 532 CAGG |||| 342343 CAGG 0 . : . : . : . : . : 871 GCTGGCTGTCCCAACTCCTTGATTAAAGAGCTCCATCACTTCAGGATTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 974059 GCTGGCTGTCCCAACTCCTTGATTAAAGAGCTCCATCACTTCAGGATTCT 50 . : . : . : . : . : 921 GGGAGAAGAGCAG TACAACCGGTACCAGCAGTATGGTGCAG |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 974109 GGGAGAAGAGCAGGTG...CAGTACAACCGGTACCAGCAGTATGGTGCAG 100 . : . : . : . : . : 962 AGGAGTGTGTCCTGCAGATGGGGGGCGTGTTATGCCCCCGCCCTGGCTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 994501 AGGAGTGTGTCCTGCAGATGGGGGGCGTGTTATGCCCCCGCCCTGGCTGT 150 . : . : . : . : . : 1012 GGAGCGGGGCTGCTGCCGGAGCCTGACCAGAGGAAAGTCACCTGCGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 994551 GGAGCGGGGCTGCTGCCGGAGCCTGACCAGAGGAAAGTCACCTGCGAAGG 200 . : . : . : . : . : 1062 GGGCAATGGCCTGGGCTGTGGG TTTGCCTTCTGCCGGGAAT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 994601 GGGCAATGGCCTGGGCTGTGGGGTG...CAGTTTGCCTTCTGCCGGGAAT 250 . : . : . : . : . : 1103 GTAAAGAAGCGTACCATGAAGGGGAGTGCAGTGCCGTATTTGAAGCCTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1156618 GTAAAGAAGCGTACCATGAAGGGGAGTGCAGTGCCGTATTTGAAGCCTCA 300 . : . : . : . : . : 1153 GGAACAACTACTCAG GCCTACAGAGTCGATGAAAGAGCCGC |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 1156668 GGAACAACTACTCAGGTA...CAGGCCTACAGAGTCGATGAAAGAGCCGC 350 . : . : . : . : . : 1194 CGAGCAGGCTCGTTGGGAAGCAGCCTCCAAAGAAACCATCAAGAAAACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1183297 CGAGCAGGCTCGTTGGGAAGCAGCCTCCAAAGAAACCATCAAGAAAACCA 400 . : . : . : . : . : 1244 CCAAGCCCTGTCCCCGCTGCCATGTACCAGTGGAAAAAAATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 1183347 CCAAGCCCTGTCCCCGCTGCCATGTACCAGTGGAAAAAAATGGTG...CA 450 . : . : . : . : . : 1286 GAGGCTGCATGCACATGAAGTGTCCGCAGCCCCAGTGCAGGCTCGAGTG >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1193264 GGAGGCTGCATGCACATGAAGTGTCCGCAGCCCCAGTGCAGGCTCGAGTG 500 . : . : . : . : . : 1335 GTGCTGGAACTGTGGCTGCGAGTGGAACCGCGTCTGCATGGGGGACCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1193314 GTGCTGGAACTGTGGCTGCGAGTGGAACCGCGTCTGCATGGGGGACCACT 550 . : 1385 GGTTCGACGTG ||||||||||| 1193364 GGTTCGACGTG