seq1 = pF1KB6940.tfa, 687 bp seq2 = pF1KB6940/gi568815587f_117052448.tfa (gi568815587f:117052448_117267696), 215249 bp >pF1KB6940 687 >gi568815587f:117052448_117267696 (Chr11) 1-81 (100001-100081) 100% -> 82-171 (107487-107576) 100% -> 172-288 (108698-108814) 100% -> 289-411 (111323-111445) 100% -> 412-687 (114974-115249) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGCCAAGGAGACTCAAACCCAGCAGCTATTCCGCATGCAGCAGAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGAGCCAAGGAGACTCAAACCCAGCAGCTATTCCGCATGCAGCAGAAGA 50 . : . : . : . : . : 51 TATTCAAGGAGATGACCGATGGATGTCTCAG CACAACAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||| 100051 TATTCAAGGAGATGACCGATGGATGTCTCAGGTA...CAGCACAACAGAT 100 . : . : . : . : . : 92 TTGTTTTGGACTGTAAAGACAAAGAGCCTGATGTACTGTTCGTGGGAGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107497 TTGTTTTGGACTGTAAAGACAAAGAGCCTGATGTACTGTTCGTGGGAGAC 150 . : . : . : . : . : 142 TCCATGGTGCAGTTAATGCAGCAATATGAG ATATGGCGAGA ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 107547 TCCATGGTGCAGTTAATGCAGCAATATGAGGTA...TAGATATGGCGAGA 200 . : . : . : . : . : 183 GCTTTTTTCCCCACTTCATGCACTGAATTTTGGAATTGGGGGAGATACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108709 GCTTTTTTCCCCACTTCATGCACTGAATTTTGGAATTGGGGGAGATACAA 250 . : . : . : . : . : 233 CAAGACATGTTTTGTGGAGACTAAAGAATGGAGAACTGGAGAATATTAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108759 CAAGACATGTTTTGTGGAGACTAAAGAATGGAGAACTGGAGAATATTAAG 300 . : . : . : . : . : 283 CCTAAG GTCATTGTTGTCTGGGTAGGAACAAATAACCACGA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 108809 CCTAAGGTG...CAGGTCATTGTTGTCTGGGTAGGAACAAATAACCACGA 350 . : . : . : . : . : 324 AAATACAGCAGAAGAAGTAGCAGGTGGGATCGAGGCCATTGTACAACTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 111358 AAATACAGCAGAAGAAGTAGCAGGTGGGATCGAGGCCATTGTACAACTTA 400 . : . : . : . : . : 374 TCAACACAAGGCAGCCACAGGCCAAAATCATTGTATTG GGT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 111408 TCAACACAAGGCAGCCACAGGCCAAAATCATTGTATTGGTA...CAGGGT 450 . : . : . : . : . : 415 TTGTTACCTCGAGGTGAGAAACCCAATCCTTTGAGGCAAAAGAACGCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114977 TTGTTACCTCGAGGTGAGAAACCCAATCCTTTGAGGCAAAAGAACGCCAA 500 . : . : . : . : . : 465 GGTGAACCAACTCCTCAAGGTTTCGCTGCCGAAGCTTGCCAACGTGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115027 GGTGAACCAACTCCTCAAGGTTTCGCTGCCGAAGCTTGCCAACGTGCAGC 550 . : . : . : . : . : 515 TCCTGGATACCGACGGGGGTTTTGTGCACTCGGACGGTGCCATCTCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115077 TCCTGGATACCGACGGGGGTTTTGTGCACTCGGACGGTGCCATCTCCTGC 600 . : . : . : . : . : 565 CACGACATGTTTGATTTTCTGCATCTGACAGGAGGGGGCTATGCAAAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115127 CACGACATGTTTGATTTTCTGCATCTGACAGGAGGGGGCTATGCAAAGAT 650 . : . : . : . : . : 615 CTGCAAACCCCTGCATGAACTGATCATGCAGTTGTTGGAGGAAACACCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115177 CTGCAAACCCCTGCATGAACTGATCATGCAGTTGTTGGAGGAAACACCTG 700 . : . : 665 AGGAGAAACAAACCACCATTGCC ||||||||||||||||||||||| 115227 AGGAGAAACAAACCACCATTGCC