Result of FASTA (ccds) for pF1KB0948
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0948, 402 aa
  1>>>pF1KB0948 402 - 402 aa - 402 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8542+/-0.00219; mu= 16.9099+/- 0.131
 mean_var=307.7495+/-55.388, 0's: 0 Z-trim(104.6): 940  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.073110
 statistics sampled from 6934 (7972) to 6934 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.245), width:  16
 Scan time:  2.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19       ( 402) 2829 313.1   3e-85
CCDS56108.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19       ( 359) 2556 284.2 1.3e-76
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1407 163.4 5.1e-40
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1407 163.5 5.2e-40
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1407 163.5 5.3e-40
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1407 163.5 5.3e-40
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19         ( 662) 1378 160.4 4.4e-39
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19         ( 664) 1378 160.4 4.4e-39
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19      ( 599) 1366 159.1   1e-38
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1365 159.1 1.1e-38
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470) 1357 157.9 1.8e-38
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19       ( 617) 1357 158.2   2e-38
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19       ( 659) 1357 158.2   2e-38
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19       ( 706) 1357 158.3 2.1e-38
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17        ( 502) 1343 156.5   5e-38
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19        ( 706) 1342 156.7 6.3e-38
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1341 156.6 6.9e-38
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 1338 155.9   7e-38
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568) 1336 155.9 8.9e-38
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604) 1336 155.9 9.1e-38
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620) 1336 156.0 9.2e-38
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1336 156.0 9.5e-38
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1336 156.0 9.5e-38
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1336 156.0 9.6e-38
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 533) 1333 155.5 1.1e-37
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19      ( 855) 1335 156.1 1.1e-37
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058) 1336 156.4 1.2e-37
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1090) 1336 156.4 1.2e-37
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX        ( 657) 1333 155.7 1.2e-37
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 555) 1332 155.4 1.2e-37
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8        ( 560) 1332 155.4 1.2e-37
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 591) 1332 155.5 1.2e-37
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 676) 1332 155.6 1.3e-37
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 697) 1332 155.6 1.3e-37
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 464) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 478) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 497) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 498) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 510) 1329 155.1 1.4e-37
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19       ( 511) 1329 155.1 1.4e-37
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1316 154.0 4.3e-37
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3         ( 544) 1313 153.4 4.7e-37
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19       ( 594) 1312 153.4 5.2e-37
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059) 1308 153.4   9e-37
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX         ( 506) 1301 152.1 1.1e-36
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1297 151.8 1.6e-36
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1297 151.8 1.6e-36
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1297 151.9 1.6e-36
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1296 151.8 1.8e-36
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1293 151.2 1.9e-36


>>CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19            (402 aa)
 initn: 2829 init1: 2829 opt: 2829  Z-score: 1643.9  bits: 313.1 E(32554): 3e-85
Smith-Waterman score: 2829; 100.0% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (1-402:1-402)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MAAAAALRAPAQSSVTFEDVAVNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAAAAALRAPAQSSVTFEDVAVNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 EDEAAPSKQSTCIHIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDEAAPSKQSTCIHIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGER
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 PYECSKYGKLFHQKPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYECSKYGKLFHQKPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYEC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 IECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 RSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 LRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400  
pF1KB0 IKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
              370       380       390       400  

>>CCDS56108.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19            (359 aa)
 initn: 2556 init1: 2556 opt: 2556  Z-score: 1488.7  bits: 284.2 E(32554): 1.3e-76
Smith-Waterman score: 2556; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (44-402:1-359)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KB0 SVTFEDVAVNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56                               MLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCI
                                             10        20        30

            80        90       100       110       120       130   
pF1KB0 HIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQ
               40        50        60        70        80        90

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB0 KPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSL
              100       110       120       130       140       150

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB0 INHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 INHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHL
              160       170       180       190       200       210

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB0 RVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHT
              220       230       240       250       260       270

           320       330       340       350       360       370   
pF1KB0 GERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPY
              280       290       300       310       320       330

           380       390       400  
pF1KB0 ECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
              340       350         

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 940 init1: 940 opt: 1407  Z-score: 831.9  bits: 163.4 E(32554): 5.1e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:222-565)

        30        40        50        60        70               80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
                                     : ::    : : . : . .       . : 
CCDS74 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
             200       210       220          230       240        

               90       100       110       120       130       140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
        :.::.::::.:  : :. .: ... .: :      :::.:::::. :: :.:.  :  :
CCDS74 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
      250       260       270             280       290       300  

              150       160       170       180       190       200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
        :.:::.: :.:.::::.: .:::: ..: .:: :.:::: ::::::.. . ::.:...:
CCDS74 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
            310       320       330       340       350       360  

              210       220       230       240       250       260
pF1KB0 SGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGER
       .: : :::.::::.:. .. : .::::::::.:: :.:::..:...::: .: :.::::.
CCDS74 TGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEK
            370       380       390       400       410       420  

              270       280       290       300       310          
pF1KB0 PYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HEC
       :::: .:::.::.:. : ::::.:: :.::::..:::.::  :.: .:::.::::. .::
CCDS74 PYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
            430       440       450       460       470       480  

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB0 GQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCG
       .:::..::. . :: : :.::::.::::..::..:...: ::.: :.:: :.:: : .::
CCDS74 NQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECG
            490       500       510       520       530       540  

     380       390       400                                       
pF1KB0 KSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK                                     
       ::: ::::. .:.:.::: .::.                                     
CCDS74 KSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFT
            550       560       570       580       590       600  

>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
 initn: 940 init1: 940 opt: 1407  Z-score: 831.7  bits: 163.5 E(32554): 5.2e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:264-607)

        30        40        50        60        70               80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
                                     : ::    : : . : . .       . : 
CCDS74 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
           240       250       260          270       280       290

               90       100       110       120       130       140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
        :.::.::::.:  : :. .: ... .: :      :::.:::::. :: :.:.  :  :
CCDS74 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
              300       310       320             330       340    

              150       160       170       180       190       200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
        :.:::.: :.:.::::.: .:::: ..: .:: :.:::: ::::::.. . ::.:...:
CCDS74 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
          350       360       370       380       390       400    

              210       220       230       240       250       260
pF1KB0 SGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGER
       .: : :::.::::.:. .. : .::::::::.:: :.:::..:...::: .: :.::::.
CCDS74 TGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEK
          410       420       430       440       450       460    

              270       280       290       300       310          
pF1KB0 PYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HEC
       :::: .:::.::.:. : ::::.:: :.::::..:::.::  :.: .:::.::::. .::
CCDS74 PYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
          470       480       490       500       510       520    

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB0 GQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCG
       .:::..::. . :: : :.::::.::::..::..:...: ::.: :.:: :.:: : .::
CCDS74 NQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECG
          530       540       550       560       570       580    

     380       390       400                                       
pF1KB0 KSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK                                     
       ::: ::::. .:.:.::: .::.                                     
CCDS74 KSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFT
          590       600       610       620       630       640    

>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 940 init1: 940 opt: 1407  Z-score: 831.7  bits: 163.5 E(32554): 5.3e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:276-619)

        30        40        50        60        70               80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
                                     : ::    : : . : . .       . : 
CCDS12 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
         250       260       270       280          290       300  

               90       100       110       120       130       140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
        :.::.::::.:  : :. .: ... .: :      :::.:::::. :: :.:.  :  :
CCDS12 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
            310       320       330             340       350      

              150       160       170       180       190       200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
        :.:::.: :.:.::::.: .:::: ..: .:: :.:::: ::::::.. . ::.:...:
CCDS12 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
        360       370       380       390       400       410      

              210       220       230       240       250       260
pF1KB0 SGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGER
       .: : :::.::::.:. .. : .::::::::.:: :.:::..:...::: .: :.::::.
CCDS12 TGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEK
        420       430       440       450       460       470      

              270       280       290       300       310          
pF1KB0 PYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HEC
       :::: .:::.::.:. : ::::.:: :.::::..:::.::  :.: .:::.::::. .::
CCDS12 PYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
        480       490       500       510       520       530      

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB0 GQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCG
       .:::..::. . :: : :.::::.::::..::..:...: ::.: :.:: :.:: : .::
CCDS12 NQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECG
        540       550       560       570       580       590      

     380       390       400                                       
pF1KB0 KSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK                                     
       ::: ::::. .:.:.::: .::.                                     
CCDS12 KSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFT
        600       610       620       630       640       650      

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 940 init1: 940 opt: 1407  Z-score: 831.6  bits: 163.5 E(32554): 5.3e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:288-631)

        30        40        50        60        70               80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
                                     : ::    : : . : . .       . : 
CCDS54 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
       260       270       280       290          300       310    

               90       100       110       120       130       140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
        :.::.::::.:  : :. .: ... .: :      :::.:::::. :: :.:.  :  :
CCDS54 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
          320       330       340             350       360        

              150       160       170       180       190       200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
        :.:::.: :.:.::::.: .:::: ..: .:: :.:::: ::::::.. . ::.:...:
CCDS54 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
      370       380       390       400       410       420        

              210       220       230       240       250       260
pF1KB0 SGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGER
       .: : :::.::::.:. .. : .::::::::.:: :.:::..:...::: .: :.::::.
CCDS54 TGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEK
      430       440       450       460       470       480        

              270       280       290       300       310          
pF1KB0 PYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HEC
       :::: .:::.::.:. : ::::.:: :.::::..:::.::  :.: .:::.::::. .::
CCDS54 PYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
      490       500       510       520       530       540        

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB0 GQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCG
       .:::..::. . :: : :.::::.::::..::..:...: ::.: :.:: :.:: : .::
CCDS54 NQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECG
      550       560       570       580       590       600        

     380       390       400                                       
pF1KB0 KSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK                                     
       ::: ::::. .:.:.::: .::.                                     
CCDS54 KSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFT
      610       620       630       640       650       660        

>>CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19              (662 aa)
 initn: 2620 init1: 928 opt: 1378  Z-score: 815.2  bits: 160.4 E(32554): 4.4e-39
Smith-Waterman score: 1379; 54.5% identity (75.3% similar) in 352 aa overlap (52-402:188-527)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB0 VNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIYKDQGG
                                     .. .: . :.:     .: :   ... :  
CCDS42 GDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDF---CHQHT---LFEHQKI
       160       170       180       190          200          210 

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB0 HSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIHE
       :. ::::::.:  :::. .: : . .:.:      ::::::.::. :: :  : ..  :.
CCDS42 HTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNH------TGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQ
             220       230       240             250       260     

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB0 RFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHS
       ..:::.. ::::::::.: ..: :::.: .::: ::: : ::::::  .. :..:.:.:.
CCDS42 KIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHT
         270       280       290       300       310       320     

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB0 GAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERP
       : . : :::::: : :.:.::.:...::::::. : :::. : .. .:: : ::::::.:
CCDS42 GERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKP
         330       340       350       360       370       380     

             270       280       290       300       310        320
pF1KB0 YECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HECG
       ::: :::: ::  :.:..::.::: :.::::::::: :   :.:: ::::::::. .::.
CCDS42 YECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECN
         390       400       410       420       430       440     

              330       340       350       360       370       380
pF1KB0 QCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGK
       .::: :    .:  : :::.::::::::.::: :... .: .: ::::::::.::  :::
CCDS42 KCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGK
         450       460       470       480       490       500     

              390       400                                        
pF1KB0 SFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK                                      
       :::  :..  :::.::: :::.                                      
CCDS42 SFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQ
         510       520       530       540       550       560     

>--
 initn: 607 init1: 607 opt: 607  Z-score: 375.7  bits: 79.1 E(32554): 1.3e-14
Smith-Waterman score: 607; 57.5% identity (82.1% similar) in 134 aa overlap (180-313:528-661)

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB0 YECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECN
                                     : :::: : ..:. : ::. : : . .::.
CCDS42 FECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECT
       500       510       520       530       540       550       

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB0 ECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGK
       :::. :. .: ::.:...:: :: :.::.::. : ..:.::.: ::::::.:::: ::::
CCDS42 ECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGK
       560       570       580       590       600       610       

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB0 SFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRK
        :: .:::..:.:.:: ::::.:::::. :.  :.::.::.:::                
CCDS42 VFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR               
       620       630       640       650       660                 

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB0 SSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFR

>>CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19              (664 aa)
 initn: 2620 init1: 928 opt: 1378  Z-score: 815.2  bits: 160.4 E(32554): 4.4e-39
Smith-Waterman score: 1379; 54.5% identity (75.3% similar) in 352 aa overlap (52-402:190-529)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB0 VNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIYKDQGG
                                     .. .: . :.:     .: :   ... :  
CCDS82 GDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDF---CHQHT---LFEHQKI
     160       170       180       190       200             210   

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB0 HSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIHE
       :. ::::::.:  :::. .: : . .:.:      ::::::.::. :: :  : ..  :.
CCDS82 HTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNH------TGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQ
           220       230       240             250       260       

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB0 RFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHS
       ..:::.. ::::::::.: ..: :::.: .::: ::: : ::::::  .. :..:.:.:.
CCDS82 KIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHT
       270       280       290       300       310       320       

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB0 GAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERP
       : . : :::::: : :.:.::.:...::::::. : :::. : .. .:: : ::::::.:
CCDS82 GERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKP
       330       340       350       360       370       380       

             270       280       290       300       310        320
pF1KB0 YECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HECG
       ::: :::: ::  :.:..::.::: :.::::::::: :   :.:: ::::::::. .::.
CCDS82 YECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECN
       390       400       410       420       430       440       

              330       340       350       360       370       380
pF1KB0 QCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGK
       .::: :    .:  : :::.::::::::.::: :... .: .: ::::::::.::  :::
CCDS82 KCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGK
       450       460       470       480       490       500       

              390       400                                        
pF1KB0 SFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK                                      
       :::  :..  :::.::: :::.                                      
CCDS82 SFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQ
       510       520       530       540       550       560       

>--
 initn: 607 init1: 607 opt: 607  Z-score: 375.7  bits: 79.1 E(32554): 1.3e-14
Smith-Waterman score: 607; 57.5% identity (82.1% similar) in 134 aa overlap (180-313:530-663)

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB0 YECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECN
                                     : :::: : ..:. : ::. : : . .::.
CCDS82 FECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECT
     500       510       520       530       540       550         

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB0 ECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGK
       :::. :. .: ::.:...:: :: :.::.::. : ..:.::.: ::::::.:::: ::::
CCDS82 ECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGK
     560       570       580       590       600       610         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB0 SFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRK
        :: .:::..:.:.:: ::::.:::::. :.  :.::.::.:::                
CCDS82 VFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR               
     620       630       640       650       660                   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB0 SSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFR

>>CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19           (599 aa)
 initn: 934 init1: 934 opt: 1366  Z-score: 808.7  bits: 159.1 E(32554): 1e-38
Smith-Waterman score: 1366; 55.1% identity (79.4% similar) in 345 aa overlap (66-402:238-576)

          40        50        60        70        80               
pF1KB0 QRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIYKDQGG-------HSGERPY
                                     : : : : . .....:       :.  : .
CCDS12 RKPLKYTESRKSFREKSVFIQHQRADSGERPYKCSECGKSFSQSSGFLRHRKAHGRTRTH
       210       220       230       240       250       260       

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB0 ECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIHERFHTGQK
       ::.:  : :. :. ::.      :. :.::::::.::. :: :.:  .:  :.: :::..
CCDS12 ECSECGKSFSRKTHLTQ------HQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRVHTGER
       270       280             290       300       310       320 

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB0 TYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYEC
        :::::::::: .:..: .... ::  ::::: ::::.:.....:. : .::.:.. :::
CCDS12 PYECSECGKSFSHSTNLYRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGVRPYEC
             330       340       350       360       370       380 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB0 NECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECG
       .::::.:. .  ::.:.:.::::::: :::::.::...: ::.: ::::::::::: :::
CCDS12 SECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYECSECG
             390       400       410       420       430       440 

      270       280       290       300       310        320       
pF1KB0 KSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HECGQCGKSFS
       : : .::.:..:.:.::. .::::::: :::: ...::.:: :::::: .::. ::::: 
CCDS12 KVFSQSSGLFRHRRAHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGERPYECSVCGKSFI
             450       460       470       480       490       500 

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB0 RKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSS
       ::. :: :  :::.::::::..::::....:.:..: ::::::::::: .::::: ... 
CCDS12 RKTHLIRHQTVHTNERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYECRECGKSFTRKNH
             510       520       530       540       550       560 

       390       400                         
pF1KB0 FRRHQRVHTGMRPYK                       
       . .:. :::: :::.                       
CCDS12 LIQHKTVHTGERPYECSECGKSFSQSSGLLRHRRVHVQ
             570       580       590         

>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8                (682 aa)
 initn: 1771 init1: 909 opt: 1365  Z-score: 807.7  bits: 159.1 E(32554): 1.1e-38
Smith-Waterman score: 1365; 54.4% identity (80.9% similar) in 329 aa overlap (74-401:335-657)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB0 MLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCL
                                     .. . :  ::::.:: :.:  : :. .: :
CCDS64 NSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNL
          310       320       330       340       350       360    

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB0 TEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSS
              ::. ..:::.:.::.. :: : :.  :. :.: :::.: :::..::: : . :
CCDS64 I------KHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVS
                370       380       390       400       410        

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB0 SLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIK
       .:.... .:: :.::.: .:::::...::::.::..:.: : . :: :::.:.:.: : :
CCDS64 NLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRK
      420       430       440       450       460       470        

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB0 HRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRV
       :. :::::.::.:: ::..:...:.::.:  ::::..:: : ::::.: :::.:. ::::
CCDS64 HQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRV
      480       490       500       510       520       530        

           290       300       310        320       330       340  
pF1KB0 HTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGE
       :: :.::::.::::.::  :.::.:::.:.: . :::.::::.:.:.:.:: : .:::::
CCDS64 HTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGE
      540       550       560       570       580       590        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB0 RPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
       .:: : .:::.:...: ::.:  .:::::::.: .:::.: . : . .:::.:::..:: 
CCDS64 KPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYD
      600       610       620       630       640       650        

CCDS64 CAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
      660       670       680  

>--
 initn: 728 init1: 537 opt: 545  Z-score: 340.2  bits: 72.6 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 555; 43.0% identity (70.4% similar) in 186 aa overlap (202-386:149-334)

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB0 HTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGE
                                     : :  .::   . :. . .:.  ..: : :
CCDS64 GVPEGRRLPQSLSQEGDFTPAAMGLLRGPLGEKDLDCNGFDSRFSLSPNLMACQEIPTEE
      120       130       140       150       160       170        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB0 RPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYE
       ::.  .  :.:: .. .:  :  : :.: :  : ::::.:. . .:.:.: ::: :  . 
CCDS64 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNPDLIQRQIVHTGEASFM
      180       190       200       210       220       230        

             300       310        320       330       340       350
pF1KB0 CSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDC
       :..:::.::  : : ...: : .:. ..:..:::.:  .:..  :   :..:::: :..:
CCDS64 CDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNEC
      240       250       260       270       280       290        

              360       370       380       390       400          
pF1KB0 GKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK        
       ::.:..:::: :: . : .:.:::: .:::.::.::                        
CCDS64 GKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAF
      300       310       320       330       340       350        

CCDS64 RRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVS
      360       370       380       390       400       410        




402 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 17:24:28 2016 done: Sat Nov  5 17:24:29 2016
 Total Scan time:  2.720 Total Display time:  0.070

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com