seq1 = pF1KB0940.tfa, 1170 bp seq2 = pF1KB0940/gi568815596f_66337736.tfa (gi568815596f:66337736_66669105), 331370 bp >pF1KB0940 1170 >gi568815596f:66337736_66669105 (Chr2) 6-239 (99998-100228) 98% -> 240-381 (102108-102249) 100% -> 382-432 (102827-102877) 100% -> 433-483 (103679-103729) 100% -> 484-630 (105167-105313) 100% -> 631-742 (126374-126485) 100% -> 743-888 (174414-174559) 100% -> 889-965 (210208-210284) 100% -> 966-1024 (229718-229776) 100% -> 1025-1114 (230932-231021) 100% -> 1115-1170 (231315-231370) 100% 0 . : . : . : . : . : 6 GCAAAGGTACGACGATCTACCCCATTACGGGGGCATGGATGGAGTAGGCA ||--||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99998 GC AG TACGACGATCTACCCCATTACGGGGGCATGGATGGAGTAGGCA 50 . : . : . : . : . : 56 TCCCCTCCACGATGTATGGGGACCCGCATGCAGCCAGGTCCATGCAGCCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100045 TCCCCTCCACGATGTATGGGGACCCGCATGCAGCCAGGTCCATGCAGCCG 100 . : . : . : . : . : 106 GTCCACCACCTGAACCACGGGCCTCCTCTGCACTCGCATCAGTACCCGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100095 GTCCACCACCTGAACCACGGGCCTCCTCTGCACTCGCATCAGTACCCGCA 150 . : . : . : . : . : 156 CACAGCTCATACCAACGCCATGGCCCCCAGCATGGGCTCCTCTGTCAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100145 CACAGCTCATACCAACGCCATGGCCCCCAGCATGGGCTCCTCTGTCAATG 200 . : . : . : . : . : 206 ACGCTTTAAAGAGAGATAAAGATGCCATTTATGG ACACCCC ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 100195 ACGCTTTAAAGAGAGATAAAGATGCCATTTATGGGTA...CAGACACCCC 250 . : . : . : . : . : 247 CTCTTCCCTCTCTTAGCACTGATTTTTGAGAAATGTGAATTAGCTACTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102115 CTCTTCCCTCTCTTAGCACTGATTTTTGAGAAATGTGAATTAGCTACTTG 300 . : . : . : . : . : 297 TACCCCCCGCGAGCCGGGGGTGGCGGGCGGGGACGTCTGCTCGTCAGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102165 TACCCCCCGCGAGCCGGGGGTGGCGGGCGGGGACGTCTGCTCGTCAGAGT 350 . : . : . : . : . : 347 CATTCAATGAAGATATAGCCGTGTTCGCCAAACAG ATTCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||| 102215 CATTCAATGAAGATATAGCCGTGTTCGCCAAACAGGTC...TAGATTCGC 400 . : . : . : . : . : 388 GCAGAAAAACCTCTATTTTCTTCTAATCCAGAACTGGATAACTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 102833 GCAGAAAAACCTCTATTTTCTTCTAATCCAGAACTGGATAACTTGGTA.. 450 . : . : . : . : . : 433 ATGATTCAAGCCATACAAGTATTAAGGTTTCATCTATTGGAATTAG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 102883 .CAGATGATTCAAGCCATACAAGTATTAAGGTTTCATCTATTGGAATTAG 500 . : . : . : . : . : 479 AGAAG GTACACGAATTATGTGACAATTTCTGCCACCGGTAT |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 103725 AGAAGGTA...TAGGTACACGAATTATGTGACAATTTCTGCCACCGGTAT 550 . : . : . : . : . : 520 ATTAGCTGTTTGAAAGGGAAAATGCCTATCGATTTGGTGATAGACGATAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105203 ATTAGCTGTTTGAAAGGGAAAATGCCTATCGATTTGGTGATAGACGATAG 600 . : . : . : . : . : 570 AGAAGGAGGATCAAAATCAGACAGTGAAGATATAACAAGATCAGCAAATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105253 AGAAGGAGGATCAAAATCAGACAGTGAAGATATAACAAGATCAGCAAATC 650 . : . : . : . : . : 620 TAACTGACCAG CCCTCTTGGAACAGAGATCATGATGACACG |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| 105303 TAACTGACCAGGTA...CAGCCCTCTTGGAACAGAGATCATGATGACACG 700 . : . : . : . : . : 661 GCATCTACTCGTTCAGGAGGAACCCCAGGCCCTTCCAGCGGTGGCCACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 126404 GCATCTACTCGTTCAGGAGGAACCCCAGGCCCTTCCAGCGGTGGCCACAC 750 . : . : . : . : . : 711 GTCACACAGTGGGGACAACAGCAGTGAGCAAG GTGATGGCT ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 126454 GTCACACAGTGGGGACAACAGCAGTGAGCAAGGTA...CAGGTGATGGCT 800 . : . : . : . : . : 752 TGGACAACAGTGTAGCTTCCCCCAGCACAGGTGACGATGATGACCCTGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174423 TGGACAACAGTGTAGCTTCCCCCAGCACAGGTGACGATGATGACCCTGAT 850 . : . : . : . : . : 802 AAGGACAAAAAGCGTCACAAAAAGCGTGGCATCTTTCCCAAAGTAGCCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174473 AAGGACAAAAAGCGTCACAAAAAGCGTGGCATCTTTCCCAAAGTAGCCAC 900 . : . : . : . : . : 852 AAATATCATGAGGGCGTGGCTGTTCCAGCATCTAACA CACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 174523 AAATATCATGAGGGCGTGGCTGTTCCAGCATCTAACAGTA...CAGCACC 950 . : . : . : . : . : 893 CTTACCCTTCTGAAGAACAGAAAAAGCAGTTGGCACAAGACACGGGACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 210212 CTTACCCTTCTGAAGAACAGAAAAAGCAGTTGGCACAAGACACGGGACTC 1000 . : . : . : . : . : 943 ACCATCCTTCAAGTGAACAATTG GTTTATTAATGCCCGGAG |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 210262 ACCATCCTTCAAGTGAACAATTGGTA...CAGGTTTATTAATGCCCGGAG 1050 . : . : . : . : . : 984 AAGAATAGTGCAGCCCATGATAGACCAGTCCAACCGAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 229736 AAGAATAGTGCAGCCCATGATAGACCAGTCCAACCGAGCAGGCA...TAG 1100 . : . : . : . : . : 1025 TAAGTCAAGGAACACCTTATAATCCTGATGGACAGCCCATGGGAGGTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 230932 TAAGTCAAGGAACACCTTATAATCCTGATGGACAGCCCATGGGAGGTTTC 1150 . : . : . : . : . : 1075 GTAATGGACGGTCAGCAACATATGGGAATTAGAGCACCAG G ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| 230982 GTAATGGACGGTCAGCAACATATGGGAATTAGAGCACCAGGTA...TAGG 1200 . : . : . : . : . : 1116 ACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGAGGGGCAGTGGCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231316 ACCTATGAGTGGAATGGGCATGAATATGGGCATGGAGGGGCAGTGGCACT 1250 . 1166 ACATG ||||| 231366 ACATG