Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0930
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0930, 371 aa
1>>>pF1KB0930 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9282+/-0.00113; mu= 16.4603+/- 0.067
mean_var=220.4397+/-43.186, 0's: 0 Z-trim(111.7): 961 B-trim: 65 in 1/50
Lambda= 0.086383
statistics sampled from 11527 (12591) to 11527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47932.1 ZNF707 gene_id:286075|Hs108|chr8 ( 371) 2697 349.0 4e-96
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CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 595) 885 123.5 4.9e-28
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CCDS10686.1 ZNF689 gene_id:115509|Hs108|chr16 ( 500) 881 122.9 6.3e-28
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 869 121.2 1.6e-27
CCDS46027.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 412) 867 121.0 1.9e-27
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CCDS12633.1 ZNF221 gene_id:7638|Hs108|chr19 ( 617) 830 116.6 5.7e-26
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 822 115.7 1.2e-25
CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 538) 805 113.4 4.6e-25
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CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 800 113.0 8.5e-25
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 797 112.4 8.9e-25
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CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 797 112.5 1e-24
CCDS54309.1 ZNF610 gene_id:162963|Hs108|chr19 ( 419) 794 111.9 1.1e-24
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 793 112.0 1.4e-24
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CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 793 112.1 1.5e-24
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 793 112.1 1.5e-24
CCDS54330.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 390) 789 111.2 1.6e-24
CCDS42534.1 ZNF682 gene_id:91120|Hs108|chr19 ( 466) 788 111.2 1.9e-24
CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 786 111.3 2.8e-24
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 784 110.8 2.8e-24
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 786 111.3 2.8e-24
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 785 111.1 2.9e-24
CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 ( 498) 782 110.5 3.2e-24
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 781 110.4 3.7e-24
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 780 110.3 3.9e-24
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 781 110.6 4.2e-24
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CCDS10914.2 ZFP1 gene_id:162239|Hs108|chr16 ( 407) 774 109.4 5.8e-24
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 774 109.4 6.1e-24
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 775 109.9 6.9e-24
>>CCDS47932.1 ZNF707 gene_id:286075|Hs108|chr8 (371 aa)
initn: 2697 init1: 2697 opt: 2697 Z-score: 1839.2 bits: 349.0 E(32554): 4e-96
Smith-Waterman score: 2697; 99.7% identity (99.7% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MDMAQEPVTFRDVAIYFSREEWACLEPSQRALYRDVMLDNFSSVAALGFCSPRPDLVSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDMAQEPVTFRDVAIYFSREEWACLEPSQRALYRDVMLDNFSSVAALGFCSPRPDLVSRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 EQWEEPWVEDRERPEFQAVQRGPRPGARKSADPKRHCDHPAWAHKKTHVRRERAREGSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQWEEPWVEDRERPEFQAVQRGPRPGARKSADPKRPCDHPAWAHKKTHVRRERAREGSSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 RKGFRLDTDDGQLPRAAPERTDAKPTAFPCQVLTQRCGRRPGRRERRKQRAVELSFICGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKGFRLDTDDGQLPRAAPERTDAKPTAFPCQVLTQRCGRRPGRRERRKQRAVELSFICGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 CGKALSCHSRLLAHQTVHTGTKAFECPECGQTFRWASNLQRHQKNHTREKPFCCEACGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CGKALSCHSRLLAHQTVHTGTKAFECPECGQTFRWASNLQRHQKNHTREKPFCCEACGQA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 FSLKDRLAQHRKVHTEHRPYSCGDCGKAFKQKSNLLRHQLVHTGERPFYCADCGKAFRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FSLKDRLAQHRKVHTEHRPYSCGDCGKAFKQKSNLLRHQLVHTGERPFYCADCGKAFRTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ENLSHHQRVHSGEKPYTCAECGKSFRWPKGFSIHRRLHLTKRFYECGHCGKGFRHLGFFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ENLSHHQRVHSGEKPYTCAECGKSFRWPKGFSIHRRLHLTKRFYECGHCGKGFRHLGFFT
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB0 RHQRTHRHGEV
:::::::::::
CCDS47 RHQRTHRHGEV
370
>>CCDS59177.1 ZFP92 gene_id:139735|Hs108|chrX (416 aa)
initn: 1385 init1: 729 opt: 964 Z-score: 671.5 bits: 133.1 E(32554): 4.4e-31
Smith-Waterman score: 964; 39.6% identity (65.6% similar) in 366 aa overlap (7-366:13-370)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MDMAQEPVTFRDVAIYFSREEWACLEPSQRALYRDVMLDNFSSVAALGFCSPRP
::.:.::..::.. :: :. :..::. :::.:.: ...::: .:
CCDS59 MAAILLTTRPKVPVSFEDVSVYFTKTEWKLLDLRQKVLYKRVMLENYSHLVSLGFSFSKP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 DLVSRLEQWEEPWVEDRERPEFQA-VQRGPRPGARKSADPKRHCDHPAWAHKKTHVRRER
:.:.::. : ::: : : : .. : : .. :.. ..: . . .. .
CCDS59 HLISQLERGEGPWVADIPRTWATAGLHIGDRTQSKTSTSTQKHSGRQLPGADPQGGKEGQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 AREGSSFRKGFRLDTDDGQLPRAAPERTDAKPTAFPCQVLTQRCGRRPGRRERR-KQRAV
: ..: ...: . :: :.:. : . . : :.::. .: :.: .
CCDS59 AARSSVLQRGAQ---GLGQSSAAGPQ----GPKGAEKRYLCQQCGKAFSRSSNLIKHRII
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB0 ---ELSFICGTCGKALSCHSRLLAHQTVHTGTKAFECPECGQTFRWASNLQRHQKNHTRE
: . : ::: . :: :: .:.: : . ::::..:: .::: .:: :. :
CCDS59 HSGEKPYACPECGKLFRRSFALLEHQRIHSGEKPYACPECSKTFTRSSNLIKHQVIHSGE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 KPFCCEACGQAFSLKDRLAQHRKVHTEHRPYSCGDCGKAFKQKSNLLRHQLVHTGERPFY
.:: : ::. : . : .: .::. .:::.: .:::::...:::..:: .: ::.:.
CCDS59 RPFACGDCGKLFRRSFALLEHARVHSGERPYACPECGKAFSRSSNLIEHQRTHRGEKPYA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 CADCGKAFRTKENLSHHQRVHSGEKPYTCAECGKSFRWPKGFSIHRRLHLTKRFYECGHC
:..:.:::. .: :::: ::::.:..: ::::.:: .:.: :::.: .. :::. :
CCDS59 CGQCAKAFKGVSQLIHHQRSHSGERPFACRECGKAFRGRSGLSQHRRVHSGEKPYECSDC
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350 360 370
pF1KB0 GKGF-RHLGFFTRHQRTHRHGEV
::.: :. ..: .:: .:
CCDS59 GKAFGRRANLF-KHQAVHGARRPAKAETARRLAGPGSTGPGSAVAATSPPRPSTAARPSR
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>>CCDS12842.2 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 (485 aa)
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Smith-Waterman score: 924; 38.0% identity (66.1% similar) in 363 aa overlap (8-366:23-376)
10 20 30 40
pF1KB0 MDMAQEPVTFRDVAIYFSREEWACLEPSQRALYRDVMLDNFSSVA
..:.:::. :.:::: :. ::..::..:::.:. ...
CCDS12 MKNATIVMSVRREQGSSSGEGSLSFEDVAVGFTREEWQFLDQSQKVLYKEVMLENYINLV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB0 ALGFCSPRPDLVSRLEQWEEPWVEDRERPEFQAVQRGPRPGARKSADPKRHCDHPAWAHK
..:. . .:: . .::: : : . : . . : .:. : : .....
CCDS12 SIGYRGTKPDSLFKLEQGEPPGIA--EGAAHSQICPGFVIQSRRYAG-KDSDAFGGYGRS
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 KTHVRRERAREGSSFRKGFRLDTDDGQLPRAAPERTDAKPTAFPCQVLTQRCGRRPGRRE
:..:... : .... . .. .:: . .:: :.: ::: .:.
CCDS12 CLHIKRDKTLTGVKYHRCVKPSSPKSQLNDLQKICAGGKP--HECSV----CGRAFSRKA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 R--RKQRAV--ELSFICGTCGKALSCHSRLLAHQTVHTGTKAFECPECGQTFRWASNLQR
. ..::. : :: :::.. . .: :: .::: : :: :::..: :.:.
CCDS12 QLIQHQRTERGEKPHGCGECGKTFMRKIQLTEHQRTHTGEKPHECSECGKAFSRKSQLMV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 HQKNHTREKPFCCEACGQAFSLKDRLAQHRKVHTEHRPYSCGDCGKAFKQKSNLLRHQLV
::..:: :::. : ::.::: : :: .:.. :: .. :.:. :::::.::. : :: .
CCDS12 HQRTHTGEKPYRCSKCGKAFSRKCRLNRHQRSHTGEKLYGCSVCGKAFSQKAYLTAHQRL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 HTGERPFYCADCGKAFRTKENLSHHQRVHSGEKPYTCAECGKSFRWPKGFSIHRRLHLTK
:::..:. :.:::..: : .:..:::.:.::::: :.:: :.:: . . :.: : .
CCDS12 HTGDKPYKCSDCGRTFYFKSDLTRHQRIHTGEKPYECSECEKAFRSKSKLIQHQRTHTGE
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB0 RFYECGHCGKGFRHLGFFTRHQRTHRHGEV
: : : .:::.: :.. . .:..::
CCDS12 RPYSCRECGKAFAHMSVLIKHEKTHIRETAINSLTVEKPSSRSHTSLYMSELIQEQKTVN
360 370 380 390 400 410
>>CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 (536 aa)
initn: 4472 init1: 713 opt: 921 Z-score: 641.5 bits: 127.9 E(32554): 2.1e-29
Smith-Waterman score: 929; 36.2% identity (65.4% similar) in 381 aa overlap (7-370:3-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MDMAQEPVTFRDVAIYFSREEWACLEPSQRALYRDVMLDNFSSVAALGFCSPRPDLVSRL
:. :::::: :: ::: ::. .:: :::.:::.:. ... ::. .:::.. :
CCDS54 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGIVVSKPDLITCL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB0 EQWEEPWVEDRERPEFQAVQRGPRPGARKSADPKRHCDHPA---W-------AHKKTHVR
:: ..: . ... :.:. :.: : : . .:. .:
CCDS54 EQGKKPLTMKKHE---------------MVANPSVTCSHFARDLWPEQSIKDSFQKVTLR
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB0 R--ERAREGSSFRKGFRLDTDDGQLPRAAPER-----TDAKPTAFPCQVLTQRCGRRPGR
: . .... .:.:: . ..:. .. . . . : .. : :. .. . .
CCDS54 RYENYGHDNLQFKKGCE-SVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKYVKVIHKFSNS
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 RERRKQRAVELSFICGTCGKALSCHSRLLAHQTVHTGTKAFECPECGQTFRWASNLQRHQ
... ... . : : ::::.. : : .:. .::: : :.: :::..: :.:.: :.
CCDS54 NRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAFNWSSHLTTHK
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 KNHTREKPFCCEACGQAFSLKDRLAQHRKVHTEHRPYSCGDCGKAFKQKSNLLRHQLVHT
. :: :: . :: ::.::: . :. :. .:. ..::.: .::::::..::: :...::
CCDS54 RIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSSNLTTHKIIHT
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 GERPFYCADCGKAFRTKENLSHHQRVHSGEKPYTCAECGKSFRWPKGFSIHRRLHLTKRF
::.:. : .:::::. . :. :. .::::::: : ::::.:. :. .. :.:.: ..
CCDS54 GEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTTHKRIHTGEKP
290 300 310 320 330 340
350 360 370
pF1KB0 YECGHCGKGFRHLGFFTRHQRTHRHGEV
:.: .::..:.... .: :. : ::
CCDS54 YKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHS-GEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYKC
350 360 370 380 390
>--
initn: 1153 init1: 584 opt: 623 Z-score: 440.8 bits: 90.8 E(32554): 3.1e-18
Smith-Waterman score: 623; 44.0% identity (76.2% similar) in 168 aa overlap (176-343:369-536)
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 TAFPCQVLTQRCGRRPGRRERRKQRAVELSFICGTCGKALSCHSRLLAHQTVHTGTKAFE
. : ::::.. :.: .:. .::: : ..
CCDS54 KPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRIHTGEKPYK
340 350 360 370 380 390
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 CPECGQTFRWASNLQRHQKNHTREKPFCCEACGQAFSLKDRLAQHRKVHTEHRPYSCGDC
: :::..:...:.: :. :: ..:: :: ::.::. . :. :...:: ..::.: .:
CCDS54 CEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGEKPYKCEEC
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 GKAFKQKSNLLRHQLVHTGERPFYCADCGKAFRTKENLSHHQRVHSGEKPYTCAECGKSF
::::...:.: :. .::::.:. : :::::. . :..:.:.:.::::: : ::::.:
CCDS54 GKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEECGKGF
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CCDS45 YLSVHTRMHNRQM
420
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CCDS42 YLSVHTRMHNRQM
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CCDS12 LNVHKRIHTGEKLYECATCGQVLSRLSTLKSHMRTHT-GEKPYVCQECGRAFSEPSSLRK
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CCDS12 HARTHSGKKPYACQECGRAFGQSSHLIVHVRTHSAGRPYQCNQCEKAFRHSSSLTVHKRT
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CCDS42 AFHLSSHLTTHKILHT-GEKPYRCRECGKAFNHSTTLFSHEKIHTGEKPYKCDECGKTFT
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CCDS32 KIFPCDKYVKVFHKFLNANRHKTRHTGKKPFKCKKCGKSFCMLLHLSQHKRIHIRENSYQ
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CCDS32 CEECGKAFKWFSTLTRHKRIHTGEKPFKCEECGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEEC
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CCDS32 NRFSYLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHT-GEKPYKCEVCGKAFNES
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CCDS32 KSYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEVCGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYK
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CCDS32 GKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKSYKCEECGKAFNQSSTLTKHRKIHTRQKPYNCEECDNTF
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371 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sat Nov 5 17:18:35 2016 done: Sat Nov 5 17:18:36 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]