Result of FASTA (ccds) for pF1KB8560
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8560, 910 aa
  1>>>pF1KB8560 910 - 910 aa - 910 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1039+/- 0.001; mu= 22.2717+/- 0.060
 mean_var=65.5904+/-12.716, 0's: 0 Z-trim(104.1): 61  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.158363
 statistics sampled from 7688 (7749) to 7688 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.238), width:  16
 Scan time:  4.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8         ( 910) 6121 1408.0       0
CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8        ( 726) 4889 1126.5       0
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1           ( 747) 1045 248.2 4.2e-65
CCDS56546.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8        ( 117)  697 168.2   8e-42
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  485 120.5 2.4e-26
CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX        (1250)  476 118.4 8.6e-26
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1058)  474 117.9   1e-25
CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10          (1849)  476 118.5 1.2e-25
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052)  426 106.9 2.1e-22
CCDS35072.1 ERCC6L2 gene_id:375748|Hs108|chr9      ( 712)  404 101.8 4.9e-21
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 700)  391 98.8 3.8e-20
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 714)  391 98.8 3.8e-20
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 740)  391 98.8   4e-20
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10          ( 838)  391 98.8 4.4e-20
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905)  395 100.0 4.5e-20
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912)  395 100.0 4.5e-20
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 884)  391 98.9 4.6e-20
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  394 99.9 8.1e-20
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966)  391 99.1 8.7e-20
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000)  391 99.1 8.8e-20
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059)  391 99.1 9.1e-20
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954)  390 98.8   1e-19
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710)  387 98.1 1.5e-19
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828)  386 97.9 1.8e-19
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302)  387 98.2 1.9e-19
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581)  387 98.2   2e-19
CCDS892.1 TTF2 gene_id:8458|Hs108|chr1             (1162)  381 96.6 2.8e-19
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613)  377 95.8 6.8e-19
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614)  377 95.8 6.8e-19
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616)  377 95.8 6.8e-19
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617)  377 95.8 6.8e-19
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 616)  369 93.7 1.1e-18
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 693)  369 93.8 1.2e-18
CCDS58914.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4      ( 596)  368 93.5 1.3e-18
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 797)  369 93.8 1.4e-18
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  372 94.7 1.5e-18
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1            ( 897)  369 93.8 1.5e-18
CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3       (1467)  370 94.2 1.9e-18
CCDS3639.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4       (1026)  368 93.6   2e-18
CCDS47101.1 SMARCAD1 gene_id:56916|Hs108|chr4      (1028)  368 93.6   2e-18
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647)  370 94.2 2.1e-18
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881)  367 93.7 5.3e-18
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897)  367 93.7 5.3e-18
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715)  364 93.0 8.2e-18
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997)  363 92.8   1e-17
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  351 89.9   4e-17
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572)  351 89.9 4.1e-17
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590)  351 89.9 4.1e-17
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054)  316 81.8 7.6e-15
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070)  316 81.8 7.7e-15


>>CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8              (910 aa)
 initn: 6121 init1: 6121 opt: 6121  Z-score: 7548.7  bits: 1408.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6121; 100.0% identity (100.0% similar) in 910 aa overlap (1-910:1-910)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVHSAPKEVAVSKEQEEKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVHSAPKEVAVSKEQEEKSD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 SLVKYFSVVWCKPSKKKHKKWEGDAVLIVKGKSFILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SLVKYFSVVWCKPSKKKHKKWEGDAVLIVKGKSFILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 GQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 VTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 KNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 ILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 PKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 SIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 EKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 KAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 KAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 RQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 RQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 SLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIF
              850       860       870       880       890       900

              910
pF1KB8 QNITTQATGT
       ::::::::::
CCDS62 QNITTQATGT
              910

>>CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8             (726 aa)
 initn: 4889 init1: 4889 opt: 4889  Z-score: 6028.9  bits: 1126.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4889; 100.0% identity (100.0% similar) in 726 aa overlap (185-910:1-726)

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB8 ILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEEGQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75                               MICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGS
                                             10        20        30

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB8 TAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSSKENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSSKENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQW
               40        50        60        70        80        90

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB8 VFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTL
              100       110       120       130       140       150

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB8 QCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQDHKV
              160       170       180       190       200       210

          400       410       420       430       440       450    
pF1KB8 EEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEK
              220       230       240       250       260       270

          460       470       480       490       500       510    
pF1KB8 RIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGER
              280       290       300       310       320       330

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB8 RAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQG
              340       350       360       370       380       390

          580       590       600       610       620       630    
pF1KB8 LLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPL
              400       410       420       430       440       450

          640       650       660       670       680       690    
pF1KB8 LFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQT
              460       470       480       490       500       510

          700       710       720       730       740       750    
pF1KB8 PISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRV
              520       530       540       550       560       570

          760       770       780       790       800       810    
pF1KB8 WRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFT
              580       590       600       610       620       630

          820       830       840       850       860       870    
pF1KB8 LHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQW
              640       650       660       670       680       690

          880       890       900       910
pF1KB8 KHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT
              700       710       720      

>>CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1                (747 aa)
 initn: 1572 init1: 554 opt: 1045  Z-score: 1282.3  bits: 248.2 E(32554): 4.2e-65
Smith-Waterman score: 1673; 43.1% identity (66.8% similar) in 708 aa overlap (218-901:68-736)

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB8 GKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKCFSNPFKSVCKPSSKE---NR
                                     :.     :. .:.::: :  :. .    .:
CCDS53 SSETQIQECFLSPFRKPLSQLTNQPPCLDSSQHEAFIRSILSKPFK-VPIPNYQGPLGSR
        40        50        60        70        80         90      

          250          260         270        280       290        
pF1KB8 QNDFQNCKPR---HDPYTPNSLVM--PRPDKNH-QWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRP
          ..    :   :::   ..::.  : : . : :  ..:. .: : ::.:: :   :::
CCDS53 ALGLKRAGVRRALHDPLEKDALVLYEPPPLSAHDQLKLDKEKLP-VHVVVDPILSKVLRP
        100       110       120       130       140        150     

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB8 HQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKT
       ::.::. ::.::: . :. :  : :.:::::::::::::.:.:::  :.:   :: : :.
CCDS53 HQREGVKFLWECVTSRRIPGSHGCIMADEMGLGKTLQCITLMWTLLRQSPEC-KPEIDKA
         160       170       180       190       200        210    

      360       370       380       390             400            
pF1KB8 LIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFTVDQ------DHKVEEFIKS----IFYSVLII
       ..:.:.:::.:: .:  ::::. ::. ...:       :.:.: :...    .   .:::
CCDS53 VVVSPSSLVKNWYNEVGKWLGG-RIQPLAIDGGSKDEIDQKLEGFMNQRGARVSSPILII
          220       230        240       250       260       270   

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB8 SYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQ
       ::: .   .  ... .  :.:::::::::::  .:  :: ::.  .:....:::::::: 
CCDS53 SYETFRLHVGVLQKGSVGLVICDEGHRLKNSENQTYQALDSLNTSRRVLISGTPIQNDLL
           280       290       300       310       320       330   

      470       480       490       500       510       520        
pF1KB8 EFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFIL
       :.:.:. ::: ::::.   ..: .: ::. .:. .::: ...:::.:  ::: ...  ..
CCDS53 EYFSLVHFVNSGILGTAHEFKKHFELPILKGRDAAASEADRQLGEERLRELTSIVNRCLI
           340       350       360       370       380       390   

      530       540       550       560        570       580       
pF1KB8 RRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLL-NSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGA
       :::..:..:::: :::.:: ::   :: :::...: ... ..  :.: .  :  :  : .
CCDS53 RRTSDILSKYLPVKIEQVVCCRLTPLQTELYKRFLRQAKPAEELLEGKMSVSS-LSSITS
           400       410       420       430       440        450  

       590       600       610       620       630       640       
pF1KB8 LKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVL
       :::::::: :...     .:       ::.. . : :..::  :.   .  . :::. ::
CCDS53 LKKLCNHPALIYD-----KCV------EEEDGFVGALDLFPPGYSSKALEPQLSGKMLVL
            460                  470       480       490       500 

       650       660       670       680       690       700       
pF1KB8 SKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFN
       . .::: .  : ..::::::::::::......:. . : :.::::   :..: ..:. ::
CCDS53 DYILAVTRS-RSSDKVVLVSNYTQTLDLFEKLCRARRYLYVRLDGTMSIKKRAKVVERFN
             510        520       530       540       550       560

       710       720       730       740       750       760       
pF1KB8 SQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYR
       :  :  :.:.::::::: ::::::...:...: :::::.: :::.::::::::   .:::
CCDS53 SPSSPDFVFMLSSKAGGCGLNLIGANRLVMFDPDWNPANDEQAMARVWRDGQKKTCYIYR
              570       580       590       600       610       620

       770       780       790       800       810       820       
pF1KB8 LLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLL
       ::..:::::::.:::  :..: . :::  .  :. .::. :::.:: : :.:   ::: :
CCDS53 LLSAGTIEEKIFQRQSHKKALSSCVVDEEQDVER-HFSLGELKELFILDEASLSDTHDRL
              630       640       650        660       670         

       830       840       850       860       870       880       
pF1KB8 DCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDP
        :.             . . ::  :. :  . :.       :.:  :.: . :. .: : 
CCDS53 HCR-------------RCVNSR--QIRPPPDGSDCT-----SDLAGWNHCT-DKWGLRDE
     680                      690       700            710         

       890           900       910  
pF1KB8 FLERI----TENVSFIFQNITTQATGT  
        :.      .  ..:.:.           
CCDS53 VLQAAWDAASTAITFVFHQRSHEEQRGLR
      720       730       740       

>>CCDS56546.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8             (117 aa)
 initn: 697 init1: 697 opt: 697  Z-score: 864.3  bits: 168.2 E(32554): 8e-42
Smith-Waterman score: 697; 98.1% identity (100.0% similar) in 104 aa overlap (1-104:1-104)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MRRSAAPSQLQGNSFKKPKFIPPGRSNPGLNEEITKLNPDIKLFEGVAINNTFLPSQNDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVHSAPKEVAVSKEQEEKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..                
CCDS56 RICSLNLPSEESTREINNRDNCSGKYCFEAPTLATLDPPHTVQTWMRRHRLVPVHYR   
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 SLVKYFSVVWCKPSKKKHKKWEGDAVLIVKGKSFILKNLEGKDIGRGIGYKFKELEKIEE

>>CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10               (1493 aa)
 initn: 755 init1: 316 opt: 485  Z-score: 586.5  bits: 120.5 E(32554): 2.4e-26
Smith-Waterman score: 944; 34.6% identity (62.1% similar) in 541 aa overlap (288-815:499-1007)

       260       270       280       290       300         310     
pF1KB8 YTPNSLVMPRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYE--CVMGMR
                                     .  .:  .:  .:. :. .:.:  :     
CCDS72 NKLRLQDKEKRLKLEDDSEESDAEFDEGFKVPGFLFKKLFKYQQTGVRWLWELHC-----
      470       480       490       500       510       520        

         320       330       340            350       360       370
pF1KB8 MNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIWTL-----QCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNW
          . :.::.::::::::.: :...  :     . .:       .  :.:: : .....:
CCDS72 --QQAGGILGDEMGLGKTIQIIAFLAGLSYSKIRTRGSNYRFEGLGPTVIVCPTTVMHQW
             530       540       550       560       570       580 

              380         390       400         410       420      
pF1KB8 KKEFQKWLGSERIKIF--TVDQDHKVEEFIKSI--FYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFD
        :::. :    :. :.  : .  :: :..:...   ...:: :: ..    :.:.   . 
CCDS72 VKEFHTWWPPFRVAILHETGSYTHKKEKLIRDVAHCHGILITSYSYIRLMQDDISRYDWH
             590       600       610       620       630       640 

        430       440       450       460       470       480      
pF1KB8 LLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLS
        .: ::::...:    .: :  ..   .::::.:.:.::.:.:...:.::. :: ::.: 
CCDS72 YVILDEGHKIRNPNAAVTLACKQFRTPHRIILSGSPMQNNLRELWSLFDFIFPGKLGTLP
             650       660       670       680       690       700 

        490       500       510       520       530         540    
pF1KB8 SYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYL--PPKIE
        . . .  :: ..   .::  . . . . :  :    . ..::: .  ..  :  : : :
CCDS72 VFMEQFSVPITMGGYSNASPVQVKTAYKCACVLRDTINPYLLRRMKSDVKMSLSLPDKNE
             710       720       730       740       750       760 

          550       560       570       580       590       600    
pF1KB8 NVVFCRPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKE
       .:.:::    : ..:.....:. :   :.: ..    ::   ::.:.:::: :.  :   
CCDS72 QVLFCRLTDEQHKVYQNFVDSKEVYRILNGEMQIFSGLI---ALRKICNHPDLF--SGGP
             770       780       790       800          810        

          610       620       630       640       650       660    
pF1KB8 KECSSTCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVV
       :. ..  : . :.. . :                :.:::. :. .:: . :  .  ..:.
CCDS72 KNLKGLPDDELEEDQF-GYW--------------KRSGKMIVVESLLKIWH--KQGQRVL
        820       830                      840       850           

          670       680       690       700       710       720    
pF1KB8 LVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGG
       : :.  : :.::.   . . :.: ..:: : :..:: ..  .: . .:.:.:::....::
CCDS72 LFSQSRQMLDILEVFLRAQKYTYLKMDGTTTIASRQPLITRYN-EDTSIFVFLLTTRVGG
     860       870       880       890       900        910        

          730       740       750       760       770       780    
pF1KB8 VGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQIS
       .:.:: :......:: ::::.:: ::  :.:: :::  : .:::::.::::::::.::: 
CCDS72 LGVNLTGANRVVIYDPDWNPSTDTQARERAWRIGQKKQVTVYRLLTAGTIEEKIYHRQIF
      920       930       940       950       960       970        

          790       800       810       820       830       840    
pF1KB8 KQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEK
       :: : . :.   :  .   :. ..: .::::                             
CCDS72 KQFLTNRVLKDPKQRRF--FKSNDLYELFTLTSPDASQSTETSAIFAGTGSDVQTPKCHL
      980       990        1000      1010      1020      1030      

          850       860       870       880       890       900    
pF1KB8 FIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNIT
                                                                   
CCDS72 KRRIQPAFGADHDVPKRKKFPASNISVNDATSSEEKSEAKGAEVNAVTSNRSDPLKDDPH
       1040      1050      1060      1070      1080      1090      

>>CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX             (1250 aa)
 initn: 907 init1: 333 opt: 476  Z-score: 576.5  bits: 118.4 E(32554): 8.6e-26
Smith-Waterman score: 934; 32.9% identity (63.7% similar) in 614 aa overlap (260-824:52-639)

     230       240       250       260       270          280      
pF1KB8 NPFKSVCKPSSKENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPRPDKNHQWVFN---KNCFPLVDV
                                     ::  :. : .: .. . .   ..   ..::
CCDS35 LRYVKEAKEATKNGDLEEAFKLFNLAKDIFPNEKVLSRIQKIQEALEELAEQGDDEFTDV
              30        40        50        60        70        80 

        290            300       310       320       330       340 
pF1KB8 VIDPYLVY-----HLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCISLIW
         .  :.:     .:  :::::: :::    ..  .:: :.::::.::::::.: :... 
CCDS35 CNSGLLLYRELHNQLFEHQKEGIAFLY----SLYRDGRKGGILADDMGLGKTVQIIAFL-
              90       100           110       120       130       

             350       360       370       380        390          
pF1KB8 TLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKIFT-VDQDHKVEEFIK-
           .: . .. .....:.. : .:.:.: ::: ::  . :.: :   ..:...... . 
CCDS35 ----SGMFDAS-LVNHVLLIMPTNLINTWVKEFIKWTPGMRVKTFHGPSKDERTRNLNRI
            140        150       160       170       180       190 

     400       410       420            430       440       450    
pF1KB8 SIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIK-----FDLLICDEGHRLKNSAIKTTTALISLSCEK
       .   .:.: .:.::. . .:.....     .: .: ::.:..:.:. :..    ..   .
CCDS35 QQRNGVIITTYQMLINNWQQLSSFRGQEFVWDYVILDEAHKIKTSSTKSAICARAIPASN
             200       210       220       230       240       250 

          460       470       480        490       500       510   
pF1KB8 RIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPG-ILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSASEEEKELGE
       :..::::::::.:::...:.::.  : .::.:....  ::.::  .:: .:.  :: :: 
CCDS35 RLLLTGTPIQNNLQELWSLFDFACQGSLLGTLKTFKMEYENPITRAREKDATPGEKALGF
             260       270       280       290       300       310 

           520       530                            540            
pF1KB8 RRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKY---------------------LPP---KIENVVFC
       . . .:  .   ..::::.: ..:                      .:    : . ... 
CCDS35 KISENLMAIIKPYFLRRTKEDVQKKKSSNPEARLNEKNPDVDAICEMPSLSRKNDLIIWI
             320       330       340       350       360       370 

     550       560       570       580       590       600         
pF1KB8 RPGALQIELYRKLLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECS-
       :   :: :.:::... . ..   . :.:.   :  .:.:::::.:: ::    . . :  
CCDS35 RLVPLQEEIYRKFVSLDHIK---ELLMETRSPLAELGVLKKLCDHPRLL----SARACCL
             380       390          400       410           420    

            610       620       630       640       650       660  
pF1KB8 ------STCDKNEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEK
             :. : :: ..    .  .  .  . :.   .::::.  :  ::   ..::   .
CCDS35 LNLGTFSAQDGNEGED-SPDVDHIDQVTDDTLM---EESGKMIFLMDLL---KRLRDEGH
          430       440        450          460          470       

             670       680       690        700       710       720
pF1KB8 VVLV-SNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQ-TPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSS
        .:: :.  : :::.... : . .   :.::  : . .:.. .. :. :.... .:::..
CCDS35 QTLVFSQSRQILNIIERLLKNRHFKTLRIDGTVTHLLEREKRINLFQ-QNKDYSVFLLTT
       480       490       500       510       520        530      

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 KAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQ
       ..:::::.: ........: .:::::: ::..::.: :::  : .:::.: ::.:::::.
CCDS35 QVGGVGLTLTAATRVVIFDPSWNPATDAQAVDRVYRIGQKENVVVYRLITCGTVEEKIYR
        540       550       560       570       580       590      

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 RQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGD
       ::. :..:   ..   : .    :: .::..:::... .. ::.                
CCDS35 RQVFKDSLIRQTTG-EKKNPFRYFSKQELRELFTIEDLQNSVTQLQLQSLHAAQRKSDIK
        600       610        620       630       640       650     

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 SLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIF
                                                                   
CCDS35 LDEHIAYLQSLGIAGISDHDLMYTCDLSVKEELDVVEESHYIQQRVQKAQFLVEFESQNK
         660       670       680       690       700       710     

>>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX             (1058 aa)
 initn: 901 init1: 431 opt: 474  Z-score: 575.1  bits: 117.9 E(32554): 1e-25
Smith-Waterman score: 896; 32.5% identity (62.1% similar) in 593 aa overlap (296-880:183-720)

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB8 PRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILA
                                     :: .: .:. .:    ...  ::  : :::
CCDS76 EDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWL----ISLYENGVNG-ILA
            160       170       180       190           200        

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB8 DEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKI
       :::::::::: :.:.  :.    : . :     ....: : ..:: .::..:. : :.  
CCDS76 DEMGLGKTLQTIALLGYLK---HYRNIP--GPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVIC
       210       220          230         240       250       260  

         390       400           410       420       430       440 
pF1KB8 FTVDQDHKVEEFIKSIF----YSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAI
       :. :.: ..  ::.. .    ..: . ::::...  . .:....  :. ::.::.::   
CCDS76 FVGDKDARAA-FIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKS
            270        280       290       300       310       320 

             450       460       470       480       490       500 
pF1KB8 KTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSRE
       : .  .  ..  .:..:::::.::.:.:..::..:. : ...: ... . ..    :.  
CCDS76 KLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLG--
             330       340       350       360       370           

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB8 PSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRK
             ...: ::  : :      :.::: .  ..: :::: :  ..   . .: : : :
CCDS76 ------DQKLVERLHAVLKP----FLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTK
           380       390           400       410       420         

             570       580       590       600       610       620 
pF1KB8 LLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYK
       .: ...  .  .: ...   :  .  :.: ::::  ::..  :     : :..       
CCDS76 ILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHP-YLFDGA-EPGPPYTTDEH-------
     430       440       450       460         470       480       

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB8 GLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCK
        ..:              .:::. ::.:::: ..:     .:.. :..:. :.::.. : 
CCDS76 -IVS--------------NSGKMVVLDKLLAKLKE--QGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCM
                             490       500         510       520   

             690       700       710       720       730       740 
pF1KB8 RHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDID
        .:: : :::::::  .:.. ...::. .:: :::.::..:::.:.:: ... .:::: :
CCDS76 WRGYEYCRLDGQTPHEEREEAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSD
           530       540       550       560       570       580   

             750       760       770       780       790           
pF1KB8 WNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKT--S
       ::: .:.:::.:. : ::: ::...::.: .:.::.: .:   :  : . :..  .   .
CCDS76 WNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQ
           590       600       610       620       630       640   

     800       810       820       830       840       850         
pF1KB8 EHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQK
       .  ... ::. ...  : ..   .    . : : :.. :   ::.   ..  ... . ::
CCDS76 QSNKLAKEEMLQMIR-HGATHVFASK--ESELTDEDITT--ILERG-EKKTAEMNERLQK
           650        660         670         680        690       

       860       870       880       890       900       910       
pF1KB8 --SNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT       
          .::. . :.  ..  .: :.                                     
CCDS76 MGESSLRNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRV
       700       710       720       730       740       750       

>>CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10               (1849 aa)
 initn: 726 init1: 375 opt: 476  Z-score: 574.0  bits: 118.5 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 803; 31.3% identity (62.7% similar) in 547 aa overlap (296-815:1266-1800)

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB8 PRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILA
                                     :: .:..:. .:   .  ....:    :: 
CCDS74 LKAKERHFLEQLLDGKKLENYKIPVPINAELRKYQQDGVNWL-AFLNKYKLHG----ILC
        1240      1250      1260      1270       1280          1290

         330       340         350           360       370         
pF1KB8 DEMGLGKTLQCISLIWTLQCQ--GPYGGKPVIK----KTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLG
       :.:::::::: : ..   .:.    :. . . .     .:.: : .:...:  :  :. .
CCDS74 DDMGLGKTLQSICILAGDHCHRAQEYARSKLAECMPLPSLVVCPPTLTGHWVDEVGKFCS
             1300      1310      1320      1330      1340      1350

     380         390       400       410       420       430       
pF1KB8 SERIKI--FTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLK
        : ..   .:    ....   .   ..... ::...  ..: ..::::.  : :::: .:
CCDS74 REYLNPLHYTGPPTERIRLQHQVKRHNLIVASYDVVRNDIDFFRNIKFNYCILDEGHVIK
             1360      1370      1380      1390      1400      1410

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB8 NSAIKTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPII
       :.  : . :. .:. . ::::.::::::.. :...:.::. ::.::.  ..   : .::.
CCDS74 NGKTKLSKAVKQLTANYRIILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFLGTERQFAARYGKPIL
             1420      1430      1440      1450      1460      1470

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB8 LSREPSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIE
        ::.  .: .:.: :      :   .  :.::: .: . . ::::: .  .:  . ::..
CCDS74 ASRDARSSSREQEAGVLAMDALHRQVLPFLLRRMKEDVLQDLPPKIIQDYYCTLSPLQVQ
             1480      1490      1500      1510      1520      1530

       560              570       580              590       600   
pF1KB8 LYRKLLNS-------QVVRFCLQGLLENSPHLICIGA-------LKKLCNHPCLLFNSIK
       ::. . .:       ..:     .   ..:.:   :        :.:::::: :...  .
CCDS74 LYEDFAKSRAKCDVDETVSSATLSEETEKPKLKATGHVFQALQYLRKLCNHPALVLTP-Q
             1540      1550      1560      1570      1580          

           610         620       630       640       650       660 
pF1KB8 EKECSSTCDK--NEEKSLYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTE
       . : ..: .:   ...::.    .   .  . ::.    ..     :   .:. . :   
CCDS74 HPEFKTTAEKLAVQNSSLHDIQHAPKLSALKQLLLDCGLGNGSTSESGTESVVAQHR---
    1590      1600      1610      1620      1630      1640         

             670        680         690       700       710        
pF1KB8 KVVLVSNYTQTLNILQ-EVCKRH--GYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLL
        ...  .  . :.:.. .. : :  . .: ::::. : .::..::. ::..  :. ..::
CCDS74 -ILIFCQLKSMLDIVEHDLLKPHLPSVTYLRLDGSIPPGQRHSIVSRFNND-PSIDVLLL
        1650      1660      1670      1680      1690       1700    

      720       730       740       750       760       770        
pF1KB8 SSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKI
       ....::.:::: :.. ... . ::::  :.:::.:. : :::  :..:::.: ::.::::
CCDS74 TTHVGGLGLNLTGADTVVFVEHDWNPMRDLQAMDRAHRIGQKRVVNVYRLITRGTLEEKI
         1710      1720      1730      1740      1750      1760    

      780       790       800       810       820       830        
pF1KB8 YQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEHIQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHT
       .  :  :... ..:..  ..: . ......: .::::                       
CCDS74 MGLQKFKMNIANTVISQENSSLQ-SMGTDQLLDLFTLDKDGKAEKADTSTSGKASMKSIL
         1770      1780       1790      1800      1810      1820   

      840       850       860       870       880       890        
pF1KB8 GDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSF
                                                                   
CCDS74 ENLSDLWDQEQYDSEYSLENFMHSLK                                  
          1830      1840                                           

>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4              (1052 aa)
 initn: 784 init1: 362 opt: 426  Z-score: 515.8  bits: 106.9 E(32554): 2.1e-22
Smith-Waterman score: 829; 29.9% identity (61.6% similar) in 591 aa overlap (296-880:180-717)

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB8 PRPDKNHQWVFNKNCFPLVDVVIDPYLVYHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILA
                                     :: .: .:. .:    ...  ::  : :::
CCDS37 EDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWL----ISLYENGING-ILA
     150       160       170       180       190           200     

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB8 DEMGLGKTLQCISLIWTLQCQGPYGGKPVIKKTLIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIKI
       :::::::::: :::.  ..    : . :     ....: : ..:: .::..:. . :   
CCDS37 DEMGLGKTLQTISLLGYMK---HYRNIP--GPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVC
          210       220            230       240       250         

         390       400           410       420       430       440 
pF1KB8 FTVDQDHKVEEFIKSIF----YSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAI
       .  :.....  :.....    ..: . :::::..  . .:....  :. ::.::.::   
CCDS37 LIGDKEQRAA-FVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKS
     260        270       280       290       300       310        

             450       460       470       480       490       500 
pF1KB8 KTTTALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSRE
       : .  .  ..  .:..:::::.::.:.:...:..:. : ...: ... . ..    :.  
CCDS37 KLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLG--
      320       330       340       350       360       370        

             510       520       530       540       550       560 
pF1KB8 PSASEEEKELGERRAAELTCLTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRK
             ...: ::    :  .   :.::: .  ..: :::: :  ..   . .: : : .
CCDS37 ------DQKLVER----LHMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTR
              380           390       400       410       420      

             570       580       590       600       610       620 
pF1KB8 LLNSQVVRFCLQGLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLLFNSIKEKECSSTCDKNEEKSLYK
       .: ...  .   : ...   :  .  :.: :::: :.             :  :    : 
CCDS37 ILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLF-------------DGAEPGPPYT
        430       440       450       460                    470   

             630       640       650       660       670       680 
pF1KB8 GLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAVIHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCK
              .:..  : :.  :::. ::.:::  ..:     .:.. :..:..:.::.. : 
CCDS37 -------TDMH--LVTN--SGKMVVLDKLLPKLKE--QGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCM
                    480         490         500       510       520

             690       700       710       720       730       740 
pF1KB8 RHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSFFIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDID
        ..: : ::::::: ..::. ....:  .:. :.:.::..:::.:.::  .. .:::: :
CCDS37 WRNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSD
              530       540       550       560       570       580

             750       760       770       780       790       800 
pF1KB8 WNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGTIEEKIYQRQISKQGLCGAVVDLTKTSEH
       ::: .:.:::.:. : ::   :...:..: .:.::.: .:   :  : . :..  .  ..
CCDS37 WNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQ
              590       600       610       620       630       640

             810       820       830       840       850           
pF1KB8 IQFSVEELKNLFTLHESSDCVTHDLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQK--
          .. . . :  .....  :  .  . : : :..   :.. .  ...  ... . .:  
CCDS37 NLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASK-ESEITDEDI---DGILERGAKKTAEMNEKLSKMG
              650       660        670          680       690      

     860       870       880       890       900       910         
pF1KB8 SNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNLTDPFLERITENVSFIFQNITTQATGT         
        .::. ..:.  ..  .: :.                                       
CCDS37 ESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSE
        700       710       720       730       740       750      

>>CCDS35072.1 ERCC6L2 gene_id:375748|Hs108|chr9           (712 aa)
 initn: 933 init1: 337 opt: 404  Z-score: 491.1  bits: 101.8 E(32554): 4.9e-21
Smith-Waterman score: 895; 30.5% identity (58.9% similar) in 694 aa overlap (198-828:39-711)

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB8 IGYKFKELEKIEEGQTLMICGKEIEVMGVISPDDFSSGRCFQLGGGSTAISHSSQVARKC
                                     :::.   :.  . .  : .......     
CCDS35 PGRMDPSAPQPRAETSGKDIWHPGERCLAPSPDN---GKLCEASIKSITVDENGKSFAVV
       10        20        30        40           50        60     

       230       240       250       260        270       280      
pF1KB8 FSNPFKSVCKPSSKENRQNDFQNCKPRHDPYTPNSLVMPR-PDKNHQWVFNKNCFPLVDV
       .   :.    : .. .. .  ..: ::.  .  ..:  :  :  :...  ..  : : : 
CCDS35 LYADFQERKIPLKQLQEVKFVKDC-PRNLIFDDEDLEKPYFP--NRKFPSSSVAFKLSDN
          70        80         90       100         110       120  

         290        300       310       320       330        340   
pF1KB8 VID-PYLV-YHLRPHQKEGIIFLYECVMGMRMNGRCGAILADEMGLGKTLQCIS-LIWTL
         . :: .  .:: .:.::  :::    :  ..:  : ::.:.::::::.: :: :  .:
CCDS35 GDSIPYTINRYLRDYQREGTRFLY----GHYIHGG-GCILGDDMGLGKTVQVISFLAAVL
            130       140           150        160       170       

                          350           360       370       380    
pF1KB8 QCQG---------P------YGGKPV---IKKT-LIVTPGSLVNNWKKEFQKWLGSERIK
       . .:         :      .  .:.    ::  :::.: :.. ::: :.. : :  :. 
CCDS35 HKKGTREDIENNMPEFLLRSMKKEPLSSTAKKMFLIVAPLSVLYNWKDELDTW-GYFRVT
       180       190       200       210       220       230       

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB8 IFTVDQDHKVEEFIKSIFYSVLIISYEMLLRSLDQIKNIKFDLLICDEGHRLKNSAIKTT
       ..  ..  .    .:.    . . .:: :   ::........ .: ::.::.::   ..:
CCDS35 VLHGNRKDNELIRVKQRKCEIALTTYETLRLCLDELNSLEWSAVIVDEAHRIKNPKARVT
        240       250       260       270       280       290      

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 TALISLSCEKRIILTGTPIQNDLQEFFALIDFVNPGILGSLSSYRKIYEEPIILSREPSA
        .. .:.:. :: :::: .::...:.. ..:.. ::.::: . ..: . .:.  ... .:
CCDS35 EVMKALKCNVRIGLTGTILQNNMKELWCVMDWAVPGLLGSGTYFKKQFSDPVEHGQRHTA
        300       310       320       330       340       350      

          510       520        530       540       550       560   
pF1KB8 SEEEKELGERRAAELTC-LTGLFILRRTQEIINKYLPPKIENVVFCRPGALQIELYRKLL
       ...:   :..   .:.  ..: : ::::. .:.  :: : . .:.:    .:  .:. .:
CCDS35 TKRELATGRKAMQRLAKKMSGWF-LRRTKTLIKDQLPKKEDRMVYCSLTDFQKAVYQTVL
        360       370        380       390       400       410     

           570                              580       590          
pF1KB8 NSQVVRFCLQ-----------------------GLLENSPHLICIGALKKLCNHPCLL--
       ... : . ::                       :   .. .:  . .:.:. ::  ::  
CCDS35 ETEDVTLILQSSEPCTCRSGQKRRNCCYKTNSHGETVKTLYLSYLTVLQKVANHVALLQA
         420       430       440       450       460       470     

      600         610          620       630       640       650   
pF1KB8 FNSIKEKEC--SSTCDKNEEKS---LYKGLLSVFPADYNPLLFTEKESGKLQVLSKLLAV
        .. :..:   .  ::.   .    . :.  ..: .  .:     : :::..::..::  
CCDS35 ASTSKQQETLIKRICDQVFSRFPDFVQKSKDAAFETLSDP-----KYSGKMKVLQQLLN-
         480       490       500       510            520          

           660       670       680       690       700       710   
pF1KB8 IHELRPTEKVVLVSNYTQTLNILQEVCKRHGYAYTRLDGQTPISQRQQIVDGFNSQHSSF
        :  .  .::.: :  :. :..::. :   :  : ::::.:   .: .::  ::: ..  
CCDS35 -HCRKNRDKVLLFSFSTKLLDVLQQYCMASGLDYRRLDGSTKSEERLKIVKEFNSTQD-V
      530       540       550       560       570       580        

           720       730       740       750       760       770   
pF1KB8 FIFLLSSKAGGVGLNLIGGSHLILYDIDWNPATDIQAMSRVWRDGQKYPVHIYRLLTTGT
        : :.:. :::.:::..:.. ..:.:  ::::.:.::..:..: ::   :.. ::.. ::
CCDS35 NICLVSTMAGGLGLNFVGANVVVLFDPTWNPANDLQAIDRAYRIGQCRDVKVLRLISLGT
       590       600       610       620       630       640       

           780       790          800             810       820    
pF1KB8 IEEKIYQRQISKQGLCGAVV---DLTKTSEHIQFSVEE------LKNLFTLHESSDCVTH
       .:: .: ::: :: :  .::   .  .  : .: : :.      ..::: .. ...:.:.
CCDS35 VEEIMYLRQIYKQQLHCVVVGSENAKRYFEAVQGSKEHQGELFGIHNLFKFRSQGSCLTK
       650       660       670       680       690       700       

          830       840       850       860       870       880    
pF1KB8 DLLDCECTGEEVHTGDSLEKFIVSRDCQLGPHHQKSNSLKPLSMSQLKQWKHFSGDHLNL
       :.:.                                                        
CCDS35 DILEV                                                       
       710                                                         




910 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 16:43:15 2016 done: Sat Nov  5 16:43:16 2016
 Total Scan time:  4.350 Total Display time:  0.260

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com