Result of FASTA (ccds) for pF1KB5866
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5866, 491 aa
  1>>>pF1KB5866 491 - 491 aa - 491 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3375+/-0.000783; mu= 14.4808+/- 0.048
 mean_var=98.6388+/-19.491, 0's: 0 Z-trim(110.8): 36  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.129137
 statistics sampled from 11835 (11871) to 11835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.365), width:  16
 Scan time:  3.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3786.1 FGB gene_id:2244|Hs108|chr4             ( 491) 3434 649.9 1.8e-186
CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4            ( 437)  560 114.5 2.5e-25
CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4             ( 453)  560 114.5 2.5e-25
CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8            ( 312)  338 73.0 5.3e-13
CCDS6868.1 ANGPTL2 gene_id:23452|Hs108|chr9        ( 493)  302 66.4   8e-11


>>CCDS3786.1 FGB gene_id:2244|Hs108|chr4                  (491 aa)
 initn: 3434 init1: 3434 opt: 3434  Z-score: 3461.4  bits: 649.9 E(32554): 1.8e-186
Smith-Waterman score: 3434; 100.0% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (1-491:1-491)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MKRMVSWSFHKLKTMKHLLLLLLCVFLVKSQGVNDNEEGFFSARGHRPLDKKREEAPSLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MKRMVSWSFHKLKTMKHLLLLLLCVFLVKSQGVNDNEEGFFSARGHRPLDKKREEAPSLR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 PAPPPISGGGYRARPAKAAATQKKVERKAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PAPPPISGGGYRARPAKAAATQKKVERKAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RPIRNSVDELNNNVEAVSQTSSSSFQYMYLLKDLWQKRQKQVKDNENVVNEYSSELEKHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RPIRNSVDELNNNVEAVSQTSSSSFQYMYLLKDLWQKRQKQVKDNENVVNEYSSELEKHQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LYIDETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQMEYCRTPCTVSCNIPVVSGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LYIDETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQMEYCRTPCTVSCNIPVVSGKE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 CEEIIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTVIQNRQDGSVDFGRKWDPYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 CEEIIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTVIQNRQDGSVDFGRKWDPYK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 QGFGNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMGPTELLIEMEDWKGDKVKAHYGGFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QGFGNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMGPTELLIEMEDWKGDKVKAHYGGFT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 VQNEANKYQISVNKYRGTAGNALMDGASQLMGENRTMTIHNGMFFSTYDRDNDGWLTSDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VQNEANKYQISVNKYRGTAGNALMDGASQLMGENRTMTIHNGMFFSTYDRDNDGWLTSDP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 RKQCSKEDGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGQYTWDMAKHGTDDGVVWMNWKGSWYSMRKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RKQCSKEDGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGQYTWDMAKHGTDDGVVWMNWKGSWYSMRKM
              430       440       450       460       470       480

              490 
pF1KB5 SMKIRPFFPQQ
       :::::::::::
CCDS37 SMKIRPFFPQQ
              490 

>>CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4                 (437 aa)
 initn: 806 init1: 295 opt: 560  Z-score: 568.3  bits: 114.5 E(32554): 2.5e-25
Smith-Waterman score: 827; 33.2% identity (64.2% similar) in 400 aa overlap (95-487:34-415)

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB5 PISGGGYRARPAKAAATQKKVERKAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQERPIR
                                     :   :  .:  ::: : . . :   .  . 
CCDS47 SLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQTKVD
            10        20        30        40        50        60   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB5 NSVDELNNNVEAVSQTSSSSFQYMYLLKDLWQKRQKQVKDNENVVNEYSSELEKHQLYID
       .... :.. .. : . .:   : .  ..  ..  ...  .  ....  : .. .. .  .
CCDS47 KDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIMKYE
            70        80        90       100       110       120   

          190       200       210       220        230       240   
pF1KB5 ETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQME-YCRTPCTVSCNIPVVSGKECEE
        .. ..  ...: :. : ..  .:: .:.  : ::.:  :. ::  . .:  ..::.:..
CCDS47 ASILTH-DSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKV-AQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQD
            130       140       150        160       170       180 

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 IIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTVIQNRQDGSVDFGRKWDPYKQGF
       :  ::.. : .:.:.: .. . . :::...  ..::::.:.: :::::: ..:  ::.::
CCDS47 IANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGF
             190       200       210       220       230       240 

           310       320       330         340       350       360 
pF1KB5 GNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMG--PTELLIEMEDWKGDKVKAHYGGFTV
       :... .  : .      :.::::.::  .. ..  :  : .:.:::.:    : :. : :
CCDS47 GHLSPT--GTT------EFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKV
               250             260       270       280       290   

             370        380       390          400       410       
pF1KB5 QNEANKYQISVNKYRG-TAGNALMDGASQLMGEN---RTMTIHNGMFFSTYDRDNDGWLT
         ::.::...   . :  ::.:. :: .  .:..   . .: :::: :::.: ::: .  
CCDS47 GPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAF-DGFD--FGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKF--
           300       310        320         330       340          

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 SDPRKQCSKEDGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGQYTWDMAKHGTDDGVVWMNWKGSWYSM
          . .:...::.:::.:.:::.. :: :: :: :.   . .: :.:..: .::  ::::
CCDS47 ---EGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSM
         350       360       370       380       390       400     

       480       490                   
pF1KB5 RKMSMKIRPFFPQQ                  
       .: .::: ::                      
CCDS47 KKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQAGDV
         410       420       430       

>>CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4                  (453 aa)
 initn: 779 init1: 295 opt: 560  Z-score: 568.1  bits: 114.5 E(32554): 2.5e-25
Smith-Waterman score: 827; 33.2% identity (64.2% similar) in 400 aa overlap (95-487:34-415)

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB5 PISGGGYRARPAKAAATQKKVERKAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQERPIR
                                     :   :  .:  ::: : . . :   .  . 
CCDS37 SLHPRNLILYFYALLFLSSTCVAYVATRDNCCILDERFGSYCPTTCGIADFLSTYQTKVD
            10        20        30        40        50        60   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB5 NSVDELNNNVEAVSQTSSSSFQYMYLLKDLWQKRQKQVKDNENVVNEYSSELEKHQLYID
       .... :.. .. : . .:   : .  ..  ..  ...  .  ....  : .. .. .  .
CCDS37 KDLQSLEDILHQVENKTSEVKQLIKAIQLTYNPDESSKPNMIDAATLKSRKMLEEIMKYE
            70        80        90       100       110       120   

          190       200       210       220        230       240   
pF1KB5 ETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQME-YCRTPCTVSCNIPVVSGKECEE
        .. ..  ...: :. : ..  .:: .:.  : ::.:  :. ::  . .:  ..::.:..
CCDS37 ASILTH-DSSIRYLQEIYNSNNQKIVNLKEKV-AQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQD
            130       140       150        160       170       180 

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 IIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTVIQNRQDGSVDFGRKWDPYKQGF
       :  ::.. : .:.:.: .. . . :::...  ..::::.:.: :::::: ..:  ::.::
CCDS37 IANKGAKQSGLYFIKPLKANQQFLVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGF
             190       200       210       220       230       240 

           310       320       330         340       350       360 
pF1KB5 GNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMG--PTELLIEMEDWKGDKVKAHYGGFTV
       :... .  : .      :.::::.::  .. ..  :  : .:.:::.:    : :. : :
CCDS37 GHLSPT--GTT------EFWLGNEKIHLISTQSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKV
               250             260       270       280       290   

             370        380       390          400       410       
pF1KB5 QNEANKYQISVNKYRG-TAGNALMDGASQLMGEN---RTMTIHNGMFFSTYDRDNDGWLT
         ::.::...   . :  ::.:. :: .  .:..   . .: :::: :::.: ::: .  
CCDS37 GPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAF-DGFD--FGDDPSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKF--
           300       310        320         330       340          

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 SDPRKQCSKEDGGGWWYNRCHAANPNGRYYWGGQYTWDMAKHGTDDGVVWMNWKGSWYSM
          . .:...::.:::.:.:::.. :: :: :: :.   . .: :.:..: .::  ::::
CCDS37 ---EGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYSKASTPNGYDNGIIWATWKTRWYSM
         350       360       370       380       390       400     

       480       490                                   
pF1KB5 RKMSMKIRPFFPQQ                                  
       .: .::: ::                                      
CCDS37 KKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETEYDSLYPEDDL
         410       420       430       440       450   

>>CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8                 (312 aa)
 initn: 575 init1: 162 opt: 338  Z-score: 347.0  bits: 73.0 E(32554): 5.3e-13
Smith-Waterman score: 657; 39.0% identity (65.7% similar) in 300 aa overlap (195-489:37-309)

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB5 NENVVNEYSSELEKHQLYIDETVNSNIPTNLRVLRSILENLRSKIQKLESDVSAQMEYCR
                                     .:.:.. ... . ::..: ..  .:.    
CCDS60 FILVTTALTMGREISALEDCAQEQMRLRAQVRLLETRVKQQQVKIKQLLQENEVQFLDKG
         10        20        30        40        50        60      

          230       240          250       260       270       280 
pF1KB5 TPCTVSCNIPVVSGKE---CEEIIRKGGETSEMYLIQPDSSVKPYRVYCDMNTENGGWTV
          ::   : . : ..   : ::.  : . : .: :.: .:   . ::::: ...:::::
CCDS60 DENTV---IDLGSKRQYADCSEIFNDGYKLSGFYKIKPLQSPAEFSVYCDM-SDGGGWTV
         70           80        90       100       110        120  

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB5 IQNRQDGSVDFGRKWDPYKQGFGNVATNTDGKNYCGLPGEYWLGNDKISQLTRMGPTELL
       :: :.::: .:.: :  :..:::         :.    ::::::: ..  :: .    : 
CCDS60 IQRRSDGSENFNRGWKDYENGFG---------NFVQKHGEYWLGNKNLHFLTTQEDYTLK
            130       140                150       160       170   

             350       360       370       380       390       400 
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