Result of FASTA (omim) for pF1KB8492
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8492, 858 aa
  1>>>pF1KB8492 858 - 858 aa - 858 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3080+/-0.000435; mu= 20.7753+/- 0.027
 mean_var=71.1970+/-14.790, 0's: 0 Z-trim(110.3): 70  B-trim: 435 in 1/46
 Lambda= 0.152000
 statistics sampled from 18537 (18595) to 18537 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.218), width:  16
 Scan time: 12.160

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor  ( 858) 5711 1262.5       0
NP_001136077 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 937) 1738 391.3 1.1e-107
NP_001245283 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 962) 1738 391.3 1.2e-107
NP_004238 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small n ( 972) 1738 391.3 1.2e-107
NP_001245282 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 smal ( 972) 1738 391.3 1.2e-107
NP_733781 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 513)  225 59.3 5.3e-08
XP_011541993 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-re ( 564)  225 59.3 5.7e-08
NP_733792 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 732)  225 59.4 7.1e-08
XP_016865475 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-re ( 779)  225 59.4 7.4e-08
NP_115756 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor ( 779)  225 59.4 7.4e-08
NP_001268231 (OMIM: 606544) ribosome-releasing fac ( 811)  225 59.4 7.7e-08
XP_006713858 (OMIM: 606639,609060) PREDICTED: elon ( 712)  200 53.9 3.1e-06
NP_001295095 (OMIM: 606639,609060) elongation fact ( 591)  197 53.2 4.2e-06
NP_079272 (OMIM: 606639,609060) elongation factor  ( 751)  197 53.3 5.1e-06
NP_001295093 (OMIM: 606639,609060) elongation fact ( 770)  197 53.3 5.2e-06
NP_001332797 (OMIM: 617064,617065) translation fac ( 629)  181 49.7   5e-05
NP_068746 (OMIM: 617064,617065) translation factor ( 669)  181 49.7 5.3e-05
NP_001393 (OMIM: 130590) elongation factor 1-alpha ( 462)  145 41.7  0.0093
XP_011533816 (OMIM: 130590) PREDICTED: elongation  ( 462)  145 41.7  0.0093


>>NP_001952 (OMIM: 130610,609306) elongation factor 2 [H  (858 aa)
 initn: 5711 init1: 5711 opt: 5711  Z-score: 6763.1  bits: 1262.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5711; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
              790       800       810       820       830       840

              850        
pF1KB8 RKGLKEGIPALDNFLDKL
       ::::::::::::::::::
NP_001 RKGLKEGIPALDNFLDKL
              850        

>>NP_001136077 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nu  (937 aa)
 initn: 2117 init1: 637 opt: 1738  Z-score: 2054.0  bits: 391.3 E(85289): 1.1e-107
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:79-919)

                                          10        20        30   
pF1KB8                            MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
NP_001 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
       50        60        70        80        90       100        

            40        50         60        70        80        90  
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
        ..: :. ..      :  .   .::    :::: . :::: ...           . ..
NP_001 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
      110       120       130       140       150                  

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
       : : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::. 
NP_001 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
       160       170       180       190       200       210       

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
        .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.:
NP_001 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
       220       230       240       250       260            270  

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
        :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . :
NP_001 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
            280       290            300              310       320

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
       :.:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . 
NP_001 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
              330          340       350       360       370       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
       .:::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: :
NP_001 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
       380       390       400       410       420       430       

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
       ::: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  .
NP_001 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
       440       450       460       470       480       490       

            460       470       480          490       500         
pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
        ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...::
NP_001 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
       500       510       520       530       540       550       

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
       :  ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : 
NP_001 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
       560       570       580       590       600       610       

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
       :: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :
NP_001 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
       620       630       640       650       660       670       

     630       640       650       660       670           680     
pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
       . ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::
NP_001 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
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         690       700       710       720       730       740     
pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
       .:.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
NP_001 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
       740       750       760       770       780       790       

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pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
       .::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: 
NP_001 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
       800       810       820       830       840       850       

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pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
       ::::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....
NP_001 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
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pF1KB8 FLDKL                
       :.:                  
NP_001 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
        920       930       

>>NP_001245283 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nu  (962 aa)
 initn: 2101 init1: 637 opt: 1738  Z-score: 2053.8  bits: 391.3 E(85289): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 2118; 39.0% identity (69.0% similar) in 872 aa overlap (4-856:114-944)

                                          10        20        30   
pF1KB8                            MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
NP_001 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
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pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSK
                   : .    .  .::    :::: . :::: ...           . ..:
NP_001 HPE---------IRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDTK
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pF1KB8 DGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKP
        : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.  
NP_001 -GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAV
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pF1KB8 VLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVG
       .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.: 
NP_001 TVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNVC
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pF1KB8 FGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKF
       :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . ::
NP_001 FSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRKF
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pF1KB8 SKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGK
       .:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . .
NP_001 TKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIR
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pF1KB8 PLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGP
       :::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: ::
NP_001 PLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGP
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pF1KB8 LMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILM
       :: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  . 
NP_001 LMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWIS
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pF1KB8 MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVE
       ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...:::
NP_001 VARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVE
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pF1KB8 AKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPI
         ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : :
NP_001 PVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDI
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pF1KB8 KKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQ
       : .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :.
NP_001 KVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKK
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pF1KB8 RARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQWA
        ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::.
NP_001 LGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWG
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pF1KB8 TKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYL
       :.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :.
NP_001 TREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYF
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pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
       ::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: :
NP_001 VEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQG
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pF1KB8 QAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDNF
       :::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....:
NP_001 QAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISKF
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pF1KB8 LDKL                
       .:                  
NP_001 FDDPMLLELAKQDVVLNYPM
            950       960  

>>NP_004238 (OMIM: 603892,610536) 116 kDa U5 small nucle  (972 aa)
 initn: 2117 init1: 637 opt: 1738  Z-score: 2053.7  bits: 391.3 E(85289): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:114-954)

                                          10        20        30   
pF1KB8                            MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
NP_004 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
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pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
        ..: :. ..      :  .   .::    :::: . :::: ...           . ..
NP_004 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
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pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
       : : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::. 
NP_004 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
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pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
        .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.:
NP_004 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
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pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
        :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . :
NP_004 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
       310       320       330            340              350     

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pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
       :.:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . 
NP_004 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
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pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
       .:::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: :
NP_004 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
            420       430       440       450       460       470  

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pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
       ::: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  .
NP_004 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
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pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
        ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...::
NP_004 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
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pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
       :  ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : 
NP_004 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
            600       610       620       630       640       650  

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pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
       :: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :
NP_004 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
            660       670       680       690       700       710  

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pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
       . ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::
NP_004 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
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pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
       .:.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
NP_004 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
            780       790       800       810       820       830  

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pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
       .::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: 
NP_004 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
            840       850       860       870       880       890  

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pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
       ::::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....
NP_004 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
            900       910       920       930       940        950 

                            
pF1KB8 FLDKL                
       :.:                  
NP_004 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
             960       970  

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                                          10        20        30   
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                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
NP_001 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
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pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
        ..: :. ..      :  .   .::    :::: . :::: ...           . ..
NP_001 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
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pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
       : : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::. 
NP_001 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
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pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
        .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.:
NP_001 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
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pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
        :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . :
NP_001 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
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pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
       :.:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . 
NP_001 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
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pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
       .:::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: :
NP_001 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
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pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
       ::: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  .
NP_001 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
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pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
        ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...::
NP_001 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
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pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
       :  ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : 
NP_001 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
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pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
       :: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :
NP_001 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
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pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
       . ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::
NP_001 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
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pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
       .:.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
NP_001 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
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pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
       .::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: 
NP_001 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
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pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
       ::::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....
NP_001 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
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pF1KB8 FLDKL                
       :.:                  
NP_001 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
             960       970  

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                                             10         20         
pF1KB8                               MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
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NP_733 NNICCYKIRASLKRLKPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHID
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      30        40           50        60        70        80      
pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
        ::.: :. ..  .:   :   .  :.:  ::   .:.:: :::.:.:...         
NP_733 AGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDT-VTDFMAQERERGITIQSAAVTF---------
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         90       100       110       120       130       140      
pF1KB8 NFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQA
              :  :. .::::.::::::. ::   ::: :::..: :  .:: .:: :: :::
NP_733 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
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pF1KB8 IAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGES--GPMGNIM
         . :  . ..::::..   ..   : . . ..     ... :   ::...  : .  .:
NP_733 DKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPI---GEAKTFKGVVDVVM
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pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
        . .: . . ..:     :  : . ::   ..    :   .     ..: :.      :.
NP_733 KEKLLWNCNSNDGKD---FERKPLLEMNDPELLK--ETTEARNALIEQVADL-----DDE
              250          260       270         280            290

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pF1KB8 YFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLD
       . : .  .::..               . : :  :.  ::      .::     . .   
NP_733 FADLVLEEFSEN---------------FDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTA-----VPVLCG
              300                      310       320            330

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB8 SEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMG
       :  :.:  .::: ::               :..::::   ..:.    :.   ::  :..
NP_733 SALKNKGIQPLLDAV---------------TMYLPSP-EERNYEFLQWYK---DDLCALA
              340                      350        360          370 

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pF1KB8 IKSCDPK--GPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDL
       .:    :  :::.                 : :..:: ..  : .. .. : :       
NP_733 FKVLHDKQRGPLV-----------------FMRIYSGTIKPQLAIHNINGNCT-------
             380                        390       400              

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pF1KB8 YLKPIQRTIL-MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSV
         . :.: .: .  ..:: : ..  :::.  ::.                          
NP_733 --ERISRLLLPFADQHVE-IPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAARRAERE
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pF1KB8 SPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDL
                                                                   
NP_733 GEKKHRQNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSLSKQPGINGLSVSTN           
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>>XP_011541993 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-releas  (564 aa)
 initn: 411 init1: 225 opt: 225  Z-score: 264.1  bits: 59.3 E(85289): 5.7e-08
Smith-Waterman score: 328; 24.9% identity (48.9% similar) in 575 aa overlap (1-543:51-529)

                                             10         20         
pF1KB8                               MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
                                     ...  . ....:..   :.:::....::.:
XP_011 NNICCYKIRASLKRLKPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHID
               30        40        50        60        70        80

      30        40           50        60        70        80      
pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
        ::.: :. ..  .:   :   .  :.:  ::   .:.:: :::.:.:...         
XP_011 AGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDT-VTDFMAQERERGITIQSAAVTF---------
               90       100        110       120       130         

         90       100       110       120       130       140      
pF1KB8 NFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQA
              :  :. .::::.::::::. ::   ::: :::..: :  .:: .:: :: :::
XP_011 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
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pF1KB8 IAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGES--GPMGNIM
         . :  . ..::::..   ..   : . . ..     ... :   ::...  : .  .:
XP_011 DKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPI---GEAKTFKGVVDVVM
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pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
        . .: . . ..:     :  : . ::   ..    :   .     ..: :.      :.
XP_011 KEKLLWNCNSNDGKD---FERKPLLEMNDPELLK--ETTEARNALIEQVADL-----DDE
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pF1KB8 YFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLD
       . : .  .::..               . : :  :.  ::      .::     . .   
XP_011 FADLVLEEFSEN---------------FDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTA-----VPVLCG
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pF1KB8 SEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMG
       :  :.:  .::: ::               :..::::   ..:.    :.   ::  :..
XP_011 SALKNKGIQPLLDAV---------------TMYLPSP-EERNYEFLQWYK---DDLCALA
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pF1KB8 IKSCDPK--GPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDL
       .:    :  :::.                 : :..:: ..  : .. .. : :       
XP_011 FKVLHDKQRGPLV-----------------FMRIYSGTIKPQLAIHNINGNCT-------
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pF1KB8 YLKPIQRTIL-MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF-------------
         . :.: .: .  ..:: : ..  :::.  ::. .  .    ...              
XP_011 --ERISRLLLPFADQHVE-IPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKSSALAAARRAERE
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pF1KB8 ---EHAHNMRVMKFSVS------PVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIE
          .: .: .. .. ..      ::   ..:  . .  : : ..:: : . :: ..  ..
XP_011 GEKKHRQNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSLSKQPDLEHALKCLQREDPSLKVRLD
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pF1KB8 -ESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNK
        .::.                                                       
XP_011 PDSGQAPPRSCPHQLYSSSIGQKFGFAVGKCWYLAKCWHH                    
          530       540       550       560                        

>>NP_733792 (OMIM: 606544) ribosome-releasing factor 2,   (732 aa)
 initn: 440 init1: 225 opt: 225  Z-score: 262.4  bits: 59.4 E(85289): 7.1e-08
Smith-Waterman score: 376; 22.7% identity (48.0% similar) in 844 aa overlap (1-829:51-723)

                                             10         20         
pF1KB8                               MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
                                     ...  . ....:..   :.:::....::.:
NP_733 NNICCYKIRASLKRLKPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHID
               30        40        50        60        70        80

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pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
        ::.: :. ..  .:   :   .  :.:  ::   .:.:: :::.:.:...         
NP_733 AGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDT-VTDFMAQERERGITIQSAAVTF---------
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pF1KB8 NFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQA
              :  :. .::::.::::::. ::   ::: :::..: :  .:: .:: :: :::
NP_733 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
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pF1KB8 IAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGES--GPMGNIM
         . :  . ..::::..   ..   : . . ..     ... :   ::...  : .  .:
NP_733 DKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPI---GEAKTFKGVVDVVM
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pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
        . .: . . ..:     :  : . ::   ..    :   .     ..: :.      :.
NP_733 KEKLLWNCNSNDGKD---FERKPLLEMNDPELLK--ETTEARNALIEQVADL-----DDE
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pF1KB8 YFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLD
       . : .  .::..               . : :  :.  ::      .::     . .   
NP_733 FADLVLEEFSEN---------------FDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTA-----VPVLCG
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pF1KB8 SEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMG
       :  :.:  .::: ::               :..::::        :  ::          
NP_733 SALKNKGIQPLLDAV---------------TMYLPSPE-------ERNYE----------
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pF1KB8 IKSCDPKGPLMMYISKMV-PTSDKGRFYAFGRVFSGLV--STGLKVRIMGPNYTPGKKED
                ..  ::... : .:.     .  . .: .  ..:::    : . . .:.  
NP_733 ---------FLERISRLLLPFADQ--HVEIPSLTAGNIALTVGLKHTATGDTIVSSKS--
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pF1KB8 LYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSV
               . :  .: .:                     . :     .. .  :..  .:
NP_733 --------SALAAARRAE---------------------REGEKKHRQNNEAERLLLAGV
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pF1KB8 S---PVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIE-ESGEHIIAGAGELHLEIC
           ::   ..:  . .  : : ..:: : . :: ..  .. .::. .. : ::::.:: 
NP_733 EIPEPVFFCTIEPPSLSKQPDLEHALKCLQREDPSLKVRLDPDSGQTVLCGMGELHIEII
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pF1KB8 LKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDI
          ...... .    .   :.::::      .:   .. .  .:          :  . .
NP_733 HDRIKREYG-LETYLGPLQVAYRET------ILNSVRATDTLDRTL--------GDKRHL
        500        510       520             530               540 

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pF1KB8 DKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKD
          :: ::     ..  .    :.. ::.                  :..:.  :.  ..
NP_733 VTVEVEARP---IETSSVMPVIEFEYAES------------------INEGL--LKVSQE
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pF1KB8 SVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTA--RRCLYASVLT
       ..  :.. :  .: :    .. :      .:::. .:: : .  . .:   ::.  ..  
NP_733 AIENGIHSACLQGPLLGSPIQDV-----AITLHSLTIHPGTSTTMISACVSRCVQKALKK
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pF1KB8 AQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFG
       :. ...::.. .:.   .. .. . . : ..::.. .: :.      :. ...:. : .:
NP_733 ADKQVLEPLMNLEVTVARDYLSPVLADLAQRRGNI-QEIQTRQDNKVVI-GFVPLAEIMG
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pF1KB8 FTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFL
       ... ::. :.:.:     .. .: .  .: :...                          
NP_733 YSTVLRTLTSGSATFALELSTYQAM--NPQDQNTLLNRRSGLT                 
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pF1KB8 DKL

>>XP_016865475 (OMIM: 606544) PREDICTED: ribosome-releas  (779 aa)
 initn: 440 init1: 225 opt: 225  Z-score: 262.0  bits: 59.4 E(85289): 7.4e-08
Smith-Waterman score: 460; 23.5% identity (49.6% similar) in 863 aa overlap (1-829:51-770)

                                             10         20         
pF1KB8                               MVNFTVDQIRAIMDKK-ANIRNMSVIAHVD
                                     ...  . ....:..   :.:::....::.:
XP_016 NNICCYKIRASLKRLKPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHID
               30        40        50        60        70        80

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pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
        ::.: :. ..  .:   :   .  :.:  ::   .:.:: :::.:.:...         
XP_016 AGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDT-VTDFMAQERERGITIQSAAVTF---------
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pF1KB8 NFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQA
              :  :. .::::.::::::. ::   ::: :::..: :  .:: .:: :: :::
XP_016 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
                     140       150       160       170       180   

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pF1KB8 IAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGES--GPMGNIM
         . :  . ..::::..   ..   : . . ..     ... :   ::...  : .  .:
XP_016 DKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPI---GEAKTFKGVVDVVM
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       . : .  .::..               . : :  :.  ::      .::     . .   
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       :  :.:  .::: ::               :..::::   ..:.    :.   ::  :..
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          .: .: .. .. ..      ::   ..:  . .  : : ..:: : . :: ..  ..
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pF1KB8 AGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVA
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XP_016 LT                    
                             

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NP_115 NNICCYKIRASLKRLKPHVPLGRNCSSLPGLIGNDIKSLHSIINPPIAKIRNIGIMAHID
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pF1KB8 HGKSTLTDSLVCKAGIIAS---ARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDL
        ::.: :. ..  .:   :   .  :.:  ::   .:.:: :::.:.:...         
NP_115 AGKTTTTERILYYSGYTRSLGDVDDGDT-VTDFMAQERERGITIQSAAVTF---------
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              :  :. .::::.::::::. ::   ::: :::..: :  .:: .:: :: :::
NP_115 -------DWKGYRVNLIDTPGHVDFTLEVERCLRVLDGAVAVFDASAGVEAQTLTVWRQA
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         . :  . ..::::..   ..   : . . ..     ... :   ::...  : .  .:
NP_115 DKHNIPRICFLNKMDKTGASFKYAVESIREKLKAKPLLLQLPI---GEAKTFKGVVDVVM
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pF1KB8 IDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDR
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NP_115 KEKLLWNCNSNDGKD---FERKPLLEMNDPELLK--ETTEARNALIEQVADL-----DDE
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       . : .  .::..               . : :  :.  ::      .::     . .   
NP_115 FADLVLEEFSEN---------------FDLLPAEKLQTAIHRVTLAQTA-----VPVLCG
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NP_115 SALKNKGIQPLLDAV---------------TMYLPSP-EERNYEFLQWYK---DDLCALA
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pF1KB8 IKSCDPK--GPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDL
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         . :.: .: .  ..:: : ..  :::.  ::. .  .    ...              
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pF1KB8 ---EHAHNMRVMKFSVS------PVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIE
          .: .: .. .. ..      ::   ..:  . .  : : ..:: : . :: ..  ..
NP_115 GEKKHRQNNEAERLLLAGVEIPEPVFFCTIEPPSLSKQPDLEHALKCLQREDPSLKVRLD
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pF1KB8 -ESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNK
        .::. .. : ::::.::    ...... .    .   :.::::      .:   .. . 
NP_115 PDSGQTVLCGMGELHIEIIHDRIKREYG-LETYLGPLQVAYRET------ILNSVRATDT
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        .:          :  . .   :: ::     ..  .    :.. ::.            
NP_115 LDRTL--------GDKRHLVTVEVEARP---IETSSVMPVIEFEYAES------------
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             :..:.  :.  ....  :.. :  .: :    .. :      .:::. .:: : 
NP_115 ------INEGL--LKVSQEAIENGIHSACLQGPLLGSPIQDV-----AITLHSLTIHPGT
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pF1KB8 AGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVA
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858 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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