Result of SIM4 for pF1KB5929

seq1 = pF1KB5929.tfa, 1521 bp
seq2 = pF1KB5929/gi568815594r_76015369.tfa (gi568815594r:76015369_76248374), 233006 bp

>pF1KB5929 1521
>gi568815594r:76015369_76248374 (Chr4)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-151  (103902-103985)   100% ->
152-295  (104083-104226)   100% ->
296-522  (111963-112189)   100% ->
523-710  (114013-114200)   100% ->
711-907  (115656-115852)   100% ->
908-962  (117091-117145)   100% ->
963-1056  (117626-117719)   100% ->
1057-1164  (123619-123726)   100% ->
1165-1284  (130181-130300)   100% ->
1285-1395  (130601-130711)   100% ->
1396-1521  (132881-133006)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTTCAATTTTGGGGCTCCCTCGGGCACCTCCGGTACCGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTTCAATTTTGGGGCTCCCTCGGGCACCTCCGGTACCGCTGCAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGCGGCCCCCGCGG         GTGGGTTTGGAGGATTTGGGACAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGCGGCCCCCGCGGGTG...TAGGTGGGTTTGGAGGATTTGGGACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATCTACAACTGCAGGTTCTGCATTCAGCTTTTCTGCCCCAACTAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103926 CATCTACAACTGCAGGTTCTGCATTCAGCTTTTCTGCCCCAACTAACACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCACTACTG         GACTCTTTGGTGGTACTCAGAACAAAGGTTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103976 GGCACTACTGGTA...AAGGACTCTTTGGTGGTACTCAGAACAAAGGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGATTTGGTACTGGTTTTGGCACAACAACGGGAACTAGTACTGGTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104114 TGGATTTGGTACTGGTTTTGGCACAACAACGGGAACTAGTACTGGTTTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTACTGGTTTGGGAACTGGACTGGGATTTGGAGGATTTAATACACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104164 GTACTGGTTTGGGAACTGGACTGGGATTTGGAGGATTTAATACACAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCAGCAAACTA         CATTAGGTGGTCTCTTCAGTCAGCCTAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104214 CAGCAGCAAACTAGTA...TAGCATTAGGTGGTCTCTTCAGTCAGCCTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAAGCTCCTACCCAGTCCAACCAGCTGATAAATACTGCGAGTGCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111991 ACAAGCTCCTACCCAGTCCAACCAGCTGATAAATACTGCGAGTGCTCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGCTCCAACGCTGTTGGGAGATGAGAGAGATGCTATTTTGGCAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112041 CTGCTCCAACGCTGTTGGGAGATGAGAGAGATGCTATTTTGGCAAAATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATCAACTGCAGGCCTTTTGGGGAACAGGAAAAGGGTATTTCAACAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112091 AATCAACTGCAGGCCTTTTGGGGAACAGGAAAAGGGTATTTCAACAATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATTCCGCCAGTGGAATTCACACAAGAAAATCCCTTTTGCCGATTTAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 112141 TATTCCGCCAGTGGAATTCACACAAGAAAATCCCTTTTGCCGATTTAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    523         GCAGTAGGTTATAGTTGCATGCCCAGTAATAAAGATGAAGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112191 TA...CAGGCAGTAGGTTATAGTTGCATGCCCAGTAATAAAGATGAAGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGCTAGTGGTTTTAGTTTTCAACAAAAAAGAAACAGAGATTCGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114055 GGGCTAGTGGTTTTAGTTTTCAACAAAAAAGAAACAGAGATTCGAAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACAACAACAGTTGGTAGAATCATTGCATAAAGTTTTGGGAGGAAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114105 ACAACAACAGTTGGTAGAATCATTGCATAAAGTTTTGGGAGGAAACCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCTTACTGTAAATGTAGAGGGCACTAAAACATTGCCAGATGATCA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 114155 CCCTTACTGTAAATGTAGAGGGCACTAAAACATTGCCAGATGATCAGTA.

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    711      GACAGAAGTTGTTATTTATGTTGTTGAGCGTTCGCCAAATGGTAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114205 ..CAGGACAGAAGTTGTTATTTATGTTGTTGAGCGTTCGCCAAATGGTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTCAAGAAGAGTTCCAGCTACAACGCTATATGCCCATTTTGAACAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115701 TTCAAGAAGAGTTCCAGCTACAACGCTATATGCCCATTTTGAACAAGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATATAAAAACACAATTGCAGCAACTTGGTGTAACCCTTTCTATGACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115751 ATATAAAAACACAATTGCAGCAACTTGGTGTAACCCTTTCTATGACTAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACAGAACTTTCTCCTGCACAGATCAAACAGCTTTTACAGAATCCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115801 ACAGAACTTTCTCCTGCACAGATCAAACAGCTTTTACAGAATCCTCCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TG         GTGTTGATCCTATTATCTGGGAACAGGCCAAGGTAGATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115851 TGGTA...TAGGTGTTGATCCTATTATCTGGGAACAGGCCAAGGTAGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACCCTGATTCTGAAAA         GTTAATTCCTGTACCAATGGTGGGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 117130 ACCCTGATTCTGAAAAGTA...CAGGTTAATTCCTGTACCAATGGTGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTTAAGGAACTTCTCCGAAGACTGAAGGTTCAAGATCAGATGACTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117651 TTTAAGGAACTTCTCCGAAGACTGAAGGTTCAAGATCAGATGACTAAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCATCAAACCAGATTAGAT         ATCATATCTGAAGATATTAGTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 117701 GCATCAAACCAGATTAGATGTA...CAGATCATATCTGAAGATATTAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCTACAAAAGAATCAAACTACATCTGTAGCCAAAATTGCACAATACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123641 AGCTACAAAAGAATCAAACTACATCTGTAGCCAAAATTGCACAATACAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGGAAACTCATGGATCTTTCCCATAGAACTTTACAG         GTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123691 AGGAAACTCATGGATCTTTCCCATAGAACTTTACAGGTA...TAGGTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AATCAAACAGGAAATTCAAAGGAAGAGTGGTTATGCCATTCAGGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130186 AATCAAACAGGAAATTCAAAGGAAGAGTGGTTATGCCATTCAGGCTGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AAGAGCAGTTGCGAGTTCAGCTGGATACGATTCAGGGTGAACTAAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130236 AAGAGCAGTTGCGAGTTCAGCTGGATACGATTCAGGGTGAACTAAATGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCTACTCAGTTCAAG         GGCCGACTAAATGAATTGATGTCTCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 130286 CCTACTCAGTTCAAGGTA...TAGGGCCGACTAAATGAATTGATGTCTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AATCAGGATGCAGAATCATTTTGGAGCAGTCAGATCTGAAGAAAGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130627 AATCAGGATGCAGAATCATTTTGGAGCAGTCAGATCTGAAGAAAGGTATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ACATAGATGCAGATCTGTTACGAGAAATCAAGCAG         CATTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 130677 ACATAGATGCAGATCTGTTACGAGAAATCAAGCAGGTA...TAGCATTTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AAACAACAACAGGAAGGCCTTAGCCATTTGATTAGCATCATTAAAGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132887 AAACAACAACAGGAAGGCCTTAGCCATTTGATTAGCATCATTAAAGACGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TCTAGAAGATATAAAGCTGGTCGAACATGGATTGAATGAAACCATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132937 TCTAGAAGATATAAAGCTGGTCGAACATGGATTGAATGAAACCATCCACA

   1600     .    :    .    :
   1502 TCAGAGGTGGTGTCTTTAGT
        ||||||||||||||||||||
 132987 TCAGAGGTGGTGTCTTTAGT

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