Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5733
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5733, 794 aa
1>>>pF1KB5733 794 - 794 aa - 794 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6414+/-0.000834; mu= 14.9604+/- 0.051
mean_var=105.5727+/-20.532, 0's: 0 Z-trim(110.8): 33 B-trim: 41 in 1/50
Lambda= 0.124824
statistics sampled from 11867 (11893) to 11867 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 4.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15 ( 794) 5462 994.5 0
CCDS12069.2 PCSK4 gene_id:54760|Hs108|chr19 ( 755) 2670 491.7 1.9e-138
CCDS73790.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 969) 1964 364.6 4.4e-100
CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 ( 913) 1941 360.4 7.4e-99
CCDS55320.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (1860) 1941 360.6 1.3e-98
CCDS73789.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 956) 1924 357.4 6.4e-98
CCDS73791.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 623) 1886 350.4 5.1e-96
CCDS73793.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 652) 1886 350.5 5.3e-96
CCDS73792.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 ( 664) 1886 350.5 5.4e-96
CCDS54881.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 706) 1804 335.7 1.6e-91
CCDS4081.1 PCSK1 gene_id:5122|Hs108|chr5 ( 753) 1804 335.7 1.7e-91
CCDS56180.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 619) 1637 305.6 1.6e-82
CCDS13125.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 638) 1637 305.6 1.7e-82
CCDS56179.1 PCSK2 gene_id:5126|Hs108|chr20 ( 603) 1624 303.3 8e-82
CCDS8382.1 PCSK7 gene_id:9159|Hs108|chr11 ( 785) 1459 273.6 8.8e-73
>>CCDS10364.1 FURIN gene_id:5045|Hs108|chr15 (794 aa)
initn: 5462 init1: 5462 opt: 5462 Z-score: 5316.0 bits: 994.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5462; 100.0% identity (100.0% similar) in 794 aa overlap (1-794:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MELRPWLLWVVAATGTLVLLAADAQGQKVFTNTWAVRIPGGPAVANSVARKHGFLNLGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MELRPWLLWVVAATGTLVLLAADAQGQKVFTNTWAVRIPGGPAVANSVARKHGFLNLGQI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 FGDYYHFWHRGVTKRSLSPHRPRHSRLQREPQVQWLEQQVAKRRTKRDVYQEPTDPKFPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FGDYYHFWHRGVTKRSLSPHRPRHSRLQREPQVQWLEQQVAKRRTKRDVYQEPTDPKFPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QWYLSGVTQRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASFDVNDQDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QWYLSGVTQRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASFDVNDQDP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DPQPRYTQMNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRMLDGEVTDAVEARSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DPQPRYTQMNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRMLDGEVTDAVEARSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGGLGSIFVWASGNGGREH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGGLGSIFVWASGNGGREH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQNEKQIVTTDLRQKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQNEKQIVTTDLRQKC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TESHTGTSASAPLAAGIIALTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHLNANDWATNGVGRKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TESHTGTSASAPLAAGIIALTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHLNANDWATNGVGRKV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SHSYGYGLLDAGAMVALAQNWTTVAPQRKCIIDILTEPKDIGKRLEVRKTVTACLGEPNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SHSYGYGLLDAGAMVALAQNWTTVAPQRKCIIDILTEPKDIGKRLEVRKTVTACLGEPNH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ITRLEHAQARLTLSYNRRGDLAIHLVSPMGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAFMTTHSWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ITRLEHAQARLTLSYNRRGDLAIHLVSPMGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAFMTTHSWD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 EDPSGEWVLEIENTSEANNYGTLTKFTLVLYGTAPEGLPVPPESSGCKTLTSSQACVVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDPSGEWVLEIENTSEANNYGTLTKFTLVLYGTAPEGLPVPPESSGCKTLTSSQACVVCE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 EGFSLHQKSCVQHCPPGFAPQVLDTHYSTENDVETIRASVCAPCHASCATCQGPALTDCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EGFSLHQKSCVQHCPPGFAPQVLDTHYSTENDVETIRASVCAPCHASCATCQGPALTDCL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SCPSHASLDPVEQTCSRQSQSSRESPPQQQPPRLPPEVEAGQRLRAGLLPSHLPEVVAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SCPSHASLDPVEQTCSRQSQSSRESPPQQQPPRLPPEVEAGQRLRAGLLPSHLPEVVAGL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 SCAFIVLVFVTVFLVLQLRSGFSFRGVKVYTMDRGLISYKGLPPEAWQEECPSDSEEDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SCAFIVLVFVTVFLVLQLRSGFSFRGVKVYTMDRGLISYKGLPPEAWQEECPSDSEEDEG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB5 RGERTAFIKDQSAL
::::::::::::::
CCDS10 RGERTAFIKDQSAL
790
>>CCDS12069.2 PCSK4 gene_id:54760|Hs108|chr19 (755 aa)
initn: 2627 init1: 2211 opt: 2670 Z-score: 2599.0 bits: 491.7 E(32554): 1.9e-138
Smith-Waterman score: 2670; 54.2% identity (76.7% similar) in 734 aa overlap (1-721:1-728)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MELRPWLLWVVAATGTLVLLAADAQGQK-----VFTNTWAVRIPGGPAVANSVARKHGFL
:. : ::. . . :.:. : : .....:::.. : .. .::: ::.
CCDS12 MRPAPIALWLRLVLA-LALVRPRAVGWAPVRAPIYVSSWAVQVSQGNREVERLARKFGFV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NLGQIF--GDYYHFWHRGVTKRSLSPHRPRHSRLQREPQVQWLEQQVAKRRTKRDVYQEP
::: :: :.:.:. ::::...::.:: .. .:...:.:::..::. .::.::.: :
CCDS12 NLGPIFPDGQYFHLRHRGVVQQSLTPHWGHRLHLKKNPKVQWFQQQTLQRRVKRSVVV-P
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TDPKFPQQWYLSGVTQRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASF
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CCDS12 TDPWFSKQWYMNSEAQPDLSILQAWSQGLSGQGIVVSVLDDGIEKDHPDLWANYDPLASY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DVNDQDPDPQPRYTQMNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRMLDGEVTD
: :: ::::::::: ..:::::::::::::.:::: ::::::.:::::::::::: .::
CCDS12 DFNDYDPDPQPRYTPSKENRHGTRCAGEVAAMANNGFCGVGVAFNARIGGVRMLDGTITD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 AVEARSLGLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGGLGSIFVWAS
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CCDS12 VIEAQSLSLQPQHIHIYSASWGPEDDGRTVDGPGILTREAFRRGVTKGRGGLGTLFIWAS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GNGGREHDSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQNEKQIVT
:::: ..:.::::::::::.:::..:.:: : ::::::::.:::.:::::: .. ::::
CCDS12 GNGGLHYDNCNCDGYTNSIHTLSVGSTTQQGRVPWYSEACASTLTTTYSSGVATDPQIVT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 TDLRQKCTESHTGTSASAPLAAGIIALTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHLNANDWAT
:::.. ::..:::::::::::::.:::.:::: :::::::::::..::::::.:.:: :
CCDS12 TDLHHGCTDQHTGTSASAPLAAGMIALALEANPFLTWRDMQHLVVRASKPAHLQAEDWRT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NGVGRKVSHSYGYGLLDAGAMVALAQNWTTVAPQRKCIIDILTEPKDIGKRLEVRKTVTA
:::::.::: ::::::::: .: :..: . ::::: . . ..: : . .:..:.:
CCDS12 NGVGRQVSHHYGYGLLDAGLLVDTARTWLPTQPQRKCAVRVQSRPTPILPLIYIRENVSA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 CLGEPNHITRLEHAQARLTLSYNRRGDLAIHLVSPMGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAF
: : : : :::.::.:::::.::::: : :.:::::::::.: :: : :..:.:.:.:
CCDS12 CAGLHNSIRSLEHVQAQLTLSYSRRGDLEISLTSPMGTRSTLVAIRPLDVSTEGYNNWVF
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KB5 MTTHSWDEDPSGEWVLEIENTSEANNYGTLTKFTLVLYGTAPE--GLPVPPE--SSGCKT
:.:: :::.:.: :.: .:: . : ::: ..::.::::: . . :. :. ::.:
CCDS12 MSTHFWDENPQGVWTLGLENKGYYFNTGTLYRYTLLLYGTAEDMTARPTGPQVTSSACVQ
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 LTSSQACVVCEEGFSLHQKSCVQHCPPGFAPQV-LDTHYSTENDVETIRASVCAPCHASC
. : .:. . . :. .::: : .. : : .. . ..: ::. :::::
CCDS12 RDTEGLCQACDGPAYILGQLCLAYCPPRFFNHTRLVTAGPGHTAAPALR--VCSSCHASC
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ATCQGPALTDCLSCPSHASLDPVEQTCSRQSQSSRESPPQQQPPRLPPEVEAGQRLRAGL
::.: . :: ::: ..:: . .: .. .. .: :. . : . .. . .:
CCDS12 YTCRGGSPRDCTSCPPSSTLDQQQGSC--MGPTTPDSRPRLRAAACPHHRCPASAMVLSL
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 LPSHLP-EVVAGLSCAFIVLVFVTVFLVLQLRSGFSFRGVKVYTMDRGLISYKGLPPEAW
: : :. :.:
CCDS12 LAVTLGGPVLCGMSMDLPLYAWLSRARATPTKPQVWLPAGT
720 730 740 750
>>CCDS73790.1 PCSK6 gene_id:5046|Hs108|chr15 (969 aa)
initn: 2330 init1: 1595 opt: 1964 Z-score: 1910.3 bits: 364.6 E(32554): 4.4e-100
Smith-Waterman score: 2257; 52.1% identity (73.4% similar) in 695 aa overlap (4-674:47-726)
10 20 30
pF1KB5 MELRPWLLWVVAATGTLVLLAADAQG--QKVFT
::: :.. :.: :: . . :.:
CCDS73 AAAATDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWR-WLL----LLALPAACSAPPPRPVYT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB5 NTWAVRIPGGPAVANSVARKHGFLNLGQI--FGDYYHFWHRGVTKRSLSPHRPRHSRLQR
: :::.. :::: :. :: ::.:::::: . :::::.: . ::: : :. :.
CCDS73 NHWAVQVLGGPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRM
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130
pF1KB5 EPQVQWLEQQVAKRRTKRDVYQEP-----TDPKFPQQWYL-----SGVTQRDLNVKAAWA
.:::.::.:: .:::.::.: ..: .:: . ..::: .. . ..::.:::
CCDS73 DPQVKWLQQQEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRCRSEMNVQAAWK
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 QGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASFDVNDQDPDPQPRYTQMNDNRHGTRCA
.::::...::.:::::::.:::::: ::: ::.::: .: ::.::: :.:.::::::
CCDS73 RGYTGKNVVVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHGTRCA
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 GEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGVRMLDGEVTDAVEARSLGLNPNHIHIYSASWGPEDD
::::: :::. : ::.::::.:::.:::::.:::.:::.:::. ::.: ::::::::.::
CCDS73 GEVAASANNSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDD
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 GKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGGLGSIFVWASGNGGREHDSCNCDGYTNSIYTLSISS
:::::::.:::..:: :...:: :::::::::::::::: : :.::::::::::.:.::
CCDS73 GKTVDGPGRLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTISVSS
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 ATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSGNQNEKQIVTTDLRQKCTESHTGTSASAPLAAGIIA
::. : ::: : :.:::::::::: :..::::::::.::..:::::.:::..:::::
CCDS73 ATENGYKPWYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPMVAGIIA
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 LTLEANKNLTWRDMQHLVVQTSKPAHLNANDWATNGVGRKVSHSYGYGLLDAGAMVALAQ
:.::::..:::::.:::.:.::.::::.:.:: .::.:.:::: ::.::.:: :.:. :.
CCDS73 LALEANSQLTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASDWKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEALVVEAK
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 NWTTVAPQRKCIIDILTEPKDIGKRLEVRKTV--TACLGEPNH-ITRLEHAQARLTLSYN
.::.: :. :. .:..: .: :. .:: . .. .. :::. .: ..:.
CCDS73 KWTAVPSQHMCVAASDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHP
500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 RRGDLAIHLVSPMGTRSTLLAARPHDYSADGFNDWAFMTTHSWDEDPSGEWVLEIENT-S
::::: :.:::: ::.: ::: : : : .::..: :::.: : : :.:.:::.. :
CCDS73 RRGDLQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLEIQDLPS
560 570 580 590 600 610
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 EANN---YGTLTKFTLVLYGTAPEGLPV-PPESSGCKTLTSSQACVVCEEGFSLHQKSCV
.. : : : ...:.::::: . . ..: . : : . : . . : :
CCDS73 QVRNPEKQGKLKEWSLILYGTAEHPYHTFSAHQSRSRMLELSAPEL--EPPKAALSPSQV
620 630 640 650 660
620 630 640 650 660
pF1KB5 QHCPPGFAPQVLDTHYSTENDVETIRASVCAPCHASCAT--CQGPALTDCLSCPSHASLD
. : : :: .... ...::: : :. :.:: .::.: : ::
CCDS73 E-VPEDEEDY---TAQSTPGSANILQTSVC---HPECGDKGCDGPNADQCLNC-VHFSLG
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 PVEQTCSRQSQSSRESPPQQQPPRLPPEVEAGQRLRAGLLPSHLPEVVAGLSCAFIVLVF
:. .
CCDS73 SVKTSRKCVSVCPLGYFGDTAARRCRRCHKGCETCSSRAATQCLSCRRGFYHHQEMNTCV
730 740 750 760 770 780
>>CCDS6652.1 PCSK5 gene_id:5125|Hs108|chr9 (913 aa)
initn: 2306 init1: 1535 opt: 1941 Z-score: 1888.3 bits: 360.4 E(32554): 7.4e-99
Smith-Waterman score: 2266; 51.7% identity (71.0% similar) in 704 aa overlap (28-675:33-720)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MELRPWLLWVVAATGTLVLLAADAQGQKVFTNTWAVRIPGGPAVANSVARKHGFLNL
.:.:: :::.: :: :: .: :.::.:.
CCDS66 WGSRCCCPGRLDLLCVLALLGGCLLPVCRTRVYTNHWAVKIAGGFPEANRIASKYGFINI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GQI--FGDYYHFWHRGVTKRSLSPHRPRHSRLQREPQVQWLEQQVAKRRTKRDV---YQE
::: . :::::.: . :::. : :: .. ::.:.:..:::.:.::::: .
CCDS66 GQIGALKDYYHFYHSRTIKRSVISSRGTHSFISMEPKVEWIQQQVVKKRTKRDYDFSRAQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB5 PT---DPKFPQQWYL--SGVT---QRDLNVKAAWAQGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLA
: :::.:..::. : : : :.:...:: .::::..:::.:::::::..::::
CCDS66 STYFNDPKWPSMWYMHCSDNTHPCQSDMNIEGAWKRGYTGKNIVVTILDDGIERTHPDLM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 GNYDPGASFDVNDQDPDPQPRYTQMNDNRHGTRCAGEVAAVANNGVCGVGVAYNARIGGV
::: :: ::: .: ::.::: :.:.:::::::::::.:::. : ::.:.::.::::
CCDS66 QNYDALASCDVNGNDLDPMPRYDASNENKHGTRCAGEVAAAANNSHCTVGIAFNAKIGGV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 RMLDGEVTDAVEARSLGLNPNHIHIYSASWGPEDDGKTVDGPARLAEEAFFRGVSQGRGG
:::::.::: :::.:...::.:.:::::::::.:::::::::: :...:: :: .:: :
CCDS66 RMLDGDVTDMVEAKSVSFNPQHVHIYSASWGPDDDGKTVDGPAPLTRQAFENGVRMGRRG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LGSIFVWASGNGGREHDSCNCDGYTNSIYTLSISSATQFGNVPWYSEACSSTLATTYSSG
:::.:::::::::: .: :.::::::::::.::::... :. ::: : ::::::::::::
CCDS66 LGSVFVWASGNGGRSKDHCSCDGYTNSIYTISISSTAESGKKPWYLEECSSTLATTYSSG
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580 590 600
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: :. ..:
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pF1KB5 QGYTGHGIVVSILDDGIEKNHPDLAGNYDPGASFDVNDQDPDPQPRYTQMNDNRHGTRCA
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CCDS73 KWTAVPSQHMCVAASDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHP
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