FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5807, 472 aa 1>>>pF1KB5807 472 - 472 aa - 472 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2798+/-0.000561; mu= 1.3161+/- 0.035 mean_var=364.2516+/-77.060, 0's: 0 Z-trim(117.0): 159 B-trim: 1080 in 2/54 Lambda= 0.067201 statistics sampled from 28466 (28642) to 28466 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16 Scan time: 10.350 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,14806 ( 472) 3021 307.4 5.6e-83 NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, ty ( 473) 2553 262.0 2.5e-69 NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, ty ( 432) 1949 203.4 1e-51 NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskele ( 456) 1866 195.4 2.8e-49 XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 463) 1813 190.3 9.9e-48 NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 458) 1783 187.4 7.4e-47 XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, ty ( 437) 1778 186.8 1e-46 NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cy ( 420) 1756 184.7 4.3e-46 NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) kera ( 584) 1643 173.9 1e-42 XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) P ( 624) 1639 173.6 1.4e-42 NP_002267 (OMIM: 148020) keratin, type I cytoskele ( 400) 1584 168.0 4.4e-41 NP_000214 (OMIM: 122100,601687) keratin, type I cy ( 494) 1551 164.9 4.6e-40 NP_000217 (OMIM: 144200,607606) keratin, type I cy ( 623) 1451 155.3 4.4e-37 NP_061889 (OMIM: 607742) keratin, type I cytoskele ( 525) 1438 154.0 9.4e-37 XP_016879788 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 494) 1415 151.7 4.2e-36 NP_853515 (OMIM: 616676) keratin, type I cytoskele ( 459) 1413 151.5 4.6e-36 NP_853513 (OMIM: 616677) keratin, type I cytoskele ( 464) 1384 148.7 3.3e-35 NP_853512 (OMIM: 616646,616760) keratin, type I cy ( 450) 1341 144.5 5.8e-34 XP_011522716 (OMIM: 616646,616760) PREDICTED: kera ( 448) 1337 144.1 7.5e-34 NP_003762 (OMIM: 604540) keratin, type I cuticular ( 467) 1337 144.1 7.7e-34 NP_002271 (OMIM: 602764) keratin, type I cuticular ( 455) 1308 141.3 5.4e-33 XP_011523096 (OMIM: 602764) PREDICTED: keratin, ty ( 455) 1308 141.3 5.4e-33 NP_061883 (OMIM: 608218) keratin, type I cytoskele ( 424) 1291 139.6 1.6e-32 NP_853517 (OMIM: 616675) keratin, type I cytoskele ( 468) 1289 139.5 2e-32 NP_002268 (OMIM: 601077) keratin, type I cuticular ( 416) 1238 134.5 5.6e-31 NP_004129 (OMIM: 602761) keratin, type I cuticular ( 404) 1230 133.7 9.4e-31 NP_002269 (OMIM: 602760) keratin, type I cuticular ( 448) 1227 133.4 1.2e-30 NP_002270 (OMIM: 602762) keratin, type I cuticular ( 404) 1222 132.9 1.6e-30 XP_006721802 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 427) 1205 131.3 5.2e-30 XP_011523095 (OMIM: 602763) PREDICTED: keratin, ty ( 412) 1201 130.9 6.7e-30 NP_066293 (OMIM: 602763) keratin, type I cuticular ( 436) 1201 130.9 6.9e-30 XP_011522762 (OMIM: 607742) PREDICTED: keratin, ty ( 422) 1195 130.3 1e-29 NP_954657 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1158 126.7 1.2e-28 NP_000215 (OMIM: 148070) keratin, type I cytoskele ( 430) 1158 126.7 1.2e-28 NP_872303 (OMIM: 616679) keratin, type I cytoskele ( 431) 1105 121.6 4.3e-27 XP_016879678 (OMIM: 616679) PREDICTED: keratin, ty ( 484) 1105 121.6 4.7e-27 NP_006762 (OMIM: 604542) keratin, type I cuticular ( 456) 1054 116.7 1.4e-25 NP_998821 (OMIM: 616678) keratin, type I cytoskele ( 491) 1053 116.6 1.6e-25 NP_003761 (OMIM: 604541) keratin, type I cuticular ( 449) 1034 114.7 5.3e-25 NP_056330 (OMIM: 606194) keratin, type I cytoskele ( 422) 1026 113.9 8.7e-25 XP_005257257 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 748 86.8 8.8e-17 XP_011522897 (OMIM: 606194) PREDICTED: keratin, ty ( 285) 748 86.8 8.8e-17 NP_001269362 (OMIM: 606194) keratin, type I cytosk ( 285) 748 86.8 8.8e-17 NP_001124491 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 431) 692 81.5 4.9e-15 XP_016879940 (OMIM: 137780,203450) PREDICTED: glia ( 472) 692 81.6 5.2e-15 NP_002046 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillary a ( 432) 686 81.0 7.4e-15 NP_001229305 (OMIM: 137780,203450) glial fibrillar ( 438) 685 80.9 7.9e-15 XP_011523088 (OMIM: 602761) PREDICTED: keratin, ty ( 245) 666 78.7 2e-14 NP_001918 (OMIM: 125660,181400,601419,602067,60476 ( 470) 672 79.7 2e-14 NP_004684 (OMIM: 609025,612318) keratin, type II c ( 551) 669 79.4 2.7e-14 >>NP_000517 (OMIM: 125595,131760,131800,131900,148066,16 (472 aa) initn: 3021 init1: 3021 opt: 3021 Z-score: 1610.8 bits: 307.4 E(85289): 5.6e-83 Smith-Waterman score: 3021; 100.0% identity (100.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN 430 440 450 460 470 >>NP_005548 (OMIM: 148067,167200,613000) keratin, type I (473 aa) initn: 2065 init1: 2065 opt: 2553 Z-score: 1365.5 bits: 262.0 E(85289): 2.5e-69 Smith-Waterman score: 2553; 87.3% identity (95.2% similar) in 458 aa overlap (1-449:1-456) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: NP_005 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSS-RFSSG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB5 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGG----FGGGFAGGDGLLVGSEK :: ::::::::::::::: ::::::::::::::::.::: ::::::::::::::::: NP_005 GACGLGGGYGGGFSSSSS-FGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKI ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: NP_005 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 LTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLE ..::..::. .:::::::::::::::::: :: ::..::::.::::::::::::::.::: NP_005 IAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 MQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAE ::::.::::::::.::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_005 MQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 KNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLE :::.::: ::..::::::.:::.:::::::..::..::::..:.:::::::::::::::: NP_005 KNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 NSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYR ::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::.:::.::::::::::::::::: NP_005 NSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYR 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 RLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDV-----TSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTK ::::::::::::.: :. : :::.: .::::: : NP_005 RLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 N >>NP_000413 (OMIM: 148069,167210,184500) keratin, type I (432 aa) initn: 2248 init1: 1867 opt: 1949 Z-score: 1049.5 bits: 203.4 E(85289): 1e-51 Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG ::: ::::::::.::: .:.:::::: : :: .:::...: :..:. NP_000 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ : :::. ::. :: ::::: ::.:..:.: ::::.:.::.::: NP_000 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT ::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.::::::: NP_000 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE :::::.:::::::::::::::::.::: ::.:::::::::::::::::::::::::::: NP_000 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK .:::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE :::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..: NP_000 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE ::..:::.::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 pF1KB5 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN :::::: .:... . ::. ::.:: : .:.::::.:..::: .: NP_000 GEDAHL--TQYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR 390 400 410 420 430 >>NP_002266 (OMIM: 148030) keratin, type I cytoskeletal (456 aa) initn: 1727 init1: 1335 opt: 1866 Z-score: 1005.8 bits: 195.4 E(85289): 2.8e-49 Smith-Waterman score: 1866; 65.9% identity (87.1% similar) in 449 aa overlap (25-466:14-454) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGG-----LSVSSS ::::.: .:.::::. . .. .:: .:.::. NP_002 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDG-LLVGS :: :.:. :::::::. . ::.: :. .:::.:.:.::::::::.:::: :: :. NP_002 RFVSSGS---GGGYGGGMRVCG--FGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGN 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK-DYSPYFKTIEDLR ::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :. . ::: ::::::.:: NP_002 EKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARA .::...:.::. :.:.:::::::::::: :::.:: ::..:::::::::::::::::::. NP_002 DKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLART 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 DLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEK :::::::.:.::::::::::::::. . .:..:.:::::::::::::.:.: :::.::: NP_002 DLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEA 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 MAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKA ::::::.:.: :::.::::::.:::.:.:..:..:.::..::::::.::::::::::::: NP_002 MAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 SLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIA .::::: ::. :: :: ::: .::..: ::..:::::: ::::::.:::.::::::::: NP_002 GLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIA 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 TYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN ::: ::::.::.... . .:... .:: ... .: . ::.:::.:.. NP_002 TYRSLLEGQDAKMAGIGIREASSGG---GGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI 410 420 430 440 450 >>XP_011523086 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (463 aa) initn: 1323 init1: 817 opt: 1813 Z-score: 977.9 bits: 190.3 E(85289): 9.9e-48 Smith-Waterman score: 1843; 64.9% identity (85.7% similar) in 456 aa overlap (25-466:14-461) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGG-----LSVSSS ::::.: .:.::::. . .. .:: .:.::. XP_011 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDG-LLVGS :: :.:. :::::::. . ::.: :. .:::.:.:.::::::::.:::: :: :. XP_011 RFVSSGS---GGGYGGGMRVCG--FGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGN 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK-DYSPYFKTIEDLR ::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :. . ::: ::::::.:: XP_011 EKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARA .::...:.::. :.:.:::::::::::: :::.:: ::..:::::::::::::::::::. XP_011 DKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLART 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KB5 DLEMQIESLKEELAYLKKNHEE-------EMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNE :::::::.:.:::::::::::: ::. . .:..:.:::::::::::::.:.: : XP_011 DLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 MRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQ ::.::: ::::::.:.: :::.::::::.:::.:.:..:..:.::..::::::.:::::: XP_011 MREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKT :::::::.::::: ::. :: :: ::: .::..: ::..:::::: ::::::.:::.:: XP_011 SQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKT 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 RLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQ :::::::::: ::::.::.... . .:... .:: ... .: . ::.:::.:.. XP_011 RLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGG---GGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKR 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 VLRTKN XP_011 EI >>NP_705694 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk (458 aa) initn: 1654 init1: 1288 opt: 1783 Z-score: 962.3 bits: 187.4 E(85289): 7.4e-47 Smith-Waterman score: 1814; 65.2% identity (83.7% similar) in 448 aa overlap (17-450:9-443) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG : . :::.:::: .. :: : :.:. :.:: :: NP_705 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQL-----GG--------GRGVSTCSTRFVSG 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB5 G-AYGLGGGYGGGFSSSSSS-FGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGG--------DGL : : : ::: . ::.....: ::.:.::: ::: :.::::::::::::: :: NP_705 GSAGGYGGGVSCGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGL 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 pF1KB5 LVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEI-KDYSPYFKTI :.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: :: .:::::.::: NP_705 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 EDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELT :.::.::::::..: :.:.:::::::::::: :::.:: ::.::::::::::::::::: NP_705 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 LARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRD :...:::::::::.:::::.::::::::. . .:: :.:::::::.::.::.:.: :::. NP_705 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 QYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQL ::: :::.::.:::::: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.::::::::: NP_705 QYEAMAERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQL 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLE ::::.:::.. ::. :: .:: ::: .:.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.::::: NP_705 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 QEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDV---TSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQ ::::::: ::::.::.. . :.:: : :.. :.:: .. : NP_705 QEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP 400 410 420 430 440 450 470 pF1KB5 VLRTKN >>XP_016880103 (OMIM: 148030) PREDICTED: keratin, type I (437 aa) initn: 1323 init1: 817 opt: 1778 Z-score: 959.9 bits: 186.8 E(85289): 1e-46 Smith-Waterman score: 1808; 68.6% identity (87.5% similar) in 417 aa overlap (25-427:14-425) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGG-----LSVSSS ::::.: .:.::::. . .. .:: .:.::. XP_016 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDG-LLVGS :: :.:. :::::::. . ::.: :. .:::.:.:.::::::::.:::: :: :. XP_016 RFVSSGS---GGGYGGGMRVCG--FGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGN 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK-DYSPYFKTIEDLR ::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :. . ::: ::::::.:: XP_016 EKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELR 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 NKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARA .::...:.::. :.:.:::::::::::: :::.:: ::..:::::::::::::::::::. XP_016 DKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLART 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KB5 DLEMQIESLKEELAYLKKNHEE-------EMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNE :::::::.:.:::::::::::: ::. . .:..:.:::::::::::::.:.: : XP_016 DLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEWVPPILQEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 MRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQ ::.::: ::::::.:.: :::.::::::.:::.:.:..:..:.::..::::::.:::::: XP_016 MREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQ 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKT :::::::.::::: ::. :: :: ::: .::..: ::..:::::: ::::::.:::.:: XP_016 SQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKT 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 RLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQ :::::::::: ::::.::... XP_016 RLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIAIREAYSFSL 410 420 430 >>NP_002265 (OMIM: 148065,615785) keratin, type I cytosk (420 aa) initn: 1630 init1: 1264 opt: 1756 Z-score: 948.5 bits: 184.7 E(85289): 4.3e-46 Smith-Waterman score: 1787; 67.5% identity (85.2% similar) in 419 aa overlap (17-424:9-414) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG : . :::.:::: .. :: : :.:. :.:: :: NP_002 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQL-----GG--------GRGVSTCSTRFVSG 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB5 G-AYGLGGGYGGGFSSSSSS-FGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGG--------DGL : : : ::: . ::.....: ::.:.::: ::: :.::::::::::::: :: NP_002 GSAGGYGGGVSCGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGL 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 pF1KB5 LVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEI-KDYSPYFKTI :.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: :: .:::::.::: NP_002 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 EDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELT :.::.::::::..: :.:.:::::::::::: :::.:: ::.::::::::::::::::: NP_002 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 LARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRD :...:::::::::.:::::.::::::::. . .:: :.:::::::.::.::.:.: :::. NP_002 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 QYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQL ::: :::.::.:::::: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.::::::::: NP_002 QYEAMAERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQL 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 SMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLE ::::.:::.. ::. :: .:: ::: .:.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.::::: NP_002 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 QEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLR ::::::: ::::.:: NP_002 QEIATYRSLLEGQDAKKRQPP 400 410 420 >>NP_000412 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) keratin, (584 aa) initn: 1232 init1: 1232 opt: 1643 Z-score: 887.7 bits: 173.9 E(85289): 1e-42 Smith-Waterman score: 1650; 65.0% identity (83.6% similar) in 426 aa overlap (12-422:37-456) 10 20 30 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG :: ::: : : ::..::: :: :: : NP_000 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 GSCRAPST--YGG--GLSVSSSRFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSG-FGGG-YGGG :.: . :. ::: :.. .: : .: :. ..::.:::.:...: ::.: :::: .::: NP_000 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR-GSYGSSSFGGSYGGSFGGGS--FGGGSFGGGSFGGG 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 pF1KB5 L--GAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRD :.:.::::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::.. NP_000 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 WYQRQ---RPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYET ::... . .: .::: :.:::.::.:.::. :.::::.::::::::::::::: :::. NP_000 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 ELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGG :. ::.::::::::::::::::::..:::::::::: ::::::::::::::. ::. : NP_000 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 DVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQS ::::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: :: :..::. :. .: : ..: NP_000 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 GKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQ ::::.::::..: :::::::::..: ::: :: ::.::::.::.::: .:...:::: : NP_000 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 LRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSR .: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: ::::: NP_000 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG 430 440 450 460 470 480 450 460 470 pF1KB5 QIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN NP_000 GSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG 490 500 510 520 530 540 >>XP_005257400 (OMIM: 113800,148080,607602,609165) PREDI (624 aa) initn: 1228 init1: 1228 opt: 1639 Z-score: 885.3 bits: 173.6 E(85289): 1.4e-42 Smith-Waterman score: 1646; 65.0% identity (83.3% similar) in 426 aa overlap (12-422:37-456) 10 20 30 pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIG---GGIGGGS-SRISSVLAG :: ::: : : ::..::: :: :: : XP_005 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 GSCRAPST--YGG--GLSVSSSRFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSG-FGGG-YGGG :.: . :. ::: :.. .: : .: :. ..::.::: :...: ::.: :::: .::: XP_005 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR-GSYGSSSFGGSYGGIFGGGS--FGGGSFGGGSFGGG 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 pF1KB5 L--GAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRD :.:.::::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::.. XP_005 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 WYQRQ---RPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYET ::... . .: .::: :.:::.::.:.::. :.::::.::::::::::::::: :::. XP_005 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 ELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGG :. ::.::::::::::::::::::..:::::::::: ::::::::::::::. ::. : XP_005 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 DVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQS ::::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: :: :..::. :. .: : ..: XP_005 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 GKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQ ::::.::::..: :::::::::..: ::: :: ::.::::.::.::: .:...:::: : XP_005 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 LRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSR .: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: ::::: XP_005 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG 430 440 450 460 470 480 450 460 470 pF1KB5 QIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN XP_005 GSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG 490 500 510 520 530 540 472 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 14:56:59 2016 done: Sat Nov 5 14:57:00 2016 Total Scan time: 10.350 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]