Result of SIM4 for pF1KB6246

seq1 = pF1KB6246.tfa, 2040 bp
seq2 = pF1KB6246/gi568815592f_41465761.tfa (gi568815592f:41465761_41698933), 233173 bp

>pF1KB6246 2040
>gi568815592f:41465761_41698933 (Chr6)

1-204  (100001-100204)   99% ->
205-300  (112226-112321)   100% ->
301-423  (119009-119131)   100% ->
424-510  (119671-119757)   100% ->
511-658  (121249-121396)   100% ->
659-872  (121539-121752)   100% ->
873-977  (122033-122137)   100% ->
978-1065  (122884-122971)   100% ->
1066-1149  (124011-124094)   100% ->
1150-1357  (124203-124410)   100% ->
1358-1434  (124511-124587)   100% ->
1435-1536  (125461-125562)   100% ->
1537-1658  (129110-129231)   100% ->
1659-1725  (131416-131482)   100% ->
1726-1895  (132021-132190)   100% ->
1896-2040  (133029-133173)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGTGGAATCTGCCTCGGAGACAATCAGGTCGGCTCCATCTGGTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGGGCAAGCAGATGGCAGCAGCGGCGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100051 GAATGGCGTGGGCAGCCTCTCTGGGCAAGCCGATGGCAGCAGCGGCGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACAGGGACAACTGCAAGTGGCACGGGCAGGGAAGTGACCACGGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACAGGGACAACTGCAAGTGGCACGGGCAGGGAAGTGACCACGGGTGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACAGCAATGGTGAGATGAGTCCCGCAGAGCTGCTGCACTTCCAGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAG         GCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAGGTA...CAGGCTCTCCAAGTGGCCCGGCAGTTCCTGCTGCAGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAAACAGTCTGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112263 CCTCAGGCCTGAGCTCCCCAGGGAACAATGACAGCAAACAGTCTGCCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGTGCAG         GTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112313 GCTGTGCAGGTG...CAGGTGCCTGTGTCGGTGGCCATGATGTCGCCGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATGCTTACCCCGCAACAGATGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119041 GATGCTTACCCCGCAACAGATGCAGCAGATCCTGTCGCCCCCGCAGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 119091 AGGCCTTGCTCCAGCAGCAGCAAGCCCTCATGCTCCAGCAGGTG...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTACAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119671 CTACAGGAGTACTACAAGAAGCAGCAGGAGCAGCTCCACCTGCAGCTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCAGCCCAAAGAG         GCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 119721 CACCCAGCAGCAGGCTGGGAAACCGCAGCCCAAAGAGGTA...CAGGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121253 TGGGGAACAAGCAGCTGGCCTTCCAGCAGCAGCTCCTGCAAATGCAACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTGCAGCAGCAGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121303 TTGCAGCAGCAGCACCTGCTCAACCTGCAGAGGCAGGGGCTGGTCAGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACCCTTCCGCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 121353 GCAGCCCAACCAAGCCTCGGGGCCCCTCCAGACCCTTCCGCAAGGTG...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    659    CAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121536 CAGCAGCTGTTTGCCCAACAGACCTGCCCCAGCTGTGGAAGGGCGAGGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCCCCGGGCAGCCTGCCGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121586 GCCCCCGGGCAGCCTGCCGAGGACAGCGTCAAGCAGGAGGGGCTGGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCCGCTCCCCCCAAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121636 CACTGGCACGGCCGCCACCGCTACCTCGTTTGCCGCTCCCCCCAAGGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121686 CACCCCCCCTCTCCCACCATACCCTGCCCAACGGACAGCCTACTGTGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACATCTCGGAGAGACAG         CTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121736 ACATCTCGGAGAGACAGGTA...CAGCTCTTCCCACGAGGAGACCCCCGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122057 CTCCCACCCCCTGTACGGACACGGAGAGTGCAAGTGGCCAGGCTGTGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAA         ACACCTCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 122107 CCCTGTGTGAAGACCTGGGCCAGTTTATCAAGTA...AAGACACCTCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACAGCCCAGTGCCGGGTACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122894 ACAGAGCACGCCCTGGATGACCGGAGTACAGCCCAGTGCCGGGTACAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAG         CTCGCCAAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 122944 GCAGGTGGTGCAGCAGCTGGAGATCCAGGTG...CAGCTCGCCAAGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCGAGCGGCTGCAGGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124024 GCGAGCGGCTGCAGGCCATGATGGCCCACCTGCACATGCGGCCCTCGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CCCAAGCCCTTCAGCCAGCCA         CTGAACCCGGTCCCCGGCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124074 CCCAAGCCCTTCAGCCAGCCAGTG...CAGCTGAACCCGGTCCCCGGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124223 CTCCTCATTCTCCAAGGTGACCGTCTCTGCAGCAGACTCATTCCCAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124273 GTCTCGTGCACCCCCCGACCTCGGCCGCAGCCCCTGTCACCCCTCTACGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124323 CCCCCTGGCCTGGGCTCTGCCTCCCTGCATGGTGGGGGCCCAGCCCGTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAG         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 124373 GAGAAGCAGTGACAAGTTCTGCTCCCCCATCTCCTCAGGTG...CAGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124514 TGGCCCAGAATCATGAGTTCTACAAGAACGCCGACGTCCGGCCCCCCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAG         GCCATCCTGGAAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 124564 ACCTACGCCTCCCTCATCCGCCAGGTG...CAGGCCATCCTGGAAACCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125478 TGACAGGCAGCTGACCCTGAATGAGATCTATAACTGGTTCACCAGGATGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAAG         AACGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 125528 TCGCCTATTTCCGCAGAAACACTGCCACCTGGAAGGTG...CAGAACGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129116 GTGCGCCACAACCTCAGCCTGCACAAGTGCTTCGTCCGCGTGGAGAACGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129166 CAAGGGTGCCGTGTGGACTGTGGACGAGCGGGAGTATCAGAAGCGGAGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CGCCAAAGATGACAGG         GAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 129216 CGCCAAAGATGACAGGGTA...CAGGAGCCCCACCCTGGTGAAGAACATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 131441 ATCTCTGGCCTCAGCTATGGAGCACTTAATGCCAGCTACCAGGTG...CA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1726  GCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132020 GGCCGCCCTGGCCGAGAGCAGCTTCCCCCTCCTCAACAGCCCTGGCATGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132070 TGAACCCTGGCTCCGCCAGCAGCCTGCTGCCCCTCAGCCACGATGACGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132120 GGTGCCCCCGTGGAGCCGCTGCCCAGCAACGGCAGCAGCAGCCCTCCTCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CCTCTCCCCGCCCCAGTACAG         CCACCAGGTGCAGGTGAAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 132170 CCTCTCCCCGCCCCAGTACAGGTG...CAGCCACCAGGTGCAGGTGAAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 AGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133049 AGGAGCCAGCAGAGGCAGAGGAAGACAGGCAGCCCGGGCCTCCCCTGGGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133099 GCCCCTAACCCCAGCGCCTCGGGGCCTCCGGAAGACAGGGACCTGGAGGA

   2150     .    :    .    :    .
   2016 GGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||
 133149 GGAGCTGCCGGGAGAAGAACTGTCC

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