Result of FASTA (ccds) for pF1KB6205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6205, 664 aa
  1>>>pF1KB6205 664 - 664 aa - 664 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7821+/-0.00117; mu= 17.8664+/- 0.070
 mean_var=88.8046+/-17.294, 0's: 0 Z-trim(102.1): 58  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.136099
 statistics sampled from 6788 (6815) to 6788 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.209), width:  16
 Scan time:  2.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9101.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12         ( 664) 4263 848.0       0
CCDS58276.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12        ( 670) 4241 843.7       0
CCDS58275.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12        ( 621) 3998 795.9       0
CCDS2882.1 APPL1 gene_id:26060|Hs108|chr3          ( 709) 2177 438.4 1.6e-122
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1           ( 834)  396 88.8 3.4e-17
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3         ( 778)  359 81.5 4.9e-15
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4      ( 786)  302 70.3 1.2e-11


>>CCDS9101.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12              (664 aa)
 initn: 4263 init1: 4263 opt: 4263  Z-score: 4527.1  bits: 848.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4263; 100.0% identity (100.0% similar) in 664 aa overlap (1-664:1-664)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFRE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 KDLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KDLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 YYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 YYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVEL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 EAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 EAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWERL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 YFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAESR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 YFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAESR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 KENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPSQNLKNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPSQNLKNS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 EMENENDKIVPKATASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGSRRTNPFGETEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 EMENENDKIVPKATASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGSRRTNPFGETEDE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 SFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTESHLMVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTESHLMVT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 SQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLSTYIFESNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLSTYIFESNS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 EGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQPDDDDGNPNEHRGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 EGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQPDDDDGNPNEHRGA
              610       620       630       640       650       660

           
pF1KB6 ESEA
       ::::
CCDS91 ESEA
           

>>CCDS58276.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12             (670 aa)
 initn: 4251 init1: 3403 opt: 4241  Z-score: 4503.7  bits: 843.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4241; 99.1% identity (99.1% similar) in 670 aa overlap (1-664:1-670)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFRE
               70        80        90       100       110       120

              130             140       150       160       170    
pF1KB6 KDLTEVSTLKDLFGLASN------EHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQ
       ::::::::::::::::::      ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDLTEVSTLKDLFGLASNDVCLFLEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQ
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB6 HLSSLQYYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HLSSLQYYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQ
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB6 SIQVELEAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SIQVELEAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVT
              250       260       270       280       290       300

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB6 TTWERLYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TTWERLYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGII
              310       320       330       340       350       360

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB6 LQAESRKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LQAESRKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPS
              370       380       390       400       410       420

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB6 QNLKNSEMENENDKIVPKATASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGSRRTNPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QNLKNSEMENENDKIVPKATASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGSRRTNPF
              430       440       450       460       470       480

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB6 GETEDESFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GETEDESFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTE
              490       500       510       520       530       540

          540       550       560       570       580       590    
pF1KB6 SHLMVTSQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLSTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHLMVTSQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLSTY
              550       560       570       580       590       600

          600       610       620       630       640       650    
pF1KB6 IFESNSEGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQPDDDDGNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IFESNSEGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQPDDDDGNP
              610       620       630       640       650       660

          660    
pF1KB6 NEHRGAESEA
       ::::::::::
CCDS58 NEHRGAESEA
              670

>>CCDS58275.1 APPL2 gene_id:55198|Hs108|chr12             (621 aa)
 initn: 3998 init1: 3998 opt: 3998  Z-score: 4246.3  bits: 795.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3998; 100.0% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (44-664:1-621)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KB6 QDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQLSKQLLAYEKQNF
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                               MQRVYGAQNEMCLATQQLSKQLLAYEKQNF
                                             10        20        30

            80        90       100       110       120       130   
pF1KB6 ALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFREKDLTEVSTLKDLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFREKDLTEVSTLKDLF
               40        50        60        70        80        90

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB6 GLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQYYCALNALQYRKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQYYCALNALQYRKQ
              100       110       120       130       140       150

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB6 MAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVELEAEAEKMRVSQQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVELEAEAEKMRVSQQE
              160       170       180       190       200       210

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB6 LLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWERLYFFTQGGNLMCQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWERLYFFTQGGNLMCQP
              220       230       240       250       260       270

           320       330       340       350       360       370   
pF1KB6 RGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAESRKENEEWICAINNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAESRKENEEWICAINNI
              280       290       300       310       320       330

           380       390       400       410       420       430   
pF1KB6 SRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPSQNLKNSEMENENDKIVPKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPSQNLKNSEMENENDKIVPKA
              340       350       360       370       380       390

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pF1KB6 TASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGSRRTNPFGETEDESFPEAEDSLLQQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGSRRTNPFGETEDESFPEAEDSLLQQM
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pF1KB6 FIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTESHLMVTSQSLRLIDPQTQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHNIFRMTESHLMVTSQSLRLIDPQTQV
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pF1KB6 SRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLSTYIFESNSEGEKICYAINLGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGEESLSTYIFESNSEGEKICYAINLGK
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQPDDDDGNPNEHRGAESEA
              580       590       600       610       620 

>>CCDS2882.1 APPL1 gene_id:26060|Hs108|chr3               (709 aa)
 initn: 2176 init1: 1606 opt: 2177  Z-score: 2313.1  bits: 438.4 E(32554): 1.6e-122
Smith-Waterman score: 2262; 55.0% identity (80.8% similar) in 629 aa overlap (1-615:1-625)

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pF1KB6 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
       ::..::: .::.:.:::::::::.:::::: ....: ::: :::.:.: ::::.  ::. 
CCDS28 MPGIDKLPIEETLEDSPQTRSLLGVFEEDATAISNYMNQLYQAMHRIYDAQNELSAATHL
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pF1KB6 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVIS-TLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFR
        :: :  :::: : :: ::.::.: ::. ::::.:::.  :. :. ::::.:..:: ::.
CCDS28 TSKLLKEYEKQRFPLG-GDDEVMSSTLQQFSKVIDELSSCHAVLSTQLADAMMFPITQFK
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pF1KB6 EKDLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSL
       :.:: :. :::..: .:::.:: .. .:::: ::.::.::: :: ..: ..:.::: . .
CCDS28 ERDLKEILTLKEVFQIASNDHDAAINRYSRLSKKRENDKVKYEVTEDVYTSRKKQHQTMM
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pF1KB6 QYYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVE
       .:.::::.:::.:..:..::..:. ..::.::: :.: ...... ::....  ::... :
CCDS28 HYFCALNTLQYKKKIALLEPLLGYMQAQISFFKMGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVRRE
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pF1KB6 LEAEAEKMRVSQQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLVTTTWER
       .... : :. . ..:  ... .:.:: : .   .:::: .:::::: :::::::..::.:
CCDS28 MDSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNRNLTRKAGYLNARNKTGLVSSTWDR
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KB6 LYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRRYCFQITTPNGKSGIILQAES
        ..:::::::: : :: ::::: .:.::::::::::::::::::::. .::.. ::::::
CCDS28 QFYFTQGGNLMSQARGDVAGGLAMDIDNCSVMAVDCEDRRYCFQITSFDGKKSSILQAES
     300       310       320       330       340       350         

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pF1KB6 RKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQESSCPS--QNL
       .:..:::::.:::::.::::..::: .: ..::.::.::::  :: ...::  :.  :. 
CCDS28 KKDHEEWICTINNISKQIYLSENPEETAARVNQSALEAVTPSPSFQQRHESLRPAAGQSR
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pF1KB6 KNSEMENENDKIVPKAT--ASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQ-------NRGS
         .   . . ..  ..:  :.:   . :.:: :::::::. :. :  ::       ..:.
CCDS28 PPTARTSSSGSLGSESTNLAALS-LDSLVAPDTPIQFDIISPVCE--DQPGQAKAFGQGG
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pF1KB6 RRTNPFGETEDESFPEAEDSLLQQMFIVRFLGSMAVKTDSTTEVIYEAMRQVLAARAIHN
       ::::::::.   .  :.:::.:.:.::::::::: ::.:.  .:.::.:::.::::::::
CCDS28 RRTNPFGESGGSTKSETEDSILHQLFIVRFLGSMEVKSDDHPDVVYETMRQILAARAIHN
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pF1KB6 IFRMTESHLMVTSQSLRLIDPQTQVSRANFELTSVTQFAAHQENKRLVGFVIRVPESTGE
       :::::::::.:: . :.::::::::.: .: :  :. .:.::::::: :::.:.  . .:
CCDS28 IFRMTESHLLVTCDCLKLIDPQTQVTRLTFPLPCVVLYATHQENKRLFGFVLRTSSGRSE
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pF1KB6 ESLST--YIFESNSEGEKICYAINLGKEIIEVQKDPEALAQLMLSIPLTNDGKYVLLNDQ
        .::.  ::::::.:::::: ...:.:.:                               
CCDS28 SNLSSVCYIFESNNEGEKICDSVGLAKQIALHAELDRRASEKQKEIERVKEKQQKELNKQ
        600       610       620       630       640       650      

>>CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1                (834 aa)
 initn: 172 init1:  78 opt: 396  Z-score: 422.2  bits: 88.8 E(32554): 3.4e-17
Smith-Waterman score: 396; 24.2% identity (59.6% similar) in 421 aa overlap (9-417:5-405)

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pF1KB6 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
               .:: ..:::. :. ..  : :.  .    ..:.    .. ... :   :  .
CCDS19     MTVEFEECVKDSPRFRATIDEVETDVVEIEAKLDKLV----KLCSGMVEAGKAYVS
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pF1KB6 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVISTLHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFRE
        :. ...  ..     .::  .   :. :.  ..:.   :  :  :   ..   . .: .
CCDS19 TSRLFVSGVRDLSQQCQGDTVISECLQRFADSLQEVVNYHMILFDQAQRSVRQQLQSFVK
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pF1KB6 KDLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRKQHLSSLQ
       .:. . .  :  :  . .. .::... .. :... .: :.  .:  . . .  .::. :.
CCDS19 EDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQAPRHRPHE-VEEATGALTLTRKCFRHLA-LD
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pF1KB6 YYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQVEL
       :   .:.:: .:.. ... :..: :.: .::..:  .. ...: .....:  .... .. 
CCDS19 YVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLL-HQLDPYMKKLAAELDQLVIDS
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pF1KB6 EAEAEKMR-----VSQQELL---SVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGL
        .: ..:.     ..:. ::   : :::    . :: ::.   ..... :::  : ....
CCDS19 AVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDES--KVEFDVDAPS---GVVME-GYLFKRASNAF
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pF1KB6 VTTTWERLYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLI-QDLDNCSVMAVDCED--RRYCFQITTPNG
          ::.: .:  :...:. : .   :  .. .::  :::    :::  ::.::.. .:. 
CCDS19 --KTWNRRWFSIQNSQLVYQKKLKDALTVVVDDLRLCSVKP--CEDIERRFCFEVLSPT-
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pF1KB6 KSGIILQAESRKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAV-AIKLNQTALQAVTPITSFGKKQ
       ::  .:::.:.:  . :. :..    . :  ..:..  . .:..::  ... : :    .
CCDS19 KS-CMLQADSEKLRQAWVQAVQASIASAY-RESPDSCYSERLDRTASPSTSSIDSATDTR
      340        350       360        370       380       390      

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pF1KB6 ESSCPSQNLKNSEMENENDKIVPKATASLPEAEELIAPGTPIQFDIVLPATEFLDQNRGS
       : .  ....                                                   
CCDS19 ERGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVLLCIECSGIHRSLGVHCSKVR
        400       410       420       430       440       450      

>>CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3              (778 aa)
 initn: 168 init1:  75 opt: 359  Z-score: 383.3  bits: 81.5 E(32554): 4.9e-15
Smith-Waterman score: 408; 25.3% identity (60.1% similar) in 411 aa overlap (9-409:7-393)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPAVDKLLLEEALQDSPQTRSLLSVFEEDAGTLTDYTNQLLQAMQRVYGAQNEMCLATQQ
               .:: :.:::. :. :   : :.. :    ..:..    .  . . .:.:..:
CCDS33   MKMTVDFEECLKDSPRFRAALEEVEGDVAELELKLDKLVKLCIAMIDTGKAFCVANKQ
                 10        20        30        40        50        

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pF1KB6 LSKQLLAYEKQNFALGKGDEEVIST-LHYFSKVVDELNLLHTELAKQLADTMVLPIIQFR
       . . .     ...:  .... :. : :  ::  ..:.  .:: :  :   ..   . .: 
CCDS33 FMNGI-----RDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFDQTQRSIKAQLQNFV
       60             70        80        90       100       110   

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pF1KB6 EKDLTEVSTLKDLFGLASNEHDLSMAKYSRLPKKKENEKVKTEVGKEVAAARRK--QHLS
       ..:: . .  :  :  .:.:.. ...: ... ..:..:   .: . .. .: ::  .:..
CCDS33 KEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQRNKQHE---VEEATNILTATRKCFRHIA
           120       130       140       150          160       170

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pF1KB6 SLQYYCALNALQYRKQMAMMEPMIGFAHGQINFFKKGAEMFSKRMDSFLSSVADMVQSIQ
        :.:   .:.:: ...  ... :..: .... ::..: ..::. .  ...... ... . 
CCDS33 -LDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSE-LGPYMKDLGAQLDRLV
               180       190       200       210        220        

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pF1KB6 VELEAEAEKMRVS----QQELLSVDESVYTPDSDVAAPQINRNLIQKAGYLNLRNKTGLV
       :.   : ..:. .    ::. .: :.:    . :.:      : :   :::  : .... 
CCDS33 VDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAA------NGIVMEGYLFKRASNAF-
      230       240       250       260             270       280  

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pF1KB6 TTTWERLYFFTQGGNLMCQPRGAVAGGLI-QDLDNCSVMAVDCED--RRYCFQITTPNGK
         ::.: .:  :...:. : .      .. .::  :.:    :::  ::.::....:. :
CCDS33 -KTWNRRWFSIQNNQLVYQKKFKDNPTVVVEDLRLCTVK--HCEDIERRFCFEVVSPT-K
              290       300       310         320       330        

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pF1KB6 SGIILQAESRKENEEWICAINNISRQIYLTDNPEAVAIKLNQTALQAVTPITSFGKKQES
       :  .:::.:.:  . :: :...     :   . :.   ::.. .  ..  . : ....: 
CCDS33 S-CMLQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDESE--KLDKKSSPSTGSLDSGNESKEK
        340       350       360       370         380       390    

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